Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
IHKKFKATSVGYDWNTFPMKLYQIGKRLFWDPAKIDFSKDKEDWKKLSKDEKNYLLNIVSLFMAGEEAVAVDITPLISTM
INEGRVEDVIYLEQFAFEEAKHAEAFRRFCDSLEINDDLTIFTTEYNPWYQKIFYEELPSVMWKLRVDPSPENLAVAVTT
YNLYVEGVAAESGYKTFKHIFNSLNIMPGLSKTVNLIATDESRHIAYGTYLITRLIVENGESIYRKAIEQFNKLVGLPFG
LTPDFTIENRKQLVNARLTVIERALKMTPEQVKS

The query sequence (length=274) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6qrz:A 274 274 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 7qbk:A 284 278 0.5474 0.5282 0.5396 8.56e-104
3 7qbp:A 291 232 0.3613 0.3402 0.4267 1.55e-62
4 4ac8:A 311 209 0.3358 0.2958 0.4402 4.55e-60 4ac8:B, 4ac8:C, 4ac8:D, 3ee4:A
5 5dcs:A 287 263 0.3759 0.3589 0.3916 1.03e-56 5dco:A, 5dcr:A, 5ekb:A, 6f65:A, 6f6b:A, 6f6c:A, 6f6c:B, 6f6e:A, 6f6e:B, 6f6f:A, 6f6g:A, 6f6g:B, 6f6h:A, 6f6h:B, 6f6k:A, 6f6k:B, 6f6l:A, 6f6l:B, 6f6m:A, 6f6m:B, 4hr0:A, 4hr4:A, 6i90:A, 6i92:A, 6i93:A, 6i94:A, 6i95:A, 5omj:A, 5omk:A, 6qjv:A, 6qk0:A, 6qk0:B, 6qk1:A, 6qk2:A, 6qk2:B, 4xb9:A, 4xbv:A, 4xbv:B, 4xbw:A
6 6y2n:A 306 253 0.2409 0.2157 0.2609 4.80e-10
7 4d8f:B 334 202 0.2190 0.1796 0.2970 2.09e-09 2ani:A, 4d8f:A, 4d8f:C, 4d8f:D, 4d8g:A, 4d8g:B, 4d8g:C, 4d8g:D, 4m1i:A, 4m1i:B, 4m1i:C, 4m1i:D, 1syy:A
8 1h0n:A 288 216 0.2007 0.1910 0.2546 6.08e-09 1h0o:A, 2uw2:A, 3vpm:A, 3vpm:B, 3vpn:A, 3vpn:B, 3vpo:A, 3vpo:B, 1w68:A, 1w69:A, 1xsm:A
9 3hf1:B 286 235 0.2190 0.2098 0.2553 5.39e-08 3hf1:A, 2vux:A
10 2vux:B 255 240 0.2080 0.2235 0.2375 2.50e-05
11 6zjk:A 317 234 0.1898 0.1640 0.2222 6.54e-05 6zjk:C, 6zjk:D, 6zjk:B
12 1jk0:A 334 248 0.2190 0.1796 0.2419 1.54e-04
13 2o1z:A 288 219 0.1934 0.1840 0.2420 6.11e-04 2o1z:B, 2p1i:A, 2p1i:B, 2p1i:C, 2p1i:D, 2p1i:E, 2p1i:F, 2p1i:G, 2p1i:H
14 5v4t:A 212 125 0.1314 0.1698 0.2880 0.001 5v4t:B
15 6w4x:C 375 222 0.1934 0.1413 0.2387 0.004 7ai8:A, 7ai9:A, 2alx:A, 1av8:A, 1av8:B, 2av8:A, 2av8:B, 7bet:A, 1biq:A, 1biq:B, 5ci0:A, 5ci1:A, 5ci2:A, 5ci3:A, 5ci4:A, 5cns:E, 5cns:F, 5cns:G, 5cns:H, 5cnt:E, 5cnt:F, 5cnt:G, 5cnt:H, 5cnu:E, 5cnu:F, 5cnu:G, 5cnu:H, 5cnv:E, 5cnv:F, 5cnv:G, 5cnv:H, 4erm:E, 4erm:F, 4erm:G, 4erm:H, 4erp:E, 4erp:F, 4erp:G, 4erp:H, 1jpr:A, 1jpr:B, 1jqc:A, 1jqc:B, 1mrr:A, 1mrr:B, 1mxr:A, 1mxr:B, 1pfr:A, 1pfr:B, 1pim:A, 1pim:B, 1piu:A, 1piu:B, 1piy:A, 1piy:B, 1piz:A, 1piz:B, 1pj0:A, 1pj0:B, 1pj1:A, 1pj1:B, 1pm2:A, 1pm2:B, 1r65:A, 1r65:B, 1rib:A, 1rib:B, 1rnr:A, 1rnr:B, 1rsr:A, 1rsr:B, 1rsv:A, 1rsv:B, 3uus:E, 3uus:F, 3uus:G, 3uus:H, 6w4x:D, 1xik:A, 1xik:B, 2xof:A, 2xof:B, 1yfd:A, 1yfd:B
16 2rcc:C 311 197 0.1496 0.1318 0.2081 0.006 2rcc:B
17 6s4c:A 185 92 0.0949 0.1405 0.2826 0.019
18 7bqk:A 459 26 0.0547 0.0327 0.5769 0.084 7bqk:B, 7bql:A, 7bql:B
19 4n83:A 285 188 0.1606 0.1544 0.2340 0.090 4n83:B, 4n83:C, 4n83:D, 4n83:E, 4n83:F, 4n83:G, 4n83:H
20 7ycx:G 910 97 0.1131 0.0341 0.3196 0.11
21 8dq5:B 265 204 0.1679 0.1736 0.2255 0.14
22 1uzr:B 288 94 0.0985 0.0938 0.2872 0.24 1uzr:A, 1uzr:C
23 8dq3:D 297 198 0.1423 0.1313 0.1970 0.35 8dq3:A, 8dq3:B, 8dq3:C
24 1oqu:C 302 102 0.1022 0.0927 0.2745 0.37 3dhz:A, 3dhz:B, 1kgn:A, 1kgn:B, 1kgn:C, 1kgn:D, 1kgo:A, 1kgo:B, 1kgo:C, 1kgo:D, 1kgp:A, 1kgp:B, 1kgp:C, 1kgp:D, 3mjo:A, 3mjo:B, 1oqu:A, 1oqu:B, 1oqu:D
25 8gxu:B 578 37 0.0438 0.0208 0.3243 0.41 3a5c:A, 3a5c:C, 3a5c:I, 3a5c:K, 8gxw:B, 8gxw:C, 8gxx:A, 8gxx:B, 8gxx:C, 8gxz:C, 3j0j:A, 3j0j:C, 6ly8:A, 6qum:A, 6r0w:C, 6r0y:B, 6r0z:A, 6r10:A, 7val:A, 7val:B, 7val:C, 7vam:A, 7vam:B, 7vam:C, 7van:A, 7van:B, 7van:C, 7vao:A, 7vao:B, 7vao:C, 7vap:A, 7vap:B, 7vap:C, 7vaq:A, 7vaq:B, 7vaq:C, 7var:A, 7var:C, 7vas:A, 7vas:C, 7vat:A, 7vat:C, 7vau:A, 7vau:C, 7vav:A, 7vav:C, 7vaw:A, 7vaw:B, 7vaw:C, 7vax:A, 7vax:C, 7vax:B, 7vay:A, 7vay:B, 7vay:C, 7vb0:A, 7vb0:B, 7vb0:C, 3w3a:A, 3w3a:C, 3w3a:I, 3w3a:K, 5y5x:A, 5y5x:C, 5y5y:A, 5y5y:C, 5y5z:B, 5y5z:C, 5y60:A, 5y60:B
26 7mdi:E 353 107 0.0949 0.0737 0.2430 0.43 7mdi:G, 7mdi:F, 7mdi:H
27 2bq1:I 294 186 0.1533 0.1429 0.2258 0.48 2bq1:J, 1r2f:A, 1r2f:B, 2r2f:A, 2r2f:B
28 6gp2:A 318 126 0.1058 0.0912 0.2302 0.77 8bt4:A, 8bt4:B, 6gp2:B, 6gp3:A, 6gp3:B
29 2xfg:A 446 139 0.1350 0.0830 0.2662 3.0
30 1ldm:A 329 53 0.0693 0.0578 0.3585 3.1 6ldh:A
31 4dr0:B 291 218 0.1569 0.1478 0.1972 3.6 4dr0:A
32 2d73:A 717 56 0.0620 0.0237 0.3036 3.7 2d73:B, 2jka:A, 2jka:B, 2jke:A, 2jke:B, 2jkp:A, 2jkp:B, 3wfa:A, 3wfa:B, 2zq0:A, 2zq0:B
33 6da0:A 378 196 0.1642 0.1190 0.2296 3.7
34 8kgf:A 1261 95 0.0876 0.0190 0.2526 4.0
35 2inc:A 491 60 0.0730 0.0407 0.3333 4.3 2ind:A, 3n1x:A, 3n1y:A, 3n1z:A, 3n20:A, 2rdb:A, 3rn9:A, 3rna:A, 3rnb:A, 3rnc:A, 3rne:A, 3rnf:A, 3rng:A, 1t0q:A, 1t0r:A, 1t0s:A
36 4bmq:A 300 229 0.1898 0.1733 0.2271 5.2 4bmo:A, 4bmp:A, 4bmr:A, 4bmr:B, 4bmt:A, 4bmt:B, 4bmu:A, 4bmu:B, 6qo7:A, 6qo7:B, 6qo8:A, 6qo8:B, 6qo9:A, 6qo9:B, 6qob:A, 6qob:B, 6tqv:A, 6tqv:B, 6tqw:A, 6tqw:B, 6tqy:A, 6tqy:B, 6tqz:A, 6tqz:B, 7z3d:A, 7z3e:A
37 2ogi:B 194 48 0.0474 0.0670 0.2708 5.2 2ogi:A
38 5vyz:C 1083 97 0.1058 0.0268 0.2990 5.4 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
39 5vyz:A 1144 97 0.1058 0.0253 0.2990 5.6 5vyw:D, 5vyz:B, 5vyz:D, 5vz0:A, 5vz0:B, 5vz0:D, 7zyy:A, 7zyy:C, 7zyy:B, 7zyy:D, 7zyz:A, 7zz0:A, 7zz1:A, 7zz2:A, 7zz3:A, 7zz3:C, 7zz3:B, 7zz3:D, 7zz4:A, 7zz5:A, 7zz6:D, 7zz6:A, 7zz8:A, 7zz8:C, 7zz8:D, 7zz8:B
40 3dhi:A 498 53 0.0693 0.0382 0.3585 6.1 3dhg:A, 3dhg:D, 3dhh:A, 3ge3:A, 3ge8:A, 3ge8:D, 3i5j:A, 3i63:A, 4p1b:A, 4p1b:D, 4p1c:A, 4p1c:D, 3q14:A, 3q2a:A, 3q3m:A, 3q3m:D, 3q3n:A, 3q3o:A, 3ri7:A, 3rmk:A, 3rmk:D, 5tds:A, 5tds:D, 5tdt:A, 5tdt:D, 5tdu:A, 5tdv:A, 5tdv:D
41 6cwq:A 308 215 0.1715 0.1526 0.2186 6.7 6cwo:A, 6cwo:B, 6cwp:B, 6cwp:A, 6cwq:B, 8dq4:A, 8dq4:B, 8dq5:A
42 5w1h:A 1301 55 0.0511 0.0108 0.2545 8.2 5w1i:A, 5w1i:C, 5wlh:A
43 5vcm:B 358 54 0.0620 0.0475 0.3148 9.0 5vcm:A, 5vcs:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218