BioLiP

>protein
IRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSL

The query sequence (length=48) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7w7t:A	1021	48	1.0000	0.0470	1.0000	1.02e-25	7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
2	5ztf:A	972	48	1.0000	0.0494	1.0000	1.75e-25
3	5zmw:A	1000	48	0.9792	0.0470	0.9792	5.69e-25	5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
4	8iwp:A	896	41	0.5833	0.0312	0.6829	1.32e-11	8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
5	8k1l:A	979	37	0.4167	0.0204	0.5405	1.83e-08
6	8d3x:A	989	37	0.3750	0.0182	0.4865	2.07e-07	8d3u:A, 8d3w:A
7	3b8e:A	998	37	0.3750	0.0180	0.4865	2.33e-07	3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
8	7wyu:A	993	37	0.3750	0.0181	0.4865	2.37e-07	3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
9	7efl:A	987	48	0.3958	0.0193	0.3958	4.54e-07	7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
10	7x20:A	986	37	0.3750	0.0183	0.4865	2.48e-06	8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
11	7nxf:A	829	41	0.3750	0.0217	0.4390	3.11e-06	7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
12	7vh6:A	768	47	0.3750	0.0234	0.3830	1.50e-05	7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
13	6zhh:A	883	41	0.5000	0.0272	0.5854	3.76e-05	6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
14	5ksd:A	833	37	0.2083	0.0120	0.2703	0.017	5ksd:B
15	7r21:J	336	21	0.1875	0.0268	0.4286	1.7	7r21:I, 7r21:K, 7r21:L, 7r21:M, 7r21:N, 7r21:O, 7r21:Q, 7r21:S, 7r2k:K, 7r2k:L, 7r2k:M, 7r2k:N, 7r2k:O, 7r2k:P, 7r2k:R, 7r2k:T, 7r2k:V, 7tr6:I, 7tr6:J, 7tr6:K, 7tr6:L, 7tr6:M, 7tr6:N, 7tr8:I, 7tr8:J, 7tr8:K, 7tr8:L, 7tr8:M, 7tr8:N, 7tr9:I, 7tr9:J, 7tr9:K, 7tr9:L, 7tr9:M, 7tr9:N, 7tra:H, 7tra:I, 7tra:J, 7tra:K, 7tra:L, 7tra:M
16	7r21:T	304	21	0.1875	0.0296	0.4286	1.9	7tr6:O, 7tr8:O, 7tr9:O, 7tra:N
17	6z2w:E	2325	37	0.2708	0.0056	0.3514	3.2	6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
18	8ieo:P	1031	31	0.1875	0.0087	0.2903	6.0	8iem:P
19	7vpk:A	1055	31	0.1875	0.0085	0.2903	6.9	8iek:P, 8ies:P, 7m5v:A, 7n70:A, 7n72:A, 7n73:A, 7n74:A, 7n77:A, 7n78:A, 7vpi:A, 7vpj:A, 7vpl:A
20	7m5x:A	1000	31	0.1875	0.0090	0.2903	7.5	7fjp:B, 7fjq:A, 8ien:P, 7m5y:A

[Back]