Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IDFENEDFCSACNQSGSFLCCDTCPKSFHFLCLDPPIDPNNLPKGDWHCNECKFKIFINNSMATLKKIESNFIKQNNNVK
IFAKLLFNIDSHNPKQFQLPNYIKETFPAVKTGSRGQYSDEDENSIKYDFFDKIYKSKMVQKRKLFQFQESLIDKL

The query sequence (length=156) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8w9c:F 156 156 1.0000 1.0000 1.0000 5.99e-113 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
2 8hxx:N 375 122 0.7692 0.3200 0.9836 2.27e-85 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
3 8hxx:N 375 163 0.3718 0.1547 0.3558 4.82e-14 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
4 8kd6:E 301 129 0.7628 0.3953 0.9225 5.07e-84 8kd2:E
5 8kd6:E 301 148 0.2821 0.1462 0.2973 1.62e-05 8kd2:E
6 7yi2:D 321 125 0.7628 0.3707 0.9520 1.52e-83 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
7 7yi2:D 321 22 0.1410 0.0685 1.0000 1.02e-06 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
8 8ihn:M 357 120 0.7564 0.3305 0.9833 1.78e-83 8kd4:E
9 8ihn:M 357 167 0.3782 0.1653 0.3533 1.75e-15 8kd4:E
10 7yi0:F 120 138 0.7628 0.9917 0.8623 2.49e-79
11 8i02:G 284 118 0.3077 0.1690 0.4068 1.48e-24 8ifg:P
12 8i02:G 284 48 0.1218 0.0669 0.3958 1.4 8ifg:P
13 8i02:F 235 120 0.2628 0.1745 0.3417 6.04e-22
14 8bpa:C 213 103 0.2115 0.1549 0.3204 2.61e-14 8c60:C
15 8bpa:C 213 61 0.1346 0.0986 0.3443 0.002 8c60:C
16 2ke1:A 66 48 0.1410 0.3333 0.4583 3.85e-13 2kft:A, 1xwh:A
17 2puy:B 60 53 0.1603 0.4167 0.4717 9.81e-13 2puy:A
18 6ryr:W 708 46 0.1410 0.0311 0.4783 4.33e-12 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
19 2yql:A 56 49 0.1603 0.4464 0.5102 5.27e-12
20 2l5u:A 61 52 0.1346 0.3443 0.4038 1.44e-11
21 6ieu:A 170 51 0.1538 0.1412 0.4706 5.26e-11 6iet:A
22 6q3m:C 219 51 0.1474 0.1050 0.4510 8.13e-11 6q3m:A, 6q3m:B
23 6guu:B 204 49 0.1346 0.1029 0.4286 2.97e-10 6guu:A
24 3u5m:E 173 49 0.1410 0.1272 0.4490 6.43e-10
25 3u5o:C 195 52 0.1474 0.1179 0.4423 6.81e-10 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
26 3o36:A 184 49 0.1410 0.1196 0.4490 8.30e-10 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
27 7ebk:A 183 49 0.1410 0.1202 0.4490 2.28e-09 7ebj:A
28 1mm3:A 61 46 0.1346 0.3443 0.4565 3.61e-09
29 4ptb:A 178 51 0.1410 0.1236 0.4314 2.31e-08 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
30 5b73:A 313 64 0.1474 0.0735 0.3594 3.22e-07 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
31 6g8r:B 164 51 0.1282 0.1220 0.3922 1.69e-06 2md7:B, 2md8:C
32 2mny:A 55 45 0.1218 0.3455 0.4222 4.73e-06 2mnz:A
33 7klo:A 59 45 0.1282 0.3390 0.4444 4.85e-06 7klr:A
34 2miq:A 94 48 0.1282 0.2128 0.4167 2.22e-05
35 6oie:B 111 51 0.1410 0.1982 0.4314 2.99e-05 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
36 1f62:A 51 48 0.1090 0.3333 0.3542 4.05e-05
37 4lk9:A 126 49 0.1282 0.1587 0.4082 9.43e-05 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
38 4gy5:A 215 47 0.1154 0.0837 0.3830 2.29e-04 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
39 5hh7:A 192 56 0.1474 0.1198 0.4107 2.67e-04
40 8bpb:C 126 61 0.1346 0.1667 0.3443 2.88e-04 8bpc:C
41 9atn:A 98 50 0.1218 0.1939 0.3800 3.55e-04
42 4gnd:C 107 51 0.1282 0.1869 0.3922 5.77e-04 4gnd:A, 4gne:A, 4gnf:A, 4gng:A, 4gng:D
43 2ysm:A 111 52 0.1282 0.1802 0.3846 0.001
44 2ysm:A 111 49 0.1154 0.1622 0.3673 0.009
45 2e6r:A 92 44 0.1026 0.1739 0.3636 0.003
46 2naa:A 94 82 0.1410 0.2340 0.2683 0.006
47 5vab:A 54 44 0.1090 0.3148 0.3864 0.013
48 7xga:A 126 58 0.1090 0.1349 0.2931 0.013 6vfo:A
49 5szb:A 115 33 0.0897 0.1217 0.4242 0.015 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
50 4tvr:A 222 46 0.0962 0.0676 0.3261 0.029
51 5b79:A 118 50 0.1090 0.1441 0.3400 0.066 5vdc:A
52 6fhq:A 58 51 0.1154 0.3103 0.3529 0.088 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
53 4q6f:A 56 35 0.0833 0.2321 0.3714 0.091 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
54 2yt5:A 66 35 0.0833 0.1970 0.3714 0.15
55 2e6s:A 77 34 0.0897 0.1818 0.4118 0.20
56 5xfr:A 309 65 0.1282 0.0647 0.3077 0.53 5xfr:B
57 2qic:A 51 47 0.1218 0.3725 0.4043 0.81
58 5yc3:A 60 33 0.0833 0.2167 0.3939 1.3 5yc4:A
59 3chm:A 161 54 0.0705 0.0683 0.2037 3.0
60 1x4i:A 70 50 0.1090 0.2429 0.3400 3.1 7zmx:A, 7zmx:B
61 1wes:A 71 58 0.1346 0.2958 0.3621 4.2 2g6q:A
62 7bbd:B 160 30 0.0769 0.0750 0.4000 7.5 8a58:C, 8a58:D, 8c07:I, 8f1f:C, 8f1f:c, 6fga:A, 6fga:B, 6fga:C, 6fga:D, 6fga:E, 6fga:F, 6fga:G, 6fga:H, 5m93:B, 5m93:C, 7nbb:C, 5o44:E, 6s53:B, 6s53:A, 6s53:H, 6s53:G, 3zlz:B
63 2l43:A 80 55 0.1026 0.2000 0.2909 7.6 2ku3:A
64 8om2:5 291 47 0.0833 0.0447 0.2766 8.3 8d8j:5, 8d8k:5, 8d8l:5, 8om3:5, 8om4:5
65 2mum:A 50 28 0.0705 0.2200 0.3929 8.9
66 4kyw:A 254 106 0.1731 0.1063 0.2547 9.8 4esj:A, 4esj:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218