BioLiP

>protein
IVYTHDTGLDYITYSDYELDPANPLAGGAAWIEGAFVPPSEARISIFDQGFYTSDATYTTFHVWNGNAFRLGDHIERLFS
NAESIRLIPPLTQDEVKEIALELVAKTELREAMVTVTITRGYSSTPFERDITKHRPQVYMSACPYQWIVPFDRIRDGVHL
MVAQSVRRTPRSSIDPQVKNFQWGDLIRAIQETHDRGFELPLLLDCDNLLAEGPGFNVVVIKDGVVRSPGRAALPGITRK
TVLEIAESLGHEAILADITPAELYDADEVLGCSTGGGVWPFVSVDGNSISDGVPGPVTQSIIRRYWELNVEPSSLLTPVQ
Y

The query sequence (length=321) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3wwh:A	329	321	0.9159	0.8936	0.9159	0.0	5fr9:A, 5fr9:B, 5fr9:C, 5fr9:D, 5fr9:E, 5fr9:F, 5fr9:G, 5fr9:H, 5fr9:I, 5fr9:J, 5fr9:K, 5fr9:L, 3wwi:A, 3wwi:B, 3wwi:C, 3wwi:D, 3wwi:E, 3wwi:F, 3wwi:G, 3wwi:H, 3wwi:I, 3wwi:J, 3wwi:K, 3wwi:L, 3wwj:A, 3wwj:B, 3wwj:C, 3wwj:D, 3wwj:E, 3wwj:F, 3wwj:G, 3wwj:H, 3wwj:I, 3wwj:J, 3wwj:K, 3wwj:L
2	8ivp:B	322	310	0.5078	0.5062	0.5258	9.56e-115	8ivp:A, 8ivp:C, 8ivp:D
3	7dbe:B	332	310	0.4798	0.4639	0.4968	6.01e-109	7dbe:A, 7dbe:C, 7dbe:D, 7wud:B, 7wud:A, 7wud:C, 7wud:D
4	4cmd:A	322	289	0.3988	0.3975	0.4429	3.22e-83	4cmd:B, 4cmf:A
5	4ce5:A	325	294	0.4081	0.4031	0.4456	1.13e-82	4ce5:B, 8x1f:A, 8x1f:B, 7xg5:A, 7xg5:B, 8xiy:A, 8xiy:B
6	6xwb:A	319	297	0.3925	0.3950	0.4242	1.74e-82	6xwb:B
7	6snl:D	320	292	0.3832	0.3844	0.4212	1.05e-80	6snl:A, 6snl:B, 6snl:C, 6snl:E, 6snl:F
8	4chi:A	320	299	0.3614	0.3625	0.3880	8.71e-79	4chi:B, 4uug:A, 4uug:B
9	6fte:B	321	290	0.3832	0.3832	0.4241	1.56e-78
10	6xu3:C	322	296	0.3738	0.3727	0.4054	1.07e-77	6xu3:A, 6xu3:B, 6xu3:D
11	5mr0:D	290	279	0.2804	0.3103	0.3226	2.22e-46	5mr0:A, 5mr0:B, 5mr0:C, 5mr0:E, 5mr0:F
12	7p3t:B	299	292	0.2897	0.3110	0.3185	9.48e-45	7p3t:A, 7p3t:C, 7p3t:D, 7p3t:E, 7p3t:F
13	5e25:A	290	278	0.2555	0.2828	0.2950	3.51e-41	5cm0:A, 5cm0:B, 5cm0:C, 5e25:B, 5e25:C
14	1a0g:B	282	274	0.2368	0.2695	0.2774	1.37e-27	1a0g:A, 1daa:A, 1daa:B, 2daa:A, 2daa:B, 2dab:A, 2dab:B, 3daa:A, 3daa:B, 4daa:A, 4daa:B, 5daa:A, 5daa:B, 1g2w:A, 1g2w:B, 3lqs:A, 3lqs:B
15	6thq:B	301	301	0.2741	0.2924	0.2924	1.21e-26	5ce8:A, 5ce8:B, 5ce8:C, 6thq:A, 6thq:C
16	7z79:B	306	274	0.2305	0.2418	0.2701	1.98e-26	7z79:A, 7z79:C, 7z79:D, 7z79:E, 7z79:F
17	2ej0:B	305	289	0.2461	0.2590	0.2734	9.17e-26	2eiy:A, 2eiy:B, 2eiy:C, 2ej0:A, 2ej0:C, 2ej0:D, 2ej0:E, 2ej0:F, 2ej2:A, 2ej2:B, 2ej2:C, 2ej2:D, 2ej2:E, 2ej2:F, 2ej3:A, 2ej3:B, 2ej3:C, 1wrv:A, 1wrv:B, 1wrv:C
18	1i1l:A	304	284	0.2181	0.2303	0.2465	4.16e-23	1a3g:A, 1a3g:B, 1a3g:C, 1i1k:A, 1i1k:B, 1i1k:C, 1i1l:B, 1i1l:C, 1i1m:A, 1i1m:B, 1i1m:C, 1iyd:A, 1iyd:B, 1iyd:C, 1iye:A, 1iye:B, 1iye:C
19	4whx:A	306	287	0.2212	0.2320	0.2474	5.33e-22	4whx:C, 4whx:D, 4whx:E
20	6h65:C	308	293	0.2399	0.2500	0.2628	2.00e-19	6h65:A, 6h65:B, 6h65:D, 6h65:E, 6h65:F
21	7nea:A	309	306	0.2399	0.2492	0.2516	1.49e-17	6gkr:A, 6gkr:B, 6gkr:C, 7neb:A, 6q8e:A
22	2y4r:A	270	257	0.2118	0.2519	0.2646	8.45e-16	2y4r:B
23	8ahu:A	283	273	0.2118	0.2403	0.2491	1.08e-14	7p7x:A, 8raf:A, 8rai:A, 8yrt:A, 8yru:A, 8yrv:A
24	8onj:A	277	285	0.2212	0.2563	0.2491	4.62e-12	8ahr:A, 8ahr:B, 8aie:A, 8aie:B, 8ayj:A, 8ayj:B, 8ayk:A, 8ayk:B, 8onj:B, 8onl:A, 8onl:B, 8onm:A, 8onm:B, 8onn:A, 8onn:B, 8onn:C, 8onn:D
25	3csw:C	275	292	0.2243	0.2618	0.2466	5.40e-11	3csw:A
26	8pnw:A	278	278	0.2056	0.2374	0.2374	3.73e-06	8pnx:A, 8pny:A
27	9j0u:A	286	273	0.2025	0.2273	0.2381	6.60e-06	9j0v:A
28	5k3w:A	298	279	0.2181	0.2349	0.2509	4.48e-05	5k3w:B
29	1i2k:A	269	263	0.1776	0.2119	0.2167	5.85e-04	1et0:A, 1i2l:A
30	6jif:B	334	78	0.0810	0.0778	0.3333	7.34e-04	6jif:A
31	6q1r:B	284	248	0.1558	0.1761	0.2016	0.062	6q1r:A, 6q1r:C, 6q1r:D, 6q1s:A, 6q1s:B, 6q1s:C, 6q1s:D
32	2zgi:D	246	204	0.1464	0.1911	0.2304	0.11	2zgi:A, 2zgi:B, 2zgi:C
33	3dtf:A	363	78	0.0779	0.0689	0.3205	0.62	3dtf:B, 3dtg:A, 3dtg:B, 3jz6:A, 3jz6:B
34	3ht5:A	335	78	0.0810	0.0776	0.3333	0.71	5u3f:A, 5u3f:B
35	1br6:A	268	45	0.0530	0.0634	0.3778	1.5	1br5:A, 5ddz:A, 3ej5:X, 4esi:A, 5gu4:A, 5gu4:B, 3hio:A, 4huo:X, 4hup:X, 4hv3:A, 4hv7:X, 8i7p:A, 1ifs:A, 1ifu:A, 1il3:A, 1il4:A, 1il5:A, 1il9:A, 1j1m:A, 7kc9:D, 7kd0:A, 7kdm:D, 7kdu:A, 4lgr:A, 7mln:A, 7mlo:A, 7mlo:B, 7mlp:A, 7mlt:A, 4mx1:A, 4mx5:X, 1obt:A, 6obg:B, 6ocd:A, 6ocd:C, 2p8n:A, 2pjo:A, 3px8:X, 3px9:X, 4q2v:A, 2r2x:A, 3rti:A, 3rtj:A, 1rzo:A, 1rzo:C, 8t9v:A, 8tab:A, 8tad:A, 6urw:A, 6urx:A, 6ury:A, 7xzs:A, 7xzt:A, 7xzu:A, 7xzw:A, 7y02:A, 7y03:A, 7y05:A, 7y06:A, 7y07:A, 7y08:A, 7y4k:A, 7y4m:A, 4z9k:A
36	4ba0:A	781	76	0.0810	0.0333	0.3421	2.2	4b9y:A, 4b9z:A, 5i23:A, 5i24:A, 5npb:A, 5npc:A, 5npd:A, 5npe:A, 7p4c:AAA, 7p4d:AAA, 8rw3:C, 8rw3:A, 8rw3:B
37	2h0r:A	216	41	0.0374	0.0556	0.2927	2.5	2h0r:B, 2h0r:C, 2h0r:D, 2h0r:E, 2h0r:F, 2h0r:G, 3v8e:A, 3v8e:B, 3v8e:C, 3v8e:D, 3v8e:E, 3v8e:F, 3v8e:G
38	4hjf:A	263	62	0.0530	0.0646	0.2742	4.9	3u2e:A, 3u2e:B
39	5xxu:B	212	54	0.0623	0.0943	0.3704	8.5

[Back]