Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IRTEKIICRDVARGYENVPIPCVNGVDGEPCPEDYKYISENCETSTMNIDRNITHLQHCTCVDDCSSSNCLCGQLSIRCW
YDKDGRLLQEPPLIFECNQACSCWRNCKNRVVQSGIKVRLQLYRTAKMGWGVRALQTIPQGTFICEYVGELISDAEADVR
EDDSYLFDLDNKDGEVYCIDARYYGNISRFINHLCDPNIIPVRVFMLHQDLRFPRIAFFSSRDIRTGEELGFDYGDRFWD
IKSKYFTCQCGSEKCKHSAEAIALEQSR

The query sequence (length=268) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7x73:A 274 272 0.9963 0.9745 0.9816 0.0 7btv:A, 7btv:B, 7buc:A, 7buc:B, 7dcf:A, 7dcf:B, 5jhn:A, 5jhn:B, 5jin:A, 5jin:B, 5jiy:A, 5jiy:B, 5jj0:A, 5jj0:B, 3k5k:A, 3k5k:B, 4nvq:A, 4nvq:B, 2o8j:A, 2o8j:B, 2o8j:C, 2o8j:D, 3rjw:A, 3rjw:B, 5t0k:A, 5t0k:B, 5t0m:A, 5t0m:B, 7t7l:A, 7t7l:B, 7t7l:C, 7t7l:D, 5ttf:A, 5ttf:B, 5ttf:C, 5ttf:D, 5tuy:A, 5tuy:B, 5v9i:A, 5v9i:B, 5v9i:C, 5v9i:D, 5vsc:A, 5vsc:B, 5vse:A, 5vse:B, 7x73:B, 7xua:A, 7xua:B, 7xub:A, 7xub:B, 7xuc:A, 7xuc:B, 7xud:A, 7xud:B
2 3hna:A 280 261 0.7537 0.7214 0.7739 3.38e-160 3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
3 6z2a:A 283 265 0.3731 0.3534 0.3774 2.11e-45 6box:A, 6box:B, 6bp4:B, 6bp4:A, 1mvh:A, 1mvx:A, 6z2a:B
4 2r3a:A 270 241 0.3433 0.3407 0.3817 3.98e-44 6p0r:A, 6p0r:B
5 6a5m:A 488 270 0.3545 0.1947 0.3519 1.03e-41 6a5k:A
6 4qen:A 472 264 0.3433 0.1949 0.3485 2.46e-41 4qeo:A, 4qep:A
7 3bo5:A 269 244 0.3172 0.3160 0.3484 6.14e-39
8 6a5n:A 502 256 0.3246 0.1733 0.3398 1.42e-38
9 4nj5:A 482 263 0.3022 0.1680 0.3080 6.29e-37
10 1peg:A 266 188 0.2575 0.2594 0.3670 1.07e-31 1ml9:A, 1peg:B
11 5kjh:B 807 148 0.2127 0.0706 0.3851 3.35e-21 5m5g:B
12 5wf7:B 765 147 0.2127 0.0745 0.3878 4.38e-21 5kji:B
13 5tqr:B 809 148 0.2127 0.0705 0.3851 5.64e-21 5bjs:B, 5vk3:B
14 5jlb:A 248 170 0.2052 0.2218 0.3235 9.89e-21 7ea8:L, 4fmu:A, 4h12:A, 6j9j:A, 5jjy:A, 5jle:A, 5lss:A, 5lsx:A, 5lsy:A, 5lsz:A, 5lt6:A, 5lt6:B, 5lt7:A, 5lt8:A, 7lzb:A, 7lzd:A, 7lzf:A, 8q5p:A, 7ty2:A, 7ty3:A, 5v21:A, 5v22:A, 6vdb:A
15 5kkl:B 839 145 0.2090 0.0667 0.3862 1.06e-20
16 5wfd:B 774 114 0.1828 0.0633 0.4298 1.08e-19 5wfc:B
17 7td5:F 447 186 0.2425 0.1454 0.3495 2.98e-19
18 7td5:A 497 186 0.2425 0.1308 0.3495 3.46e-19
19 7kso:A 395 186 0.2425 0.1646 0.3495 3.47e-19 7ksr:A, 7ktp:A
20 8tas:E 570 186 0.2425 0.1140 0.3495 1.51e-18 8tb9:E
21 5hyn:A 581 186 0.2425 0.1119 0.3495 1.72e-18 5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
22 6wkr:C 606 186 0.2425 0.1073 0.3495 1.74e-18 4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
23 8t9g:C 536 186 0.2425 0.1213 0.3495 1.92e-18 8fyh:A, 8fyh:G
24 5ij7:B 469 186 0.2425 0.1386 0.3495 1.98e-18 6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
25 7at8:A 311 215 0.2612 0.2251 0.3256 2.19e-18
26 9c8u:A 475 186 0.2425 0.1368 0.3495 2.28e-18
27 5wg6:A 517 185 0.2425 0.1257 0.3514 4.90e-18 5wg6:C
28 6ine:A 247 174 0.2201 0.2389 0.3391 5.52e-18 6ago:A, 6ago:B, 3ope:A, 3ope:B, 6wzw:A, 6x0p:A, 6x0p:B, 6x0p:C, 6x0p:D, 4ynm:A, 4ynm:B, 4ynp:A, 4ynp:B, 4ypa:A, 4ypa:B, 4ypa:C, 4ypa:D, 4ype:A, 4ype:B, 4ypu:A, 4ypu:B
29 8fbh:A 232 172 0.2127 0.2457 0.3314 8.23e-18 8fbg:A, 8fbg:B, 6kqp:A, 6kqq:A, 6kqq:B, 3ooi:A
30 6cen:A 226 233 0.2575 0.3053 0.2961 1.98e-17 7crp:I, 7crq:L, 7crq:I, 7crr:I, 5upd:A
31 5lsu:A 231 170 0.2164 0.2511 0.3412 4.35e-17 7cro:I, 7e8d:K, 5lsu:B
32 6ugm:M 188 148 0.2052 0.2926 0.3716 8.59e-17
33 6ven:N 218 145 0.1978 0.2431 0.3655 1.03e-16
34 7ea5:K 228 165 0.2090 0.2456 0.3394 3.66e-16
35 2w5z:A 180 154 0.1978 0.2944 0.3442 4.10e-16 5f5e:A, 5f6l:A, 6pwv:C, 6pww:C, 7u5v:A, 6u9k:A, 6u9k:B, 6u9m:A, 6u9m:B, 6u9n:A, 6u9n:B, 6u9r:A, 6u9r:B, 2w5y:A, 7w67:C, 7w6a:C, 7w6i:C, 7w6j:C
36 6uh5:M 222 141 0.2015 0.2432 0.3830 1.25e-15 6chg:C
37 7bre:B 163 154 0.1791 0.2945 0.3117 6.56e-15 7bre:E
38 7w6l:C 158 159 0.1866 0.3165 0.3145 6.60e-15 5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
39 6nzo:S 233 162 0.1903 0.2189 0.3148 1.57e-14 6px3:S
40 6kiu:K 179 154 0.1903 0.2849 0.3312 2.23e-14 6kiv:K, 6kix:K, 6kiz:K, 7ud5:K
41 4z4p:A 161 159 0.1791 0.2981 0.3019 2.36e-10
42 7xpx:K 167 140 0.1679 0.2695 0.3214 2.83e-10 6boz:A, 6boz:B, 2bqz:A, 2bqz:E, 3f9w:B, 3f9w:A, 3f9w:C, 3f9w:D, 3f9x:B, 3f9x:A, 3f9x:C, 3f9x:D, 3f9y:A, 3f9y:B, 3f9z:B, 3f9z:A, 3f9z:C, 3f9z:D, 4ij8:A, 4ij8:B, 5t5g:A, 5teg:A, 5teg:B, 5th7:A, 5th7:B, 5w1y:A, 5w1y:B, 1zkk:A, 1zkk:B, 1zkk:C, 1zkk:D
43 4o30:A 217 134 0.1642 0.2028 0.3284 0.006 4o30:B, 5va6:A, 5va6:B, 5vac:A, 5vah:A, 5vah:B, 5vbc:A, 5vbc:B
44 8sr6:A 451 125 0.1231 0.0732 0.2640 0.038 5czy:A, 8swi:A
45 2g46:A 119 128 0.1231 0.2773 0.2578 0.36 2g46:B, 3kmt:A, 3kmt:B, 3kmt:C
46 4pbp:B 210 112 0.0896 0.1143 0.2143 0.73 4pbp:A, 4pbp:C
47 5ex0:A 429 64 0.0784 0.0490 0.3281 1.4 7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
48 6jau:A 283 73 0.0821 0.0777 0.3014 2.6
49 4au7:A 243 114 0.1119 0.1235 0.2632 3.5 4au7:B, 3rq4:A
50 4cys:A 534 65 0.0634 0.0318 0.2615 4.9 5aj9:A, 5aj9:B, 4cxk:A, 4cxk:B, 4cxs:A, 4cxs:B, 4cxu:A, 4cxu:B, 4cyr:A, 4cyr:B, 4cys:B, 1hdh:A, 1hdh:B
51 3urz:B 206 75 0.0896 0.1165 0.3200 7.9 3urz:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218