BioLiP

>protein
ISINDNQRLQLEPLEVPSRLLLGPGPSNAHPSVLQAMNVSPVGHLDPAFLALMDEIQSLLRYVWQTENPLTIAVSGTGTA
AMEATIANAVEPGDVVLIGVAGYFGNRLVDMAGRYGADVRTISKPWGEVFSLEELRTALETHRPAILALVHAETSTGARQ
PLEGVGELCREFGTLLLVDTVTSLGGVPIFLDAWGVDLAYSCSQKGLGCSPGASPFTMSSRAIEKLQRRRTKVANWYLDM
NLLGKYWGSERVYHHTAPINLYYALREALRLIAQEGLANCWQRHQKNVEYLWERLEDIGLSLHVEKEYRLPTLTTVCIPD
GVDGKAVARRLLNEHNIEVGGGLGELAGKVWRVGLMGFNSRKESVDQLIPALEQVLR

The query sequence (length=377) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1vjo:A	377	377	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	3kgw:B	388	368	0.4509	0.4381	0.4620	5.19e-117	3kgw:A, 3kgx:A
3	2huf:A	385	368	0.4483	0.4390	0.4592	1.15e-116	2huf:B, 2hui:A, 2hui:B, 2huu:A, 2huu:B
4	1j04:A	387	371	0.4324	0.4212	0.4394	3.44e-112	4cbr:A, 4cbs:A, 5f9s:A, 5f9s:B, 1h0c:A, 5hhy:A, 5hhy:B, 5luc:A, 5luc:B, 5luc:E, 5luc:G, 5luc:M, 5luc:N, 5luc:S, 5luc:T, 5ofy:A, 5og0:A, 6rv0:A, 6rv1:A, 2yob:A, 2yob:B
5	2ch1:A	388	369	0.4324	0.4201	0.4417	2.59e-105	2ch1:D, 2ch1:B, 2ch1:C, 2ch2:A, 2ch2:D, 2ch2:B, 2ch2:C
6	6mfb:D	386	369	0.4005	0.3912	0.4092	1.21e-104	6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
7	3isl:A	387	363	0.3714	0.3618	0.3857	2.71e-92	3isl:B
8	2yri:A	352	359	0.3607	0.3864	0.3788	1.23e-63	2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
9	2dr1:A	381	363	0.2785	0.2756	0.2893	4.72e-47	2dr1:B
10	6pk3:B	400	347	0.2971	0.2800	0.3228	1.03e-45	6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
11	1iug:A	348	353	0.3210	0.3477	0.3428	5.34e-35	1iug:B
12	3zrq:A	382	364	0.2865	0.2827	0.2967	2.06e-33	3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
13	2z9v:A	392	340	0.2467	0.2372	0.2735	2.11e-33	2z9v:B, 2z9w:A, 2z9w:B, 2z9x:A, 2z9x:B
14	2bkw:A	381	360	0.2599	0.2572	0.2722	1.11e-28
15	1m32:B	362	311	0.2281	0.2376	0.2765	1.37e-26	1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
16	6pd2:C	616	325	0.2202	0.1347	0.2554	4.34e-24	6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
17	3ffr:A	361	238	0.1485	0.1551	0.2353	6.10e-11
18	3lvm:B	394	281	0.1724	0.1650	0.2313	3.23e-07	3lvj:A, 3lvj:B, 3lvk:A, 3lvl:B, 3lvm:A, 1p3w:B, 1p3w:A
19	1qz9:A	404	118	0.0955	0.0891	0.3051	2.22e-06
20	5zss:A	388	68	0.0584	0.0567	0.3235	3.27e-05
21	8irk:A	379	154	0.1088	0.1082	0.2662	7.79e-05	8irk:B, 8irk:C, 8irk:D, 8iry:A, 8iry:B, 8iry:C, 8iry:D, 8irz:A, 8irz:B, 8is0:A, 8is0:B
22	5wt6:A	366	84	0.0690	0.0710	0.3095	1.13e-04	7cet:A, 7ceu:A, 6kg0:A, 6kg1:A, 5wt2:A, 5wt4:A, 7xeq:A, 7xes:A
23	1t3i:A	406	138	0.0875	0.0813	0.2391	2.20e-04	1t3i:B
24	6qp3:A	387	127	0.0875	0.0853	0.2598	8.93e-04	6qp3:B, 6qp3:C, 6qp3:D
25	6hrh:A	429	255	0.1618	0.1422	0.2392	0.041	6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
26	3hqt:B	386	55	0.0477	0.0466	0.3273	0.047	3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
27	2e7i:A	344	100	0.0663	0.0727	0.2500	0.047	2e7i:B, 2e7j:A, 2e7j:B
28	5wgb:A	291	175	0.0955	0.1237	0.2057	0.049
29	2wk8:B	364	55	0.0477	0.0495	0.3273	0.051
30	8odq:D	410	132	0.0928	0.0854	0.2652	0.055	8odq:B
31	6ndn:A	406	121	0.0796	0.0739	0.2479	0.084	1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
32	6nzu:A	402	70	0.0371	0.0348	0.2000	0.088	6nzu:E, 8pk8:A, 8pk9:A, 8pka:A, 7rtk:A, 8tvt:A, 6uxe:A, 6w1d:A, 6wi2:A, 6wih:A, 5wkp:A, 5wkp:E, 5wlw:A, 5wlw:E
33	7tlp:A	391	127	0.0743	0.0716	0.2205	0.14
34	8erb:K	429	142	0.0955	0.0839	0.2535	0.16	8erb:A, 8erb:C, 8erb:B, 8erb:D, 8erb:G, 8erb:H, 8erb:F, 8erb:P, 8erb:I, 8erb:J, 8erb:M, 8erb:E, 8erb:Q, 8erb:N, 8erb:L, 8erj:A, 8erj:B, 8erj:C, 8erj:D, 8erj:E, 8erj:F, 8erj:H, 8erj:G
35	7tlm:A	415	127	0.0743	0.0675	0.2205	0.17	7tlp:B, 7tlp:C, 7tlp:D, 7tlp:E, 7tlp:F, 7tlq:A, 7tlq:B, 7tlr:A, 7tlr:B
36	3vax:A	358	258	0.1565	0.1648	0.2287	0.20	3vax:B
37	2hzp:A	447	83	0.0531	0.0447	0.2410	0.68	3e9k:A
38	9boh:A	402	138	0.0875	0.0821	0.2391	0.81	9boh:B, 9bow:A, 9bow:B, 9bpe:A, 9bpe:B, 2dkj:A, 2dkj:B, 8ssy:A, 8ssy:B, 8sui:B
39	1b8g:B	425	95	0.0769	0.0682	0.3053	1.0	1b8g:A, 1m4n:A, 1m7y:A, 3piu:A, 1ynu:A
40	4ppm:A	464	132	0.1088	0.0884	0.3106	1.1	4ppm:B
41	3bof:A	560	73	0.0584	0.0393	0.3014	1.2	3bof:B, 3bol:A, 3bol:B, 1q8j:A, 1q8j:B
42	5v1x:D	447	82	0.0531	0.0447	0.2439	1.6	5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
43	8pkp:N	652	84	0.0557	0.0322	0.2500	1.8	9gaw:N
44	2cfb:A	360	111	0.0690	0.0722	0.2342	2.0
45	8ht4:B	390	177	0.1114	0.1077	0.2373	2.2	8ht4:A
46	1qvr:A	803	104	0.0769	0.0361	0.2788	2.4	4fcv:A, 4fcv:B, 4fcv:C, 4fcw:A, 4fcw:C, 4fcw:F, 4fd2:A, 4fd2:B, 4fd2:D, 4lj5:A, 4lj6:A, 4lj7:A, 4lj7:B, 4lj7:C, 4lj8:A, 4lj9:A, 4lja:A, 1qvr:B, 1qvr:C
47	8cpl:C	499	155	0.1034	0.0782	0.2516	3.7	8cpl:A, 8cpl:B, 8cpl:D, 1lp1:B, 4uox:A, 4uox:B, 4uox:C, 4uox:D, 4uoy:A, 4uoy:B, 4uoy:C, 4uoy:D
48	4obv:C	471	184	0.1167	0.0934	0.2391	4.4	4obu:E, 4obu:A, 4obu:U, 4obu:G, 4obu:H, 4obu:F, 4obu:B, 4obu:C, 4obv:D, 4obv:B, 4obv:A
49	6m4j:A	347	85	0.0504	0.0548	0.2235	4.5	6m4j:B
50	1vpe:A	398	50	0.0398	0.0377	0.3000	4.7
51	6kv9:A	299	50	0.0451	0.0569	0.3400	6.1	6kvc:A
52	2ctz:A	421	47	0.0424	0.0380	0.3404	6.2	2ctz:B
53	8d3z:A	399	27	0.0345	0.0326	0.4815	6.2	8d3t:A, 8d3t:B, 8d3t:C, 8d3z:B
54	5b7u:A	402	61	0.0345	0.0323	0.2131	6.5	5b7u:B, 5b87:A, 5b87:B, 5b89:A, 5b89:B
55	6dju:F	531	146	0.0981	0.0697	0.2534	7.4	6w6g:F
56	6wnn:A	420	59	0.0584	0.0524	0.3729	7.8	3dod:A, 3dod:B, 6wnn:B
57	3du4:A	448	59	0.0584	0.0491	0.3729	8.4	3du4:B
58	6w6i:F	605	146	0.0981	0.0612	0.2534	8.9	6w6j:F
59	5x6b:J	377	95	0.0451	0.0451	0.1789	9.6	5x6b:I
60	7x5o:B	412	113	0.0769	0.0704	0.2566	9.9	7v3d:A, 7v3d:B, 7x5n:A, 7x5n:B, 7x5o:A

[Back]