Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFK
SAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKVNF
KIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITL

The query sequence (length=226) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6hr1:A 406 224 0.9735 0.5419 0.9821 4.30e-167 6hr1:B
2 4z4k:A 282 223 0.9779 0.7837 0.9910 1.68e-166 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
3 8b6s:A 517 224 0.9912 0.4333 1.0000 1.20e-164 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
4 7ydq:A 598 228 0.9912 0.3746 0.9825 1.83e-164 4as8:A, 2b3q:A, 2b3q:D, 8dhy:A, 8dpd:A, 4eul:A, 6gqg:A, 6ir7:A, 4jfg:A, 4jfg:B, 4jfg:C, 4jfg:D, 4jfg:E, 4jfg:F, 4jfg:G, 4jfg:H, 6jgj:A, 4ka9:A, 4kw9:A, 1kyr:A, 1kys:A, 4l1i:A, 5nhn:B, 5nhn:A, 5ni3:A, 5ni3:D, 5ni3:B, 5ni3:C, 2o24:A, 7pca:A, 6sm0:A, 5t3i:A, 4w7c:D, 4w7e:A
5 7bwn:J 280 228 0.9513 0.7679 0.9430 3.90e-160 7bwn:O, 7bwn:C, 7bwn:M, 4gf6:B, 4w74:A, 4w74:B, 4w74:H, 4w74:C, 4w74:D, 4w74:E, 4w76:A, 4w76:B, 4w77:A, 4w77:B, 4w7a:A, 4w7a:B, 4w7c:B, 4w7d:A, 4w7f:A, 4w7r:A, 4w7r:B, 4w7r:C, 4w7r:D
6 4anj:A 995 223 0.9690 0.2201 0.9821 4.64e-158 1jbz:A
7 6quh:B 228 225 0.8407 0.8333 0.8444 7.39e-153 6quh:E, 6qui:B, 6qui:E, 6quj:B, 6quj:E
8 6gez:B 532 221 0.9248 0.3929 0.9457 3.48e-151 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
9 6gez:B 532 167 0.6991 0.2970 0.9461 1.48e-111 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
10 6gez:B 532 117 0.3053 0.1297 0.5897 2.68e-30 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
11 4pa0:A 974 221 0.9159 0.2125 0.9367 6.75e-145 4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
12 3u8p:A 336 189 0.8363 0.5625 1.0000 3.57e-142 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
13 3u8p:A 336 38 0.1637 0.1101 0.9737 2.52e-17 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
14 8smu:D 394 188 0.8274 0.4746 0.9947 6.79e-140 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
15 8smu:D 394 38 0.1681 0.0964 1.0000 2.48e-17 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
16 4w75:B 187 212 0.7345 0.8877 0.7830 2.03e-112
17 4pa0:B 920 214 0.7655 0.1880 0.8084 3.65e-107 8qyu:B
18 7vcm:A 371 139 0.6106 0.3720 0.9928 7.57e-100 7pvc:A, 7vcm:B
19 7vcm:A 371 83 0.3407 0.2075 0.9277 2.19e-47 7pvc:A, 7vcm:B
20 6xu4:A 389 150 0.6195 0.3599 0.9333 1.11e-98 6xu4:B, 6xu4:E
21 6xu4:A 389 79 0.3230 0.1877 0.9241 1.21e-44 6xu4:B, 6xu4:E
22 3osr:A 603 142 0.6150 0.2305 0.9789 2.89e-98 3osr:B
23 3osr:A 603 84 0.3496 0.1310 0.9405 2.38e-48 3osr:B
24 3osq:A 607 141 0.6150 0.2290 0.9858 4.19e-98
25 3osq:A 607 95 0.3717 0.1384 0.8842 4.50e-50
26 3o78:A 402 139 0.5929 0.3333 0.9640 2.74e-96 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
27 3o78:A 402 84 0.3496 0.1965 0.9405 3.36e-50 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
28 8ovo:A 503 142 0.6018 0.2704 0.9577 2.96e-96 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
29 8ovo:A 503 85 0.3584 0.1610 0.9529 4.31e-51 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
30 7e9y:A 563 141 0.6062 0.2433 0.9716 4.08e-96
31 7e9y:A 563 85 0.3451 0.1385 0.9176 3.32e-48
32 6m63:A 359 139 0.5885 0.3705 0.9568 1.95e-95 6m63:B
33 6m63:A 359 86 0.3363 0.2117 0.8837 6.48e-47 6m63:B
34 6wvb:A 408 139 0.5929 0.3284 0.9640 7.59e-95 6wv8:A
35 6wvb:A 408 85 0.3584 0.1985 0.9529 4.43e-52 6wv8:A
36 6wv7:B 388 139 0.5929 0.3454 0.9640 8.32e-95 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
37 6wv7:B 388 85 0.3584 0.2088 0.9529 4.65e-52 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
38 6wvf:A 386 139 0.5929 0.3472 0.9640 1.62e-94 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
39 6wvf:A 386 85 0.3584 0.2098 0.9529 4.69e-52 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
40 7s7t:A 509 140 0.5929 0.2633 0.9571 7.37e-93 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
41 7s7t:A 509 83 0.3496 0.1552 0.9518 1.51e-48 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
42 8xld:A 213 216 0.2965 0.3146 0.3102 5.66e-29 8ill:B
43 4dxp:A 216 182 0.2522 0.2639 0.3132 1.42e-20
44 4ljb:C 223 139 0.1991 0.2018 0.3237 2.03e-20 4ljb:A, 4ljc:C, 4ljd:A, 4ljd:B, 4ljd:C, 4ljd:D, 3p8u:A, 3p8u:B, 3p8u:D, 3tmr:A, 3tmr:B, 3tmr:C, 3tmr:D, 2vvh:A, 2vvh:B, 2vvh:C, 2vvh:D, 2vvi:A, 2vvi:B, 2vvi:C, 2vvi:D, 2vvj:A, 2vvj:B, 2vvj:C, 2vvj:D
45 4q9x:A 213 125 0.1947 0.2066 0.3520 5.65e-20 4r6d:A
46 2vad:A 217 221 0.2566 0.2673 0.2624 6.31e-20
47 7qgk:A 217 123 0.1814 0.1889 0.3333 5.82e-19
48 8hgi:A 220 138 0.1947 0.2000 0.3188 1.94e-18 8hgi:B, 8tjh:A, 8tjh:B
49 3u0k:A 397 123 0.1814 0.1033 0.3333 3.24e-17
50 2gx2:F 217 190 0.2124 0.2212 0.2526 6.78e-17 2gx2:A, 2gx2:D, 2gx2:H, 2gx2:K, 5hzs:A, 5hzs:B, 5hzs:C, 5hzs:D, 5hzs:E, 5hzs:F, 5hzs:G, 5hzs:H, 5hzs:I, 5hzs:J, 5hzs:K, 5hzs:L, 5hzt:B, 5hzt:C, 5hzt:D, 5hzt:E, 5hzt:F, 5hzt:G, 5hzt:H, 5hzt:I, 5hzt:J, 5hzt:L
51 1xmz:B 231 128 0.1770 0.1732 0.3125 3.36e-16 1xmz:A
52 7x2b:A 217 193 0.2168 0.2258 0.2539 6.73e-16
53 1uis:A 224 125 0.1593 0.1607 0.2880 5.06e-15 1uis:B
54 2arl:A 218 187 0.2212 0.2294 0.2674 1.33e-14
55 5ukg:A 393 133 0.1637 0.0941 0.2782 4.63e-14 5ukg:B
56 6u1a:A 220 148 0.1726 0.1773 0.2635 1.26e-13
57 5exc:gg 165 135 0.1637 0.2242 0.2741 1.29e-10 5exc:ee, 5exc:ff, 5exc:hh
58 5hzt:A 192 122 0.1416 0.1667 0.2623 9.43e-10 5hzt:K
59 5mwc:D 275 122 0.1637 0.1345 0.3033 2.04e-08
60 8c0t:A 281 134 0.1814 0.1459 0.3060 3.99e-08
61 7dna:I 207 56 0.0885 0.0966 0.3571 1.44e-07 7dna:F
62 7dna:I 207 58 0.0885 0.0966 0.3448 0.001 7dna:F
63 6xw2:A 387 122 0.1593 0.0930 0.2951 7.55e-07
64 4i2y:A 381 91 0.1018 0.0604 0.2527 1.06e-06 4i2y:B
65 8osi:A 400 122 0.1593 0.0900 0.2951 1.25e-06
66 4q7r:A 223 215 0.2389 0.2422 0.2512 1.30e-06 8bgl:A, 8bgl:B, 4q7r:B
67 5exc:E 59 50 0.0885 0.3390 0.4000 4.82e-04 5exc:F, 5exc:G, 5exc:H
68 6hvn:A 175 55 0.0841 0.1086 0.3455 0.62 8c4j:A, 8c4j:B, 8c4m:A, 8c4n:A, 8c4n:B, 8c4o:A, 8c4o:B, 8c4p:A, 8c4p:B, 8c4r:A, 6hvl:A, 6hvl:B, 6hvm:B, 4rv7:A, 4rv7:B, 4rv7:C, 4rv7:D, 8s45:B, 8s46:B, 8s47:A, 8s47:B, 8s48:B, 8s49:B, 8s4a:A, 8s4a:B, 8s4b:B
69 6qp4:A 157 85 0.1018 0.1465 0.2706 1.1
70 1oj7:A 390 74 0.0796 0.0462 0.2432 3.0 1oj7:B, 1oj7:C, 1oj7:D, 4qgs:A
71 7n4y:B 2455 56 0.0752 0.0069 0.3036 4.1 7n4y:A
72 8eqm:C 453 55 0.0531 0.0265 0.2182 7.3 8eqm:c, 7sa3:C
73 8ogp:A 153 61 0.0752 0.1111 0.2787 8.8 8ogn:A, 8ogo:A, 8ogq:A, 8ogr:B, 8ogs:A, 8ogs:B, 8ogt:A, 8ogu:A, 8ogv:A, 8ogw:A, 8ogw:B, 8ogy:A, 8ogz:B, 8oh0:A, 8oh0:B, 8oh1:A, 8ohb:A, 8ohb:B, 8ohc:B, 8ohe:A, 8ohf:A, 8ohf:B, 8ohg:A, 8ohh:A, 8ohj:B, 8ohk:A, 8ohl:A, 8oho:A, 8oho:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218