BioLiP

>protein
ISSETGEMGILWEFDPIINKWIRLSMKLKVERKPFAEGALREAYHTVSLGVGTDENYPLGTTTKLFPPIEMISPISKNNE
AMTQLKNGTKFVLKLYKKEAEQQASRELYFEAVKMQMVCRDWGNKFNQKKPPKKIEFLMSWVVELIDRSPPILCSIEPLL
VGEFKKNNSNYGAVLTNRSTPQAFSHFTYELSNKQMIVVDIQGVDDLYTDPQIHTPDGKGFGLGNLGKAGINKFITTHKC
NAVCALLDLDVKL

The query sequence (length=253) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zme:A	262	258	0.9842	0.9504	0.9651	0.0	5dyj:A, 5dyj:B, 5e4h:A, 5e4h:B, 5e4h:C, 5e4h:D, 5e4h:E, 5e4h:F, 5e4h:G, 5e4h:H, 5e9e:A, 5e9e:B, 3lkm:A, 3lla:A, 3lla:B, 3lmh:A, 3lmh:B, 3lmi:A, 3lmi:B, 3lmi:C, 3lmi:D, 3pdt:A, 4zme:B, 4zmf:A, 4zmf:B, 4zs4:A, 4zs4:B
2	8gm4:A	462	237	0.3518	0.1926	0.3755	7.40e-48
3	8fny:A	497	238	0.3478	0.1771	0.3697	7.84e-47	8fny:C, 8fo6:A, 8gm5:A, 7shq:A
4	4kuj:B	268	277	0.2727	0.2575	0.2491	1.17e-16	4kuj:A, 4nl0:A, 4nl0:B
5	1ia9:B	280	185	0.2213	0.2000	0.3027	7.09e-16	1ia9:A, 1iah:A, 1iah:B, 1iaj:B
6	1iaj:A	253	174	0.1976	0.1976	0.2874	1.62e-11
7	3gon:A	329	53	0.0632	0.0486	0.3019	0.96
8	5gcn:A	166	81	0.0870	0.1325	0.2716	1.5	1m1d:A, 1m1d:C, 1pu9:A, 1pua:A, 1q2c:A, 1q2d:A, 1qsn:A, 1qsr:A
9	4amc:A	1019	39	0.0553	0.0137	0.3590	1.7
10	7d6v:C	264	32	0.0514	0.0492	0.4062	6.0	7d6x:C
11	6h6c:A	151	90	0.0949	0.1589	0.2667	9.3	5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A

[Back]