Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IICRDVARGYENVPIPCVNGVDGEPCPEDYKYISENCETSTMNIDRNITHLQHCTCVDDCSSSNCLCGQLSIRCWYDKDG
RLLQEFNKIEPPLIFECNQACSCWRNCKNRVVQSGIKVRLQLYRTAKMGWGVRALQTIPQGTFICEYVGELISDAEADVR
EDDSYLFDLDGEVYCIDARYYGNISRFINHLCDPNIIPVRVFMLHQDLRFPRIAFFSSRDIRTGEELGFDYGDRFWDIKS
KYFTCQCGSEKCKHSAEAIALEQS

The query sequence (length=264) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7x73:A 274 267 1.0000 0.9635 0.9888 0.0 7btv:A, 7btv:B, 7buc:A, 7buc:B, 7dcf:A, 7dcf:B, 5jhn:A, 5jhn:B, 5jin:A, 5jin:B, 5jiy:A, 5jiy:B, 5jj0:A, 5jj0:B, 3k5k:A, 3k5k:B, 4nvq:A, 4nvq:B, 2o8j:A, 2o8j:B, 2o8j:C, 2o8j:D, 3rjw:A, 3rjw:B, 5t0k:A, 5t0k:B, 5t0m:A, 5t0m:B, 7t7l:A, 7t7l:B, 7t7l:C, 7t7l:D, 5ttf:A, 5ttf:B, 5ttf:C, 5ttf:D, 5tuy:A, 5tuy:B, 5v9i:A, 5v9i:B, 5v9i:C, 5v9i:D, 5vsc:A, 5vsc:B, 5vse:A, 5vse:B, 7x73:B, 7xua:A, 7xua:B, 7xub:A, 7xub:B, 7xuc:A, 7xuc:B, 7xud:A, 7xud:B
2 3hna:A 280 258 0.7614 0.7179 0.7791 3.18e-159 3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
3 6z2a:A 283 267 0.3750 0.3498 0.3708 1.64e-44 6box:A, 6box:B, 6bp4:B, 6bp4:A, 1mvh:A, 1mvx:A, 6z2a:B
4 2r3a:A 270 245 0.3561 0.3481 0.3837 1.39e-43 6p0r:A, 6p0r:B
5 4qen:A 472 264 0.3447 0.1928 0.3447 2.76e-40 4qeo:A, 4qep:A
6 3bo5:A 269 245 0.3220 0.3160 0.3469 1.46e-38
7 6a5m:A 488 275 0.3561 0.1926 0.3418 4.87e-38 6a5k:A
8 6a5n:A 502 261 0.3258 0.1713 0.3295 8.73e-35
9 4nj5:A 482 259 0.2955 0.1618 0.3012 5.23e-34
10 1peg:A 266 274 0.3106 0.3083 0.2993 1.31e-30 1ml9:A, 1peg:B
11 5kjh:B 807 146 0.2159 0.0706 0.3904 1.05e-20 5m5g:B
12 5wf7:B 765 145 0.2159 0.0745 0.3931 1.07e-20 5kji:B
13 5tqr:B 809 146 0.2159 0.0705 0.3904 1.46e-20 5bjs:B, 5vk3:B
14 5jlb:A 248 168 0.2083 0.2218 0.3274 1.60e-20 7ea8:L, 4fmu:A, 4h12:A, 6j9j:A, 5jjy:A, 5jle:A, 5lss:A, 5lsx:A, 5lsy:A, 5lsz:A, 5lt6:A, 5lt6:B, 5lt7:A, 5lt8:A, 7lzb:A, 7lzd:A, 7lzf:A, 8q5p:A, 7ty2:A, 7ty3:A, 5v21:A, 5v22:A, 6vdb:A
15 5kkl:B 839 143 0.2121 0.0667 0.3916 2.96e-20
16 5wfd:B 774 112 0.1856 0.0633 0.4375 2.84e-19 5wfc:B
17 7kso:A 395 188 0.2462 0.1646 0.3457 4.41e-19 7ksr:A, 7ktp:A
18 7td5:F 447 188 0.2462 0.1454 0.3457 4.56e-19
19 7td5:A 497 188 0.2462 0.1308 0.3457 5.22e-19
20 6ine:A 247 173 0.2197 0.2348 0.3353 1.84e-18 6ago:A, 6ago:B, 3ope:A, 3ope:B, 6wzw:A, 6x0p:A, 6x0p:B, 6x0p:C, 6x0p:D, 4ynm:A, 4ynm:B, 4ynp:A, 4ynp:B, 4ypa:A, 4ypa:B, 4ypa:C, 4ypa:D, 4ype:A, 4ype:B, 4ypu:A, 4ypu:B
21 8fbh:A 232 169 0.2083 0.2371 0.3254 2.08e-18 8fbg:A, 8fbg:B, 6kqp:A, 6kqq:A, 6kqq:B, 3ooi:A
22 7at8:A 311 188 0.2462 0.2090 0.3457 2.41e-18
23 8tas:E 570 188 0.2462 0.1140 0.3457 2.95e-18 8tb9:E
24 6wkr:C 606 188 0.2462 0.1073 0.3457 3.22e-18 4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
25 5hyn:A 581 188 0.2462 0.1119 0.3457 3.53e-18 5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
26 8t9g:C 536 188 0.2462 0.1213 0.3457 3.56e-18 8fyh:A, 8fyh:G
27 9c8u:A 475 188 0.2462 0.1368 0.3457 3.83e-18
28 5ij7:B 469 188 0.2462 0.1386 0.3457 4.23e-18 6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
29 5wg6:A 517 132 0.2008 0.1025 0.4015 6.86e-18 5wg6:C
30 6ugm:M 188 145 0.2083 0.2926 0.3793 2.89e-17
31 5lsu:A 231 170 0.2197 0.2511 0.3412 3.02e-17 7cro:I, 7e8d:K, 5lsu:B
32 6ven:N 218 142 0.2008 0.2431 0.3732 3.74e-17
33 6cen:A 226 169 0.2008 0.2345 0.3136 1.31e-16 7crp:I, 7crq:L, 7crq:I, 7crr:I, 5upd:A
34 6uh5:M 222 138 0.2045 0.2432 0.3913 4.46e-16 6chg:C
35 7ea5:K 228 142 0.1856 0.2149 0.3451 8.73e-16
36 2w5z:A 180 151 0.1894 0.2778 0.3311 1.06e-15 5f5e:A, 5f6l:A, 6pwv:C, 6pww:C, 7u5v:A, 6u9k:A, 6u9k:B, 6u9m:A, 6u9m:B, 6u9n:A, 6u9n:B, 6u9r:A, 6u9r:B, 2w5y:A, 7w67:C, 7w6a:C, 7w6i:C, 7w6j:C
37 7w6l:C 158 156 0.1856 0.3101 0.3141 7.04e-15 5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
38 6nzo:S 233 161 0.1932 0.2189 0.3168 1.86e-14 6px3:S
39 7bre:B 163 151 0.1780 0.2883 0.3113 2.02e-14 7bre:E
40 6kiu:K 179 151 0.1818 0.2682 0.3179 6.29e-14 6kiv:K, 6kix:K, 6kiz:K, 7ud5:K
41 7xpx:K 167 137 0.1742 0.2754 0.3358 3.60e-11 6boz:A, 6boz:B, 2bqz:A, 2bqz:E, 3f9w:B, 3f9w:A, 3f9w:C, 3f9w:D, 3f9x:B, 3f9x:A, 3f9x:C, 3f9x:D, 3f9y:A, 3f9y:B, 3f9z:B, 3f9z:A, 3f9z:C, 3f9z:D, 4ij8:A, 4ij8:B, 5t5g:A, 5teg:A, 5teg:B, 5th7:A, 5th7:B, 5w1y:A, 5w1y:B, 1zkk:A, 1zkk:B, 1zkk:C, 1zkk:D
42 4z4p:A 161 156 0.1818 0.2981 0.3077 1.51e-10
43 8sr6:A 451 122 0.1326 0.0776 0.2869 0.001 5czy:A, 8swi:A
44 4o30:A 217 134 0.1591 0.1935 0.3134 0.055 4o30:B, 5va6:A, 5va6:B, 5vac:A, 5vah:A, 5vah:B, 5vbc:A, 5vbc:B
45 2g46:A 119 121 0.1174 0.2605 0.2562 0.37 2g46:B, 3kmt:A, 3kmt:B, 3kmt:C
46 5a3u:A 215 77 0.0833 0.1023 0.2857 0.80 8j1k:A, 6qgv:A, 6yvt:A, 6yvt:C, 6yvt:E, 6yvt:F, 6zbn:A, 6zbn:C, 6zbn:E, 6zbn:F, 6zbo:B, 6zbo:E, 6zbo:F
47 5ex0:A 429 86 0.0985 0.0606 0.3023 1.3 7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
48 6c26:B 397 107 0.0985 0.0655 0.2430 3.9 8age:G, 6ezn:G, 7oci:G
49 4kbz:A 231 53 0.0568 0.0649 0.2830 6.4 5a3u:B, 5a3u:C, 4bqw:A, 4bqx:A, 4bqy:A, 2g19:A, 2g1m:A, 2hbt:A, 2hbu:A, 3hqr:A, 3hqu:A, 4jzr:A, 5l9b:A, 5l9b:B, 5l9r:A, 5l9v:A, 5l9v:B, 5la9:A, 5la9:B, 5las:A, 5las:B, 5lat:A, 5lb6:A, 5lbb:A, 5lbc:A, 5lbe:A, 5lbf:A, 6nmq:A, 3ouh:A, 3oui:A, 3ouj:A, 5ox5:A, 5ox6:A, 7q5v:A, 7q5x:A, 8q5s:A, 8q64:A, 8q6d:A, 8q6e:A, 6st3:A, 6st3:B, 7ujv:B, 7ump:A, 4uwd:A, 5v18:A, 2y33:A, 2y34:A, 6yvt:B, 6yvt:D, 6yvw:A, 6yvx:A, 6yvz:A, 6yw0:A, 6yw1:A, 6yw2:A, 6yw3:A, 6yw4:A, 6zbn:B, 6zbn:D, 6zbo:A, 6zbo:C, 6zbo:D
50 4au7:A 243 114 0.1136 0.1235 0.2632 7.1 4au7:B, 3rq4:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218