BioLiP

>protein
IPKFKRLPRHIAIIPDGNRRWALARGLEKHEGYSSGIIPGLEVYDICVKIGIGEVTFFGFTQDNTKRPQIQRKAFTDACI
KSVQEIAKRDAEILVVGNTNSDIFPEELLEYTKRTKVGIKINFLINYGWYWDLTYAYMIENIASAEIPRVDLLIRWGGRC
RLSGMLPVQTVYSDIYVVDEMWPDFKPEHLFKALEFYQNQ

The query sequence (length=200) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cav:B	222	211	1.0000	0.9009	0.9479	2.72e-145	7caq:A, 7caq:B, 7car:A, 7car:B, 7cas:B, 7cav:A, 7cav:C, 7cav:D, 7cav:E, 7cav:F, 7cav:G, 7cav:H, 7cc3:A, 7cc3:B, 7cc3:C, 7cc3:D, 7cc3:E, 7cc3:F, 7cc3:G, 7cc3:H
2	7vqb:A	207	206	0.8750	0.8454	0.8495	5.95e-131	7vq9:A, 7vq9:B, 7vqa:A, 7vqa:B, 7vqb:B, 7vqc:B, 7vqd:A, 7vqd:B
3	8kgb:C	245	224	0.3700	0.3020	0.3304	9.63e-28	8kgb:A, 8kgb:B, 8kgb:D, 8x35:A, 8x35:B, 8x36:A, 8x36:B, 8x37:A, 8x37:B
4	5hxq:C	227	219	0.3350	0.2952	0.3059	1.73e-24	5hxp:A, 5hxp:C, 5hxq:A, 5hxt:A, 5hxt:B
5	1x07:A	231	223	0.2900	0.2511	0.2601	5.71e-23	5cqj:A, 2e98:A, 2e98:B, 2e99:A, 2e99:B, 2e9a:A, 2e9a:B, 2e9c:A, 2e9c:B, 2e9d:A, 2e9d:B, 4h2j:A, 4h2j:B, 4h2m:A, 4h2m:B, 4h2o:B, 4h2o:A, 4h38:A, 4h3a:A, 4h3a:B, 4h3c:A, 4h3c:B, 1jp3:A, 3sgt:B, 3sgv:B, 3sgv:A, 3sgx:A, 3sh0:B, 3sh0:A, 3th8:B, 1ueh:A, 1ueh:B, 1v7u:A, 3wyj:A, 1x06:A, 1x08:A, 1x09:A
6	4u82:A	236	225	0.2950	0.2500	0.2622	1.18e-22	4h8e:A, 3wyi:A
7	6szg:A	222	223	0.3000	0.2703	0.2691	2.65e-22	6szg:B, 6szh:B
8	4q9o:A	240	228	0.3200	0.2667	0.2807	1.77e-21	5kh4:A, 5kh4:B, 5kh5:B, 4q9m:A, 4q9m:B, 4q9o:B
9	5zhe:B	200	215	0.2750	0.2750	0.2558	4.39e-19
10	7jlr:A	237	225	0.2950	0.2489	0.2622	3.52e-18	7jlj:A, 7jlm:A, 7jlm:B
11	6ime:A	285	224	0.3050	0.2140	0.2723	2.29e-17	6ime:B, 4onc:A, 4onc:B, 2vg2:A, 2vg2:C, 2vg2:B, 2vg2:D, 2vg3:A, 2vg3:C, 2vg3:B, 2vg3:D
12	7pay:A	329	232	0.3100	0.1884	0.2672	1.69e-16	7pax:A, 7pb0:A, 7pb1:A, 6w2l:A, 6z1n:A
13	2vg1:A	228	227	0.2950	0.2588	0.2599	1.41e-14	2vg0:A, 2vg0:B, 2vg1:B
14	5hc8:A	236	226	0.2700	0.2288	0.2389	1.69e-14	5hc7:A
15	3ugs:B	208	212	0.2350	0.2260	0.2217	8.95e-11	3ugs:A
16	5ygk:C	217	193	0.2150	0.1982	0.2228	1.55e-06	5gul:A, 5gul:B, 5gul:C, 5gul:D, 5ygk:A, 5ygk:B, 5ygk:H, 5ygk:D, 5ygk:E, 5ygk:F, 5ygk:G
17	5xk6:A	218	205	0.2100	0.1927	0.2049	3.78e-04	5xk6:B, 5xk6:C, 5xk6:D, 5xk7:A, 5xk7:B, 5xk7:C, 5xk7:D, 5xk8:A, 5xk8:B, 5xk8:C, 5xk8:D, 5xk9:A, 5xk9:B, 5xk9:C, 5xk9:D, 5xk9:E, 5xk9:F, 5xk9:G, 5xk9:H
18	8aaf:e	1527	37	0.0700	0.0092	0.3784	1.8	8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
19	1bdm:B	327	30	0.0650	0.0398	0.4333	2.4	1bdm:A, 1bmd:A, 1bmd:B, 2cvq:A, 2cvq:B, 1wze:A, 1wze:B, 1wzi:A, 1wzi:B, 1y7t:A, 1y7t:B
20	3pxx:A	282	37	0.0700	0.0496	0.3784	2.8	3pxx:B, 3pxx:C, 3pxx:D, 3pxx:E, 3pxx:F
21	8r3p:A	672	58	0.0750	0.0223	0.2586	4.4	8r3p:B, 8r3p:C, 8r3p:D
22	3tho:B	366	64	0.1050	0.0574	0.3281	4.8	6asc:A, 6asc:B, 4nzv:A, 4nzv:B, 4o24:A, 4o24:B, 4o43:A, 4o43:B, 4o4k:A, 4o4k:B, 4o5g:A, 4o5g:B, 3thn:A, 6x1y:A, 6x1y:B, 6x1z:A, 6x1z:B
23	6agm:A	334	49	0.0950	0.0569	0.3878	6.3	6agm:B, 6agm:C, 6agm:D
24	2gsr:A	207	44	0.0800	0.0773	0.3636	7.1	2gsr:B

[Back]