BioLiP

>protein
ILQHPDGTVLKQLQPPPRGPRELEFYNMVYAADCFDGVLLELRKYLPKYYGIWSPPTAPNDLYLKLEDVTHKFNKPCIMD
VKIGQKSYDPFASSEKIQQQVSKYPLMEEIGFLVLGMRVYHVHSDSYETENQHYGRSLTKETIKDGVSRFFHNGYCLRKD
AVAASIQKIEKILQWFENQKQLNFYASSLLFVYEGSSGGEVEVRMIDFAHVFPSNTIDEGYVYGLKHLISVLRSILDN

The query sequence (length=238) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5w2i:A	239	239	1.0000	0.9958	0.9958	1.85e-179	6m88:A, 6m89:A, 6m8a:A, 6m8b:A, 6m8c:A, 6m8d:A, 6m8e:A, 5w2h:A
2	4o4e:A	246	247	0.2731	0.2642	0.2632	7.02e-22	4o4d:A, 4o4f:A, 8omi:A
3	2iew:A	258	263	0.3193	0.2946	0.2890	6.20e-20	2if8:A
4	8t8z:A	217	240	0.2647	0.2903	0.2625	1.82e-11	8t8u:A, 8t8v:A, 8t8w:A, 8t8x:A, 8t8y:A, 8t90:A, 8t91:A, 8t92:A, 8t93:A, 8t95:A, 8t96:A, 8t97:A
5	2aqx:A	289	251	0.2479	0.2042	0.2351	1.89e-08	2aqx:B
6	8ppg:B	243	217	0.2017	0.1975	0.2212	6.18e-07
7	2a98:A	259	239	0.2311	0.2124	0.2301	1.78e-06
8	8ppb:A	276	252	0.2395	0.2065	0.2262	4.35e-05	8pp8:A, 8pp8:B, 8pp9:A, 8pp9:B, 8ppa:A, 8ppa:B, 8ppb:B, 8ppc:A, 8ppc:B, 8ppd:A, 8ppd:B, 8ppe:A, 8ppe:B, 8ppf:A, 8ppf:B, 8ppg:A, 8pph:A, 8pph:B, 8ppi:A, 8ppi:B, 8ppj:A, 8ppj:B, 1tzd:A, 1tzd:B, 1w2c:A, 1w2c:B, 1w2d:A, 1w2d:B
9	6mrj:B	142	96	0.0924	0.1549	0.2292	4.8	2cad:A, 2cad:B, 3lgh:A, 3lgh:B, 3lgh:C, 3lgh:D, 6mrj:A, 6mrj:C, 6mrj:D, 3pht:A, 3pht:B, 3qsi:B, 3qsi:C, 3qsi:D, 3qsi:A, 3qsi:F, 3qsi:G, 3qsi:H, 3qsi:E, 3qsi:I, 2wvf:B, 2y3y:A, 2y3y:B, 2y3y:C, 2y3y:D
10	4laj:A	343	38	0.0546	0.0379	0.3421	5.6	4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
11	2gdz:A	266	25	0.0504	0.0451	0.4800	6.9	8cvn:A, 8cvn:B, 8cwl:A, 8cwl:B
12	6xyw:Bv	149	43	0.0588	0.0940	0.3256	9.0
13	8d0y:G	455	38	0.0546	0.0286	0.3421	9.9	5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G

[Back]