Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGAARADDARQLFVLAG
SAVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLY
FKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFE
EKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNL

The query sequence (length=313) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1agr:A 350 317 0.9425 0.8429 0.9306 0.0 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
2 3ffb:A 327 317 0.8658 0.8287 0.8549 0.0 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
3 3v00:C 353 317 0.7412 0.6572 0.7319 7.12e-179 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3c7k:C 311 311 0.6997 0.7042 0.7042 2.76e-160 3c7k:A
5 1shz:D 327 325 0.6837 0.6544 0.6585 1.67e-155 1shz:A
6 8pjk:A 222 169 0.5080 0.7162 0.9408 1.39e-119 7e2x:A, 7e2z:A
7 8pjk:A 222 31 0.0703 0.0991 0.7097 2.79e-05 7e2x:A, 7e2z:A
8 7rkf:A 350 318 0.5304 0.4743 0.5220 1.77e-109
9 8iys:A 355 303 0.5208 0.4592 0.5380 3.33e-107 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
10 1zca:A 318 318 0.4377 0.4308 0.4308 2.26e-87 1zca:B
11 8fn0:B 212 167 0.3994 0.5896 0.7485 6.20e-86
12 8fn0:B 212 25 0.0703 0.1038 0.8800 2.83e-05
13 6eg8:I 372 333 0.4633 0.3898 0.4354 1.56e-83 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
14 8htg:B 334 327 0.4537 0.4251 0.4343 1.89e-83 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
15 3ab3:A 322 324 0.4217 0.4099 0.4074 6.67e-81 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
16 2xtz:A 343 338 0.4249 0.3878 0.3935 2.30e-75
17 4fid:A 318 319 0.3930 0.3868 0.3856 1.10e-71 4fid:B
18 2xtz:B 291 323 0.4089 0.4399 0.3963 3.55e-69
19 8uo1:A 334 331 0.4217 0.3952 0.3988 1.60e-65 8gga:A
20 8ggb:A 310 326 0.4089 0.4129 0.3926 2.17e-63 8gg9:A, 8ggc:A
21 2xtz:C 270 323 0.3834 0.4444 0.3715 6.12e-60
22 8uo4:A 292 325 0.3610 0.3870 0.3477 5.09e-48 8uo2:A
23 8xql:A 240 184 0.2620 0.3417 0.4457 1.24e-41
24 8xql:A 240 23 0.0575 0.0750 0.7826 3.92e-04
25 8unx:A 244 183 0.2492 0.3197 0.4262 2.41e-41 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
26 8unx:A 244 21 0.0607 0.0779 0.9048 1.37e-04 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
27 3lvq:E 420 97 0.0958 0.0714 0.3093 3.05e-08 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 6a8d:A 181 110 0.0990 0.1713 0.2818 3.41e-07
29 3lrp:A 181 132 0.1214 0.2099 0.2879 4.37e-07
30 8d4c:C 180 97 0.0958 0.1667 0.3093 4.39e-07 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
31 6bbp:A 520 97 0.0927 0.0558 0.2990 4.42e-07 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
32 1z6x:A 175 97 0.0895 0.1600 0.2887 6.07e-06 1z6x:B
33 2k5u:A 181 99 0.0958 0.1657 0.3030 6.35e-06 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
34 7rll:B 177 95 0.0927 0.1638 0.3053 7.67e-06 7rll:A
35 2h57:B 167 145 0.1182 0.2216 0.2552 1.01e-05 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
36 2h57:B 167 23 0.0383 0.0719 0.5217 7.4 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
37 8e0c:A 185 102 0.0799 0.1351 0.2451 1.63e-04 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
38 1upt:G 170 97 0.0863 0.1588 0.2784 2.50e-04 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
39 3aq4:A 170 97 0.0863 0.1588 0.2784 2.90e-04 3aq4:B
40 3o47:A 289 97 0.0895 0.0969 0.2887 3.61e-04 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
41 5uf8:D 160 97 0.0863 0.1688 0.2784 5.83e-04
42 1yzg:A 168 84 0.0767 0.1429 0.2857 8.95e-04
43 2b6h:A 171 97 0.0799 0.1462 0.2577 0.001
44 4y0v:A 165 97 0.0863 0.1636 0.2784 0.001 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
45 5di3:B 204 103 0.0863 0.1324 0.2621 0.002 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
46 4ile:A 176 95 0.0735 0.1307 0.2421 0.002 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
47 3doe:A 189 86 0.0767 0.1270 0.2791 0.003 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
48 5de3:A 166 78 0.0671 0.1265 0.2692 0.003 5di3:A
49 6pta:A 165 97 0.0799 0.1515 0.2577 0.004 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
50 2x77:A 181 85 0.0703 0.1215 0.2588 0.009 2x77:B
51 4v0l:A 168 95 0.0799 0.1488 0.2632 0.043 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
52 6zga:C 168 102 0.0767 0.1429 0.2353 0.099 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
53 8oun:A 181 191 0.1086 0.1878 0.1780 0.11 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
54 8oul:A 185 99 0.0863 0.1459 0.2727 0.23 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
55 3p27:B 444 192 0.1502 0.1059 0.2448 0.27 3p27:A
56 4bas:A 172 55 0.0543 0.0988 0.3091 0.32
57 4q66:C 134 69 0.0607 0.1418 0.2754 1.1
58 3lww:C 871 109 0.1022 0.0367 0.2936 1.1 1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
59 5z3g:X 202 39 0.0351 0.0545 0.2821 1.3
60 4zi2:A 185 79 0.0575 0.0973 0.2278 1.7 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
61 4zi2:A 185 22 0.0351 0.0595 0.5000 3.2 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
62 8e0a:A 168 85 0.0607 0.1131 0.2235 2.1 8e0b:A
63 4wnr:A 323 21 0.0351 0.0341 0.5238 2.8
64 6vs4:A 223 125 0.0831 0.1166 0.2080 4.8 6vs4:B
65 8e0h:A 179 105 0.0703 0.1229 0.2095 5.3 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
66 8dr5:A 646 38 0.0447 0.0217 0.3684 6.0 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
67 7tfk:A 360 38 0.0447 0.0389 0.3684 6.7 7tfl:A
68 5kdv:A 891 28 0.0479 0.0168 0.5357 7.0 7jtv:B, 7jtv:A, 5kdw:A, 5kdw:B, 5kdx:A, 5kdx:B
69 8hbw:A 290 44 0.0383 0.0414 0.2727 8.2 8g8w:A, 8j1n:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218