Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KFHCPHCDTVIARKSDLGVHLRKQHSYIEQGKKCRYCDAVFHERYALIQHQKSHKNE

The query sequence (length=57) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7w1m:H 322 57 1.0000 0.1770 1.0000 2.74e-35 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
2 7w1m:H 322 54 0.3333 0.0590 0.3519 0.019 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
3 7w1m:H 322 51 0.2281 0.0404 0.2549 0.35 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
4 7w1m:H 322 53 0.2982 0.0528 0.3208 6.5 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
5 2ct1:A 77 27 0.4737 0.3506 1.0000 1.23e-14
6 2i13:B 144 56 0.3333 0.1319 0.3393 0.004
7 2i13:B 144 56 0.2982 0.1181 0.3036 0.018
8 2i13:B 144 56 0.2632 0.1042 0.2679 0.73
9 2i13:A 151 56 0.3333 0.1258 0.3393 0.005
10 2i13:A 151 53 0.3158 0.1192 0.3396 0.015
11 2i13:A 151 56 0.2632 0.0993 0.2679 0.86
12 2i13:A 151 56 0.2807 0.1060 0.2857 3.9
13 2i13:A 151 47 0.2456 0.0927 0.2979 4.9
14 3w5k:B 110 52 0.3333 0.1727 0.3654 0.007
15 2lv2:A 85 55 0.3509 0.2353 0.3636 0.010
16 1mey:F 84 56 0.2982 0.2024 0.3036 0.022 1mey:C
17 1mey:F 84 54 0.2982 0.2024 0.3148 0.077 1mey:C
18 2yu5:A 44 26 0.2105 0.2727 0.4615 0.029
19 2rsi:A 92 50 0.2982 0.1848 0.3400 0.043 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
20 2rsi:A 92 22 0.1930 0.1196 0.5000 0.52 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
21 8dey:C 57 53 0.3333 0.3333 0.3585 0.046 8dey:F
22 1g2d:C 89 61 0.3509 0.2247 0.3279 0.054 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
23 2dlq:A 124 57 0.3509 0.1613 0.3509 0.074
24 2kmk:A 82 56 0.2982 0.2073 0.3036 0.085
25 2kmk:A 82 56 0.2807 0.1951 0.2857 2.6
26 2emb:A 44 22 0.2105 0.2727 0.5455 0.10
27 1x6h:A 86 51 0.2281 0.1512 0.2549 0.18
28 2emh:A 46 24 0.1930 0.2391 0.4583 0.22
29 8e3e:F 121 53 0.2982 0.1405 0.3208 0.24 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
30 8e3e:F 121 54 0.2807 0.1322 0.2963 3.1 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
31 1x6e:A 72 55 0.2982 0.2361 0.3091 0.26
32 2emy:A 46 25 0.1754 0.2174 0.4000 0.28 2el5:A
33 2em3:A 46 25 0.1754 0.2174 0.4000 0.30
34 2rsj:A 92 37 0.2456 0.1522 0.3784 0.33 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
35 2rsj:A 92 24 0.1754 0.1087 0.4167 2.7 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
36 2cot:A 77 56 0.3158 0.2338 0.3214 0.53
37 5v3g:D 170 55 0.3158 0.1059 0.3273 0.70 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
38 5v3g:D 170 54 0.2982 0.1000 0.3148 1.5 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
39 5v3g:D 170 54 0.2982 0.1000 0.3148 2.3 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
40 5v3g:D 170 55 0.2982 0.1000 0.3091 2.3 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
41 5v3g:D 170 51 0.2807 0.0941 0.3137 5.7 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
42 2ema:A 46 25 0.2105 0.2609 0.4800 0.70
43 5wjq:D 281 54 0.3158 0.0641 0.3333 0.72 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
44 5wjq:D 281 53 0.3158 0.0641 0.3396 2.2 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
45 5wjq:D 281 25 0.1754 0.0356 0.4000 7.1 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
46 8tho:A 100 51 0.2982 0.1700 0.3333 0.91 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
47 2emk:A 46 25 0.1754 0.2174 0.4000 0.98
48 2em0:A 46 29 0.2105 0.2609 0.4138 0.98
49 2ma7:A 73 57 0.3158 0.2466 0.3158 1.0
50 2yso:A 46 29 0.1754 0.2174 0.3448 1.4
51 1p7a:A 37 27 0.1930 0.2973 0.4074 1.4 1u85:A, 1u86:A
52 2eow:A 46 25 0.1754 0.2174 0.4000 1.5
53 6j0d:A 87 20 0.1754 0.1149 0.5000 1.5
54 8gn3:B 60 60 0.3158 0.3000 0.3000 1.8 8gn3:A, 8gn4:A
55 2ytg:A 46 25 0.1754 0.2174 0.4000 1.9
56 2ep3:A 46 29 0.1930 0.2391 0.3793 2.1
57 2ytf:A 46 25 0.1579 0.1957 0.3600 2.1 2eof:A
58 2k7r:A 106 17 0.1754 0.0943 0.5882 2.2
59 7y3m:C 70 25 0.1930 0.1571 0.4400 2.4 8u15:C, 8u15:F, 8u16:C, 8u16:F, 8u17:C, 8u17:F, 7y3m:B, 7y3m:A, 7y3m:F, 7y3m:J, 7y3m:I
60 1gec:E 216 18 0.1404 0.0370 0.4444 2.4
61 8qbn:Y 119 16 0.1228 0.0588 0.4375 2.8
62 5jc8:D 262 27 0.1930 0.0420 0.4074 2.8
63 2emm:A 46 29 0.2105 0.2609 0.4138 2.9
64 2eme:A 46 24 0.1579 0.1957 0.3750 3.7
65 2dmd:A 96 56 0.2982 0.1771 0.3036 3.9
66 2eom:A 46 29 0.1754 0.2174 0.3448 4.0
67 2eou:A 44 26 0.1579 0.2045 0.3462 4.1
68 2yte:A 42 21 0.1579 0.2143 0.4286 4.2
69 7y9p:A 357 23 0.1754 0.0280 0.4348 5.3
70 2eoj:A 44 25 0.1579 0.2045 0.3600 6.5
71 2en6:A 46 24 0.1404 0.1739 0.3333 6.5
72 8e1h:A 332 39 0.2632 0.0452 0.3846 6.6 8e1i:A, 8e1j:A, 8e1j:B, 8e1s:A, 8e1s:B, 8e1t:A, 8e1t:B, 8e1v:A
73 8wfx:M 296 26 0.1754 0.0338 0.3846 6.8
74 7mop:A 2445 15 0.1228 0.0029 0.4667 7.2 6fyh:A, 6pfl:A, 6pfl:B, 8r7o:A, 8r7o:C, 8rd0:C, 8rd0:D, 8rd1:A, 8rd1:C, 8rd1:D, 8rd7:D, 6xz1:A
75 2ee8:A 106 24 0.1404 0.0755 0.3333 8.1
76 2ysp:A 46 25 0.1579 0.1957 0.3600 8.2
77 7lui:A 180 30 0.2281 0.0722 0.4333 8.2
78 3c5k:A 108 32 0.1930 0.1019 0.3438 8.9 5b8d:A, 6ce6:A, 6ce8:A, 6cea:A, 6cec:A, 6ced:A, 6cee:A, 6cef:A, 8g43:A, 8g44:A, 8g45:A, 3gv4:A, 5kh3:A, 5kh7:A, 5kh9:A, 3phd:A, 3phd:B, 3phd:C, 3phd:D, 5wbn:A, 5wpb:A, 7zyu:A
79 4is1:D 54 51 0.2281 0.2407 0.2549 9.0 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
80 2ebt:A 100 50 0.2807 0.1600 0.3200 9.2
81 2en9:A 46 25 0.1579 0.1957 0.3600 9.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218