Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KHLEACLEGEVAYQKTTTGLEGFRLRYQALAGLALSEVDLTTPFLGKTLKAPFLIGAMTERINLALAEAAEALGVGMMLG
SGRILLERPEAVRKVAPKALLIANLGLAQLRRYGRDDLLRLVEMLEADALAFHVNPLQEAVQRGDTDFRGLVERLAELLP
LPFPVMVKEVGHGLSREAALALRDLPLAAVDVAGAGGTSWARVEEWVRFGEVRHPELCEIGIPTARAILEVREVLPHLPL
VASGGVYTGTDGAKALALGADLLAVARPLLRPALEGAERVAAWIGDYLEELRTALFAIGARNPKEARGRVERV

The query sequence (length=313) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3dh7:A 318 318 1.0000 0.9843 0.9843 0.0 3dh7:B, 3dh7:C, 3dh7:D, 1vcf:A, 1vcf:B, 1vcg:A, 1vcg:B, 1vcg:C, 1vcg:D
2 3b03:B 364 323 0.3706 0.3187 0.3591 1.43e-56 3b03:A, 3b03:C, 3b03:D, 3b04:A, 3b04:B, 3b04:C, 3b04:D, 3b05:A, 3b05:B, 3b05:C, 3b05:D, 3b06:A, 3b06:B, 3b06:C, 3b06:D, 3vkj:A, 3vkj:B, 3vkj:C, 3vkj:D, 2zru:A, 2zru:B, 2zru:C, 2zru:D, 2zrv:A, 2zrv:B, 2zrv:C, 2zrv:D, 2zrw:A, 2zrw:B, 2zrw:C, 2zrw:D, 2zrx:A, 2zrx:B, 2zrx:C, 2zrx:D, 2zry:A, 2zry:B, 2zry:C, 2zry:D, 2zrz:A, 2zrz:B, 2zrz:C, 2zrz:D
3 1p0k:B 309 300 0.3195 0.3236 0.3333 6.15e-33 1p0k:A, 1p0n:A, 1p0n:B
4 4n02:A 332 282 0.2812 0.2651 0.3121 4.26e-28
5 7r4p:A 337 290 0.2588 0.2404 0.2793 4.83e-08 7m2o:A, 2rdt:A, 2w0u:A, 2w0u:B, 2w0u:C, 2w0u:D, 6w44:A, 6w45:A, 6w4c:A
6 6gmb:A 362 302 0.2556 0.2210 0.2649 1.13e-04 6gmc:A, 2nzl:A, 5qib:A, 5qic:A, 5qid:A, 5qie:A, 5qif:A, 5qig:A, 5qih:A, 7r4n:A, 7r4o:A, 2rdu:A, 2rdw:A
7 2nli:B 326 279 0.2300 0.2209 0.2581 6.79e-04
8 1eep:A 314 248 0.2077 0.2070 0.2621 0.002
9 1ldc:B 382 271 0.2077 0.1702 0.2399 0.002
10 7l01:B 385 114 0.0927 0.0753 0.2544 0.003 5boo:A, 5boo:B, 4cq8:A, 4cq8:B, 4cq9:A, 4cq9:B, 4cqa:A, 4cqa:B, 5del:A, 6e0b:A, 5fi8:A, 6gjg:A, 6gjg:B, 6i4b:A, 6i4b:B, 6i55:A, 6i55:B, 3i65:A, 3i68:A, 3i6r:A, 7kyk:A, 7kyk:B, 7kyk:C, 7kyk:D, 7kyv:A, 7kyy:A, 7kyy:B, 7kyy:C, 7kyy:D, 7kz4:A, 7kz4:B, 7kzy:A, 7kzy:B, 7l01:A, 7l0k:A, 7l0k:B, 3o8a:A, 4orm:A, 4rx0:A, 7s87:A, 7s87:B, 3sfk:A, 5tbo:A, 1tv5:A, 6vtn:A, 6vty:A, 6vty:B, 6vty:C, 6vty:D, 7wyf:A
11 2j6x:H 348 146 0.1406 0.1264 0.3014 0.003 8ufy:B, 2zfa:B
12 8p4q:E 390 62 0.0639 0.0513 0.3226 0.004 8p37:A, 8p4q:A, 8p4q:B, 8p4q:C, 8p4q:D, 8p4q:F, 8p4q:G, 8p4q:H
13 6r9v:A 369 92 0.0927 0.0786 0.3152 0.006 6rhs:A, 6rht:A
14 2du2:A 374 72 0.0799 0.0668 0.3472 0.014 2du2:B, 2du2:C, 2du2:D, 2e77:A, 2e77:B, 2e77:C, 2e77:D, 5ebu:A, 5ebu:B, 5ebu:C, 5ebu:D, 5ebu:E, 5ebu:F, 5ebu:G, 5ebu:H, 7f1y:A, 7f1y:B, 7f20:A, 7f20:B, 7f21:A, 7f21:B, 7f22:A, 7f22:B, 2j6x:A, 2j6x:B, 2j6x:C, 2j6x:D, 2j6x:E, 2j6x:F, 2j6x:G, 2nli:A, 4rje:A, 4rje:B, 4rje:C, 4rje:D, 8ufy:A, 4yl2:A, 4yl2:B, 4yl2:C, 4yl2:D, 2zfa:A
15 6dvh:A 394 326 0.2524 0.2005 0.2423 0.055 6dvh:B, 6dvh:C, 6dvh:D, 6dvh:E, 6dvh:F, 6dvi:A, 6dvi:B, 6dvi:C, 6dvi:E, 6dvi:F
16 1kbi:A 504 43 0.0639 0.0397 0.4651 0.065 1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
17 4ww9:A 238 109 0.1022 0.1345 0.2936 0.071 4ww5:A, 4ww7:A
18 6dvi:D 338 86 0.0863 0.0799 0.3140 0.079
19 3sgz:A 336 48 0.0671 0.0625 0.4375 0.090 3sgz:B, 3sgz:C, 1tb3:A, 1tb3:B, 1tb3:C, 1tb3:D, 1tb3:E, 1tb3:F, 1tb3:G, 1tb3:H
20 1gth:A 1019 73 0.0735 0.0226 0.3151 0.15 8f5w:A, 8f5w:B, 8f5w:C, 8f5w:D, 8f61:A, 8f61:B, 8f61:C, 8f61:D, 8f6n:A, 8f6n:B, 8f6n:C, 8f6n:D, 1gt8:A, 1gt8:B, 1gt8:C, 1gt8:D, 1gte:A, 1gte:B, 1gte:C, 1gte:D, 1gth:B, 1gth:C, 1gth:D, 1h7w:A, 1h7w:B, 1h7w:C, 1h7w:D, 1h7x:A, 1h7x:B, 1h7x:C, 1h7x:D, 7ljs:A, 7ljs:B, 7ljs:C, 7ljs:D, 7ljt:A, 7ljt:B, 7ljt:C, 7ljt:D, 7lju:A, 7lju:C, 7lju:D, 7lju:B, 7m31:A, 7m31:B, 7m31:C, 7m31:D, 7m32:A, 7m32:B, 7m32:C, 7m32:D
21 5zbm:B 353 51 0.0639 0.0567 0.3922 0.16 1al7:A, 1al8:A, 1gox:A, 1gyl:A, 5zbm:A
22 9c4m:A 335 94 0.1022 0.0955 0.3404 0.26 9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H
23 1hg3:A 224 56 0.0639 0.0893 0.3571 0.33 1hg3:B, 1hg3:C, 1hg3:D, 1hg3:E, 1hg3:F, 1hg3:G, 1hg3:H
24 4qj1:D 346 99 0.0863 0.0780 0.2727 0.43 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
25 1r9j:B 671 70 0.0703 0.0328 0.3143 1.0 1r9j:A
26 6m73:A 364 33 0.0479 0.0412 0.4545 1.0 6m74:A
27 6mgr:C 369 48 0.0575 0.0488 0.3750 2.0 6mgr:A, 6mgr:B, 6mgr:D, 4mz1:A, 4mz1:B, 4mz1:C, 4mz8:A, 4mz8:B, 4mz8:C, 4mz8:D, 4r7j:A, 5uqf:A, 5uqf:B, 5uqf:C, 5uqg:A, 5uqg:B, 5uqg:H, 5uqg:C, 5uqg:G, 5uqg:D, 5uqg:E, 5uqg:F, 5uqh:A, 5uqh:B, 5uqh:C, 5uqh:D, 5uqh:E, 5uqh:F, 5uqh:G, 5uqh:H, 5urq:A, 5urq:D, 5urq:B, 5urq:C, 5urq:E, 5urq:H, 5urq:F, 5urq:G
28 2cbz:A 230 81 0.0639 0.0870 0.2469 2.1
29 3khj:A 302 52 0.0543 0.0563 0.3269 2.4 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
30 3oix:A 310 143 0.1022 0.1032 0.2238 2.5 3oix:B, 3oix:C, 3oix:D
31 6uc2:A 453 58 0.0671 0.0464 0.3621 2.7 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
32 6jig:A 480 203 0.1629 0.1062 0.2512 2.9 6lk4:A
33 8z9h:C 748 45 0.0415 0.0174 0.2889 3.9 8z90:C, 8z9r:C
34 8qqp:A 464 43 0.0639 0.0431 0.4651 4.9 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
35 8rq4:A 1402 203 0.1406 0.0314 0.2167 5.0
36 8qqv:A 356 43 0.0639 0.0562 0.4651 5.2 8qqv:B, 8qqv:D, 8qqv:C, 8qqv:E, 8qqv:F, 8qqv:G, 8qqv:H, 8qqx:A, 8qqx:B, 8qqx:C, 8qqx:D, 8qqx:E, 8qqx:F, 8qqx:G, 8qqx:H
37 6aqh:B 490 47 0.0447 0.0286 0.2979 5.3 6aqh:A, 6aqh:C, 6aqh:D
38 7pmz:B 430 96 0.0927 0.0674 0.3021 5.4 7pmz:A, 7pmz:C, 7pmz:D, 7pmz:E, 7pmz:F, 7pmz:G, 7pmz:H, 7pmz:I, 7pmz:J, 7pmz:K, 7pmz:L, 7pmz:M, 7pmz:N, 7pmz:O, 7pmz:P
39 8g8f:A 491 47 0.0607 0.0387 0.4043 6.0 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
40 1nf7:A 454 47 0.0607 0.0419 0.4043 6.2 1jr1:A, 1nf7:B
41 8fuz:A 390 47 0.0607 0.0487 0.4043 6.4 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
42 6i2n:D 336 108 0.0767 0.0714 0.2222 6.6
43 1nfb:A 396 47 0.0607 0.0480 0.4043 7.3 1nfb:B
44 1b3o:B 410 47 0.0607 0.0463 0.4043 7.8
45 3tsb:A 490 46 0.0511 0.0327 0.3478 8.8 3tsd:A, 3usb:A
46 6a08:A 335 69 0.0735 0.0687 0.3333 8.8 6a00:A, 6a01:A, 6a0b:A, 6a0d:A, 6a0g:A, 6a0m:A, 6a0o:A, 6a0v:A, 6a0y:A, 6a11:A, 6a13:A, 6a19:A, 6a1a:A, 6a1b:A, 6a1h:A, 6a1l:A, 6a1m:A, 6a1n:A, 6a1p:A, 6a1r:A, 6a1w:A, 6a21:A, 6a23:A, 6a36:A, 6a39:A, 6a3d:A, 6a3t:A, 6a4g:A, 6a4h:A, 6ai7:A, 7bsr:A, 5zzr:A, 5zzs:A, 5zzt:A, 5zzx:A, 5zzy:A, 5zzz:A
47 3tsd:B 426 46 0.0511 0.0376 0.3478 8.9
48 3tsb:B 434 46 0.0511 0.0369 0.3478 9.0
49 5upx:A 380 207 0.1502 0.1237 0.2271 9.1
50 2ygm:B 352 27 0.0351 0.0312 0.4074 9.2 2ygl:A, 2ygl:B, 2ygm:A
51 5zzq:A 355 69 0.0735 0.0648 0.3333 9.4 6a24:A, 5zzp:A
52 4myx:G 356 46 0.0511 0.0449 0.3478 9.5 6mgu:A, 6mgu:B, 7mtu:A, 7mtu:C, 7mtu:B, 7mtu:D, 7mtu:E, 7mtu:G, 7mtu:F, 7mtu:H, 7mtx:A, 7mtx:C, 7mtx:B, 7mtx:D, 7mtx:E, 7mtx:G, 7mtx:F, 7mtx:H, 4my1:A, 4my1:C, 4my1:B, 4my1:D, 4my1:E, 4my1:F, 4my1:G, 4my1:H, 4my8:A, 4my8:B, 4my8:C, 4my8:D, 4my9:A, 4my9:C, 4my9:B, 4my9:D, 4my9:E, 4my9:F, 4my9:H, 4my9:G, 4mya:A, 4mya:B, 4myx:A, 4myx:C, 4myx:B, 4myx:D, 4myx:E, 4myx:F, 4myx:H, 4qm1:A, 4qm1:B, 4qm1:D, 4qm1:C, 5urs:A, 5urs:C, 5urs:B, 5urs:D, 5urs:E, 5urs:G, 5urs:F, 5urs:H, 5uuv:A, 5uuv:D, 5uuv:B, 5uuv:C, 5uuz:A, 5uuz:C, 5uuz:B, 5uuz:D, 5uuz:E, 5uuz:G, 5uuz:F, 5uuz:H
53 3usb:B 401 46 0.0511 0.0399 0.3478 9.9
54 7rfh:H 451 84 0.0767 0.0532 0.2857 9.9 7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
55 6e2a:A 326 51 0.0639 0.0613 0.3922 10.0 2gjl:A, 2gjn:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218