Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KDLKGTKTAENLKQGFIGESMANRRYLYFAKRADEEGYPEIAGLLRSIAEGETAHAFGHLDFIRQGGLTDPATDKPIGTL
EQMIESAIAGETYEWTQMYPGFAKVAREEGFPEVAEWFETLARAEKSHAEKFQNVLKQL

The query sequence (length=139) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7o91:A 146 139 1.0000 0.9521 1.0000 7.25e-101 1j30:A, 1j30:B, 7o8a:A, 7o8a:B, 7o8a:C, 7o8d:A, 7o8d:B, 7o90:A, 7o90:B, 7o91:B, 7o91:C, 7o93:A, 7o93:B, 7o99:A, 7o99:B, 7o9d:A, 7o9d:B, 7ppt:A, 7ppt:B, 7ppu:A, 7ppu:B, 7ppv:A, 7ppv:B
2 4di0:B 140 137 0.6115 0.6071 0.6204 3.86e-56 4di0:A, 8fvv:A, 8fvv:B, 8fvv:C, 8fvv:D, 8fvv:E, 8fvv:F, 8fxd:A, 8fxd:B, 8fxd:M, 8fxd:S, 8fxd:Y, 8fxd:5
3 1b71:A 191 143 0.3885 0.2827 0.3776 1.88e-24 1dvb:A, 1jyb:A, 1lkm:A, 1lko:A, 1lkp:A, 1qyb:A, 1ryt:A, 1s2z:A, 1s30:A
4 2hr5:A 170 132 0.3741 0.3059 0.3939 4.81e-20 2hr5:B, 3mps:A, 3mps:B, 3mps:D, 3mps:I, 3mps:F, 3mps:K, 3mps:G, 3mps:H, 1nnq:A, 1nnq:B, 3pwf:A, 3pwf:B, 3pza:A, 3pza:B, 3qvd:A, 3qvd:B, 3qvd:C, 3qvd:D, 3qvd:E, 3qvd:F, 3qvd:G, 3qvd:H
5 1yux:B 202 128 0.3165 0.2178 0.3438 5.58e-14 1yux:A, 1yuz:A, 1yuz:B, 1yv1:A, 1yv1:B
6 3qhb:A 179 132 0.2950 0.2291 0.3106 1.42e-09 3qhb:B, 3qhc:A, 3qhc:B, 3sid:A, 3sid:B
7 3qhb:A 179 83 0.1942 0.1508 0.3253 6.92e-07 3qhb:B, 3qhc:A, 3qhc:B, 3sid:A, 3sid:B
8 3qhb:A 179 35 0.1007 0.0782 0.4000 2.4 3qhb:B, 3qhc:A, 3qhc:B, 3sid:A, 3sid:B
9 1nf6:F 171 133 0.2518 0.2047 0.2632 0.002 1nf4:A, 1nf4:B, 1nf4:C, 1nf4:D, 1nf4:E, 1nf4:F, 1nf4:G, 1nf4:H, 1nf4:I, 1nf4:J, 1nf4:K, 1nf4:L, 1nf4:M, 1nf4:N, 1nf4:O, 1nf4:P, 1nf6:A, 1nf6:B, 1nf6:C, 1nf6:D, 1nf6:E, 1nf6:G, 1nf6:H, 1nf6:I, 1nf6:J, 1nf6:K, 1nf6:L, 1nf6:M, 1nf6:N, 1nf6:O, 1nf6:P, 1nfv:A, 1nfv:B, 1nfv:C, 1nfv:D, 1nfv:E, 1nfv:F, 1nfv:G, 1nfv:H, 1nfv:I, 1nfv:J, 1nfv:K, 1nfv:L, 1nfv:M, 1nfv:N, 1nfv:O, 1nfv:P
10 8eep:A 221 96 0.1439 0.0905 0.2083 0.58 6axv:A, 6ay9:A, 6aya:A, 4b4n:A, 8cky:A, 8cl0:A, 8cl0:F, 8cl0:B, 8cl0:C, 8cl0:D, 8cl0:E, 8cl1:A, 8cl3:A, 3ds0:A, 3ds1:A, 3ds3:A, 3ds3:B, 3ds4:A, 4e91:A, 4e91:B, 4e92:A, 4e92:B, 8ejl:L, 8ejl:M, 8f22:A, 8f22:F, 8f22:B, 8f22:C, 8f22:D, 8f22:E, 8fiu:A, 8fiu:B, 8fiu:C, 8gdv:A, 8gdv:F, 8gdv:C, 8gdv:D, 8gdv:E, 5hgl:A, 5hgl:B, 5hgl:C, 5hgl:D, 5hgl:E, 5hgl:F, 4inb:A, 4j93:A, 2jpr:A, 7m9f:A, 7mkc:A, 3nte:A, 3nte:B, 4nx4:C, 6pu1:A, 4qnb:A, 8qub:A, 8quh:A, 8qui:A, 8quj:A, 8quk:A, 8qul:A, 8quw:A, 8qux:A, 8quy:A, 8qv1:A, 8qv4:A, 8qv9:A, 8qva:A, 7rhn:C, 7rj2:C, 7rj4:A, 7rj4:B, 7rj4:C, 7rmj:A, 7rmj:B, 7rmj:C, 7snl:A, 7snn:A, 7snq:A, 7snq:F, 7snq:B, 7snq:C, 7snq:D, 7snq:E, 7snq:G, 7snq:L, 7snq:H, 7snq:I, 7snq:J, 7snq:K, 8tov:G, 8tov:J, 8tov:I, 8tov:K, 8tov:L, 8tov:H, 8tov:A, 8tov:C, 8tov:B, 8tov:D, 8tov:E, 8tov:F, 8tqp:A, 8tqp:D, 8tqp:B, 8tqp:C, 8tqp:E, 8tqp:F, 8tqp:G, 8tqp:J, 8tqp:I, 8tqp:K, 8tqp:L, 8tqp:H, 5tsv:A, 5tsv:B, 5tsx:A, 5tsx:D, 5tsx:B, 5tsx:C, 5tsx:J, 5tsx:L, 5tsx:I, 5tsx:K, 5tsx:E, 5tsx:H, 5tsx:F, 5tsx:G, 4u0a:A, 4u0b:A, 4u0b:B, 4u0b:D, 4u0b:F, 4u0b:L, 4u0b:H, 4u0b:I, 4u0c:A, 4u0d:A, 4u0d:F, 4u0d:G, 4u0d:H, 4u0d:B, 4u0d:C, 4u0d:J, 4u0e:A, 4u0f:A, 7urn:A, 6v2f:A, 6v2f:B, 6v2f:C, 6v2f:D, 6v2f:E, 6v2f:F, 6vkv:A, 6vkv:B, 6vkv:C, 4wym:A, 4wym:F, 4wym:B, 4wym:C, 4wym:D, 4wym:E, 4wym:G, 4wym:H, 4wym:I, 4wym:J, 4wym:K, 4wym:L, 2xde:A, 2xde:B, 4xfz:A, 4xrq:A, 2xxm:A, 7zud:A
11 4am2:A 159 134 0.2590 0.2264 0.2687 0.60 4am2:B, 4am4:A, 4am4:B, 4am5:A, 4am5:B
12 4gc3:A 263 51 0.1151 0.0608 0.3137 0.82 4gk8:A, 4gyf:A
13 5veu:L 448 60 0.1295 0.0402 0.3000 0.98 7lad:A, 8sg5:H, 7sv2:D, 5veu:E
14 5veu:C 469 60 0.1295 0.0384 0.3000 1.1 6mjm:A, 8sg5:A, 8sg5:B, 8sg5:C, 8sg5:D, 8sg5:E, 8sg5:F, 8sg5:G, 7sv2:A, 7sv2:B, 7sv2:C, 5veu:A, 5veu:B, 5veu:D, 5veu:F, 5veu:G, 5veu:H, 5veu:I, 5veu:J, 5veu:K
15 6zjk:A 317 63 0.1151 0.0505 0.2540 1.1 6zjk:C, 6zjk:D, 6zjk:B
16 3shx:A 175 41 0.1007 0.0800 0.3415 1.2 6i36:A, 6i9p:A, 6i9t:A, 6iaf:A, 6iaj:A, 5j8s:A, 5j8w:A, 5j93:A, 5j9v:A, 5jac:A, 3ka3:A, 3ka4:A, 3ka6:A, 3ka8:A, 3ka9:A, 4lpj:A, 4lpm:A, 4lpn:A, 4lqh:A, 4lqj:A, 4lqv:A, 4lyu:A, 4lyx:A, 1mfr:A, 1mfr:B, 1mfr:C, 1mfr:D, 1mfr:E, 1mfr:F, 1mfr:G, 1mfr:H, 1mfr:I, 1mfr:J, 1mfr:K, 1mfr:L, 1mfr:M, 1mfr:N, 1mfr:O, 1mfr:P, 1mfr:Q, 1mfr:R, 1mfr:S, 1mfr:T, 1mfr:U, 1mfr:V, 1mfr:W, 1mfr:X, 4mjy:A, 4mku:A, 4ml5:A, 4mn9:A, 4my7:A, 3rbc:A, 3rbc:B, 3rbc:C, 3rbc:D, 3rbc:E, 3rbc:F, 3rbc:G, 3rbc:H, 3rbc:I, 3rbc:J, 3rbc:K, 3rbc:L, 3rbc:M, 3rbc:N, 3rbc:O, 3rbc:P, 3rbc:Q, 3rbc:R, 3rbc:S, 3rbc:T, 3rbc:U, 3rbc:V, 3rbc:W, 3rbc:X, 3re7:A, 3re7:B, 3re7:C, 3re7:D, 3re7:E, 3re7:F, 3re7:G, 3re7:H, 3re7:I, 3re7:J, 3re7:K, 3re7:L, 3re7:V, 3re7:M, 3re7:N, 3re7:O, 3re7:P, 3re7:Q, 3re7:R, 3re7:S, 3re7:T, 3re7:U, 3re7:W, 3re7:X, 3rgd:A, 3rgd:B, 3rgd:C, 3rgd:D, 3rgd:E, 3rgd:F, 3rgd:G, 3rgd:H, 3rgd:I, 3rgd:J, 3rgd:K, 3rgd:L, 3rgd:M, 3rgd:N, 3rgd:O, 3rgd:P, 3rgd:Q, 3rgd:R, 3rgd:S, 3rgd:T, 3rgd:U, 3rgd:V, 3rgd:W, 3rgd:X, 3se1:A, 3sh6:A, 5xhi:A, 5xhm:A, 5xhn:A, 5xho:A
17 2rcc:C 311 70 0.1367 0.0611 0.2714 1.4 2rcc:B
18 3r5y:D 142 38 0.1079 0.1056 0.3947 2.1 3r5y:A, 3r5y:B, 3r5y:C
19 6ubn:B 791 36 0.1079 0.0190 0.4167 3.3 6byw:B, 6byw:A, 6byw:C, 6byw:D, 6eer:A, 6eer:B, 6eer:C, 6eer:D, 6ubn:A, 6ubn:C, 6ubn:D, 6ubr:B, 6ubr:A, 6ubr:C, 6ubr:D, 6ubz:B, 6ubz:A, 6ubz:C, 6ubz:D, 6uc1:B, 6uc1:A, 6uc1:D, 6uc1:C, 6ufq:A, 6ufq:B, 6ufq:C, 6ufq:D, 6vl7:A, 6vl7:B, 6vl7:C, 6vl7:D, 6vmf:A, 6vmf:B, 6vmf:C, 6vmf:D, 6vmv:A, 6vmv:B, 6vmv:C, 6vmv:D, 6vmw:B, 6vmw:A, 6vmw:C, 6vmw:D
20 8cip:A 665 55 0.1223 0.0256 0.3091 3.7 8cip:B, 8cip:C, 8cip:D
21 2lba:A 127 42 0.0935 0.1024 0.3095 4.2
22 7s5k:I 68 34 0.0935 0.1912 0.3824 4.3 7s5c:A, 7s5c:B, 7s5c:E, 7s5c:F, 7s5c:G, 7s5c:H, 7s5c:I, 7s5c:J, 7s5c:C, 7s5c:D, 7s5k:A, 7s5k:B, 7s5k:F, 7s5k:E, 7s5k:G, 7s5k:H, 7s5k:J, 7s5k:C, 7s5k:D
23 7dya:H 164 100 0.1799 0.1524 0.2500 7.0 7dl5:H, 7dl5:A, 7dy8:H, 7dy8:A, 7dya:A, 7dya:B, 7dya:C, 7dya:D, 7dya:E, 7dya:F, 7dya:G, 7dyb:H, 7dyb:A, 7dyb:B, 6ls0:H, 6ls0:A, 6ls0:B, 6ls0:C, 6ls3:B, 6ls3:E, 6ls3:A, 6ls3:C, 6ls3:D, 6ls3:F, 6ls3:G, 6ls3:H, 6txi:A, 6txi:B, 6txi:C, 6txi:D, 6txi:E, 6txi:F, 6txi:G, 6txi:H, 6txj:A, 6txj:B, 6txj:C, 6txj:D, 6txj:E, 6txj:F, 6txj:G, 6txj:H, 6txk:A, 6txk:B, 6txk:C, 6txk:D, 6txk:E, 6txk:F, 6txk:G, 6txk:H, 6txl:A, 6txl:B, 6txl:C, 6txl:D, 6txl:E, 6txl:F, 6txl:G, 6txl:H, 6txn:A, 6txn:B, 6txn:C, 6txn:D, 6txn:E, 6txn:F, 6txn:G, 6txn:H, 7v4v:H, 7v4v:A, 7v4v:B, 7v4v:C, 1vlg:A, 1vlg:B, 1vlg:C, 1vlg:D, 1vlg:E, 1vlg:F, 1vlg:G, 1vlg:H, 7vvs:H, 7vvs:A, 7vvs:B, 7vvs:C, 7vvs:D, 7vvs:E, 7vvs:F, 7vvs:G, 7x9x:A, 7x9x:B, 7x9z:A, 7x9z:B, 7xa1:A, 7xa2:A, 7xa4:A
24 8i9x:CC 658 55 0.1079 0.0228 0.2727 7.3 8i9r:CC, 8i9t:CC, 8i9v:CC, 8i9w:CC, 8i9y:CC, 8i9z:CC, 8ia0:CC, 8pv2:CC
25 5t5i:A 569 29 0.0791 0.0193 0.3793 7.3 5t5i:I, 5t5m:A, 5t61:A, 5t61:G, 5t61:M, 5t61:S, 5t61:Y, 5t61:e, 5t61:k, 5t61:q
26 2e21:A 317 30 0.0863 0.0379 0.4000 8.1 2e21:C, 2e89:A, 2e89:B, 2e89:C, 2e89:D
27 1eio:A 127 41 0.0935 0.1024 0.3171 8.2
28 8p5d:LS0 170 24 0.0791 0.0647 0.4583 9.5 8p60:LS0, 8p60:KS0, 7qca:LS0

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218