Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KHEYSFGVIPIRFFDRSTLKACFICHTDGKHWGFPKGHAEEKEGPQEAAERELVEETGLGIVNFFPKIFVENYSFNFVRK
EVTYFLAEVKGEVHADPDEICDVQWLSFQEGLRLLNFPEIRNIVTEADKFVQSYLF

The query sequence (length=136) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4mpo:B 148 144 1.0000 0.9189 0.9444 4.53e-95 4mpo:A, 4mpo:C, 4mpo:D, 4mpo:E, 4mpo:F, 4mpo:G, 4mpo:H
2 1vc8:A 126 88 0.2353 0.2540 0.3636 6.55e-08 1vc8:B, 1vc9:A, 1vc9:B
3 1xsc:A 153 128 0.3015 0.2680 0.3203 1.61e-07 4ick:B, 4ijx:A, 4ijx:B
4 1v8m:A 159 119 0.3088 0.2642 0.3529 1.66e-07 1v8l:A, 1v8r:A, 1v8s:A, 1v8t:A, 1v8v:A, 1v8y:A, 3x0k:A, 3x0l:A, 3x0m:A, 3x0n:A, 3x0o:A, 3x0p:A, 3x0q:A, 3x0r:A
5 3i7v:A 134 119 0.2426 0.2463 0.2773 1.38e-06 3i7v:B
6 5qoh:A 149 104 0.2132 0.1946 0.2788 7.27e-06 5qoi:A, 5qoj:A, 5qok:A, 5qom:A, 5qon:A, 5qoo:A, 5qop:A, 5qoq:A, 5qor:A, 5qos:A, 5qot:A, 5qou:A, 5qov:A, 5qow:A, 5qox:A, 5qoy:A, 5qoz:A, 5qp0:A, 5qp1:A, 5qp2:A, 5qp3:A, 5qp4:A, 5qp5:A, 5qp6:A, 5qp7:A, 5qp8:A, 5qp9:A, 5qpa:A, 5qpb:A
7 5gg6:B 295 108 0.2132 0.0983 0.2685 1.76e-05 5gg6:A, 5gg7:A, 5gg7:B, 5gg8:A, 5gg9:A, 5gga:A, 5ggb:A, 5ggc:A, 5ggc:B, 5ggd:A, 5ggd:B, 6m65:A, 6m69:A, 6m6y:A, 6m72:A, 5xd1:A, 5xd2:A, 5xd3:A, 5xd4:A, 5xd5:B, 5xd5:A
8 2gb5:A 265 112 0.2500 0.1283 0.3036 4.08e-05 7e44:A, 7e44:B, 7e44:E, 7e44:F, 2gb5:B, 5isy:A, 5isy:C, 5iw4:A, 5iw4:B, 5iw5:B, 5iw5:A, 1vk6:A
9 1k26:A 150 120 0.2426 0.2200 0.2750 2.70e-04
10 6am0:A 260 61 0.1397 0.0731 0.3115 0.001 6am0:E, 5lop:A
11 3hhj:B 131 62 0.1618 0.1679 0.3548 0.005 3hhj:A
12 1su2:A 159 30 0.1176 0.1006 0.5333 0.006 1su2:B, 1sz3:A, 1sz3:B
13 6ywe:6 273 115 0.1912 0.0952 0.2261 0.010 6yws:6, 6ywv:6, 6ywx:6, 6ywy:6
14 4nfw:F 153 108 0.2426 0.2157 0.3056 0.011 4nfw:A, 4nfw:B, 4nfw:C, 4nfw:D, 4nfw:E, 4nfw:G, 4nfw:H, 4nfw:J, 4nfw:K, 3shd:A, 3shd:B, 3shd:C, 3shd:D, 3shd:E, 3shd:F, 3shd:G, 3shd:H, 3shd:I, 3shd:J, 3shd:K, 3shd:L
15 2fvv:A 135 92 0.1912 0.1926 0.2826 0.012 8g9c:A, 8g9d:A, 6pck:A, 6pcl:A, 2q9p:A, 8t98:A, 8t99:A, 8tf9:A, 8tfa:A, 7tn4:A, 6wo7:A, 6wo8:A, 6wo9:A, 6woa:A, 6wob:A, 6woc:A, 6wod:A, 6woe:A, 6wof:A, 6wog:A, 6woh:A, 6woi:A
16 2qkm:B 266 55 0.1471 0.0752 0.3636 0.019 5j3t:B, 5kq4:E, 5kq4:B, 5n2v:B, 5n2v:E, 2qkm:F
17 2b06:A 150 32 0.1176 0.1067 0.5000 0.029
18 1jkn:A 165 28 0.1103 0.0909 0.5357 0.044
19 3son:A 147 117 0.1912 0.1769 0.2222 0.046 3son:B
20 6ypf:A 129 73 0.1838 0.1938 0.3425 0.049
21 1ktg:A 137 125 0.1985 0.1971 0.2160 0.054 1ktg:B
22 6y3z:A 243 110 0.2132 0.1193 0.2636 0.063
23 6p5r:A 308 77 0.1544 0.0682 0.2727 0.065 6u9x:D, 6u9x:A
24 3ffu:A 133 28 0.1103 0.1128 0.5357 0.19 3ef5:A, 3ef5:B, 3ffu:B
25 4s2v:A 139 33 0.1103 0.1079 0.4545 0.20
26 6nci:B 197 38 0.1176 0.0812 0.4211 0.21 6nch:B
27 1vhz:A 186 53 0.1471 0.1075 0.3774 0.21 1vhz:B
28 6vcr:A 161 32 0.1103 0.0932 0.4688 0.27 6d1v:B, 4s2x:A, 4s2y:A, 7sp3:A, 6vck:B, 6vcl:B, 6vcm:B, 6vcn:A, 6vco:A, 6vcp:A, 6vcq:A
29 5mzg:A 155 85 0.1912 0.1677 0.3059 0.40 6ehh:A, 6ehh:B, 6ehh:C, 6ehh:D, 5mze:A, 5mze:B, 5mze:C, 5mze:D, 5mzg:B
30 3r03:A 131 28 0.1029 0.1069 0.5000 0.49
31 5gp0:I 139 29 0.1103 0.1079 0.5172 0.50 6dbz:A, 6dbz:B, 6fl4:A, 6fl4:B, 5gp0:E, 5gp0:F, 5gp0:A, 5wwd:A, 5wwd:B
32 6hiv:Cv 1059 34 0.0956 0.0123 0.3824 0.54 6hiw:Cv, 6hiy:Cv, 7pub:Cv
33 7syc:A 122 57 0.1324 0.1475 0.3158 0.59
34 3bm4:A 197 64 0.1544 0.1066 0.3281 0.89 3ac9:A, 3ac9:B, 3aca:A, 3aca:B, 3bm4:B, 2dsc:A, 2dsc:B, 2dsd:A, 2dsd:B, 6gru:A, 6gru:B, 6gru:C, 6gru:D, 3l85:A, 3l85:B, 5nqr:A, 5nqr:B, 5nwh:A, 5nwh:B, 8ptt:A, 8ptt:B, 8ptt:C, 8ptt:D, 5qj4:A, 5qj4:B, 5qj4:C, 5qj4:D, 5qj5:A, 5qj5:B, 5qj5:C, 5qj5:D, 5qj6:A, 5qj6:B, 5qj6:C, 5qj6:D, 5qj7:A, 5qj7:B, 5qj7:C, 5qj7:D, 5qj8:A, 5qj8:B, 5qj8:C, 5qj9:A, 5qj9:B, 5qj9:C, 5qj9:D, 5qja:A, 5qja:B, 5qja:C, 5qja:D, 5qjb:A, 5qjb:B, 5qjb:C, 5qjb:D, 5qjc:A, 5qjc:B, 5qjc:C, 5qjc:D, 5qjd:A, 5qjd:B, 5qjd:C, 5qjd:D, 5qje:A, 5qje:B, 5qje:C, 5qje:D, 5qjf:A, 5qjf:B, 5qjf:C, 5qjf:D, 5qjg:A, 5qjg:B, 5qjg:C, 5qjg:D, 5qjh:A, 5qjh:B, 5qjh:C, 5qji:A, 5qji:B, 5qji:C, 5qji:D, 5qjj:A, 5qjj:B, 5qjj:C, 5qjj:D, 5qjk:A, 5qjk:B, 5qjk:C, 5qjk:D, 5qjl:A, 5qjl:B, 5qjl:C, 5qjl:D, 5qjm:A, 5qjm:B, 5qjm:C, 5qjm:D, 5qjn:A, 5qjn:B, 5qjn:C, 5qjo:A, 5qjo:B, 5qjo:C, 5qjo:D, 5qjp:A, 5qjp:B, 5qjp:C, 5qjp:D, 5qjq:A, 5qjq:B, 5qjq:C, 5qjq:D, 5qjr:A, 5qjr:B, 5qjr:C, 5qjr:D, 5qjs:A, 5qjs:B, 5qjs:C, 5qjs:D, 5qjt:A, 5qjt:B, 5qjt:C, 5qjt:D, 5qju:A, 5qju:B, 5qju:C, 5qju:D, 5qjv:A, 5qjv:B, 5qjv:C, 5qjv:D, 5qjw:A, 5qjw:B, 5qjw:C, 5qjw:D, 5qjx:A, 5qjx:B, 5qjx:C, 5qjx:D, 5qjy:A, 5qjy:B, 5qjy:C, 5qjy:D, 5qjz:A, 5qjz:B, 5qjz:C, 5qjz:D, 5qk0:A, 5qk0:B, 5qk0:C, 5qk0:D, 5qk1:A, 5qk1:B, 5qk1:C, 5qk1:D, 5qk2:A, 5qk2:B, 5qk2:C, 5qk2:D, 5qk3:A, 5qk3:B, 5qk3:C, 5qk3:D, 5qk4:A, 5qk4:B, 5qk4:C, 5qk4:D, 5qk5:A, 5qk5:B, 5qk5:C, 5qk5:D, 5qk6:A, 5qk6:B, 5qk6:C, 5qk6:D, 5qk7:A, 5qk7:B, 5qk7:C, 5qk7:D, 5qk8:A, 5qk8:B, 5qk8:C, 5qk8:D, 5qk9:A, 5qk9:B, 5qk9:C, 5qk9:D, 5qka:A, 5qka:B, 5qka:C, 5qka:D, 5qkb:A, 5qkb:B, 5qkb:C, 5qkb:D, 5qtl:A, 5qtl:B, 5qtl:C, 5qtl:D, 5qtm:A, 5qtm:B, 5qtm:C, 5qtm:D, 5qtn:A, 5qtn:B, 5qtn:C, 5qtn:D, 5qto:A, 5qto:B, 5qto:C, 5qto:D, 5qtp:A, 5qtp:B, 5qtp:C, 5qtp:D, 5qtq:A, 5qtq:B, 5qtq:C, 5qtq:D, 5qtr:A, 5qtr:B, 5qtr:C, 5qtr:D, 5qts:A, 5qts:B, 5qts:C, 5qts:D, 8rdz:A, 8rdz:C, 8rdz:B, 8rdz:D, 8riy:AAA, 8riy:BBB
35 2yvm:A 182 42 0.1250 0.0934 0.4048 1.2 2yvo:A, 2yvp:A
36 4zbp:C 262 83 0.1544 0.0802 0.2530 1.4
37 1ppx:A 129 86 0.1912 0.2016 0.3023 1.4 3a6t:A, 3a6u:A, 3a6v:A, 3a6v:B, 1pun:A, 1puq:A, 1pus:A, 1tum:A, 7ww5:A, 7ww6:A, 7ww7:A, 7ww8:A, 7ww9:A, 7wwa:A, 7x9h:A, 7x9i:A, 7x9j:A, 7x9k:A, 7x9l:A, 7x9n:A, 7x9o:A
38 4aq4:A 418 21 0.0956 0.0311 0.6190 1.7 6x84:B
39 7dnu:A 247 28 0.0956 0.0526 0.4643 1.8
40 7mix:A 1326 65 0.1691 0.0173 0.3538 2.0 7miy:A
41 3fcm:B 183 40 0.0956 0.0710 0.3250 2.3 3fcm:A
42 7vfs:A 1266 65 0.1691 0.0182 0.3538 2.4 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
43 6qfb:C 1011 58 0.1176 0.0158 0.2759 3.3
44 8g1e:A 1037 58 0.1176 0.0154 0.2759 3.4 8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D
45 1xrk:B 121 32 0.0882 0.0992 0.3750 3.8 1xrk:A, 2zhp:A, 2zhp:B
46 7aor:z 1071 34 0.0956 0.0121 0.3824 3.8
47 4jzt:A 158 101 0.2059 0.1772 0.2772 4.0 4jzu:A, 4jzv:A, 4jzv:B
48 4qqw:A 911 50 0.1176 0.0176 0.3200 4.4 4qqw:C, 4qqw:E, 4qqw:G, 4qqx:A, 4qqx:C, 4qqx:E, 4qqy:A, 4qqy:C, 4qqy:E, 4qqy:G, 4qqz:A, 4qqz:C, 4qqz:E, 4qqz:G
49 7b66:A 161 66 0.1544 0.1304 0.3182 4.5 7aom:A, 7aom:B, 7aop:A, 7b63:A, 7b63:B, 7b64:A, 7b65:A, 7b65:B, 7b66:B, 7b66:C, 7b66:D, 7b67:A, 7b67:B, 7b7v:A, 7b7v:B, 5bon:A, 5bon:B, 5bon:C, 5bon:D, 5bon:E, 5bon:F, 5bon:G, 5bon:H, 5lpg:A, 5lpg:B, 7nr6:A, 7nr6:B, 7r0d:AAA, 7r0d:BBB, 6t5j:A, 6t5j:B
50 5otn:A 156 50 0.1544 0.1346 0.4200 4.8 5hzx:A, 5hzx:B
51 6m1w:A 354 48 0.1176 0.0452 0.3333 5.4 8ful:A, 8ful:C, 8ful:E, 8ful:G, 8fum:A, 8fum:C, 8fum:E, 8fum:G, 8fun:A, 8fun:C, 8fuo:A, 8fuo:C, 6m2i:A
52 2r5w:B 345 38 0.0956 0.0377 0.3421 5.4 2qjt:B, 2qjt:A, 2r5w:A
53 1dil:A 381 24 0.0735 0.0262 0.4167 6.4 7aey:AAA, 1dim:A, 2sim:A, 6tvi:AAA
54 5j71:A 338 30 0.0809 0.0325 0.3667 6.5
55 3crl:B 383 30 0.0809 0.0287 0.3667 7.0 2bu2:A, 2bu5:A, 2bu6:A, 2bu7:A, 2bu8:A, 3crk:A, 3crk:B, 3crl:A, 7ea0:A, 7eas:A, 7ebh:A, 5j6a:A, 1jm6:A, 1jm6:B, 6lil:A, 6lil:B, 6lin:A, 6lin:B, 6lin:C, 6lin:D, 6lio:A, 6lio:B, 5m4k:A, 5m4m:A, 5m4n:A, 5m4p:A, 4mp2:A, 4mp7:A, 4mpc:A, 4mpe:A, 4mpn:A, 6tmp:AAA, 6tmq:AAA, 6tmz:AAA, 6tn0:AAA, 6tn2:AAA, 4v25:A, 4v26:A, 7vbu:A, 7vbv:A, 7vbv:B, 7vbx:A, 8zm1:A, 8zm2:A
56 3nzg:D 380 43 0.1103 0.0395 0.3488 7.3 3nzg:A, 3nzg:B, 3nzg:C
57 1y8p:A 381 53 0.1324 0.0472 0.3396 7.6 2q8i:A, 1y8n:A, 1y8o:A
58 1mqw:A 200 110 0.2353 0.1600 0.2909 8.0 1mk1:A, 1mqe:A, 1mr2:A
59 2pnr:B 341 53 0.1324 0.0528 0.3396 8.2
60 2j0k:A 598 58 0.1103 0.0251 0.2586 9.4 4gu9:A, 4kab:A, 4kao:A, 1mp8:A, 4q9s:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218