BioLiP

>protein
IVDPGPLDVTALAVAAALAAGLHSAADDPAAALDKCIVLDELTEFAEKLVVHDRPGGIGTTVEYVEVYEDASGVRLGTAT
GNAVVLKMEPHMWQFHQSVSELADGSFEAVGVIDCTAMLRRMTQVLRVTGRSGRYAGKSGFMTLAISDPNQRPPHYSVQV
VLC

The query sequence (length=163) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5bu3:A	181	163	1.0000	0.9006	1.0000	1.45e-119	5bu3:B, 5bu3:C, 5bu3:D, 7dvk:A, 7dvk:B, 7dvk:C, 7dvk:D
2	8of7:B	119	110	0.1963	0.2689	0.2909	4.44e-04
3	8of7:A	139	81	0.1595	0.1871	0.3210	0.001
4	7pxo:AAA	136	85	0.1534	0.1838	0.2941	0.002	7pxo:BBB, 7pxo:DDD
5	3sbx:A	177	94	0.1840	0.1695	0.3191	0.35	3sbx:B, 3sbx:C, 3sbx:D, 3sbx:E, 3sbx:F, 3sbx:G, 3sbx:H
6	7nba:K	331	118	0.1718	0.0846	0.2373	0.65
7	7x81:A	145	96	0.1656	0.1862	0.2812	1.0	7x81:B, 7x86:A, 7x86:B, 7x86:C, 7x86:D
8	2z00:A	426	50	0.1104	0.0423	0.3600	1.9
9	7zla:B	458	78	0.1166	0.0415	0.2436	2.1	7pq9:AAA, 7pq9:BBB, 7pq9:CCC, 7pq9:DDD, 7pq9:EEE, 7pq9:FFF, 7pq9:GGG, 7pq9:HHH, 7pq9:III, 7pq9:JJJ, 7zpa:A, 7zpa:B
10	3guh:A	477	42	0.0859	0.0294	0.3333	2.9	3cop:A, 3cx4:A, 2qzs:A, 2r4t:A, 2r4u:A
11	5bn4:A	567	37	0.0736	0.0212	0.3243	3.3	5bn3:A
12	4rvu:A	329	131	0.2147	0.1064	0.2672	4.8	4rvu:B, 4rvu:C, 4rvu:D
13	7op8:A	1118	35	0.0982	0.0143	0.4571	6.6	7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
14	8sfb:D	314	61	0.0920	0.0478	0.2459	6.7	8sfc:D, 8sfd:D, 8sfk:D, 8sfm:D, 3uf9:A, 3uf9:B, 3uf9:C, 3uf9:D, 2vc5:A, 2vc5:B, 2vc5:C, 2vc5:D, 2vc7:A, 2vc7:B, 2vc7:C, 2vc7:D, 5vri:A, 5vri:B, 5vri:C, 5vri:D, 5vrk:A, 5vrk:B, 5vsa:A, 5vsa:B, 5vsa:C, 5vsa:D, 5w3u:B, 5w3w:A, 5w3w:B, 5w3w:C, 5w3w:D, 5w3z:B, 5w3z:C, 5w3z:D
15	6hiv:CZ	151	46	0.0859	0.0927	0.3043	7.2	6hiw:CZ, 6hiy:CZ
16	6d2v:A	315	37	0.0798	0.0413	0.3514	7.6	6d2v:B, 6nd7:A, 6nd7:B
17	1eil:A	289	82	0.1288	0.0727	0.2561	8.0	1dhy:A, 1eiq:A, 1eir:A, 1kw3:B, 1kw6:B, 1kw8:B, 1kw9:B, 1kwc:B
18	6hg1:A	371	44	0.0920	0.0404	0.3409	9.3	4by3:A, 4c6c:A, 4c6d:A, 4c6e:A, 4c6f:A, 4c6i:A, 4c6j:A, 4c6k:A, 4c6l:A, 4c6m:A, 4c6n:A, 4c6o:A, 4c6p:A, 4c6q:A, 8gvz:A, 8gw0:A, 6hfd:A, 6hfe:A, 6hff:A, 6hfh:A, 6hfi:A, 6hfj:A, 6hfk:A, 6hfl:A, 6hfn:A, 6hfp:A, 6hfq:A, 6hfr:A, 6hfs:A, 6hfu:A, 6hg2:A, 6hg3:A, 8pbe:A, 8pbg:A, 8pbh:A, 8pbi:A, 8pbj:A, 8pbk:A, 8pbm:A, 8pbn:A, 8pbp:A, 8pbq:A, 8pbr:A, 8pbs:A, 8pbt:A, 8pbu:A, 5ynz:A

[Back]