Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
IAKMRTMIEGFDDISHGGLPIGRSTLVSGTSGTGKTLFSIQFLYNGIIEFDEPGVFVTFEETPQDIIKNARSFGWDLAKL
VDEGKLFILDASPDPEFDLSALIERINYAIQKYRARRVSIDSVTSVFDASSVVRRELFRLVARLKQIGATTVMTTERIEE
YGPIARYGVEEFVSDNVVILRNVLEGERRRRTLEILKLRGTSHMKGEYPFTITDHGINIFPLGSSNVRVSSGVVRLDEMC
GGGFFKDSIILATGATGTGKTLLVSRFVENACANKERAILFAYEESRAQLLRNAYSWGMDFEEMERQNLLKIVCAYPESA
GLEDHLQIIKSEINDFKPARIAIDSLSALARGVSNNAFRQFVIGVTGYAKQEEITGLFTNTSDQFMGAHSITDSHISTIT
DTIILLQYVEIRGEMSRAINVFKMRGSWHDKAIREFMISDKGPDIKDSFRNFERIISGSPTRI

The query sequence (length=463) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4dug:A 506 480 0.9978 0.9130 0.9625 0.0 4dug:B, 4dug:C, 4dug:D, 4dug:E, 4dug:F, 3dvl:A, 3dvl:B, 3dvl:C, 3dvl:D, 3dvl:E, 3dvl:F, 7dxq:A, 7dxq:B, 7dxq:C, 7dxq:E, 7dxq:F, 7dxq:D, 7dy2:A, 7dy2:B, 7dy2:C, 7dy2:E, 7dy2:F, 7dy2:I, 7dy2:K, 7dy2:J, 2gbl:A, 2gbl:B, 2gbl:C, 2gbl:D, 2gbl:E, 2gbl:F, 4ijm:A, 4ijm:B, 4ijm:F, 4ijm:C, 4ijm:D, 4ijm:E, 8jon:A, 8jon:B, 8jon:C, 8jon:D, 8jon:E, 8jon:F, 3jzm:A, 3jzm:B, 3jzm:C, 3jzm:D, 3jzm:E, 3jzm:F, 3k09:A, 3k09:B, 3k09:C, 3k09:D, 3k09:E, 3k09:F, 3k0a:A, 3k0a:B, 3k0a:F, 3k0a:C, 3k0a:D, 3k0a:E, 3k0c:A, 3k0c:B, 3k0c:C, 3k0c:D, 3k0c:E, 3k0c:F, 3k0e:A, 3k0e:B, 3k0e:C, 3k0e:D, 3k0e:E, 3k0e:F, 3k0f:A, 3k0f:B, 3k0f:C, 3k0f:D, 3k0f:E, 3k0f:F, 3s1a:A, 3s1a:B, 3s1a:C, 3s1a:D, 3s1a:E, 3s1a:F, 7s65:A, 7s65:B, 7s65:C, 7s65:D, 7s65:E, 7s65:F, 7s66:A, 7s66:B, 7s66:C, 7s66:D, 7s66:E, 7s66:F, 7s67:A, 7s67:B, 7s67:F, 7s67:C, 7s67:D, 7s67:E, 1tf7:A, 1tf7:B, 1tf7:C, 1tf7:D, 1tf7:E, 1tf7:F, 4tl6:A, 4tl6:B, 4tl6:C, 4tl7:A, 4tl7:B, 4tl7:C, 4tl7:D, 4tl7:E, 4tl7:F, 4tl8:A, 4tl8:B, 4tl8:C, 4tl8:D, 4tl8:E, 4tl8:F, 4tl9:A, 4tl9:B, 4tl9:C, 4tl9:D, 4tl9:E, 4tl9:F, 4tla:A, 4tla:B, 4tla:C, 4tla:D, 4tla:E, 4tla:F, 4tlb:A, 4tlb:B, 4tlb:C, 4tlb:D, 4tlb:E, 4tlb:F, 4tlc:A, 4tlc:B, 4tlc:C, 4tlc:D, 4tlc:E, 4tlc:F, 4tld:A, 4tld:B, 4tld:C, 4tld:D, 4tld:E, 4tld:F, 4tle:A, 4tle:B, 4tle:C, 4tle:D, 4tle:E, 4tle:F, 1u9i:A, 1u9i:B, 1u9i:C, 1u9i:D, 1u9i:E, 1u9i:F, 7v3x:A, 7v3x:B, 7v3x:C, 7v3x:E, 7v3x:F, 7v3x:D, 7v3x:G, 7v3x:H, 7v3x:I, 7v3x:K, 7v3x:L, 7v3x:J, 7v3x:R, 7v3x:M, 7v3x:Q, 7v3x:W, 7x1y:A, 7x1y:B, 7x1y:C, 7x1y:D, 7x1y:E, 7x1y:F, 7x1z:A, 7x1z:B, 7x1z:C, 7x1z:D, 7x1z:E, 7x1z:F, 5yz8:A, 5yz8:B, 5yz8:C, 5yz8:D, 5yz8:E, 5yz8:F
2 7v3x:O 461 467 0.9741 0.9783 0.9657 0.0 7dy2:D, 7dy2:G, 7dy2:H, 7dy2:L, 7dye:A, 7dye:B, 7dyi:A, 7dyi:B, 7dyj:A, 7dyj:B, 7dyk:A, 7dyk:B, 7v3x:N, 7v3x:P, 7v3x:X, 7v3x:S, 7wdc:A, 7wdc:B, 8wv8:A, 8wv8:B, 8wve:A, 8wve:B
3 7v3x:V 437 470 0.9244 0.9794 0.9106 0.0 7v3x:U
4 4o0m:A 494 480 0.8294 0.7773 0.8000 0.0 5jwo:A, 4o0m:B, 4o0m:C
5 7dy1:D 458 464 0.8121 0.8210 0.8103 0.0 7dy1:A, 7dy1:B, 7dy1:C, 7dy1:E, 7dy1:F
6 7v3x:T 415 463 0.8898 0.9928 0.8898 0.0
7 5jwq:A 413 445 0.7257 0.8136 0.7551 0.0 5jwq:C
8 8fwj:A 552 460 0.3866 0.3243 0.3891 2.05e-96 8db3:A, 8db3:B, 8db3:C, 8dba:A, 8dba:E, 8dba:D, 8dba:G, 8dba:H, 8dba:K, 8fwi:A, 8fwi:D, 8fwi:B, 8fwi:K, 8fwi:C, 8fwi:F, 8fwi:E, 8fwi:H, 8fwi:G, 8fwi:J, 8fwi:I, 8fwi:L, 8fwj:B, 8fwj:C, 8fwj:D, 8fwj:E, 8fwj:F, 8fwj:G, 8fwj:H, 8fwj:I, 8fwj:J, 8fwj:K, 8fwj:L
9 8fwj:A 552 210 0.1253 0.1051 0.2762 1.21e-11 8db3:A, 8db3:B, 8db3:C, 8dba:A, 8dba:E, 8dba:D, 8dba:G, 8dba:H, 8dba:K, 8fwi:A, 8fwi:D, 8fwi:B, 8fwi:K, 8fwi:C, 8fwi:F, 8fwi:E, 8fwi:H, 8fwi:G, 8fwi:J, 8fwi:I, 8fwi:L, 8fwj:B, 8fwj:C, 8fwj:D, 8fwj:E, 8fwj:F, 8fwj:G, 8fwj:H, 8fwj:I, 8fwj:J, 8fwj:K, 8fwj:L
10 8dba:J 510 453 0.3758 0.3412 0.3841 1.62e-92 8dba:C, 8dba:B, 8dba:F, 8dba:I, 8dba:L
11 8dba:J 510 210 0.1188 0.1078 0.2619 1.05e-09 8dba:C, 8dba:B, 8dba:F, 8dba:I, 8dba:L
12 2zts:C 226 228 0.1793 0.3673 0.3640 2.59e-35 2zts:A, 2zts:B
13 2zts:C 226 222 0.1296 0.2655 0.2703 1.07e-07 2zts:A, 2zts:B
14 2dr3:D 242 235 0.1749 0.3347 0.3447 3.31e-34 2dr3:A, 2dr3:B, 2dr3:C, 2dr3:E, 2dr3:F
15 2dr3:D 242 231 0.1317 0.2521 0.2641 1.15e-19 2dr3:A, 2dr3:B, 2dr3:C, 2dr3:E, 2dr3:F
16 2w0m:A 220 221 0.1425 0.3000 0.2986 6.45e-21
17 2w0m:A 220 229 0.1296 0.2727 0.2620 8.70e-12
18 4yds:A 226 81 0.0605 0.1239 0.3457 6.45e-05
19 4yds:A 226 203 0.1080 0.2212 0.2463 0.21
20 8gbj:C 317 37 0.0302 0.0442 0.3784 0.066 8faz:C, 8ouy:B, 8ouz:B
21 3fyh:A 296 70 0.0410 0.0642 0.2714 0.43 2gdj:A
22 3fyh:A 296 243 0.1274 0.1993 0.2428 1.3 2gdj:A
23 8gja:C 274 37 0.0324 0.0547 0.4054 0.52 8gj8:A, 8gja:A, 8gja:E
24 1xu4:A 318 70 0.0410 0.0597 0.2714 0.60 2b21:A, 2f1h:A, 2f1i:A, 2f1j:A, 2fpk:A, 2fpl:A, 2fpm:A, 2i1q:A, 3ntu:A, 1t4g:A
25 1xmv:A 293 134 0.0734 0.1160 0.2537 1.7
26 6hqu:G 194 36 0.0324 0.0773 0.4167 1.9 6hqu:H
27 4d6p:B 229 36 0.0324 0.0655 0.4167 2.4 4a6x:A, 4a6x:B, 4b2i:A, 4b2l:A, 4b2p:A, 4b32:A, 4b33:A, 4b34:A, 4b35:A, 4b3b:A, 4b3d:A, 4b3d:C, 4d6p:A, 5fos:A, 5fot:A, 5fou:A, 5fov:A, 5fov:C, 5fow:A, 5fow:C, 5fox:A, 5fpk:A, 5j4h:A, 5j4k:A, 5jee:A, 5jfg:A, 5lbi:A, 5qub:A, 5quc:A, 5qud:A, 5que:A, 5quf:A, 5qug:A, 5quh:A, 5qui:A, 5quj:A, 5qur:A, 5qus:A, 5qut:A, 6tuu:A, 6tuu:B, 6tuu:C, 6tuu:D, 6tv3:A, 6tw3:A, 6tw4:A, 6tw9:A, 4uqo:A, 4uqo:B, 6xtw:A, 6xuf:A, 6xuj:A
28 5xc3:A 168 60 0.0432 0.1190 0.3333 2.6 5xc5:A
29 6hqu:B 219 37 0.0324 0.0685 0.4054 2.9 8br9:A, 8c3n:A, 6hqu:C, 6hqu:F, 6hqu:A, 6hqu:D, 6hqu:E
30 4zc0:B 434 78 0.0540 0.0576 0.3205 3.4 3gxv:A
31 5lkm:A 390 148 0.0713 0.0846 0.2230 3.4 5lkm:C
32 5lkm:A 390 168 0.0778 0.0923 0.2143 4.1 5lkm:C
33 3cmv:A 1190 450 0.2160 0.0840 0.2222 3.5 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
34 2bov:A 173 28 0.0216 0.0578 0.3571 3.8 2a78:A, 2a9k:A, 8fjh:B, 8fji:B, 6p0i:B, 6p0j:B, 6p0k:B, 6p0l:B, 6p0m:B, 6p0n:B, 6p0o:B, 1u8y:A, 1u8y:B, 1u8z:A, 1u8z:B, 1u90:A, 1u90:B, 1uad:A, 1uad:B, 1zc3:A, 1zc3:C, 1zc4:A, 1zc4:C
35 5lb9:A 365 49 0.0367 0.0466 0.3469 4.3 1guf:A, 1guf:B, 5lbx:A, 5lbx:B, 1n9g:A, 1n9g:B, 1n9g:E, 4was:A, 4was:B, 4was:C
36 2kwi:A 178 28 0.0216 0.0562 0.3571 4.5 2ke5:A, 6zqt:A, 6zqt:B, 6zrn:A, 6zrn:B
37 6o75:A 710 55 0.0410 0.0268 0.3455 4.6 6o74:A, 6o78:A, 6o79:A, 6o7b:A, 6o7d:A
38 4j2o:C 316 52 0.0389 0.0570 0.3462 5.3 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
39 6muu:A 780 55 0.0410 0.0244 0.3455 5.4 6iqw:A, 6mur:A, 6mus:A, 6mut:A, 6o7e:A, 6o7h:A
40 7uqj:A 585 32 0.0302 0.0239 0.4375 5.5 7uqi:A, 7uqi:B, 7uqi:C, 7uqi:D, 7uqj:C, 7uqj:D, 7uqj:E, 7uqj:F, 7uqj:B, 7uqk:A, 7uqk:B, 7uqk:C, 7uqk:D
41 7uqi:E 558 32 0.0302 0.0251 0.4375 5.6 7uqk:E
42 3ew9:A 314 68 0.0432 0.0637 0.2941 6.0 3etl:A, 3ewa:A
43 3ram:A 391 60 0.0389 0.0460 0.3000 6.7 3ram:B, 3ram:C, 3ram:D
44 8szq:A 861 33 0.0281 0.0151 0.3939 7.5 3llm:A, 3llm:B, 8szp:A, 8szp:B, 8szr:A, 8szs:A
45 1gl6:B 420 89 0.0518 0.0571 0.2697 7.9 1gki:A, 1gki:B, 1gki:D, 1gki:E, 1gki:F, 1gki:G, 1gl6:A, 1gl6:D, 1gl6:E, 1gl6:F, 1gl6:G, 1gl7:A, 1gl7:B, 1gl7:D, 1gl7:E, 1gl7:F, 1gl7:G
46 8a3v:A 450 60 0.0346 0.0356 0.2667 7.9 8a3v:B, 6t66:A, 6t66:B, 6t66:C, 6t66:D, 6t66:E, 6t66:F
47 7qv8:A 208 155 0.0864 0.1923 0.2581 8.9
48 6bbm:A 405 60 0.0324 0.0370 0.2500 9.1
49 3cmv:G 1167 68 0.0432 0.0171 0.2941 9.9 3cmv:B, 3cmv:E
50 3cmv:G 1167 68 0.0432 0.0171 0.2941 9.9 3cmv:B, 3cmv:E
51 3cmv:G 1167 68 0.0432 0.0171 0.2941 9.9 3cmv:B, 3cmv:E
52 3cmv:G 1167 68 0.0432 0.0171 0.2941 9.9 3cmv:B, 3cmv:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218