Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
IRPNHTIYINNMNDKIKKEELKRSLYALFSQFGHVVDIVALKTMKMRGQAFVIFKELGSSTNALRQLQGFPFYGKPMRIQ
YAKTDSDIISKM

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7abg:B 169 92 1.0000 0.5444 1.0000 2.59e-64 7a5p:X, 1a9n:B, 1a9n:D, 7abi:B, 6ah0:p, 6ahd:p, 8c6j:Y, 8ch6:s, 7evo:G, 9fmd:p, 8h6e:2C, 8h6j:2C, 8h6k:2C, 8h6l:2C, 8hk1:G, 8i0p:p, 8i0r:p, 8i0s:p, 8i0t:p, 8i0u:p, 8i0v:p, 8i0w:p, 6icz:p, 6id0:p, 6id1:p, 5mqf:X, 6qdv:Y, 8qo9:2B, 6qx9:2B, 8qxd:2B, 8qzs:2B, 8r08:2B, 8r09:2B, 8r0a:2B, 8r0b:2B, 8rm5:2B, 7vpx:G, 7w59:p, 7w5a:p, 7w5b:p, 5xjc:p, 6y53:b, 6y5q:b, 5yzg:p, 5z56:p, 5z57:p, 5z58:p
2 4pkd:B 240 91 0.7609 0.2917 0.7692 5.69e-50 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
3 6xh2:A 93 87 0.6630 0.6559 0.7011 4.68e-43 6cmn:A, 3k0j:D, 3k0j:C, 6xh0:A, 6xh1:A, 6xh3:A
4 6f4h:C 96 90 0.7391 0.7083 0.7556 4.90e-43 6f4g:B, 6f4g:E, 6f4h:A, 6f4h:E
5 8ro1:p 76 76 0.5217 0.6316 0.6316 4.23e-36
6 3jb9:k 89 87 0.5109 0.5281 0.5402 1.82e-29
7 7b9v:Y 88 85 0.2935 0.3068 0.3176 1.25e-14 6bk8:r, 7dco:p, 6exn:Y, 6g90:Y, 5gmk:a, 6j6g:a, 6j6h:a, 6j6n:a, 6j6q:a, 5lj3:Y, 5lj5:Y, 5mq0:Y, 5nrl:Y, 7oqb:Y, 7oqe:Y, 5wsg:X, 5y88:p, 5ylz:p, 5zwm:p, 5zwo:p
8 3lqv:B 115 67 0.2391 0.1913 0.3284 3.25e-07 2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
9 2fy1:A 108 82 0.2500 0.2130 0.2805 1.89e-06
10 7s7b:C 79 80 0.3043 0.3544 0.3500 4.00e-06 7s7b:G, 7s7c:C
11 7q33:A 93 86 0.2283 0.2258 0.2442 4.08e-06 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
12 2leb:A 101 81 0.2174 0.1980 0.2469 8.05e-04 2lec:A
13 7zew:A 117 80 0.2283 0.1795 0.2625 0.001 7zex:A
14 8i0v:4 161 86 0.2826 0.1615 0.3023 0.001
15 8i0v:4 161 80 0.2283 0.1304 0.2625 0.007
16 2n7c:A 89 74 0.1630 0.1685 0.2027 0.003
17 5mqf:o 223 85 0.2391 0.0987 0.2588 0.003 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
18 8xxm:3G 84 83 0.2283 0.2500 0.2530 0.009 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
19 2i2y:A 150 74 0.2065 0.1267 0.2568 0.009 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
20 7qde:B 169 59 0.1957 0.1065 0.3051 0.009 7qdd:B
21 2yka:A 124 90 0.2065 0.1532 0.2111 0.014
22 4f02:A 175 67 0.2174 0.1143 0.2985 0.016 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
23 6g90:B 193 68 0.2283 0.1088 0.3088 0.022
24 6dg0:B 84 80 0.2391 0.2619 0.2750 0.026 6dg0:A
25 4qqb:A 169 70 0.2283 0.1243 0.3000 0.034 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
26 6snj:A 131 46 0.1522 0.1069 0.3043 0.040 6gbm:B
27 6n7p:A 186 68 0.2283 0.1129 0.3088 0.046 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
28 8h6e:4R 106 77 0.1848 0.1604 0.2208 0.071 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
29 2adc:A 208 80 0.2391 0.1058 0.2750 0.25
30 7dco:4 174 64 0.2174 0.1149 0.3125 0.37 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
31 8ro0:O 342 49 0.1630 0.0439 0.3061 0.43 8ro1:O
32 8ro0:o 162 58 0.1413 0.0802 0.2241 0.55 8ro1:o
33 4uer:b 572 64 0.2283 0.0367 0.3281 0.65
34 5d2e:A 485 38 0.1630 0.0309 0.3947 0.79
35 6gsn:p 658 64 0.2283 0.0319 0.3281 0.96 8cah:p, 8cas:p, 6fyx:p, 6fyy:p, 6gsm:p, 6zce:p, 6zu9:p
36 8y6o:W 167 71 0.1848 0.1018 0.2394 1.7
37 1qo8:A 564 48 0.1413 0.0230 0.2708 1.7 1qo8:D
38 8xxn:3B 536 53 0.1413 0.0243 0.2453 1.8 6zon:B, 6zp4:B, 6zvj:B
39 8pj1:1 588 53 0.1413 0.0221 0.2453 2.2 6fec:w, 2krb:A, 8oz0:I, 8pj2:1, 8pj3:1, 8pj5:1, 8pj6:1
40 4yd1:A 334 27 0.1196 0.0329 0.4074 3.6 6aec:A, 6aeh:A, 6ak5:A, 6ak6:A, 6ak8:A, 6ak9:A, 6akh:A, 7co6:A, 7co8:A, 7co9:A, 7coa:A, 7cob:A, 7coc:A, 7cod:A, 6ipd:A, 6ipe:A, 6ipf:A, 6ipg:A, 6iph:A, 6ipi:A, 6ipj:A, 6ipk:A, 6ipl:A, 6ipm:A, 6ipn:A, 7kss:A, 7kst:A, 7ksu:A, 7ksv:A, 7ksw:A, 7ksx:A, 7ksy:A, 7ksz:A, 7kt0:A, 7kt1:A, 7kt2:A, 7kt3:A, 7kt4:A, 7kt5:A, 7kt6:A, 7kt7:A, 7kt8:A, 7kt9:A, 7kta:A, 7ktb:A, 7ktc:A, 7ktd:A, 7kte:A, 7ktf:A, 7ktg:A, 7kth:A, 7kti:A, 7ktj:A, 7ktk:A, 7ktl:A, 7ktm:A, 7ktn:A, 4lzg:A, 4m04:A, 4m0a:A, 6p1m:A, 6p1n:A, 6p1o:A, 6p1p:A, 6p1q:A, 6p1r:A, 6p1s:A, 6p1t:A, 6p1u:A, 6p1v:A, 6p1w:A, 5twp:A, 5twq:A, 5twr:A, 5tws:A, 5txx:A, 5txz:A, 5tyb:A, 5tyc:A, 5tyd:A, 5tye:A, 5tyf:A, 5tyg:A, 5tyu:A, 5tyv:A, 5tyw:A, 5tyx:A, 5tyy:A, 5tyz:A, 6vez:A, 6vf0:A, 6vf1:A, 6vf2:A, 6vf3:A, 6vf4:A, 6vf5:A, 6vf6:A, 6vf7:A, 6vf8:A, 6vf9:A, 6vfa:A, 6vfb:A, 6vfc:A, 5vz7:A, 5vz8:A, 5vz9:A, 5vza:A, 5vzb:A, 5vzc:A, 5vzd:A, 5vze:A, 5vzf:A, 5vzg:A, 5vzh:A, 5vzi:A, 6wic:A, 6wid:A, 6wie:A, 4ycx:A, 4yd2:A, 5zlc:A
41 6hx2:B 156 37 0.1304 0.0769 0.3243 5.1 6hui:D, 6hui:A, 6hui:B, 6hui:C, 6hui:E, 6hui:F, 6hx2:A, 6hx2:C, 6hx2:D, 6hx2:E, 6hx2:F, 2iy4:B, 2iy4:C, 2iy4:D, 2iy4:E, 2iy4:G, 2iy4:F, 2iy4:H, 2iy4:I, 2iy4:J, 2iy4:K, 2iy4:L, 2iy4:M, 2iy4:O, 2iy4:N, 2iy4:P, 2iy4:Q, 2iy4:S, 2iy4:R, 2iy4:T, 2iy4:U, 2iy4:X, 2iy4:V, 2iy4:Y, 1qgh:E, 1qgh:G, 1qgh:A, 1qgh:C, 1qgh:I, 1qgh:K, 1qgh:F, 1qgh:H, 1qgh:J, 1qgh:L, 1qgh:B, 1qgh:D, 6sev:A, 6sev:B, 6sev:D, 6sev:E
42 3cei:A 213 29 0.1196 0.0516 0.3793 6.7 3cei:B
43 2xn9:C 215 42 0.1304 0.0558 0.2857 7.2 1ewc:A, 1hxy:D
44 4dtf:A 356 48 0.1957 0.0506 0.3750 7.8 4dth:A, 4dtl:A, 4e1c:A, 4e1d:A, 4e1f:A, 4gqk:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218