BioLiP

>protein
ILPDSVDWREKGCVTEVKYQGSCGACWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSTEKYGNKGCNGGFMTTAFQYII
DNKGIDSDASYPYKAMDQKCQYDSKYRAATCSKYTELPYGREDVLKEAVANKGPVSVGVDARHPSFFLYRSGVYYEPSCT
QNVNHGVLVVGYGDLNGKEYWLVKNSWGHNFGEEGYIRMARNKGNHCGIASFPSYPEI

The query sequence (length=218) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5qcd:A	223	218	0.9954	0.9731	0.9954	1.83e-164	2f1g:A, 2f1g:B, 2fq9:A, 2fq9:B, 2fra:A, 2fra:B, 2frq:A, 2frq:B, 2ft2:A, 2ft2:B, 2fud:A, 2fud:B, 2fye:A, 2g6d:A, 2g7y:A, 2g7y:B, 9gj2:A, 9gj2:B, 2h7j:A, 2h7j:B, 2hh5:B, 2hh5:A, 2hhn:B, 2hxz:A, 2hxz:B, 2hxz:C, 3iej:A, 3iej:B, 1ms6:A, 3n3g:A, 3n3g:B, 3n4c:A, 3n4c:B, 1npz:A, 1npz:B, 1nqc:A, 2op3:A, 2op3:B, 3ovx:A, 3ovx:B, 4p6e:A, 4p6e:B, 4p6g:A, 4p6g:B, 4p6g:C, 4p6g:D, 8pi3:A, 5qbu:A, 5qbu:B, 5qbv:A, 5qbv:B, 5qbw:A, 5qbx:A, 5qbx:B, 5qby:A, 5qby:B, 5qbz:A, 5qc0:A, 5qc0:B, 5qc1:A, 5qc1:B, 5qc2:A, 5qc2:B, 5qc3:A, 5qc3:B, 5qc4:A, 5qc4:B, 5qc5:A, 5qc5:B, 5qc6:A, 5qc6:B, 5qc7:A, 5qc7:B, 5qc8:A, 5qc8:B, 5qc9:A, 5qc9:B, 5qca:A, 5qca:B, 5qcb:A, 5qcb:B, 5qcc:A, 5qcc:B, 5qce:A, 5qce:B, 5qcf:A, 5qcg:A, 5qcg:B, 5qch:A, 5qch:B, 5qch:D, 5qch:C, 5qci:A, 5qcj:A, 5qcj:B, 5qcj:C, 2r9m:A, 2r9m:B, 2r9n:A, 2r9n:B, 2r9o:A, 2r9o:B, 8rnd:A, 6yyn:AAA, 6yyn:BBB, 6yyo:AAA, 6yyo:BBB, 6yyp:AAA, 6yyq:AAA, 6yyq:BBB, 6yyq:CCC, 6yyr:AAA, 6yyr:BBB
2	4bpv:A	219	218	0.8165	0.8128	0.8165	1.78e-133	4bpv:B, 4bpv:C, 4bpv:D, 4bpv:E, 4bqv:A, 4bqv:B, 4bqv:C, 4bqv:D, 4bqv:E, 4bqv:F, 4bqv:G, 4bqv:H, 4bs5:A, 4bs6:A, 4bs6:B, 4bsq:A, 4mzo:A, 4mzo:B, 4mzo:C, 4mzo:D, 4mzo:E, 4mzo:F, 4mzo:G, 4mzo:H, 4mzs:A, 4mzs:B
3	8iui:A	218	219	0.5826	0.5826	0.5799	2.16e-87	8iui:B
4	5j94:A	223	217	0.5734	0.5605	0.5760	1.02e-86	6ash:A, 1atk:A, 2ato:A, 1au0:A, 1au2:A, 1au3:A, 1au4:A, 2aux:A, 2auz:A, 1ayu:A, 1ayv:A, 1ayw:A, 2bdl:A, 1bgo:A, 8c3d:A, 3c9e:A, 4dmx:A, 4dmy:A, 4dmy:B, 2f7d:A, 2ftd:A, 2ftd:B, 3h7d:A, 3h7d:E, 6hgy:A, 5ja7:A, 5ja7:B, 3kw9:A, 3kwb:X, 3kwb:Y, 3kwz:A, 3kx1:A, 1mem:A, 1nl6:A, 1nl6:B, 1nlj:A, 1nlj:B, 7nxl:AAA, 7nxm:A, 3o0u:A, 3o1g:A, 3ovz:A, 6pxf:A, 1q6k:A, 6qbs:A, 6qbs:B, 7qbl:A, 7qbm:A, 7qbn:A, 7qbo:A, 6ql8:A, 6qlm:A, 6qlm:B, 6qlw:A, 6qlw:B, 6qlw:C, 6qlw:D, 6qlx:A, 6qm0:A, 6qm0:B, 2r6n:A, 1snk:A, 5tdi:A, 1tu6:A, 1tu6:B, 1u9v:A, 1u9w:A, 1u9x:A, 1vsn:A, 4x6h:A, 4x6i:A, 4x6j:A, 1yk7:A, 1yk8:A, 1yt7:A, 4yv8:A
5	7q8g:AA	222	222	0.5688	0.5586	0.5586	2.57e-85	1fh0:A, 1fh0:B, 7q8d:AA, 7q8d:BA, 7q8f:BA, 7q8f:AA, 7q8g:BA, 7q8h:AA, 7q8h:BA, 7q8i:AA, 7q8i:BA, 7q8j:AA, 7q8j:BA, 7q8k:AA, 7q8k:BA, 7q8l:AA, 7q8l:BA, 7q8m:AA, 7q8m:BA, 7q8n:AA, 7q8n:BA, 7q8o:BA, 7q8o:AA, 7q8p:AA, 7q8p:BA, 7q8q:AA, 7q8q:BA, 7q9c:AA, 7q9c:BA, 7q9h:AA, 7q9h:BA, 7qff:AA, 7qff:BA, 7qfh:AA, 7qfh:BA, 7qgw:A, 7qgw:B, 7qhj:AA, 7qhj:BA, 7qhk:AA, 7qhk:BA, 7qns:AA, 7qns:BA, 7qo2:AA, 7qo2:BA
6	6jd0:A	314	220	0.5505	0.3822	0.5455	9.99e-85	8a4u:A, 8a4u:B, 8a4u:C, 8a4u:D, 8a4v:A, 8a4v:B, 8a4v:C, 8a4v:D, 8a4w:A, 8a4w:B, 8a4w:C, 8a4w:D, 8a4x:A, 8a4x:B, 8a4x:C, 8a4x:D, 8a5b:A, 8a5b:B, 8a5b:C, 8a5b:D, 8ahv:A, 8ahv:B, 8ahv:C, 8ahv:D, 4axl:A, 4axm:A, 4axm:B, 4axm:F, 4axm:I, 4axm:L, 4axm:O, 8b4f:A, 8b4f:B, 8b4f:C, 8b4f:D, 3bc3:A, 3bc3:B, 8c77:A, 8c77:B, 8c77:C, 8c77:D, 6ezp:A, 6ezx:A, 6ezx:B, 5f02:A, 6f06:A, 6f06:B, 8gx2:A, 8gx2:B, 3h89:A, 3h89:B, 3h89:C, 3h89:D, 3h89:E, 3h89:F, 3h8b:A, 3h8b:B, 3h8b:C, 3h8b:F, 3h8b:D, 3h8b:E, 3h8c:A, 3h8c:B, 8het:A, 8hfv:A, 8hfv:B, 8hfv:C, 8hfv:D, 3hha:A, 3hha:B, 3hha:C, 3hha:D, 3hwn:A, 3hwn:B, 3hwn:C, 3hwn:D, 3k24:B, 3k24:A, 5mae:A, 5maj:A, 1mhw:A, 1mhw:B, 1mhw:C, 1mhw:D, 5mqy:A, 3of8:A, 3of9:A, 8ofa:A, 8ofa:B, 8ofa:C, 8ofa:D, 8oza:A, 8oza:B, 8oza:C, 8oza:D, 8prx:A, 8prx:B, 8prx:C, 8prx:D, 7qkb:A, 7qkb:B, 7qkb:C, 7qkb:D, 7qkc:A, 7qkc:B, 7qkc:C, 7qkc:D, 7qkd:A, 7qkd:B, 7qkd:C, 7qkd:D, 8qkb:A, 8qkb:B, 8qkb:C, 8qkb:D, 8uac:A, 8uac:B, 7w33:A, 7w34:A, 2xu1:A, 2xu1:B, 2xu1:C, 2xu1:D, 2xu3:A, 2xu4:A, 2xu5:A, 2yj2:A, 2yj8:A, 2yj9:A, 2yjb:A, 2yjc:A, 7z58:A, 7z58:B, 7z58:C, 7z58:D, 7zs7:A, 7zs7:B, 7zs7:C, 7zs7:D, 7zvf:A, 7zvf:B, 7zvf:C, 7zvf:D, 7zxa:A, 7zxa:B, 7zxa:C, 7zxa:D
7	1iwd:A	215	218	0.4908	0.4977	0.4908	1.21e-68
8	3p5u:A	220	218	0.4817	0.4773	0.4817	1.24e-66	3p5v:A, 3p5x:A
9	1aec:A	218	218	0.4679	0.4679	0.4679	2.97e-66
10	2pre:A	208	216	0.4817	0.5048	0.4861	1.22e-64	2pre:B
11	1s4v:B	226	220	0.4954	0.4779	0.4909	6.90e-64	1s4v:A
12	3bcn:A	209	217	0.4771	0.4976	0.4793	5.57e-62	3bcn:B
13	2fo5:A	224	226	0.4954	0.4821	0.4779	1.51e-60	2fo5:B, 2fo5:C, 2fo5:D
14	5a24:A	222	223	0.4908	0.4820	0.4798	2.39e-59
15	6mis:A	215	221	0.4266	0.4326	0.4208	6.77e-58	6mis:B, 6ycc:A, 6ycc:B, 6ycd:A, 6ycd:B
16	6ycf:A	215	221	0.4587	0.4651	0.4525	8.06e-58	6ycf:B, 6ycg:B
17	6czs:A	312	218	0.4404	0.3077	0.4404	2.31e-56	1nb3:A, 1nb3:B, 1nb3:C, 1nb3:D, 1nb5:A, 1nb5:B, 1nb5:C, 1nb5:D, 8pch:A
18	2bdz:A	212	218	0.4404	0.4528	0.4404	3.00e-55	2bdz:D, 2bdz:B, 2bdz:C
19	2b1n:A	227	228	0.4450	0.4273	0.4254	2.11e-54
20	8jcq:A	214	220	0.4450	0.4533	0.4409	5.55e-53	8jcr:A
21	6ex8:A	217	211	0.4128	0.4147	0.4265	1.43e-51	6ex8:B, 6exo:A, 6exo:B, 6exq:A, 6exq:B, 2p7u:A, 2p86:A
22	1bp4:A	212	220	0.4358	0.4481	0.4318	4.07e-48	1bqi:A, 2cio:A, 1cvz:A, 6h8t:A, 6h8t:J, 1khp:A, 1khq:A, 3lfy:C, 1pad:A, 2pad:A, 4pad:A, 5pad:A, 6pad:A, 1pe6:A, 1pip:A, 1pop:A, 1ppp:A, 6tcx:AAA
23	6p4e:B	217	219	0.4128	0.4147	0.4110	5.80e-47	6p4e:A
24	1aim:A	215	211	0.4083	0.4140	0.4218	1.71e-46	2aim:A, 1ewl:A, 1ewm:A, 1ewo:A, 1ewp:A, 1f29:A, 1f29:B, 1f29:C, 1f2a:A, 1f2b:A, 1f2c:A, 3hd3:A, 3hd3:B, 3i06:A, 3iut:A, 7juj:A, 7juj:B, 7juj:C, 7juj:D, 7juj:E, 7juj:F, 3kku:A, 4klb:A, 4klb:B, 4klb:C, 3lxs:A, 3lxs:C, 1me3:A, 1me4:A, 2oz2:A, 2oz2:C, 4pi3:A, 4pi3:B, 4qh6:A, 7s18:A, 7s19:A, 1u9q:X, 6ux6:A, 4w5b:A, 4w5b:B, 4w5b:C, 4w5c:A, 4w5c:B, 4w5c:C, 4w5c:D, 4xui:A, 4xui:B, 4xui:C
25	1meg:A	216	212	0.4358	0.4398	0.4481	2.80e-46
26	1gec:E	216	219	0.4495	0.4537	0.4475	1.29e-45
27	3ioq:A	213	219	0.4128	0.4225	0.4110	1.24e-43
28	7ei0:A	241	226	0.3761	0.3402	0.3628	5.62e-40	3bpf:A, 3bpf:B, 3bpf:C, 3bpf:D, 8gt7:C, 6jw9:A
29	3bpm:A	243	211	0.3670	0.3292	0.3791	1.75e-39	3bpm:B, 3bwk:A, 3bwk:B, 3bwk:C, 3bwk:D
30	1m6d:A	214	213	0.3624	0.3692	0.3709	4.30e-37	1m6d:B
31	3pdf:A	351	225	0.3440	0.2137	0.3333	3.03e-29	4cdc:B, 4cdc:E, 4cdc:F, 4cdc:H, 4cdc:K, 4cdd:A, 4cdd:B, 4cdd:D, 4cdd:E, 4cde:B, 4cde:C, 4cde:E, 4cde:F, 4cdf:A, 4cdf:B, 4cdf:C, 4cdf:D, 4cdf:E, 4cdf:F, 2djf:B, 2djf:C, 6ic5:A, 6ic5:B, 6ic5:C, 6ic6:A, 6ic6:B, 6ic7:A, 6ic7:B, 6ic7:C, 4oel:A, 4oem:A, 6rn6:E, 6rn6:F, 6rn7:A, 6rn7:B, 6rn7:C, 6rn9:A, 6rn9:B, 6rn9:C, 6rne:B, 6rne:C, 6rni:A, 6rni:B
32	5vpl:A	223	199	0.2936	0.2870	0.3216	8.79e-27
33	2as8:A	222	203	0.2890	0.2838	0.3103	1.36e-26	2as8:B, 3f5v:A, 3f5v:B, 5vcn:A, 5vcn:B, 5vco:E, 5vco:F, 5vpg:A, 5vph:A
34	3ai8:B	256	249	0.3624	0.3086	0.3173	2.03e-26	3ai8:A, 6ay2:A, 6ay2:B, 8b4t:A, 8b5f:A, 1csb:A, 1csb:B, 1csb:D, 1csb:E, 1gmy:A, 1gmy:B, 1gmy:C, 8he9:A, 8hei:A, 8hen:A, 2ipp:A, 1sp4:A
35	1cte:A	253	250	0.3670	0.3162	0.3200	5.34e-25	1cte:B, 1the:A, 1the:B
36	8cc2:AAA	254	249	0.3211	0.2756	0.2811	1.42e-22	8ccu:AAA, 8cd9:AAA, 5ogq:A, 5ogq:B, 5ogq:C, 5ogr:A, 5ogr:B, 5ogr:C, 3qsd:A, 3s3q:A, 3s3r:A, 3s3r:C, 3s3r:B, 6yi7:A
37	2dc6:A	251	247	0.3532	0.3068	0.3117	9.34e-20	2dc7:A, 2dc8:A, 2dc9:A, 2dca:A, 2dcb:A, 2dcc:A, 2dcd:A, 1ito:A, 1qdq:A, 1sp4:B
38	3hhi:B	260	238	0.3165	0.2654	0.2899	1.96e-19	3hhi:A
39	2wbf:X	265	234	0.2661	0.2189	0.2479	2.47e-11	3ch3:X, 6x42:X
40	4ci7:A	456	213	0.2844	0.1360	0.2911	2.57e-08	4ci7:B, 4d59:A, 4d59:B, 4d5a:A, 4d5a:B
41	3ois:A	268	121	0.1789	0.1455	0.3223	0.003	3ois:B, 3ois:C, 3ois:D
42	3pw3:D	353	28	0.0642	0.0397	0.5000	0.25	6w4n:A, 6w4n:B, 6w4n:C, 6w4n:D, 5wdk:B, 5wdk:C, 5wdk:E
43	3pw3:D	353	32	0.0642	0.0397	0.4375	0.59	6w4n:A, 6w4n:B, 6w4n:C, 6w4n:D, 5wdk:B, 5wdk:C, 5wdk:E
44	3pw3:A	374	28	0.0642	0.0374	0.5000	0.27	3pw3:B, 3pw3:C, 3pw3:E, 3pw3:F, 6w4n:E, 6w4n:F, 5wdk:A, 5wdk:D, 5wdk:F, 5wdl:A, 5wdl:B, 5wdl:C, 5wdl:D, 5wdl:E, 5wdl:F
45	3pw3:A	374	32	0.0642	0.0374	0.4375	0.64	3pw3:B, 3pw3:C, 3pw3:E, 3pw3:F, 6w4n:E, 6w4n:F, 5wdk:A, 5wdk:D, 5wdk:F, 5wdl:A, 5wdl:B, 5wdl:C, 5wdl:D, 5wdl:E, 5wdl:F
46	4uyq:A	143	96	0.1193	0.1818	0.2708	0.47
47	8ebw:H	532	114	0.1330	0.0545	0.2544	1.2	8ebs:H, 8ebt:H, 8ebv:H, 8ebx:H
48	6n1a:A	386	59	0.0917	0.0518	0.3390	2.9	6n1b:A
49	4wd1:A	646	84	0.1101	0.0372	0.2857	5.2
50	2z51:A	154	42	0.0642	0.0909	0.3333	6.0
51	3lkf:A	292	41	0.0688	0.0514	0.3659	9.8
52	6lga:A	570	53	0.0688	0.0263	0.2830	9.8	6lga:B, 6lgb:A, 6lgb:B, 6lgc:A, 6lgc:B, 6lgd:A, 6lgd:B, 6lge:A, 6lge:B, 6lgf:A, 6lgf:B, 6lgg:A, 6lgg:B, 6lgh:A, 6lgh:B, 6lgi:A, 6lgi:B

[Back]