Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNSVSLEEVTHEEAVTALKNTSD
FVYLKVAKP

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7pc3:A 405 89 0.9775 0.2148 0.9775 1.17e-56 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
2 2ka9:A 189 89 0.8876 0.4180 0.8876 2.39e-52 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
3 2ka9:A 189 86 0.5281 0.2487 0.5465 4.01e-24 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 8bq8:C 93 89 0.6629 0.6344 0.6629 7.61e-36 8bq8:A, 8bq8:B
5 8cn1:H 101 89 0.5393 0.4752 0.5393 5.51e-26 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 8c1t:A 90 87 0.4607 0.4556 0.4713 7.59e-24 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
7 7p73:A 420 84 0.4494 0.0952 0.4762 3.23e-20 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 6xa7:B 96 80 0.4157 0.3854 0.4625 1.65e-19 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
9 2m0z:A 97 88 0.4382 0.4021 0.4432 3.21e-17 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 4xhv:A 94 89 0.3820 0.3617 0.3820 2.05e-14
11 8b82:A 108 88 0.3708 0.3056 0.3750 2.04e-13 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
12 3jxt:A 96 87 0.3820 0.3542 0.3908 5.25e-13 3jxt:B
13 4wyu:A 201 92 0.4045 0.1791 0.3913 6.64e-13 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
14 4wyu:A 201 78 0.3146 0.1393 0.3590 3.06e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
15 2exg:A 101 84 0.3820 0.3366 0.4048 1.91e-11 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
16 8bv7:A 95 60 0.3146 0.2947 0.4667 2.07e-11 8buw:A, 8buw:B
17 5heb:A 119 77 0.3371 0.2521 0.3896 2.71e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
18 1n7t:A 103 90 0.3820 0.3301 0.3778 8.90e-11 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
19 2r4h:C 98 85 0.3034 0.2755 0.3176 1.18e-10
20 2pdz:A 86 75 0.3820 0.3953 0.4533 2.28e-10
21 2kaw:A 90 64 0.3034 0.3000 0.4219 2.66e-10 6lcb:A, 2mx6:A
22 2koh:A 111 70 0.3258 0.2613 0.4143 2.82e-10 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
23 7weg:B 96 74 0.3483 0.3229 0.4189 3.99e-10 7weg:A
24 7qqm:A 413 85 0.4157 0.0896 0.4353 4.12e-10
25 5wou:A 95 87 0.3483 0.3263 0.3563 4.30e-10
26 2l4t:A 124 84 0.3820 0.2742 0.4048 6.45e-10 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
27 1l6o:A 95 65 0.2921 0.2737 0.4000 7.63e-10 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
28 7p70:A 407 75 0.3708 0.0811 0.4400 9.63e-10 7pc4:A, 7qql:A
29 3ch8:A 190 79 0.3596 0.1684 0.4051 1.62e-09 2qbw:A
30 6x23:A 89 87 0.3034 0.3034 0.3103 4.29e-09
31 6gbe:A 119 90 0.3258 0.2437 0.3222 5.73e-09
32 7pc5:A 405 73 0.3258 0.0716 0.3973 6.46e-09
33 6q0m:B 94 90 0.3483 0.3298 0.3444 9.65e-09
34 6zbq:A 89 51 0.2247 0.2247 0.3922 4.77e-08 6zc4:A
35 4e34:A 87 77 0.3371 0.3448 0.3896 6.25e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
36 8bp4:A 93 66 0.3258 0.3118 0.4394 6.36e-08 8bp4:C, 8bp4:B
37 2i0i:A 81 82 0.3483 0.3827 0.3780 1.71e-07 2i0i:B, 2i0i:C
38 1n7f:A 86 87 0.3483 0.3605 0.3563 2.38e-07 1n7f:B
39 2qt5:A 194 74 0.2697 0.1237 0.3243 2.64e-07 2qt5:B
40 2qt5:A 194 77 0.2809 0.1289 0.3247 2.87e-06 2qt5:B
41 7qqn:C 414 76 0.3146 0.0676 0.3684 8.56e-07 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
42 7d6f:A 87 76 0.2584 0.2644 0.3026 2.14e-06
43 7qct:A 90 58 0.2135 0.2111 0.3276 2.52e-06 7qct:B
44 5zys:A 90 77 0.2809 0.2778 0.3247 6.62e-06
45 2m0u:A 117 86 0.3034 0.2308 0.3140 7.13e-06
46 2ejy:A 85 56 0.2022 0.2118 0.3214 1.31e-05
47 7pcb:A 415 80 0.2809 0.0602 0.3125 1.56e-05 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
48 3tsz:A 341 74 0.3146 0.0821 0.3784 3.08e-05 3shw:A
49 7x2e:A 163 79 0.3034 0.1656 0.3418 6.21e-05 2kbs:A
50 2os6:A 89 61 0.2472 0.2472 0.3607 9.92e-05
51 1b8q:A 127 65 0.2360 0.1654 0.3231 9.96e-05
52 6nid:B 88 58 0.1798 0.1818 0.2759 1.66e-04 6nid:A, 6nid:C
53 1u38:A 89 52 0.2022 0.2022 0.3462 1.71e-04
54 6kz1:A 97 69 0.2584 0.2371 0.3333 1.92e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
55 2kpl:A 129 77 0.2360 0.1628 0.2727 1.97e-04
56 5n7d:A 423 76 0.2360 0.0496 0.2763 2.77e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
57 4wsi:A 372 60 0.1910 0.0457 0.2833 7.05e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
58 1ihj:B 95 74 0.2584 0.2421 0.3108 8.25e-04 1ihj:A
59 3bpu:A 86 75 0.2360 0.2442 0.2800 0.002
60 3vqg:A 85 57 0.1685 0.1765 0.2632 0.004
61 4xh7:A 110 65 0.2360 0.1909 0.3231 0.007
62 6ar4:B 87 58 0.2022 0.2069 0.3103 0.093 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
63 6hks:B 94 69 0.2360 0.2234 0.3043 0.095 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
64 5ez0:D 95 69 0.2022 0.1895 0.2609 0.40 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
65 3cyy:B 81 47 0.1573 0.1728 0.2979 0.41 3cyy:A
66 3d8f:A 127 67 0.1798 0.1260 0.2388 0.41 3d8f:C
67 3r0h:D 199 82 0.2360 0.1055 0.2561 0.60 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
68 5f67:A 98 54 0.1910 0.1735 0.3148 1.1 5f67:B
69 3la4:A 837 65 0.2360 0.0251 0.3231 1.2
70 1zub:A 109 58 0.2135 0.1743 0.3276 1.2
71 2egn:A 83 53 0.1685 0.1807 0.2830 2.1
72 7pog:A 2382 38 0.1124 0.0042 0.2632 2.8 4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
73 5k4w:C 321 42 0.1461 0.0405 0.3095 3.8 5k4q:A, 5k4q:B, 5k4q:C, 5k4q:D, 5k4q:E, 5k4q:F, 5k4u:A, 5k4u:C, 5k4v:A, 5k4v:C, 5k4w:A, 5k4y:A, 5k4y:B, 5k4y:C, 5k4y:D, 5k4y:E, 5k4y:F, 5k50:A, 5k50:C, 5k50:E, 5k50:G, 5k50:I, 5k50:J, 5lc1:A, 5lc1:B, 5lc1:C, 5lc1:D, 5lc1:E, 5lc1:F
74 4g7e:B 833 69 0.2247 0.0240 0.2899 4.4
75 7t2r:C 152 61 0.1798 0.1053 0.2623 5.7 7t2r:H
76 8c05:A 305 30 0.1461 0.0426 0.4333 7.8
77 3jqo:B 130 38 0.1348 0.0923 0.3158 8.0 3jqo:E, 3jqo:H, 3jqo:K, 3jqo:N, 3jqo:Q, 3jqo:T, 3jqo:W, 3jqo:Z, 3jqo:c, 3jqo:f, 3jqo:i, 3jqo:l, 3jqo:o, 2ofq:A, 3zbi:B, 3zbi:E, 3zbi:H, 3zbi:K, 3zbi:N, 3zbi:Q, 3zbi:T, 3zbi:W, 3zbi:Z, 3zbi:c, 3zbi:f, 3zbi:i, 3zbi:l, 3zbi:o
78 8xud:D 651 39 0.1236 0.0169 0.2821 8.3 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218