Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IIIATKNGKVRGMQLTVFGGTVTAFLGIPYAQPPLGRLRFKKPQSLTKWSDIWNATKYANSCCQNIDQSFPGFHGSEMWN
PNTDLSEDCLYLNVWIPAPKPKNATVLIWIYGGGFQTGTSSLHVYDGKFLARVERVIVVSMNYRVGALGFLALPGNPEAP
GNMGLFDQQLALQWVQKNIAAFGGNPKSVTLFGESAGAASVSLHLLSPGSHSLFTRAILQSGSFNAPWAVTSLYEARNRT
LNLAKLTGCSRENETEIIKCLRNKDPQEILLNEAFVVPYGTPLSVNFGPTVDGDFLTDMPDILLELGQFKKTQILVGVNK
DEGTAFLVYGAPGFSKDNNSIITRKEFQEGLKIFFPGVSEFGKESILFHYTDWVDDQRPENYREALGDVVGDYNFICPAL
EFTKKFSEWGNNAFFYYFEHRSSKLPWPEWMGVMHGYEIEFVFGLPLERRDQYTKAEEILSRSIVKRWANFAKYGNPQET
QNQSTSWPVFKSTEQKYLTLNTESTRIMTKLRAQQCRFWTSFFPKV

The query sequence (length=526) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6i2t:B 562 526 0.9924 0.9288 0.9924 0.0 7aiy:A, 8ai7:F, 7amz:A, 8am1:A, 8am2:A, 4aqd:A, 4aqd:B, 7awg:A, 7awh:A, 7awi:A, 4axb:A, 4b0o:A, 4b0p:A, 4bbz:A, 4bds:A, 7bgc:A, 7bo3:A, 7bo4:A, 8cgo:A, 3djy:A, 3dkk:A, 5dyt:A, 5dyt:B, 5dyw:A, 5dyw:B, 5dyy:A, 5dyy:B, 6ep4:A, 6eqp:A, 6eqq:A, 6esj:A, 6esj:B, 6esy:B, 6esy:A, 6eyf:A, 6f7q:A, 6f7q:B, 6i0b:A, 6i0c:A, 6i2t:A, 6i2t:C, 6i2t:D, 2j4c:A, 5k5e:A, 5k5e:B, 5lkr:A, 5lkr:B, 5nn0:A, 3o9m:A, 3o9m:B, 1p0i:A, 1p0m:A, 1p0p:A, 1p0q:A, 7q1m:A, 7q1n:A, 7q1o:A, 7q1p:A, 6qaa:A, 6qab:A, 6qac:A, 6qad:A, 6qae:A, 7qbq:A, 7qbr:A, 7qhd:A, 7qhe:A, 6r6v:A, 6r6w:A, 6rua:A, 6rua:B, 6sam:A, 6t9p:A, 6t9s:A, 4tpk:A, 4tpk:B, 2wid:A, 2wif:A, 2wig:A, 2wij:A, 2wik:A, 2wil:B, 2wil:A, 2wsl:A, 4xii:A, 4xii:B, 1xlu:A, 1xlv:A, 1xlw:A, 2xmb:A, 2xmc:A, 2xmd:A, 2xmg:A, 2xqf:A, 2xqg:A, 2xqi:A, 2xqj:A, 2xqk:A, 6xta:A, 2y1k:A, 7zpb:A, 6zwi:A
2 5ei5:A 534 526 0.5342 0.5262 0.5342 0.0 1acj:A, 1acl:A, 2ace:A, 2ack:A, 7ais:A, 7ais:B, 7ait:A, 7ait:B, 7aiu:A, 7aiu:B, 7aiv:B, 7aiw:A, 7aiw:B, 7aix:A, 1amn:A, 1ax9:A, 7b38:A, 7b8e:A, 2bag:A, 5bwb:A, 5bwc:A, 2c4h:A, 2c58:A, 2c5f:A, 2c5g:A, 2cek:A, 1cfj:A, 2ckm:A, 2cmf:A, 5dlp:A, 1dx6:A, 5e2i:A, 1e3q:A, 5e4j:A, 5e4t:A, 1e66:A, 5ehx:A, 6euc:A, 1eve:A, 6ewk:A, 6ezg:A, 6ezg:B, 6ezh:A, 6ezh:B, 6fld:A, 6fqn:A, 6g17:A, 6g1u:A, 6g1u:B, 6g1v:A, 6g1v:B, 6g1w:A, 6g1w:B, 6g4m:A, 6g4m:B, 6g4n:A, 6g4n:B, 6g4o:A, 6g4o:B, 6g4p:A, 6g4p:B, 1gpk:A, 1gpn:A, 1gqr:A, 1gqs:A, 6h12:A, 6h12:B, 6h13:A, 6h13:B, 6h14:A, 6h14:B, 1h22:A, 1h23:A, 1hbj:A, 3i6m:A, 3i6z:A, 5ih7:A, 2j3d:A, 2j3q:A, 2j4f:A, 1jjb:A, 5nap:A, 5nau:A, 5nuu:A, 1oce:A, 1odc:A, 1qti:A, 1som:A, 6tt0:A, 4tvk:A, 1u65:A, 1ut6:A, 2v96:A, 2v96:B, 2v97:A, 2v97:B, 2v98:A, 2v98:B, 2vja:A, 2vja:B, 2vjb:A, 2vjb:B, 2vjc:A, 2vjc:B, 2vjd:A, 2vjd:B, 1vot:A, 2vq6:A, 1vxo:A, 1vxr:A, 1w4l:A, 1w6r:A, 2w6c:X, 4w63:A, 1w76:A, 1w76:B, 2wfz:A, 2wg0:A, 2wg1:A, 2wg2:A, 4x3c:A, 2xi4:A, 2xi4:B, 1zgb:A, 1zgc:A, 1zgc:B, 3zv7:A
3 4qww:A 529 524 0.5266 0.5236 0.5286 0.0 4qww:B
4 4bdt:A 563 532 0.5285 0.4938 0.5226 0.0 8aen:B, 8aen:A, 8aev:A, 8aev:B, 6cqt:A, 6cqt:B, 6cqu:A, 6cqu:B, 6cqv:A, 6cqv:B, 6cqw:A, 6cqw:B, 6cqx:A, 6cqx:B, 6cqy:A, 6cqy:B, 6cqz:A, 6cqz:B, 7d9o:A, 7d9o:B, 7d9p:A, 7d9p:B, 7d9q:A, 7d9q:B, 8dt4:A, 8dt4:B, 8dt5:A, 8dt5:B, 8dt7:A, 8dt7:B, 7e3h:A, 7e3h:B, 4ey5:A, 4ey5:B, 4ey6:A, 4ey6:B, 4ey7:A, 4ey7:B, 6f25:A, 6f25:B, 5hf6:B, 5hf6:A, 5hf8:A, 5hf8:B, 5hf9:A, 5hf9:B, 5hfa:A, 5hfa:B, 5hq3:A, 5hq3:B, 4m0e:A, 4m0e:B, 4m0f:A, 4m0f:B, 6nea:A, 6nea:B, 6ntg:A, 6ntg:B, 6nth:A, 6nth:B, 6ntk:A, 6ntk:B, 6ntl:A, 6ntl:B, 6ntm:A, 6ntm:B, 6ntn:A, 6ntn:B, 6nto:A, 6nto:B, 6o4w:A, 6o4w:B, 6o4x:A, 6o4x:B, 6o50:A, 6o50:B, 6o52:A, 6o52:B, 6o5r:A, 6o5r:B, 6o5s:A, 6o5s:B, 6o5v:A, 6o5v:B, 6o66:A, 6o66:B, 7p1n:aa, 7p1n:A, 7p1n:bb, 7p1p:aa, 7p1p:A, 7p1p:bb, 7rb5:A, 7rb6:A, 7rb6:B, 7rb7:A, 7rb7:B, 6u34:A, 6u34:B, 6u37:A, 6u37:B, 6u3p:A, 6wuv:A, 6wuv:B, 6wuy:A, 6wuy:B, 6wuz:A, 6wuz:B, 6wv1:A, 6wv1:B, 6wvc:A, 6wvc:B, 6wvo:A, 6wvo:B, 6wvp:A, 6wvp:B, 6wvq:A, 6wvq:B, 7xn1:A, 7xn1:B, 6zwe:A
5 4bc0:A 542 532 0.5285 0.5129 0.5226 0.0 4a16:A, 4a16:B, 4a16:C, 4a16:D, 4a23:A, 4a23:B, 4ara:A, 4ara:B, 4arb:A, 4arb:B, 4b7z:A, 4b7z:B, 4b80:A, 4b80:B, 4b81:A, 4b81:B, 4b82:A, 4b82:B, 4b83:A, 4b83:B, 4b84:A, 4b84:B, 4b85:A, 4b85:B, 4bc0:B, 4bc0:C, 4bc0:D, 4bc1:A, 4bc1:B, 4bc1:C, 4bc1:D, 4btl:A, 4btl:B, 2c0p:A, 2c0p:B, 2c0q:A, 2c0q:B, 5dtj:A, 5dtj:B, 5ehn:A, 5ehn:B, 5ehq:A, 5ehq:B, 5ehz:A, 5ehz:B, 5eia:A, 5eia:B, 5eie:A, 5eie:B, 5eih:A, 5eih:B, 5fkj:A, 5fkj:D, 5fkj:B, 5fkj:C, 5foq:A, 5foq:B, 5fpp:A, 5fpp:B, 6fsd:A, 6fsd:B, 6fse:A, 6fse:B, 5fum:A, 5fum:B, 2gyu:A, 2gyu:B, 2gyv:A, 2gyv:B, 2gyw:A, 2gyw:B, 2h9y:A, 2h9y:B, 2ha0:A, 2ha0:B, 2ha2:A, 2ha2:B, 2ha3:A, 2ha3:B, 2ha4:A, 2ha4:B, 2ha5:A, 2ha5:B, 2ha6:A, 2ha6:B, 2ha7:A, 2ha7:B, 1j06:A, 1j06:B, 1j07:A, 1j07:B, 2jey:A, 2jey:B, 2jez:A, 2jez:B, 2jf0:A, 2jf0:B, 1maa:A, 1maa:B, 1maa:C, 1maa:D, 1n5m:A, 1n5m:B, 1n5r:A, 8orc:A, 8orc:B, 5ov9:A, 5ov9:B, 1q83:A, 1q83:B, 1q84:A, 1q84:B, 7qak:A, 7qak:B, 7qb4:A, 7qb4:B, 7qyn:A, 7qyn:B, 7r02:A, 7r02:B, 7r0a:A, 7r0a:B, 7r2f:A, 7r2f:B, 7r3c:A, 7r3c:B, 7r4e:A, 7r4e:B, 6td2:A, 6td2:B, 2whp:A, 2whp:B, 2whq:A, 2whq:B, 2whr:A, 2whr:B, 2wls:A, 2wls:B, 2wu3:A, 2wu3:B, 2wu4:A, 2wu4:B, 2xud:A, 2xuf:A, 2xuf:B, 2xug:A, 2xug:B, 2xuh:A, 2xuh:B, 2xui:A, 2xui:B, 2xuj:A, 2xuj:B, 2xuk:A, 2xuk:B, 2xuo:A, 2xuo:B, 2xup:A, 2xup:B, 2xuq:A, 2xuq:B, 3zlu:B, 3zlv:A, 3zlv:B
6 5ydj:B 538 534 0.4848 0.4740 0.4775 2.05e-170 6ary:A, 6ary:B
7 6xyu:A 537 539 0.4087 0.4004 0.3989 1.03e-134 6xys:A, 6xyy:A
8 8axc:B 532 550 0.3669 0.3628 0.3509 1.91e-89 8axc:A, 8axc:C, 8axc:D
9 1aql:A 532 545 0.3289 0.3252 0.3174 9.31e-82 1aql:B
10 6h18:A 523 542 0.3289 0.3308 0.3192 6.72e-75 6h0t:A, 6h0v:A, 6h19:A, 6h1a:A
11 1mx9:D 533 561 0.3612 0.3565 0.3387 2.73e-72 2dqy:A, 2dqy:B, 2dqy:C, 2dqz:A, 2dqz:B, 2dqz:C, 2dr0:A, 2dr0:B, 2dr0:C, 2h7c:A, 2h7c:F, 2h7c:B, 2h7c:D, 2h7c:C, 2h7c:E, 2hrq:A, 2hrq:B, 2hrq:C, 2hrq:D, 2hrq:E, 2hrq:F, 2hrr:A, 2hrr:B, 2hrr:C, 1mx1:A, 1mx1:B, 1mx1:C, 1mx1:D, 1mx1:E, 1mx1:F, 1mx5:A, 1mx5:B, 1mx5:C, 1mx5:D, 1mx5:E, 1mx5:F, 1mx9:A, 1mx9:B, 1mx9:C, 1mx9:E, 1mx9:F, 1mx9:G, 1mx9:H, 1mx9:I, 1mx9:J, 1mx9:K, 1mx9:L, 1ya4:A, 1ya4:B, 1ya4:C, 1ya8:A, 1ya8:B, 1ya8:C, 1yah:A, 1yah:B, 1yah:C, 1yaj:A, 1yaj:B, 1yaj:D, 1yaj:E, 1yaj:F, 1yaj:G, 1yaj:H, 1yaj:I, 1yaj:J, 1yaj:K, 1yaj:L
12 3k9b:B 499 537 0.3517 0.3707 0.3445 4.59e-72 3k9b:A
13 1k4y:A 501 551 0.3460 0.3633 0.3303 9.35e-72
14 3k9b:C 453 528 0.3384 0.3929 0.3371 1.23e-69
15 1c7i:A 483 516 0.3118 0.3395 0.3178 9.71e-64 1qe3:A
16 7n4y:B 2455 550 0.3270 0.0701 0.3127 4.48e-59 7n4y:A
17 4fnm:A 569 555 0.3099 0.2865 0.2937 8.36e-58 5ch5:A, 5ivi:A, 5ivk:A, 4qwm:A, 5tyj:A, 5tyk:A, 5tyl:A, 5tym:A, 5tyn:A, 5tyo:A, 5typ:A, 4ubi:A, 4ubj:A, 4ubk:A, 4ubl:A, 4ubm:A, 4ubn:A, 4ubo:A, 4w1p:A, 4w1q:A, 4w1r:A, 4w1s:A
18 7w1i:A 497 530 0.2985 0.3159 0.2962 6.26e-57 7w1j:A, 7w1l:A
19 7mp4:A 534 565 0.3308 0.3258 0.3080 1.34e-56 7mp4:B, 7mp4:C, 7mp4:D, 7mp4:E, 7mp4:F, 7mp4:G, 7mp4:H
20 4be9:A 538 546 0.2909 0.2844 0.2802 3.95e-46 4be9:B, 4upd:A, 4upd:B
21 5thm:A 520 332 0.2148 0.2173 0.3404 4.25e-44
22 1lpm:A 534 454 0.2738 0.2697 0.3172 4.02e-43 1lpn:A, 1lpo:A, 1lpp:A, 1lps:A, 3rar:A
23 1cle:A 534 455 0.2681 0.2640 0.3099 3.26e-41 1cle:B, 1llf:A, 1llf:B
24 2fj0:A 530 564 0.2833 0.2811 0.2642 2.00e-39
25 7auy:B 245 105 0.0513 0.1102 0.2571 6.21e-06
26 7at3:A 295 105 0.0513 0.0915 0.2571 8.32e-06 7at3:B, 7at4:A, 7atd:B, 7atf:A, 7atf:B, 7atq:A, 7auy:A, 7av5:AAA, 7av5:BBB, 7nb5:A
27 1qz3:A 309 116 0.0589 0.1003 0.2672 2.59e-05
28 6i8d:A 315 98 0.0532 0.0889 0.2857 2.60e-05 6i8d:B, 6rb0:A, 6rb0:B, 6rky:A, 6rky:B, 6rky:C, 6rky:D
29 5aob:A 278 121 0.0532 0.1007 0.2314 0.001 5aoc:A, 7bfr:A
30 8p7e:A 309 99 0.0532 0.0906 0.2828 0.003 8p7e:B, 8p8f:A, 8p8f:B
31 6iey:A 307 113 0.0532 0.0912 0.2478 0.016
32 7cih:C 311 92 0.0475 0.0804 0.2717 0.030 7ci0:A, 7ci0:B, 7ci0:C, 7ci0:D, 7cih:A, 7cih:B, 7cih:D, 7cip:A, 7cip:B, 7cip:C, 7cip:D, 6keu:A, 6keu:B, 6keu:C, 6keu:D, 6kf1:A, 6kf1:B, 6kf1:C, 6kf1:D, 6kf5:A, 6kf5:B, 6kf5:C, 6kf5:D, 6kf7:A, 6kf7:B, 6kf7:C, 6kf7:D, 7w8n:A, 7w8n:B, 7w8n:C, 7w8n:D
33 3ebl:A 323 104 0.0570 0.0929 0.2885 0.062 3ebl:B, 3ebl:C, 3ebl:D, 3ebl:E, 3ebl:F, 3ed1:A, 3ed1:B, 3ed1:C, 3ed1:D, 3ed1:E, 3ed1:F
34 7lnp:A 565 51 0.0304 0.0283 0.3137 0.30 7ljj:A, 7lk7:A, 7lnp:C, 7lnp:D, 7lnp:E
35 4pee:C 446 92 0.0475 0.0561 0.2717 0.30 5hdr:A, 5hdr:B, 5hdr:C, 5hdr:D, 6hzy:A, 6hzy:B, 5i5r:A, 5i5r:B, 5i5r:C, 5i5r:D, 4j28:A, 4j28:B, 4jfs:A, 4jfs:B, 4jft:A, 4jft:B, 4jfu:A, 4jfu:B, 4jfv:A, 4jfv:B, 4jfv:C, 4jfv:D, 4jfw:A, 4jfw:B, 4jfw:C, 4jfw:D, 4jl1:A, 4jl1:B, 4jl2:A, 4jl2:B, 4pcs:A, 4pcs:B, 4pcs:C, 4pcs:D, 4pct:A, 4pct:B, 4pct:C, 4pct:D, 4pee:A, 4pee:B, 4pee:D, 4wsj:A, 4wsj:B, 4wsj:C, 4wsj:D, 4wsk:A, 4wsk:B, 4wsk:C, 2wvs:A, 2wvs:B, 2wvs:C, 2wvs:D, 2wvt:A, 2wvt:B, 2wvu:A, 2wvu:B, 2wvu:C, 2wvu:D, 2xib:A, 2xib:B, 2xib:C, 2xib:D, 2xii:A, 2xii:B
36 2zsi:A 339 96 0.0494 0.0767 0.2708 0.35 2zsh:A
37 3bht:B 262 117 0.0570 0.1145 0.2564 0.75 3bht:D, 3bhu:B, 3bhu:D, 3bhv:B, 3bhv:D, 2c5v:B, 2c5v:D, 2cch:B, 2cch:D, 2cci:B, 2cci:D, 4cfu:D, 4cfv:B, 4cfv:D, 4eoj:B, 4eol:B, 4eom:D, 4eon:B, 4eon:D, 4eoo:B, 4eop:D, 4eoq:B, 1gy3:D, 1h24:B, 1h25:B, 1h26:B, 1h27:B, 1h28:B, 1h28:D, 2iw6:B, 2iw9:B, 2iw9:D, 5lmk:B, 1oi9:B, 1oiu:B, 1oiy:B, 1okv:B, 1okv:D, 1okw:B, 1okw:D, 1ol1:B, 1ol1:D, 1ol2:B, 1ol2:D, 6p3w:B, 6p3w:D, 3qhr:D, 3qhr:B, 3qhw:B, 3qhw:D, 1urc:B, 1urc:D, 2uue:B, 2uue:D, 2v22:B, 2v22:D, 2wev:B, 2wev:D, 2wfy:B, 2wfy:D, 2whb:B, 2whb:D, 2wma:B, 2wmb:B, 2x1n:D
38 5hc2:A 343 113 0.0627 0.0962 0.2920 1.4 5hc0:A, 5hc2:B, 5hc2:C, 5hc2:D, 5hc3:B, 5hc3:D, 5hc4:A
39 4j6r:G 343 73 0.0380 0.0583 0.2740 1.5
40 2eer:B 347 34 0.0285 0.0432 0.4412 5.9 2eer:A
41 7dz7:2 217 115 0.0475 0.1152 0.2174 7.0 7bgi:2, 7d0j:2, 7dz8:2, 6ijo:2
42 2vh9:A 266 92 0.0475 0.0940 0.2717 7.8 2vh9:B
43 8tpu:AN 147 86 0.0437 0.1565 0.2674 9.0 3j79:N, 3jbn:AN, 3jbo:AN, 3jbp:AN, 5umd:N

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218