BioLiP

>protein
IREILKMGDPRLLRIADPVDHFDTPELHELVKDMFETMHDANGAGLAAPQIGVNLQVVIFGFGPPVPETVLINPTITPVS
QDMEEGWEGCLSVPGLRGAVSRFSMIKYHGFDQYGKPIDRVAEGFHARVVQHECDHLIGKLYPMRINDFAKFGFTEVLFP
D

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5kob:A	171	168	0.9938	0.9357	0.9524	6.90e-115	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
2	5hgw:A	174	168	0.7764	0.7184	0.7440	2.40e-83	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
3	6jfc:B	161	161	0.7205	0.7205	0.7205	2.59e-81	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
4	5cy7:A	171	169	0.6025	0.5673	0.5740	9.76e-66	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
5	1y6h:A	177	168	0.4969	0.4520	0.4762	2.40e-50	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
6	1ix1:A	169	143	0.3975	0.3787	0.4476	2.20e-35	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
7	6ck7:A	172	143	0.4161	0.3895	0.4685	9.37e-35	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
8	4dr8:A	188	155	0.3665	0.3138	0.3806	1.76e-29	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
9	6jex:A	172	140	0.3602	0.3372	0.4143	2.10e-29	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
10	6jes:A	159	154	0.3665	0.3711	0.3831	3.79e-27	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
11	1bs4:A	168	142	0.3416	0.3274	0.3873	5.82e-27	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
12	1ws1:A	151	149	0.3913	0.4172	0.4228	5.03e-26
13	3fwx:A	165	142	0.3478	0.3394	0.3944	3.80e-25	3fwx:B
14	4je6:A	193	159	0.3540	0.2953	0.3585	1.61e-24	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
15	5j46:A	169	140	0.3292	0.3136	0.3786	2.84e-23
16	3qu1:A	168	144	0.3354	0.3214	0.3750	5.40e-22	3qu1:B
17	3oca:A	179	163	0.3416	0.3073	0.3374	9.42e-22	3oca:B, 3u04:A
18	3cpm:A	184	149	0.3478	0.3043	0.3758	1.71e-21	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
19	3uwb:A	149	149	0.3665	0.3960	0.3960	1.83e-21	3uwa:A
20	3g5k:A	183	175	0.3354	0.2951	0.3086	8.62e-21	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
21	1jym:A	179	144	0.3043	0.2737	0.3403	3.19e-20	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
22	4wxl:C	165	136	0.3106	0.3030	0.3676	5.34e-20	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
23	3e3u:A	196	157	0.3478	0.2857	0.3567	8.89e-18
24	5mtc:A	137	137	0.3168	0.3723	0.3723	3.91e-17	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
25	2ew5:A	166	156	0.3292	0.3193	0.3397	7.23e-16	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
26	2os1:A	179	171	0.3354	0.3017	0.3158	4.77e-13
27	3cmd:B	188	169	0.3354	0.2872	0.3195	1.84e-12	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
28	2okl:A	185	171	0.3230	0.2811	0.3041	1.93e-12	2okl:B
29	5jex:A	203	188	0.3416	0.2709	0.2926	3.85e-11	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
30	6ow7:P	196	135	0.2795	0.2296	0.3333	5.63e-11	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
31	1lqy:A	184	167	0.3043	0.2663	0.2934	1.40e-10
32	2os3:A	205	143	0.3106	0.2439	0.3497	1.53e-10
33	1lm4:A	190	164	0.3106	0.2632	0.3049	1.95e-09	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
34	3l87:A	200	138	0.2857	0.2300	0.3333	4.66e-09
35	4jgi:B	206	72	0.1242	0.0971	0.2778	1.3	4jgi:A
36	5z7w:B	271	49	0.1118	0.0664	0.3673	1.5	5z7w:A
37	2ajr:A	320	45	0.0932	0.0469	0.3333	3.0	2ajr:B
38	3r0h:D	199	83	0.1304	0.1055	0.2530	5.3	3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
39	5lg8:A	173	41	0.0807	0.0751	0.3171	5.5	6ts0:AAA, 6ts1:AAA, 6tsa:AAA, 6tsf:AAA, 6tsj:AAA, 4v6b:AA, 4v6b:Ax, 4v6b:AO, 4v6b:BI, 4v6b:Bv, 4v6b:BW, 4v6b:Bf, 4v6b:BH, 4v6b:Cq, 4v6b:Cj, 4v6b:Cm, 4v6b:Cp

[Back]