Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KAYACGLCNRAFTRRDLLIRHAQKIHSGNL

The query sequence (length=30) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2adr:A 60 30 0.9333 0.4667 0.9333 1.53e-15 1paa:A
2 2emh:A 46 29 0.5000 0.3261 0.5172 8.83e-05
3 2em3:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 6.79e-04
4 1x6e:A 72 29 0.4000 0.1667 0.4138 8.75e-04
5 1x6e:A 72 27 0.4000 0.1667 0.4444 0.27
6 2ytj:A 46 27 0.5000 0.3261 0.5556 0.001
7 2eoj:A 44 27 0.4333 0.2955 0.4815 0.001
8 2ep3:A 46 29 0.5000 0.3261 0.5172 0.001
9 2eml:A 46 29 0.4667 0.3043 0.4828 0.001
10 2emf:A 46 29 0.4667 0.3043 0.4828 0.002
11 2yrj:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.002
12 2eok:A 42 28 0.4667 0.3333 0.5000 0.003
13 2emk:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.004
14 2eq2:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.004 2ytr:A
15 2emv:A 44 29 0.4667 0.3182 0.4828 0.004
16 2i13:B 144 29 0.4333 0.0903 0.4483 0.005
17 2i13:B 144 29 0.3667 0.0764 0.3793 0.14
18 2i13:B 144 27 0.3667 0.0764 0.4074 0.51
19 2i13:B 144 29 0.3667 0.0764 0.3793 1.2
20 2i13:B 144 29 0.3667 0.0764 0.3793 3.6
21 2enh:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.006
22 2drp:D 65 26 0.3667 0.1692 0.4231 0.007 2drp:A
23 2drp:D 65 29 0.3000 0.1385 0.3103 7.1 2drp:A
24 2eme:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.007
25 7mc3:A 31 28 0.4000 0.3871 0.4286 0.008
26 2ebt:A 100 24 0.3667 0.1100 0.4583 0.008
27 2ebt:A 100 30 0.4333 0.1300 0.4333 8.2
28 2emw:A 44 29 0.4000 0.2727 0.4138 0.009
29 2eqw:A 42 29 0.4000 0.2857 0.4138 0.010
30 2ema:A 46 28 0.4333 0.2826 0.4643 0.011
31 2epx:A 47 29 0.4000 0.2553 0.4138 0.012
32 2eq3:A 46 28 0.4333 0.2826 0.4643 0.012
33 2em1:A 44 28 0.4000 0.2727 0.4286 0.013
34 2ytq:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.021 2eog:A
35 2enf:A 46 28 0.4000 0.2609 0.4286 0.022 2yti:A, 2ytn:A, 2yu8:A
36 2epv:A 44 28 0.4000 0.2727 0.4286 0.023
37 1x6h:A 86 22 0.3333 0.1163 0.4545 0.025
38 1x6h:A 86 30 0.3667 0.1279 0.3667 0.026
39 7w1m:H 322 30 0.3667 0.0342 0.3667 0.028 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
40 7w1m:H 322 21 0.3333 0.0311 0.4762 0.076 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
41 7w1m:H 322 30 0.3000 0.0280 0.3000 9.0 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
42 1mey:F 84 26 0.4000 0.1429 0.4615 0.028 1mey:C
43 1mey:F 84 29 0.3333 0.1190 0.3448 0.34 1mey:C
44 1mey:F 84 29 0.3333 0.1190 0.3448 0.38 1mey:C
45 1f2i:G 66 30 0.4667 0.2121 0.4667 0.029 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
46 1f2i:G 66 21 0.3000 0.1364 0.4286 2.5 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
47 2eps:A 54 27 0.3333 0.1852 0.3704 0.030
48 2en6:A 46 29 0.3333 0.2174 0.3448 0.034
49 2eoe:A 46 28 0.4000 0.2609 0.4286 0.034 2ytk:A
50 2ytg:A 46 29 0.3333 0.2174 0.3448 0.036
51 2emy:A 46 28 0.4000 0.2609 0.4286 0.036 2el5:A
52 5wjq:D 281 29 0.4333 0.0463 0.4483 0.042 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
53 5wjq:D 281 29 0.4333 0.0463 0.4483 0.044 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
54 5wjq:D 281 29 0.4667 0.0498 0.4828 0.048 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
55 5wjq:D 281 28 0.4000 0.0427 0.4286 0.67 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
56 5wjq:D 281 27 0.4000 0.0427 0.4444 0.83 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
57 5wjq:D 281 29 0.3333 0.0356 0.3448 3.9 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
58 2eq4:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.045
59 1p47:A 87 31 0.4667 0.1609 0.4516 0.046 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
60 1p47:A 87 26 0.4333 0.1494 0.5000 0.13 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
61 1p47:A 87 29 0.3667 0.1264 0.3793 1.2 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
62 2yt9:A 95 28 0.4000 0.1263 0.4286 0.050
63 2yt9:A 95 30 0.3333 0.1053 0.3333 9.6
64 2yte:A 42 27 0.3333 0.2381 0.3704 0.054
65 2en0:A 42 29 0.4000 0.2857 0.4138 0.058
66 2i13:A 151 29 0.4000 0.0795 0.4138 0.065
67 2i13:A 151 29 0.3667 0.0728 0.3793 0.15
68 2i13:A 151 26 0.4000 0.0795 0.4615 0.17
69 2i13:A 151 29 0.3667 0.0728 0.3793 1.3
70 2i13:A 151 29 0.3667 0.0728 0.3793 4.0
71 2emg:A 46 27 0.4000 0.2609 0.4444 0.067
72 2yto:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.075
73 2yu5:A 44 20 0.2667 0.1818 0.4000 0.078
74 2ene:A 46 28 0.4000 0.2609 0.4286 0.079
75 2eox:A 44 25 0.4667 0.3182 0.5600 0.081
76 2ytb:A 42 29 0.3667 0.2619 0.3793 0.084
77 2cot:A 77 29 0.4000 0.1558 0.4138 0.098
78 2ytf:A 46 28 0.3667 0.2391 0.3929 0.12 2eof:A
79 2em9:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.12
80 2ep1:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.13 2ep2:A
81 2eon:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.14
82 2emx:A 44 23 0.2667 0.1818 0.3478 0.15
83 2yta:A 41 29 0.3333 0.2439 0.3448 0.15
84 6h0f:C 32 28 0.3667 0.3438 0.3929 0.17 6h0f:F, 6h0f:I, 6h0f:L
85 2em5:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.17
86 2emp:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.18
87 8gn3:B 60 22 0.2667 0.1333 0.3636 0.18 8gn3:A, 8gn4:A
88 2eq0:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.19
89 2eor:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.20
90 6e93:A 112 29 0.4000 0.1071 0.4138 0.20 6e94:A
91 6e93:A 112 28 0.3667 0.0982 0.3929 8.5 6e94:A
92 2eol:A 42 29 0.4000 0.2857 0.4138 0.21
93 2yts:A 46 28 0.3667 0.2391 0.3929 0.21
94 2em6:A 46 29 0.3333 0.2174 0.3448 0.22
95 2ysv:A 42 29 0.3667 0.2619 0.3793 0.22
96 8e3e:F 121 29 0.4333 0.1074 0.4483 0.23 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
97 8e3e:F 121 24 0.3333 0.0826 0.4167 2.1 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
98 2en9:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.26
99 2epy:A 42 28 0.4000 0.2857 0.4286 0.30
100 2eow:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.31
101 2emi:A 46 27 0.3667 0.2391 0.4074 0.31 2ytp:A
102 2en4:A 46 29 0.4333 0.2826 0.4483 0.33
103 2epc:A 42 20 0.3000 0.2143 0.4500 0.37
104 2en7:A 44 29 0.3667 0.2500 0.3793 0.37
105 2ytd:A 46 28 0.4000 0.2609 0.4286 0.39
106 2ep0:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.41
107 1llm:C 87 21 0.3333 0.1149 0.4762 0.44 1llm:D
108 1llm:C 87 29 0.3667 0.1264 0.3793 0.92 1llm:D
109 2ma7:A 73 28 0.3667 0.1507 0.3929 0.45
110 2kmk:A 82 28 0.3667 0.1341 0.3929 0.48
111 2m9a:A 89 24 0.2333 0.0787 0.2917 0.52
112 2eov:A 46 29 0.4000 0.2609 0.4138 0.52
113 3w5k:B 110 28 0.4000 0.1091 0.4286 0.55
114 3w5k:B 110 26 0.3667 0.1000 0.4231 3.5
115 2ely:A 46 29 0.3667 0.2391 0.3793 0.56
116 2ee8:A 106 27 0.4000 0.1132 0.4444 0.59
117 1p7a:A 37 24 0.3000 0.2432 0.3750 0.60 1u85:A, 1u86:A
118 8dey:C 57 29 0.3667 0.1930 0.3793 0.67 8dey:F
119 7txc:E 84 28 0.4000 0.1429 0.4286 0.69
120 7txc:E 84 21 0.2333 0.0833 0.3333 0.72
121 7ysf:A 113 30 0.3333 0.0885 0.3333 0.74
122 7ysf:A 113 28 0.3667 0.0973 0.3929 5.7
123 2csh:A 110 28 0.3667 0.1000 0.3929 0.75
124 2csh:A 110 21 0.3000 0.0818 0.4286 8.0
125 8ffz:A 314 30 0.4000 0.0382 0.4000 0.75
126 2en1:A 46 29 0.3333 0.2174 0.3448 0.82 2yth:A
127 2epu:A 45 29 0.3333 0.2222 0.3448 0.84
128 2lvr:A 30 29 0.4000 0.4000 0.4138 0.90
129 2epq:A 45 30 0.3333 0.2222 0.3333 0.97
130 5v3g:D 170 28 0.4000 0.0706 0.4286 0.99 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
131 5v3g:D 170 28 0.4000 0.0706 0.4286 1.1 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
132 2eq1:A 46 28 0.4000 0.2609 0.4286 1.0
133 4r7e:A 69 17 0.3000 0.1304 0.5294 1.3 8ieg:A, 8ieg:B, 8t3t:K, 8t3t:L, 8t3w:K, 8t3w:L, 8t3y:K, 8t3y:L
134 7w7g:A 1528 13 0.3333 0.0065 0.7692 1.4
135 8r6y:A 1991 21 0.3000 0.0045 0.4286 1.5 8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
136 7alp:U 1935 21 0.3000 0.0047 0.4286 1.5
137 8asd:A 1826 21 0.3000 0.0049 0.4286 1.5
138 8asb:A 1715 21 0.3000 0.0052 0.4286 1.5 8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
139 4r7x:A 150 17 0.3000 0.0600 0.5294 1.6 4r7x:B
140 7y3l:A 57 28 0.3667 0.1930 0.3929 1.8
141 5ke9:A 88 24 0.3000 0.1023 0.3750 1.9 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
142 5ke9:A 88 31 0.4333 0.1477 0.4194 9.4 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
143 2m0d:A 30 23 0.2667 0.2667 0.3478 2.0
144 2ept:A 41 29 0.3000 0.2195 0.3103 2.0
145 2ena:A 46 29 0.3333 0.2174 0.3448 2.1
146 2emb:A 44 27 0.4000 0.2727 0.4444 2.1
147 2eoq:A 46 22 0.2667 0.1739 0.3636 2.4
148 2elz:A 46 28 0.3667 0.2391 0.3929 2.4
149 2dlq:A 124 26 0.3333 0.0806 0.3846 2.6
150 6pv0:A 31 22 0.3333 0.3226 0.4545 2.7 6pv1:A, 6pv2:A, 6pv3:A, 1sp2:A, 6uco:A, 6ucp:A, 1va2:A
151 2ghf:A 102 27 0.3667 0.1078 0.4074 2.9
152 8a4i:L 56 21 0.3000 0.1607 0.4286 2.9 8a4i:I, 8a4i:K, 8a4i:J, 8cuc:F, 8cuc:G, 7y3i:B, 7y3i:A, 7y3k:A, 7y3k:B
153 2eoo:A 46 24 0.2667 0.1739 0.3333 3.0
154 2lce:A 64 28 0.4000 0.1875 0.4286 3.2
155 1zfd:A 32 25 0.3333 0.3125 0.4000 3.9
156 6o7g:B 60 28 0.3333 0.1667 0.3571 4.2 8u2y:B
157 8fjl:D 1138 25 0.2667 0.0070 0.3200 4.4 8fjk:E, 8fjk:G, 8fjk:I, 8fjk:K, 8fjl:E, 8fjl:G, 8fjl:I, 8fjl:K, 6m99:C
158 6ml4:A 143 29 0.3333 0.0699 0.3448 4.5 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
159 1ubd:C 114 29 0.3333 0.0877 0.3448 5.4
160 1q3i:A 192 11 0.2667 0.0417 0.7273 5.4
161 2ct1:A 77 30 0.3000 0.1169 0.3000 6.0
162 2eoz:A 46 21 0.2667 0.1739 0.3810 6.2
163 2eou:A 44 25 0.3333 0.2273 0.4000 6.4
164 2nab:A 41 21 0.3000 0.2195 0.4286 7.1
165 1x3c:A 73 23 0.3333 0.1370 0.4348 7.2
166 2epp:A 66 18 0.2667 0.1212 0.4444 7.4
167 3mjh:B 34 30 0.2667 0.2353 0.2667 8.1 3mjh:D
168 2epa:A 72 23 0.3333 0.1389 0.4348 8.3
169 4ijd:A 215 25 0.2667 0.0372 0.3200 8.5 4ijd:B, 6nm4:A, 6nm4:B
170 3iuf:A 32 26 0.3000 0.2812 0.3462 8.6
171 8p5d:LR0 164 18 0.3000 0.0549 0.5000 10.0 8p60:LR0, 8p60:KR0, 7qca:LR0

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218