BioLiP

>protein
IWKKKYIKLIVVGDSGLGKTTLIKSLISIPGERLQVHDGSYTPTEQFRRDPESLSSTVSWRDEEDRVIWVYKIQDTPGYG
DELDVFRNLKMVQDYIESQNRKWLELEQARIEDPRVDLCIFCIPPHRLRPIDLKYMFELGKHVPVVPVVTKADTMTIREA
NTYRTEVANRIANPMVPGIHDKINIFKFERDTLERAGVQDHATPHPPFLVIASNDISEELAAAEPPLFWPERRYPWGTAE
AFNKEHSDLLAVRALLMKEALEEISKTKRARYEAWRRT

The query sequence (length=278) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5irr:B	281	278	1.0000	0.9893	1.0000	0.0	5irr:A
2	7m6j:D	273	276	0.3022	0.3077	0.3043	2.47e-31	7m6j:C, 6n0b:C, 6n0b:A, 6n0b:B, 6n0b:D, 6n12:A, 6n12:B, 3t5d:A, 3t5d:C, 6uqq:A, 6uqq:B
3	9bht:E	288	282	0.2734	0.2639	0.2695	5.02e-31	9bht:B
4	6upq:A	270	288	0.3273	0.3370	0.3160	5.25e-31	3ftq:A, 7m6j:F, 6upr:A
5	3ftq:B	252	275	0.3129	0.3452	0.3164	4.24e-30	3ftq:C, 3ftq:D, 2qnr:B, 6upa:A
6	4kva:B	258	278	0.2878	0.3101	0.2878	2.17e-29	4kv9:A, 4kv9:B, 4kva:A
7	8pfh:B	287	298	0.2914	0.2822	0.2718	4.57e-29	8fwp:B, 8sgd:B, 8sgd:D
8	8dkt:B	262	283	0.2950	0.3130	0.2898	7.89e-29
9	7m6j:A	234	279	0.3058	0.3632	0.3047	1.59e-28
10	7m6j:E	296	282	0.2662	0.2500	0.2624	3.68e-28	7m6j:B, 6upa:B
11	6upr:B	270	284	0.2554	0.2630	0.2500	1.05e-27
12	9bht:C	282	275	0.2806	0.2766	0.2836	1.23e-27	9bht:D, 9bhw:A, 9bhw:D
13	6uqq:C	280	276	0.2878	0.2857	0.2899	1.68e-27	3sop:A, 3sop:B, 6uqq:D, 4z51:A, 4z54:A, 4z54:B
14	8dkt:A	264	281	0.2950	0.3106	0.2918	1.14e-26
15	5cyo:A	272	277	0.3022	0.3088	0.3032	7.55e-26	5cyo:B, 4yqf:B, 4yqf:A
16	6upq:B	247	292	0.2626	0.2955	0.2500	8.16e-26
17	6mq9:B	267	277	0.2734	0.2846	0.2744	1.33e-24	6mq9:A, 6mq9:D, 6mq9:C, 6mqb:A, 6mqk:A, 6mqk:D, 6mqk:B, 6mqk:C, 6mql:A
18	9bhw:B	299	284	0.2662	0.2475	0.2606	8.44e-24	9bhw:C
19	5cyp:A	248	276	0.2842	0.3185	0.2862	1.34e-23	5cyp:B, 5cyp:C
20	8pfh:C	289	279	0.2950	0.2837	0.2939	4.84e-21
21	9bht:A	220	270	0.2590	0.3273	0.2667	1.24e-20	9bht:F
22	5cyp:D	227	212	0.2374	0.2907	0.3113	2.45e-20
23	3tw4:A	218	275	0.2590	0.3303	0.2618	1.75e-17	3tw4:B
24	2qa5:B	234	274	0.2842	0.3376	0.2883	2.33e-17	2qa5:A, 2qag:A, 2qnr:A
25	2qag:C	224	272	0.2554	0.3170	0.2610	8.59e-17
26	8pfh:D	291	209	0.2194	0.2096	0.2919	1.33e-14
27	8sgd:A	291	293	0.2698	0.2577	0.2560	3.02e-13	8fwp:A, 8pfh:A, 8sgd:C
28	2qag:B	246	278	0.2338	0.2642	0.2338	1.69e-12
29	1ky2:A	180	21	0.0432	0.0667	0.5714	0.21	1ky3:A, 4phf:A, 4phg:A, 4phh:A, 4phh:B, 4phh:C, 4phh:D
30	4fmc:F	73	68	0.0791	0.3014	0.3235	0.37
31	4n4g:A	209	110	0.1115	0.1483	0.2818	0.71	4n4h:A, 4n4i:A, 4ns5:A
32	6vno:A	1084	23	0.0432	0.0111	0.5217	0.74	6vp6:A
33	1vg8:A	184	22	0.0360	0.0543	0.4545	0.78	7f6j:A, 7f6j:B, 6iyb:A, 6iyb:C, 8kb8:C, 8kb8:D, 3law:A, 3law:B, 3law:C, 3law:D, 3law:E, 1t91:A, 1t91:B, 1t91:C, 1t91:D, 1vg0:B, 1vg1:A, 1vg8:B, 1vg8:C, 1vg8:D, 1vg9:B, 1vg9:D, 1vg9:F, 1vg9:H, 6wcw:B, 1yhn:A, 5z2m:A, 5z2m:C, 8zq3:A
34	2wkp:A	320	161	0.1295	0.1125	0.2236	0.81	6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
35	1htw:A	158	45	0.0540	0.0949	0.3333	0.91	1htw:B, 1htw:C
36	2qor:A	196	57	0.0683	0.0969	0.3333	1.0
37	6hxu:A	182	173	0.1619	0.2473	0.2601	1.1	2fv8:A, 6sge:A, 6sge:C
38	6s5h:A	175	25	0.0432	0.0686	0.4800	1.3	6hdu:A, 6hdu:B, 6hdu:C, 6hdu:D
39	4xj3:A	369	109	0.1007	0.0759	0.2569	1.3	4txy:B, 4txz:B, 4ty0:B, 4xj5:A
40	2zet:A	181	17	0.0396	0.0608	0.6471	1.5	2f7s:A, 2f7s:B, 2iey:A, 2iey:B, 2iez:A, 2iez:B, 2iez:H, 2iez:I, 2if0:A, 2if0:B, 2zet:B
41	3ref:B	180	75	0.0827	0.1278	0.3067	1.6	4dvg:A, 3ref:A, 3reg:A, 3reg:B
42	2dy1:A	660	88	0.1007	0.0424	0.3182	1.8	1wdt:A
43	5c1s:A	288	22	0.0468	0.0451	0.5909	1.8	5c1s:B, 5c1t:A, 5c1t:B
44	4ppv:A	246	57	0.0468	0.0528	0.2281	1.9	4ppu:A
45	2q3h:A	171	153	0.1295	0.2105	0.2353	2.0
46	1byu:B	215	38	0.0540	0.0698	0.3947	2.0	6a38:A, 6a3a:A, 6a3b:A, 6a3c:A, 6a3e:A, 3a6p:C, 3a6p:H, 7b51:B, 2bku:A, 2bku:C, 5bxq:C, 5bxq:D, 5bxq:E, 1byu:A, 4c0q:C, 4c0q:D, 3ch5:A, 5ciq:A, 5ciq:B, 5cit:A, 5cit:B, 5ciw:A, 5ciw:B, 6cit:A, 5cj2:A, 5cj2:B, 5cj2:C, 5cj2:D, 5cj2:E, 5cj2:F, 5cj2:G, 5cj2:H, 5cll:A, 5cll:C, 5clq:A, 5clq:C, 7cnd:A, 7dbg:A, 5dh9:A, 5dha:A, 5dhf:A, 5di9:A, 5dif:A, 5dis:B, 5dlq:C, 5dlq:D, 3ea5:A, 3ea5:C, 3gj0:A, 3gj0:B, 3gj3:A, 3gj4:A, 3gj4:C, 3gj5:A, 3gj5:C, 3gj6:A, 3gj7:A, 3gj7:C, 3gj8:A, 3gj8:C, 3gjx:C, 3gjx:F, 4gmx:A, 4gpt:A, 4hat:A, 4hau:A, 4hav:A, 4haw:A, 4hax:A, 4hay:A, 4haz:A, 4hb0:A, 4hb2:A, 4hb3:A, 4hb4:A, 8hq3:A, 8hq4:A, 8hq5:A, 8hq6:A, 8huf:A, 8hug:A, 1ibr:A, 1ibr:C, 8itv:A, 5jlj:A, 1k5d:A, 1k5d:D, 1k5d:G, 1k5d:J, 1k5g:A, 1k5g:D, 1k5g:G, 1k5g:J, 6kft:A, 7l5e:A, 6lq9:A, 6m60:A, 6m6x:A, 7mnp:A, 7mnp:C, 7mnq:A, 7mnr:A, 7mns:A, 7mnt:A, 7mnt:C, 7mnu:A, 7mnv:A, 7mnw:A, 7mnw:C, 7mnw:E, 7mnw:G, 7mnx:A, 7mnx:C, 7mnx:E, 7mnx:G, 7mnx:I, 7mnx:K, 7mny:A, 7mny:C, 7mny:E, 7mny:G, 7mny:I, 7mny:K, 7mnz:A, 7mnz:C, 7mnz:E, 7mnz:G, 7mnz:I, 7mnz:K, 7mo0:A, 7mo0:C, 7mo1:A, 7mo2:A, 7mo2:C, 7mo3:A, 7mo3:C, 7mo4:A, 7mo4:C, 7mo5:A, 3nby:C, 3nby:F, 3nbz:C, 3nbz:F, 3nc0:C, 3nc0:F, 3nc1:C, 4ol0:A, 6q82:B, 6q84:B, 6q84:E, 1qbk:C, 1qg2:A, 1qg4:A, 1qg4:B, 3ran:A, 3ran:B, 3ran:C, 3ran:D, 1rrp:A, 1rrp:C, 6tvo:B, 5uwh:A, 5uwi:A, 5uwj:A, 5uwo:A, 5uwp:A, 5uwq:A, 5uwr:A, 5uws:A, 5uwt:A, 5uwu:A, 5uww:A, 3w3z:B, 1wa5:A, 4wvf:A, 6x2m:A, 6x2o:A, 6x2p:A, 6x2r:A, 6x2s:A, 6x2u:A, 6x2v:A, 6x2w:A, 6x2x:A, 6x2y:A, 6xjp:A, 6xjr:A, 6xjs:A, 6xjt:A, 6xju:A, 7ypz:A, 5yro:A, 5yst:A, 5ysu:A, 5ytb:A, 5yu6:B, 5yu6:D, 3zjy:A, 3zjy:D, 3zjy:F, 5zpu:A
47	8fo9:A	1173	23	0.0396	0.0094	0.4783	2.0	8fo9:C
48	8u7h:C	1111	23	0.0396	0.0099	0.4783	2.0
49	1nf3:A	194	182	0.1367	0.1959	0.2088	2.4	1a4r:A, 1a4r:B, 1am4:D, 1am4:E, 1am4:F, 1an0:A, 1an0:B, 5c2j:B, 1cee:A, 1cf4:A, 5cjp:A, 5cjp:B, 5cjp:C, 5cjp:D, 4did:A, 1doa:A, 1e0a:A, 3eg5:A, 3eg5:C, 1grn:A, 5hzk:A, 5hzk:C, 4itr:C, 4itr:D, 4js0:A, 1nf3:B, 2ngr:A, 2odb:A, 3qbv:A, 3qbv:C, 7s0y:B, 6siu:C, 6siu:D, 6tkz:C, 6tkz:D, 5upk:C, 2wmn:B, 2wmo:B, 4yc7:A, 4ydh:B, 4ydh:D
50	8fo9:F	2289	21	0.0396	0.0048	0.5238	2.4	9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
51	3m1i:A	200	18	0.0396	0.0550	0.6111	2.4	8dyo:B, 8f19:B, 8f1e:D, 8f7a:B, 3icq:B, 3icq:C, 3wyf:A, 3wyf:D, 3wyg:A, 2x19:A, 5xoj:A
52	8u8b:A	1712	21	0.0396	0.0064	0.5238	2.4	8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
53	8tzf:A	1589	21	0.0396	0.0069	0.5238	2.5
54	5dn8:A	405	49	0.0647	0.0444	0.3673	2.6
55	8smc:C	1084	21	0.0396	0.0101	0.5238	2.6
56	7p7q:0	534	22	0.0396	0.0206	0.5000	2.8	7p7r:0, 7p7s:0, 7p7t:0
57	5oql:Z	639	19	0.0396	0.0172	0.5789	2.8
58	8tzg:A	906	23	0.0396	0.0121	0.4783	3.0
59	7o80:Bz	595	55	0.0647	0.0303	0.3273	3.1	7a09:J, 6hcf:k1, 6hcm:k1, 3jag:jj, 3jah:jj, 3jai:jj, 5lzv:jj, 8p03:k, 8p09:k, 8scb:jj, 6yal:k, 6yam:k, 6zme:CI, 6zvj:1
60	6rxt:CI	822	19	0.0396	0.0134	0.5789	3.1	6rxu:CI, 6rxv:CI, 6rxx:CI, 6rxy:CI, 6rxz:CI
61	2j1l:A	157	26	0.0360	0.0637	0.3846	3.5
62	4u03:A	389	128	0.1115	0.0797	0.2422	3.6	4txy:A, 4txz:A, 4ty0:A, 4u03:B, 4u0m:A, 4u0m:B, 4u0n:A, 4u0n:B, 4xj4:A
63	6y09:A	176	98	0.0755	0.1193	0.2143	3.6	2g77:B, 6sur:A, 6sur:B, 6sur:C, 6sur:D, 6sur:E, 6sur:F, 6y09:B, 1z06:A, 6zay:A, 6zay:B
64	4djt:B	204	71	0.0683	0.0931	0.2676	3.9	4djt:A
65	8tzh:A	1485	20	0.0396	0.0074	0.5500	3.9	3d6t:B
66	8tyq:A	957	20	0.0396	0.0115	0.5500	4.1	8tze:A
67	4mit:C	181	19	0.0432	0.0663	0.6316	4.1	4mit:A, 4mit:B, 4mit:D
68	7kdc:A	180	42	0.0576	0.0889	0.3810	4.1	7kdc:B
69	6o62:A	169	17	0.0360	0.0592	0.5882	4.1
70	4rke:A	176	33	0.0504	0.0795	0.4242	4.2	1z0a:C
71	6vij:B	191	20	0.0360	0.0524	0.5000	4.4	6vii:B, 6vii:A, 6vij:A, 6vik:B
72	1ser:B	421	56	0.0647	0.0428	0.3214	4.4	1ses:A, 1ses:B, 1set:A, 1set:B
73	6s5f:A	188	38	0.0576	0.0851	0.4211	4.6
74	3err:A	527	56	0.0647	0.0342	0.3214	4.6	3err:B, 1ser:A
75	4lhv:E	148	47	0.0576	0.1081	0.3404	5.0
76	3cbq:A	169	67	0.0683	0.1124	0.2836	5.2
77	7am2:BU	463	76	0.0791	0.0475	0.2895	5.5
78	6if2:B	178	17	0.0324	0.0506	0.5294	5.7	6ekk:C, 6ekk:D, 6if3:B
79	5hh9:A	390	44	0.0576	0.0410	0.3636	6.0	5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
80	6h5q:B	381	53	0.0576	0.0420	0.3019	6.1	6h5s:C, 4uft:B
81	4u00:A	241	19	0.0360	0.0415	0.5263	6.1
82	8xfc:D	517	35	0.0504	0.0271	0.4000	6.7	8wdb:D
83	5xr4:B	171	17	0.0324	0.0526	0.5294	7.1	5xr4:A, 5xr6:A, 5xr6:B, 5xr7:A, 5xr7:B
84	6d71:A	172	22	0.0360	0.0581	0.4545	7.7	6d71:B
85	6or5:A	2058	26	0.0360	0.0049	0.3846	7.8
86	7z15:I	253	18	0.0432	0.0474	0.6667	9.4	7z15:J, 7z16:I, 7z16:J, 7z18:I, 7z18:J

[Back]