BioLiP

>protein
ITIDSISNGILNNLLTTLIQDIVARETTQQQLLKTRYPDLRSYYFDPNGSLDINGLQKQQESSQYIHCENCGRDVSANRL
AAHLQRCLSR

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3mhh:C	93	90	1.0000	0.9677	1.0000	8.02e-63	6aqr:C, 4fk5:C, 3kjl:E, 3kjl:H, 3m99:B, 3mhs:C, 6t9l:M, 4wa6:C, 4zux:W, 4zux:b, 4zux:g, 4zux:l
2	4wa6:G	71	89	0.7333	0.9296	0.7416	1.20e-36
3	2lo2:A	38	33	0.3667	0.8684	1.0000	1.66e-18
4	3mhh:E	92	42	0.1667	0.1630	0.3571	0.066	6aqr:E, 4fip:D, 4fip:H, 4fjc:D, 4fk5:E, 3m99:D, 3mhs:E, 6t9l:N, 4wa6:E, 4zux:Y, 4zux:d, 4zux:i, 4zux:n
5	8ro0:A	2231	38	0.1444	0.0058	0.3421	0.074	8ro1:A
6	7w3u:A	343	90	0.2444	0.0641	0.2444	0.12	7w3r:A, 7w3u:B, 7w3u:C
7	4w4u:E	84	41	0.1556	0.1667	0.3415	0.44	4fjc:H, 4w4u:H, 4wa6:H
8	6lpw:B	436	74	0.2111	0.0436	0.2568	0.85
9	7oop:M	810	34	0.1556	0.0173	0.4118	1.0	7opc:M, 7opd:M
10	8om5:A	828	28	0.1333	0.0145	0.4286	1.3	8omo:A
11	8ag6:A	896	28	0.1333	0.0134	0.4286	1.3	2o8b:A, 2o8c:A, 2o8d:A, 2o8e:A, 2o8f:A, 8olx:A, 8om9:A, 8oma:A, 8omq:A, 3thw:A, 3thx:A, 3thy:A, 3thz:A
12	8y6o:C	2227	30	0.1444	0.0058	0.4333	1.4	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
13	4uqz:A	258	32	0.1556	0.0543	0.4375	1.5	4uqy:A
14	2czr:A	226	23	0.1111	0.0442	0.4348	2.1
15	8q7x:A	1914	16	0.1000	0.0047	0.5625	2.7
16	8qp8:A	1918	16	0.1000	0.0047	0.5625	2.7
17	5z57:A	1978	16	0.1000	0.0046	0.5625	2.7
18	8i0p:A	2149	16	0.1000	0.0042	0.5625	2.7	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
19	5z56:A	2232	16	0.1000	0.0040	0.5625	2.8	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
20	8c6j:A	2261	16	0.1000	0.0040	0.5625	2.8	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
21	7abg:A	2174	16	0.1000	0.0041	0.5625	2.9	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
22	8h6k:5B	2253	16	0.1000	0.0040	0.5625	3.1	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
23	2cjb:B	495	69	0.2000	0.0364	0.2609	4.7	2cim:A, 2cim:B, 2cj9:A, 2cj9:B, 2cja:A, 2cja:B, 2cjb:A
24	1n83:A	251	43	0.1333	0.0478	0.2791	5.1	1s0x:A, 4s15:A, 4s15:B
25	4pee:C	446	23	0.1222	0.0247	0.4783	5.5	5hdr:A, 5hdr:B, 5hdr:C, 5hdr:D, 6hzy:A, 6hzy:B, 5i5r:A, 5i5r:B, 5i5r:C, 5i5r:D, 4j28:A, 4j28:B, 4jfs:A, 4jfs:B, 4jft:A, 4jft:B, 4jfu:A, 4jfu:B, 4jfv:A, 4jfv:B, 4jfv:C, 4jfv:D, 4jfw:A, 4jfw:B, 4jfw:C, 4jfw:D, 4jl1:A, 4jl1:B, 4jl2:A, 4jl2:B, 4pcs:A, 4pcs:B, 4pcs:C, 4pcs:D, 4pct:A, 4pct:B, 4pct:C, 4pct:D, 4pee:A, 4pee:B, 4pee:D, 4wsj:A, 4wsj:B, 4wsj:C, 4wsj:D, 4wsk:A, 4wsk:B, 4wsk:C, 2wvs:A, 2wvs:B, 2wvs:C, 2wvs:D, 2wvt:A, 2wvt:B, 2wvu:A, 2wvu:B, 2wvu:C, 2wvu:D, 2xib:A, 2xib:B, 2xib:C, 2xib:D, 2xii:A, 2xii:B
26	6g88:C	597	18	0.1222	0.0184	0.6111	6.5	6g88:B
27	8f3i:A	641	18	0.1222	0.0172	0.6111	6.7	8f3g:A, 8f3l:A, 8f3n:A, 8f3p:A, 8f3s:A, 8f3u:A, 8f3w:A, 8f3y:A, 6g88:A, 6mkf:A, 6mkg:A
28	3zvh:A	415	61	0.2000	0.0434	0.2951	6.9	1kcz:A, 1kcz:B, 3zvh:B, 3zvi:A, 3zvi:B
29	5vf0:B	43	25	0.1000	0.2093	0.3600	7.4	2mre:B, 2mrf:A
30	2ct1:A	77	43	0.1333	0.1558	0.2791	7.4
31	7w1m:H	322	43	0.1333	0.0373	0.2791	8.1	5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
32	2g7c:B	254	19	0.1000	0.0354	0.4737	8.9	2g7c:A
33	3tyw:D	399	36	0.1667	0.0376	0.4167	9.0	4fxb:A, 4fxb:B, 3tyw:A, 3tyw:B, 3tyw:C
34	2lo3:A	44	40	0.1444	0.2955	0.3250	9.2
35	4ywo:A	444	15	0.1000	0.0203	0.6000	9.6
36	7kzv:V	1155	38	0.1222	0.0095	0.2895	9.9	8a9k:B
37	6exn:H	411	45	0.1778	0.0389	0.3556	10.0	5lj3:H, 5lj5:H, 5mps:H, 5mq0:H

[Back]