BioLiP

>protein
ISSETGEMGILWEFDPIINKWIRLSMKLKVERKPFAEGALREAYHTVSLGVGTDENYPLGTTKLFPPIEMISPISKNNEA
MTQLKNGTKFVLKLYKKQQASRELYFEDVKMQMVCRDWGNKFNQKKPPKKIEFLMSWVVELIDRSPSSNGQPILCSIEPL
LVGEFKKNNSNYGAVLTNRSTPQAFSHFTYELSNKQMIVVDIQGVDDLYTAPQIHTPDGKGFGLGNLGKAGINKFITTHK
CNAVCALLDLDVKL

The query sequence (length=254) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zme:A	262	255	0.9961	0.9656	0.9922	0.0	5dyj:A, 5dyj:B, 5e4h:A, 5e4h:B, 5e4h:C, 5e4h:D, 5e4h:E, 5e4h:F, 5e4h:G, 5e4h:H, 5e9e:A, 5e9e:B, 3lkm:A, 3lla:A, 3lla:B, 3lmh:A, 3lmh:B, 3lmi:A, 3lmi:B, 3lmi:C, 3lmi:D, 3pdt:A, 4zme:B, 4zmf:A, 4zmf:B, 4zs4:A, 4zs4:B
2	8gm4:A	462	238	0.3543	0.1948	0.3782	2.64e-47
3	8fny:A	497	239	0.3504	0.1791	0.3724	2.30e-46	8fny:C, 8fo6:A, 8gm5:A, 7shq:A
4	4kuj:B	268	273	0.2638	0.2500	0.2454	1.13e-15	4kuj:A, 4nl0:A, 4nl0:B
5	1ia9:B	280	190	0.2165	0.1964	0.2895	1.13e-14	1ia9:A, 1iah:A, 1iah:B, 1iaj:B
6	1iaj:A	253	179	0.1929	0.1937	0.2737	3.53e-10
7	6h6c:A	151	90	0.0984	0.1656	0.2778	0.19	5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
8	3gon:A	329	26	0.0433	0.0334	0.4231	1.4
9	7d6v:C	264	48	0.0630	0.0606	0.3333	2.8	7d6x:C
10	4lqf:A	78	30	0.0276	0.0897	0.2333	8.0
11	6gy5:A	285	62	0.0709	0.0632	0.2903	8.1
12	7d8t:A	199	35	0.0472	0.0603	0.3429	8.2	4ati:A, 4ati:B, 4atk:A, 4atk:B, 7d8t:B, 6g1l:A, 8vu0:A, 8vu0:B

[Back]