Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
HVNKVALIGAGFVGSSYAFALINQGITDELVVIDVNKEKAMGDVMDLNHGKAFAPQPVKTSYGTYEDCKDADIVCICAGR
LELVEKNLKIFKGIVSEVMASGFDGIFLVATNPVDILTYATWKFSGLPKERVIGSGTTLDSARFRFMLSEYFGAAPQNVH
AHIIGEHGDTELPVWSHANVGGVPVSELVEKNDAYKQEELDQIVDDVKNAAYHIIEKKGATYYGVAMSLARITKAILHNE
NSILTVSTYLDGQYGADDVYIGVPAVVNRGGIAGITELNLNEKEKEQFLHSAGVLKNILKP

The query sequence (length=301) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3pqd:B 312 309 1.0000 0.9647 0.9741 0.0 3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
2 1ldn:A 316 304 0.6711 0.6392 0.6645 2.88e-152 1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
3 4ln1:B 321 308 0.6478 0.6075 0.6331 6.64e-145 4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
4 1ldb:A 294 296 0.6478 0.6633 0.6588 3.47e-144
5 3h3j:B 314 305 0.6412 0.6146 0.6328 2.53e-139 3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
6 1llc:A 320 305 0.5449 0.5125 0.5377 1.27e-114 6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
7 3wsw:A 316 305 0.5183 0.4937 0.5115 1.74e-112 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
8 1ez4:B 318 305 0.5249 0.4969 0.5180 7.63e-106 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
9 2e37:C 310 303 0.4186 0.4065 0.4158 1.31e-82 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
10 6h9s:B 292 301 0.4352 0.4486 0.4352 2.06e-81 6h9s:A
11 1lld:A 313 306 0.4286 0.4121 0.4216 6.22e-78 1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
12 8ab3:A 330 307 0.4452 0.4061 0.4365 6.69e-78 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
13 1a5z:A 312 302 0.4252 0.4103 0.4238 1.19e-76
14 7dbj:A 333 311 0.3920 0.3544 0.3794 9.44e-72 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
15 6k13:A 332 308 0.3887 0.3524 0.3799 2.04e-71 6k13:B
16 4qsm:A 332 308 0.3854 0.3494 0.3766 4.07e-70 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
17 7epm:A 335 308 0.4020 0.3612 0.3929 1.24e-69 7epm:B
18 1ldm:A 329 307 0.3721 0.3404 0.3648 2.60e-65 6ldh:A
19 1v6a:A 332 308 0.3887 0.3524 0.3799 7.65e-64 1v6a:B
20 8rwl:A 312 306 0.3987 0.3846 0.3922 5.69e-59 9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
21 4plf:B 330 314 0.3555 0.3242 0.3408 7.59e-58 4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
22 7f8d:A 313 314 0.3654 0.3514 0.3503 4.59e-56 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
23 1guz:A 305 303 0.3389 0.3344 0.3366 7.32e-56 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
24 7nay:A 322 311 0.3322 0.3106 0.3215 1.03e-55
25 4plt:B 319 288 0.3355 0.3166 0.3507 2.04e-55 4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
26 1gv0:A 301 299 0.3355 0.3355 0.3378 1.27e-52 1gv0:B
27 1d3a:A 303 291 0.3355 0.3333 0.3471 2.66e-50 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
28 2x0i:A 294 307 0.3455 0.3537 0.3388 3.19e-48 2x0j:A
29 3gvh:A 318 300 0.3189 0.3019 0.3200 6.32e-48 3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
30 4ros:A 318 309 0.3322 0.3145 0.3236 1.20e-47 5ujk:A
31 1uxg:A 308 308 0.3223 0.3149 0.3149 2.07e-47 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
32 1hyg:A 313 309 0.3455 0.3323 0.3366 4.90e-47 1hye:A, 1hyg:B
33 3czm:B 323 305 0.3256 0.3034 0.3213 5.97e-47 3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
34 6ct6:B 331 296 0.2990 0.2719 0.3041 1.19e-45 6ct6:A
35 2hjr:B 314 308 0.3256 0.3121 0.3182 1.38e-45 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
36 1hyh:A 297 294 0.3156 0.3199 0.3231 1.63e-45 1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
37 2a92:C 318 299 0.2990 0.2830 0.3010 2.79e-45 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
38 1t2e:A 317 299 0.3056 0.2902 0.3077 1.43e-44 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
39 6r8g:C 312 299 0.3056 0.2949 0.3077 1.97e-38 6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
40 3ldh:A 329 325 0.3189 0.2918 0.2954 4.13e-37
41 2fn7:A 317 308 0.2957 0.2808 0.2890 1.66e-36 2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
42 6qss:A 303 304 0.3056 0.3036 0.3026 3.01e-34 6qss:D
43 3om9:A 329 306 0.3023 0.2766 0.2974 4.51e-32 3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
44 6ihd:B 304 294 0.2724 0.2697 0.2789 7.44e-25 6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
45 1emd:A 312 295 0.2591 0.2500 0.2644 4.79e-09 1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46 2dfd:A 314 290 0.2392 0.2293 0.2483 2.08e-07 2dfd:B, 2dfd:C, 2dfd:D, 4wlo:A, 4wlo:B, 4wlo:C, 4wlo:D, 4wlu:A, 4wlu:B, 4wlu:C, 4wlu:D, 4wlv:A, 4wlv:B, 4wlv:C, 4wlv:D
47 6itl:A 312 165 0.1495 0.1442 0.2727 1.06e-05
48 7mdh:B 360 135 0.1130 0.0944 0.2519 0.063 7mdh:A, 7mdh:C, 7mdh:D
49 4xr9:A 456 89 0.0897 0.0592 0.3034 0.072
50 5kvv:A 327 143 0.1395 0.1284 0.2937 0.074 5kvv:B
51 1civ:A 374 135 0.1063 0.0856 0.2370 0.15
52 2x6t:G 308 40 0.0598 0.0584 0.4500 0.19 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
53 1eq2:A 273 40 0.0598 0.0659 0.4500 0.21 1eq2:C
54 6itk:A 318 143 0.1329 0.1258 0.2797 0.23 6itk:B
55 1bdm:B 327 211 0.1827 0.1682 0.2607 0.53 1bdm:A, 1bmd:A, 1bmd:B, 2cvq:A, 2cvq:B, 1wze:A, 1wze:B, 1wzi:A, 1wzi:B, 1y7t:A, 1y7t:B
56 8adl:B 801 122 0.1030 0.0387 0.2541 0.53 8adl:G, 8adl:O, 8adl:J
57 4k28:A 266 64 0.0731 0.0827 0.3438 1.7 4k28:B
58 4uup:A 335 147 0.1362 0.1224 0.2789 2.3 4uup:B
59 3uer:A 651 20 0.0299 0.0138 0.4500 3.3
60 3x2f:A 406 147 0.1395 0.1034 0.2857 3.7 5tov:B, 5tow:B, 3x2e:A, 3x2e:B, 3x2e:C, 3x2e:D, 3x2f:B
61 3atq:A 452 39 0.0465 0.0310 0.3590 4.7 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
62 6u05:A 413 60 0.0764 0.0557 0.3833 5.1 6tzm:A, 6tzo:A, 6tzx:A, 6u00:B, 6u03:A, 5u32:A
63 8q9t:A 1075 100 0.0864 0.0242 0.2600 7.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218