Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
IQVLEGLEAVRKRPGMYIGSTSERGLHHLVWEIVDNSIDEALAGYANQIEVVIEKDNWIKVTDNGRGIPVDIQGRPAVEV
ILTSSVVNALSQDLEVYVHRNETIYHQAYKKGVPQFDLKEVGTTDKTGTVIRFKADGEIFTETTVYNYETLQQRIRELAF
LNKGIQITLRDERDEENVREDSYHYEG

The query sequence (length=187) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4urm:B 195 195 0.9626 0.9231 0.9231 7.96e-127 5cph:A, 5cph:B, 5ctu:A, 5ctu:B, 5ctw:A, 5ctw:B, 5ctx:B, 5cty:B, 5d6p:A, 5d6p:B, 5d6q:B, 5d7c:A, 5d7c:B, 5d7d:A, 5d7d:B, 5d7r:A, 5d7r:B, 3g75:A, 3g75:B, 3g7b:A, 3g7b:B, 4p8o:A, 4p8o:B, 6tck:A, 6tck:B, 3ttz:A, 3ttz:B, 6ttg:A, 6ttg:B, 3u2d:A, 3u2d:B, 3u2k:A, 3u2k:B, 4urm:A, 4urm:C, 4urm:D, 4uro:A, 4uro:B, 4uro:C, 4uro:D, 5z9p:A, 5z9p:B
2 4gee:A 193 192 0.6096 0.5907 0.5938 1.23e-72 4gfn:A, 4ggl:A, 4hxw:A, 4k4o:A, 4ksg:A, 4ksh:A, 4ktn:A
3 6y8o:A 188 192 0.5668 0.5638 0.5521 1.18e-65 4b6c:A, 4b6c:B, 6y8o:B
4 3zm7:A 359 194 0.5508 0.2869 0.5309 3.54e-62 3zm7:B, 3zm7:C, 3zm7:D, 3zm7:E, 3zm7:F
5 6y8l:A 184 189 0.5294 0.5380 0.5238 4.89e-61 6y8l:B, 6y8n:A, 6y8n:B
6 7ptf:A 212 214 0.5561 0.4906 0.4860 3.83e-60 8bn6:A, 6m1j:A, 6m1j:B, 6m1s:A, 6m1s:B, 7ptf:B, 7ptf:C, 7ptg:B
7 7ptg:A 183 175 0.5187 0.5301 0.5543 3.90e-60
8 4hz5:A 191 192 0.5615 0.5497 0.5469 3.95e-60 4hz5:B, 4hz5:C, 4hz5:D, 4hz5:E, 4hz5:F, 4hz5:G, 4hz5:J
9 6zt3:A 394 212 0.5668 0.2690 0.5000 4.73e-60 4bae:A, 4bae:B, 4bae:C, 4bae:D
10 9gbv:B 782 198 0.5668 0.1355 0.5354 2.56e-59 1aj6:A, 7c7n:A, 7c7o:A, 7dor:A, 7dor:B, 7dpr:A, 7dpr:B, 7dps:A, 7dps:B, 7dqf:A, 7dqf:B, 7dqh:A, 7dqh:B, 7dqi:A, 7dqi:B, 7dqj:A, 7dqj:B, 7dql:A, 7dql:B, 7dqm:A, 7dqm:B, 7dqs:A, 7dqs:B, 7dqu:A, 7dqu:B, 7dqw:A, 7dqw:B, 4duh:A, 4duh:B, 1ei1:A, 1ei1:B, 6eng:A, 6eng:B, 6f86:A, 6f8j:A, 6f94:A, 6f96:A, 3g7e:A, 9gbv:D, 9ggq:D, 9ggq:B, 4hyp:A, 4hyp:B, 4hyp:C, 4hyp:D, 6j90:A, 4kfg:A, 4kfg:B, 1kzn:A, 6kzv:A, 6kzx:A, 6kzz:A, 6l01:A, 5l3j:A, 5mmn:A, 5mmo:A, 5mmp:A, 7p2m:A, 7p2n:A, 7p2w:A, 7p2x:A, 4prv:A, 4prx:A, 4pu9:A, 8qdx:B, 8qdx:D, 8qqi:D, 8qqi:B, 8qqs:B, 8qqs:D, 8qqu:D, 6rku:D, 6rku:B, 6rkv:D, 6rkv:B, 6rkw:D, 6rkw:B, 4wub:A, 4wuc:A, 4wud:A, 4xtj:A, 6yd9:A, 5z4h:A, 5z4h:B, 5z4o:A, 5z4o:B, 5z9b:A, 5z9b:B, 5z9e:A, 5z9e:B, 5z9f:A, 5z9f:B, 5z9l:A, 5z9l:B, 5z9m:A, 5z9m:B, 5z9n:A, 5z9q:A, 5z9q:B, 7z9c:D, 7z9c:B, 7z9g:D, 7z9g:B, 7z9k:B, 7z9k:D, 7z9m:B, 7z9m:D, 4zvi:A, 5zxm:A, 5zxm:B
11 3zkb:D 392 217 0.5508 0.2628 0.4747 5.95e-59 3zkb:A, 3zkb:B, 3zkb:C, 3zkb:E, 3zkb:F, 3zkb:G, 3zkb:H, 3zkb:I, 3zkb:J, 3zkb:K, 3zkb:L, 3zkb:M, 3zkb:N, 3zkb:O, 3zkb:P, 3zkd:A, 3zkd:B, 3zkd:C, 3zkd:D, 3zkd:E, 3zkd:F, 3zkd:G, 3zkd:H
12 4url:A 364 194 0.5668 0.2912 0.5464 1.69e-58 4url:B, 4urn:A, 4urn:B, 4urn:C
13 7pqi:A 198 201 0.5348 0.5051 0.4975 2.36e-57 7pql:A, 7pql:B, 7pqm:A, 7pqm:B
14 6gau:A 1088 171 0.5027 0.0864 0.5497 3.65e-53 5bs8:A, 5bs8:B, 5bs8:C, 5bs8:D, 5bta:A, 5bta:B, 5bta:C, 5bta:D, 5btc:A, 5btc:B, 5btc:C, 5btc:D, 5btd:A, 5btd:B, 5btd:C, 5btd:D, 5btf:A, 5btf:B, 5btf:C, 5btf:D, 5btg:A, 5btg:B, 5btg:C, 5btg:D, 5bti:A, 5bti:B, 5bti:C, 5bti:D, 5btl:A, 5btl:B, 5btl:C, 5btl:D, 5btn:A, 5btn:B, 5btn:C, 5btn:D, 9foy:A, 9foy:B, 6gau:B, 7ugw:A, 7ugw:B, 7ugw:C, 7ugw:D
15 5j5p:A 397 214 0.5348 0.2519 0.4673 3.67e-53 5boc:A, 5bod:A, 4em7:A, 4emv:A, 5j5p:B, 5j5q:B, 5j5q:A, 5j5q:C, 5j5q:D, 4lp0:A, 4lpb:A, 4mb9:A, 4mbc:A, 4mot:A, 5yig:A, 5yig:B
16 3fv5:B 181 175 0.4118 0.4254 0.4400 3.27e-39 3fv5:A, 1s14:A, 1s14:B
17 1kij:A 384 199 0.4439 0.2161 0.4171 9.78e-38 6enh:A, 1kij:B
18 4i3h:A 1037 194 0.4599 0.0829 0.4433 4.61e-37 3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
19 7cmp:A 374 214 0.4385 0.2193 0.3832 2.69e-36 7cmp:B, 7cmp:C, 7cmp:D, 3lps:A
20 1s16:A 380 200 0.4278 0.2105 0.4000 4.90e-36 4hz0:A, 4hz0:B, 1s16:B
21 4hxz:A 366 204 0.4064 0.2077 0.3725 1.94e-33 4hxz:B, 4hy1:A, 4hy1:B, 4hym:A, 4kqv:A, 4kqv:B
22 8yon:C 605 101 0.2193 0.0678 0.4059 8.58e-11 9imj:A, 8ylu:C, 8ylu:D, 8yo1:C, 8yo1:D, 8yo7:D, 8yo7:C, 8yod:C, 8yod:D, 8yon:D
23 7ebg:A 337 53 0.0909 0.0504 0.3208 0.010 2zdx:A
24 3d2r:B 362 58 0.1016 0.0525 0.3276 0.036 3d2r:A, 2e0a:A, 2e0a:B, 7eat:A, 7eat:B, 7ebb:A, 7ebb:B, 7ebg:B, 2zdx:B, 2zdy:A, 2zdy:B, 2zkj:A, 2zkj:B
25 8sbm:B 126 46 0.0963 0.1429 0.3913 0.048 8sbm:A, 3zxo:A, 3zxo:B
26 6eqo:A 1804 49 0.0856 0.0089 0.3265 0.26 6eqo:B
27 2q8g:A 368 80 0.1283 0.0652 0.3000 0.66 2q8h:A
28 4gfh:A 1102 116 0.1711 0.0290 0.2759 0.82 4gfh:F, 3l4j:A, 3l4k:A, 1pvg:A, 1pvg:B, 1qzr:A, 1qzr:B, 2rgr:A
29 6lzj:A 245 48 0.1070 0.0816 0.4167 0.91 6lzi:A
30 8g8e:X 140 44 0.0642 0.0857 0.2727 1.6 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
31 3l1p:A 147 51 0.0642 0.0816 0.2353 2.4 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
32 7l6s:A 396 73 0.1230 0.0581 0.3151 2.8
33 2zbk:B 506 88 0.1230 0.0455 0.2614 3.4 2hkj:A, 1mu5:A, 1mx0:A, 1mx0:B, 1mx0:C, 1mx0:D, 1mx0:E, 1mx0:F, 1z59:A, 1z5a:A, 1z5a:B, 1z5b:A, 1z5b:B, 1z5c:A, 1z5c:B, 2zbk:D, 2zbk:F, 2zbk:H
34 4r3a:B 278 45 0.0802 0.0540 0.3333 3.7
35 4r1f:A 366 88 0.1390 0.0710 0.2955 7.0 1zxn:A
36 3tz6:A 342 47 0.0749 0.0409 0.2979 7.5 3vos:A
37 8bw6:A 99 36 0.0749 0.1414 0.3889 8.7
38 8p23:B 715 38 0.0695 0.0182 0.3421 8.8 8p23:A, 8p27:A, 8p27:B, 8p28:A, 8p28:B, 8p28:C, 8p28:D, 8p2c:A, 8p2c:B, 8p2c:C, 8p2c:D, 8p2d:A, 8p2d:B, 8p2s:A, 8p2s:B, 8p39:A, 8p39:B
39 5j71:A 338 53 0.0749 0.0414 0.2642 8.9
40 6zy7:B 1160 88 0.1390 0.0224 0.2955 9.0 4fm9:A, 5gwk:A, 5gwk:B, 4r1f:B, 4r1f:C, 4r1f:D, 1zxm:A, 1zxm:B, 1zxn:B, 1zxn:C, 1zxn:D, 6zy5:B, 6zy5:A, 6zy6:A, 6zy6:B, 6zy7:A, 6zy8:A, 6zy8:B
41 3crl:B 383 53 0.0695 0.0339 0.2453 10.0 2bu2:A, 2bu5:A, 2bu6:A, 2bu7:A, 2bu8:A, 3crk:A, 3crk:B, 3crl:A, 7ea0:A, 7eas:A, 7ebh:A, 5j6a:A, 1jm6:A, 1jm6:B, 6lil:A, 6lil:B, 6lin:A, 6lin:B, 6lin:C, 6lin:D, 6lio:A, 6lio:B, 5m4k:A, 5m4m:A, 5m4n:A, 5m4p:A, 4mp2:A, 4mp7:A, 4mpc:A, 4mpe:A, 4mpn:A, 6tmp:AAA, 6tmq:AAA, 6tmz:AAA, 6tn0:AAA, 6tn2:AAA, 4v25:A, 4v26:A, 7vbu:A, 7vbv:A, 7vbv:B, 7vbx:A, 8zm1:A, 8zm2:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218