Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IEEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQAL
QQNGSSVLSEDKSKRLNTILNTMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLY
EEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQLIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIG
CLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGLPNMTQGFWENSMLTDPGNVQ
KAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKS
IGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDP
ASLFHVSNDYSFIRYYTRTLYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMN
VRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSPYADQSIKVRISLKSALGDKAYEWNDNEMYLFRSSVAYAMRQYFLKVKN
QMILFGEEDVRVANLKPRISFNFFVTAPKNVSDIIPRTEVEKAIRMSRSRINDAFRLNDNSLEFLGIQPTLGPPNQPPVS
IWLIVFGVVMGVIVVGIVILIFTGIRDR

The query sequence (length=748) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8p2x:A 750 748 1.0000 0.9973 1.0000 0.0 7a91:D, 7a92:D, 7a94:D, 2ajf:A, 2ajf:B, 8aqs:B, 8b9p:A, 8b9p:B, 8bfw:A, 8bfw:C, 7bh9:A, 8bn1:B, 8bn1:A, 8byj:B, 8byj:A, 3d0g:A, 3d0g:B, 3d0h:A, 3d0h:B, 7ddo:A, 7ddp:A, 8df5:E, 8df5:F, 7dmu:A, 7dmu:C, 7dqa:A, 7drv:A, 7drv:B, 7dwx:B, 7dwx:D, 7e7e:A, 7e7e:B, 8e7m:A, 7ekc:A, 7eke:A, 7ekf:A, 7ekg:A, 7ekh:A, 9fmm:A, 9fmm:B, 8fxc:A, 8h06:A, 8h5c:A, 8i91:A, 8i91:C, 8i92:A, 8i92:C, 8i93:A, 8i93:C, 8if2:A, 8iou:D, 8iov:A, 8jje:A, 8jyn:D, 8jyo:E, 8jyo:D, 8jyp:D, 7l0n:E, 7l0n:F, 7lo4:A, 6lzg:A, 6m0j:A, 6m17:B, 6m17:D, 7p19:A, 7p19:B, 8p2x:B, 8p2y:A, 8p2y:B, 8p30:A, 8p30:B, 8p31:A, 8p31:B, 7r0z:D, 7r10:D, 7r11:D, 7r12:D, 7r1a:D, 7r1a:E, 7r1a:F, 1r42:A, 1r4l:A, 7rpv:A, 3sci:A, 3sci:B, 3scj:A, 3scj:B, 3sck:A, 3sck:B, 3scl:A, 3scl:B, 7sn0:A, 7sn0:B, 8sph:A, 8sph:B, 8spi:A, 8spi:B, 7tn0:E, 8toq:A, 8tor:A, 8tos:A, 8tot:A, 8tot:B, 8tou:A, 7u0n:A, 7u0n:B, 7ufk:A, 7ufk:B, 7ufl:A, 7ufl:B, 8uze:A, 8uze:B, 8uzf:A, 8uzf:B, 7vib:A, 7vib:C, 8vqr:A, 8vqr:B, 7vx4:A, 7vx5:A, 7wbl:A, 7wbp:A, 7wbq:A, 7wbq:C, 8wdr:A, 8wdr:C, 8wds:A, 8wds:C, 8wdy:A, 8wdz:A, 8we0:A, 8we1:A, 8we4:A, 7whh:A, 8whs:D, 8whu:D, 8whu:E, 8whz:A, 7wnm:B, 7wpb:D, 7wpc:D, 8wp8:A, 7xaz:A, 7xaz:C, 7xb0:A, 7xb1:A, 7xbf:A, 7xbf:C, 7xbg:A, 7xbg:C, 7xbh:A, 7xch:D, 7xch:E, 7xci:A, 7xcp:A, 8xlm:D, 8xln:D, 8xn2:A, 8xn3:A, 8xn5:A, 8xnf:A, 8xnk:A, 7xo7:E, 7xo7:F, 7xo8:D, 7xo8:F, 7xo8:E, 7xo9:D, 8xsf:A, 8xsj:A, 7xwa:A, 7xwa:C, 8y16:A, 8y16:E, 8y16:F, 8y18:A, 8y6a:A, 7y75:A, 7y75:C, 7y76:A, 7y76:C, 7y9z:D, 7ya0:D, 7ya0:E, 7ya0:F, 7ya1:A, 7ydi:A, 7yeg:E, 7yeg:J, 7yeg:M, 7yhw:A, 7yj3:A, 7yr2:A, 7yr3:D, 7yr3:G, 7zf7:A
2 7e3j:A 695 685 0.7767 0.8360 0.8482 0.0 7c8d:A, 7w8s:A, 7wa1:A, 7wa3:A, 7wa3:B, 7wsg:A, 7wsh:A, 8xyz:A, 8xzb:A, 8xzd:A
3 7wsf:A 693 691 0.7701 0.8312 0.8336 0.0 8hfx:E, 8hfy:A, 8hfz:E, 8hg0:A, 8ify:F, 8wlo:E, 8wlr:A, 7wse:A
4 7c8j:A 707 705 0.7607 0.8048 0.8071 0.0 7c8k:A, 8k4u:B, 8u0t:A, 7xa7:A, 7xa7:C, 7xa7:E, 7xa7:G
5 8xxw:A 561 579 0.7473 0.9964 0.9655 0.0
6 7w6u:A 597 593 0.6939 0.8693 0.8752 0.0 7w6r:A, 7xby:A
7 8woy:A 596 594 0.6912 0.8674 0.8704 0.0 8wox:A, 8woz:A
8 7tn0:F 547 582 0.7286 0.9963 0.9364 0.0
9 7wsk:A 596 593 0.6765 0.8490 0.8533 0.0
10 8gry:A 597 595 0.6711 0.8409 0.8437 0.0 8ka8:A, 8kc2:A, 7wrh:D, 7wri:A, 7xo4:D, 7xo4:E, 7yv8:A, 7yvu:A
11 7dhx:A 593 593 0.6751 0.8516 0.8516 0.0
12 7q3y:A 1201 596 0.3342 0.2082 0.4195 1.14e-164 5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
13 7q3y:A 1201 604 0.3396 0.2115 0.4205 3.99e-159 5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
14 6s1y:A 595 577 0.2914 0.3664 0.3778 9.28e-138 6s1z:A
15 4aa1:A 598 598 0.2901 0.3629 0.3629 2.77e-135 5a2r:A, 4aa2:A, 4asq:A, 4asr:A, 4ca7:A, 4ca8:A, 1j36:A, 1j36:B, 1j37:A, 1j37:B, 1j38:A, 1j38:B, 2x8y:A, 2x8z:A, 2x90:A, 2x91:A, 2x92:A, 2x93:A, 2x94:A, 2x95:A, 2x96:A, 2x97:A, 2xhm:A, 3zqz:A
16 8crq:B 40 26 0.0201 0.3750 0.5769 1.7 8cs9:R, 8cs9:b
17 5i8f:A 164 53 0.0227 0.1037 0.3208 2.1 4n3e:A, 4n3e:B, 4n3e:Z, 4n3e:b, 4n3e:C, 4n3e:D, 4n3e:E, 4n3e:F, 4n3e:G, 4n3e:H, 4n3e:I, 4n3e:J, 4n3e:K, 4n3e:L, 4n3e:P, 4n3e:M, 4n3e:N, 4n3e:O, 4n3e:Q, 4n3e:S, 4n3e:R, 4n3e:U, 4n3e:V, 4n3e:W, 4n3e:X, 4n3e:Y, 4n3e:a, 6sjj:B, 6sjj:j, 6sjj:A, 6sjj:R, 6sjj:Q, 6sjj:P, 6sjj:O, 6sjj:N, 6sjj:M, 6sjj:L, 6sjj:K, 6sjj:J, 6sjj:I, 6sjj:a, 6sjj:Y, 6sjj:H, 6sjj:G, 6sjj:F, 6sjj:D, 6sjj:f, 6sjj:E, 6sjj:C, 6sjj:e, 6sjj:d, 6sjj:c, 6sjj:b, 6sjj:Z, 6sjj:X, 6sjj:W, 6sjj:V, 6sjj:U, 6sjj:T, 6sjj:S, 6sjj:i, 6sjj:h, 6sjj:g
18 1xc4:A 240 46 0.0201 0.0625 0.3261 2.5 1xc4:B
19 6wg3:D 932 49 0.0241 0.0193 0.3673 4.1 5qsn:B, 5qsq:B, 5qsr:B, 5qsy:B, 6rrk:A, 6rrk:B
20 7w1m:D 967 49 0.0241 0.0186 0.3673 4.2 5qsm:A, 5qso:A, 5qsp:A, 5qsq:A, 5qsr:A, 5qss:A, 5qst:C, 5qsu:C, 5qsv:D, 5qsw:C, 5qsw:D, 5qsx:C, 5qsx:D, 5qsz:A, 6rrc:C, 6rrc:A
21 8b08:A 269 46 0.0201 0.0558 0.3261 6.7 1a50:A, 1a5b:A, 1a5s:A, 5bw6:A, 1c29:A, 6c73:A, 1c8v:A, 1c9d:A, 3cep:A, 5cgq:A, 2cle:A, 2clf:A, 2clh:A, 2cli:A, 2clk:A, 2cll:A, 2clm:A, 2clo:A, 1cw2:A, 1cx9:A, 6d0v:A, 6duc:A, 6dzo:A, 1fuy:A, 4hn4:A, 4hpj:A, 4hpx:A, 4ht3:A, 2j9x:A, 7jhw:A, 7jll:A, 7jmq:A, 7jqw:A, 7jtt:A, 1k3u:A, 7k5a:A, 1k7e:A, 1k7f:A, 1k8z:A, 7ka1:A, 7kbn:A, 1kfb:A, 7kh6:A, 7ki7:A, 4kkx:A, 7kqf:A, 7ku9:A, 7kwv:A, 7kxc:A, 7kyt:A, 7l03:A, 7l1h:A, 7lgx:A, 7lkl:A, 7lpf:A, 7lt4:A, 7ltp:A, 7lv5:A, 7lvx:A, 7ly8:A, 7m2l:A, 7m3s:A, 7mt4:A, 7mt5:A, 7mt6:A, 6o1h:A, 3pr2:A, 1qoq:A, 2rh9:A, 2rhg:A, 1tjp:A, 2trs:A, 2tsy:A, 6vfd:A, 6vnt:A, 1wbj:A, 4wx2:A, 6wx3:A, 6x0c:A, 6xe3:A, 6xin:A, 6xnc:A, 6xoy:A, 6xrh:A, 6xsy:A, 6xt0:A, 4xug:A, 4y6g:A, 4zqc:A
22 2cx8:A 225 44 0.0174 0.0578 0.2955 8.0 2cx8:B, 2z0y:A, 2z0y:B
23 5ve8:B 1030 92 0.0321 0.0233 0.2609 9.3 5ve8:A, 5w0v:A, 5w0v:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218