BioLiP

>protein
KESYYSIGEVSKLANVSIKALRYYDKIDLFKPAYVDPDTSYRYYTDSQLIHLDLIKSLKYIGTPLEEMKKAQDLEMEELF
AFYTEQERQIREKLDFLSALEQTISLVKKRMKRQMEYPALGEVFVLDEEEIRIIQTEAEGLGPENVLNASYSKLKKFIES
ADGFTNNSYGATFSFQPYTSIDEMTYRHIFTPVLTNKQISSITPDMEITTIPKGRYACIAYNFSPEHYFLNLQKLIKYIA
DRQLTVVSDVYELIIPIHYSPKKQEEYRVEMKIRIL

The query sequence (length=276) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3d6y:A	277	276	0.9928	0.9892	0.9928	0.0	1bow:A, 7ckq:G, 7ckq:I, 3d6z:A, 3d70:A, 3d71:A, 1exi:A, 1exj:A, 3q1m:A, 3q2y:A, 3q3d:A, 3q5p:A, 3q5r:A, 3q5s:A, 1r8e:A
2	2bow:A	130	157	0.4674	0.9923	0.8217	5.36e-83
3	6xl5:G	268	118	0.1630	0.1679	0.3814	1.00e-13	6wl5:A, 6wl5:B, 6wl5:C, 6wl5:D, 6xl5:H, 6xl6:G, 6xl6:H, 6xl9:G, 6xl9:H, 6xla:G, 6xla:H, 6xlj:G, 6xlj:H, 6xlk:G, 6xlk:H
4	5xbt:A	271	160	0.1413	0.1439	0.2437	2.49e-10	5xbi:A, 5xbi:B, 5xbt:B, 5xql:A
5	1r8d:A	109	69	0.0942	0.2385	0.3768	7.95e-08	1r8d:B
6	6jni:A	145	114	0.0978	0.1862	0.2368	1.15e-06	6jgw:B, 6jgw:A, 6jgx:A, 6jgx:B, 6jni:B, 6jni:H, 6jni:C, 6jni:D, 6jni:E, 6jni:F, 6jni:G, 6jyw:A, 6jyw:B
7	2vz4:A	100	69	0.0833	0.2300	0.3333	4.75e-06
8	4wlw:A	130	62	0.0725	0.1538	0.3226	3.19e-04	7c17:G, 7c17:H, 6ldi:G, 6ldi:H, 1q05:A, 1q05:B, 4wls:A, 4wls:B, 6xh7:G, 6xh7:H, 6xh8:G, 6xh8:H
9	5d8c:B	128	125	0.1087	0.2344	0.2400	0.002	5d8c:A, 5e01:A, 5e01:B
10	5crl:B	119	104	0.0906	0.2101	0.2404	0.004
11	5gpe:D	129	104	0.0942	0.2016	0.2500	0.020	5gpe:A, 5gpe:B, 5gpe:C, 5gpe:E, 5gpe:F, 5gpe:G, 5gpe:H
12	2zhg:A	121	88	0.0870	0.1983	0.2727	0.039	2zhh:A
13	7tea:B	78	68	0.0761	0.2692	0.3088	0.12	7tea:E, 7tea:A, 7tea:C
14	4hdr:A	335	77	0.0797	0.0657	0.2857	0.31	4hdk:A, 4hdm:A, 4hdr:C, 4hds:A
15	5erd:B	559	108	0.0978	0.0483	0.2500	0.33	5erd:A, 6sit:D
16	5j5j:A	552	108	0.0978	0.0489	0.2500	0.38
17	4ua1:B	125	113	0.0906	0.2000	0.2212	0.53	4ua1:A
18	5h4r:A	375	102	0.0906	0.0667	0.2451	1.2
19	6kdv:B	283	60	0.0543	0.0530	0.2500	1.8	6kdv:D, 6kdv:C, 6kdv:A
20	4bmo:B	118	104	0.1123	0.2627	0.2981	2.2	4bmp:B, 2x2o:A, 2x2p:A, 2xod:A, 2xoe:A, 7z3d:B, 7z3e:B
21	1qha:A	903	32	0.0507	0.0155	0.4375	3.0	1bg3:A, 1bg3:B, 1cza:N, 1dgk:N, 4f9o:A, 4f9o:B, 4foe:A, 4foe:B, 4foi:A, 4foi:B, 4fpa:A, 4fpa:B, 4fpb:A, 4fpb:B, 1hkb:A, 1hkb:B, 1hkc:A, 1qha:B
22	7rzw:B	864	85	0.0833	0.0266	0.2706	3.0	7rzw:A
23	6chd:A	506	72	0.0688	0.0375	0.2639	3.1	3bju:A, 3bju:B, 3bju:C, 3bju:D, 6chd:B, 4dpg:A, 4dpg:B, 4dpg:C, 4dpg:D, 4dpg:E, 4dpg:F, 4dpg:G, 4dpg:H, 7ea9:A, 7ea9:B, 7ea9:C, 7ea9:D, 6ild:A, 6ild:B, 6ilh:A, 6ilh:B, 4ycu:A, 4ycu:B, 4ycw:A, 4ycw:B, 4ycw:E, 4ycw:F
24	3gp4:A	132	63	0.0543	0.1136	0.2381	3.8	3gp4:B
25	8bsi:a	815	48	0.0507	0.0172	0.2917	4.5
26	4lpl:A	142	51	0.0616	0.1197	0.3333	4.5
27	1usi:A	345	79	0.0725	0.0580	0.2532	6.5	1usi:C, 1usk:A, 1usk:D, 1usk:B, 1usk:C
28	1gsq:A	202	75	0.0616	0.0842	0.2267	6.6	2gsq:A
29	3ffc:E	247	77	0.0797	0.0891	0.2857	9.8	3ffc:J, 7n1e:E, 6py2:E, 4qrp:E, 4qrp:I, 6r2l:E, 5wkf:E, 5wkf:J, 5wkh:E, 5wkh:J

[Back]