BioLiP

>protein
HVNKVALIGAGFVGSSYAFALINQGITDELVVIDVNKEKAMGDVMDLNHGKAFAPQPVKTSYGTYEDCKDADIVCICAGA
NQKPGETRLELVEKNLKIFKGIVSEVMASGFDGIFLVATNPVDILTYATWKFSGLPKERVIGSGTTLDSARFRFMLSEYF
GAAPQNVHAHIIGEHGDTELPVWSHANVGGVPVSELVEKNDAYKQEELDQIVDDVKNAAYHIIEKKGATYYGVAMSLARI
TKAILHNENSILTVSTYLDGQYGADDVYIGVPAVVNRGGIAGITELNLNEKEKEQFLHSAGVLKNILKPHF

The query sequence (length=311) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3pqd:B	312	311	1.0000	0.9968	1.0000	0.0	3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
2	1ldn:A	316	308	0.6785	0.6677	0.6851	3.31e-162	1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
3	4ln1:B	321	308	0.6463	0.6262	0.6526	1.64e-152	4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
4	3h3j:B	314	305	0.6431	0.6369	0.6557	6.22e-148	3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
5	1ldb:A	294	308	0.6367	0.6735	0.6429	5.26e-144
6	1llc:A	320	309	0.5466	0.5312	0.5502	2.62e-122	6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
7	3wsw:A	316	305	0.5209	0.5127	0.5311	6.83e-121	3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
8	1ez4:B	318	305	0.5273	0.5157	0.5377	8.75e-114	1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
9	2e37:C	310	303	0.4212	0.4226	0.4323	5.21e-90	2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
10	1lld:A	313	306	0.4277	0.4249	0.4346	9.93e-85	1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
11	1a5z:A	312	302	0.4309	0.4295	0.4437	2.40e-84
12	8ab3:A	330	307	0.4437	0.4182	0.4495	9.68e-84	8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
13	6h9s:B	292	305	0.4309	0.4589	0.4393	2.44e-83	6h9s:A
14	6k13:A	332	308	0.3891	0.3645	0.3929	1.02e-77	6k13:B
15	7dbj:A	333	311	0.3891	0.3634	0.3891	2.43e-77	6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
16	7epm:A	335	308	0.4051	0.3761	0.4091	1.87e-76	7epm:B
17	4qsm:A	332	308	0.3859	0.3614	0.3896	3.23e-76	4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
18	1ldm:A	329	307	0.3730	0.3526	0.3779	1.59e-71	6ldh:A
19	1v6a:A	332	308	0.3891	0.3645	0.3929	5.26e-70	1v6a:B
20	8rwl:A	312	308	0.3955	0.3942	0.3994	8.50e-62	9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
21	1guz:A	305	303	0.3408	0.3475	0.3498	1.13e-61	1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
22	7f8d:A	313	314	0.3633	0.3610	0.3599	3.39e-61	7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
23	4plf:B	330	314	0.3505	0.3303	0.3471	5.23e-61	4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
24	7nay:A	322	311	0.3344	0.3230	0.3344	1.87e-60
25	4plt:B	319	288	0.3344	0.3260	0.3611	2.13e-59	4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
26	1d3a:A	303	291	0.3344	0.3432	0.3574	6.76e-56	1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
27	1gv0:A	301	303	0.3248	0.3355	0.3333	1.61e-55	1gv0:B
28	2x0i:A	294	307	0.3473	0.3673	0.3518	5.38e-54	2x0j:A
29	1uxg:A	308	307	0.3248	0.3279	0.3290	2.00e-53	1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
30	3gvh:A	318	300	0.3183	0.3113	0.3300	2.35e-53	3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
31	4ros:A	318	309	0.3312	0.3239	0.3333	4.98e-53	5ujk:A
32	1hyg:A	313	309	0.3408	0.3387	0.3430	4.67e-51	1hye:A, 1hyg:B
33	2hjr:B	314	309	0.3280	0.3248	0.3301	1.43e-50	2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
34	3czm:B	323	305	0.3215	0.3096	0.3279	6.47e-50	3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
35	6ct6:B	331	296	0.2958	0.2779	0.3108	9.39e-49	6ct6:A
36	2a92:C	318	299	0.2958	0.2893	0.3077	1.60e-48	2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
37	1t2e:A	317	299	0.3023	0.2965	0.3144	1.03e-47	4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
38	1hyh:A	297	304	0.3087	0.3232	0.3158	1.43e-43	1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
39	3ldh:A	329	325	0.3215	0.3040	0.3077	2.91e-43
40	6r8g:C	312	299	0.3055	0.3045	0.3177	2.94e-43	6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
41	2fn7:A	317	308	0.2894	0.2839	0.2922	1.10e-39	2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
42	3om9:A	329	306	0.2990	0.2827	0.3039	4.09e-35	3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
43	6qss:A	303	308	0.3023	0.3102	0.3052	2.33e-34	6qss:D
44	6ihd:B	304	294	0.2733	0.2796	0.2891	5.18e-30	6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
45	1emd:A	312	294	0.2540	0.2532	0.2687	1.59e-13	1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46	2dfd:A	314	290	0.2444	0.2420	0.2621	1.66e-12	2dfd:B, 2dfd:C, 2dfd:D, 4wlo:A, 4wlo:B, 4wlo:C, 4wlo:D, 4wlu:A, 4wlu:B, 4wlu:C, 4wlu:D, 4wlv:A, 4wlv:B, 4wlv:C, 4wlv:D
47	6itl:A	312	165	0.1576	0.1571	0.2970	9.06e-11
48	5nue:B	332	247	0.1961	0.1837	0.2470	8.58e-07	5nue:A, 5nue:C, 5nuf:A, 5nuf:B, 5nuf:C
49	5zi2:A	339	334	0.2701	0.2478	0.2515	6.41e-06	5zi2:B, 5zi4:A, 5zi4:B
50	7qoz:A	323	267	0.2090	0.2012	0.2434	1.09e-04	7qoz:B, 7qoz:C, 7qoz:D, 7qoz:E, 7qoz:F, 7qoz:G, 7qoz:H
51	1bdm:B	327	211	0.1865	0.1774	0.2749	1.48e-04	1bdm:A, 1bmd:A, 1bmd:B, 2cvq:A, 2cvq:B, 1wze:A, 1wze:B, 1wzi:A, 1wzi:B, 1y7t:A, 1y7t:B
52	1civ:A	374	217	0.1608	0.1337	0.2304	5.21e-04
53	4uup:A	335	169	0.1543	0.1433	0.2840	5.77e-04	4uup:B
54	7mdh:B	360	217	0.1704	0.1472	0.2442	6.90e-04	7mdh:A, 7mdh:C, 7mdh:D
55	1b8u:A	327	234	0.1640	0.1560	0.2179	0.001	1b8v:A
56	4mdh:A	333	240	0.1897	0.1772	0.2458	0.008	4mdh:B, 5mdh:A, 5mdh:B, 7rm9:A
57	5kvv:A	327	239	0.2154	0.2049	0.2803	0.020	5kvv:B
58	4xr9:A	456	106	0.0997	0.0680	0.2925	0.048
59	4uun:B	337	218	0.1672	0.1543	0.2385	0.15	5a1t:A, 5a1t:B, 4uun:A
60	2x6t:G	308	40	0.0579	0.0584	0.4500	0.18	1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
61	1eq2:A	273	40	0.0579	0.0659	0.4500	0.19	1eq2:C
62	6itk:A	318	143	0.1286	0.1258	0.2797	0.24	6itk:B
63	4gvq:A	315	66	0.0772	0.0762	0.3636	0.39	4gvq:B, 4gvs:B
64	8adl:B	801	122	0.0997	0.0387	0.2541	0.51	8adl:G, 8adl:O, 8adl:J
65	4k28:A	266	64	0.0707	0.0827	0.3438	1.5	4k28:B
66	1qgc:4	218	73	0.0707	0.1009	0.3014	1.7	1acy:L, 1ai1:L, 1ejo:L, 7f35:A, 7f35:C, 7f35:E, 3f58:L, 4gag:L, 4gaj:L, 1ggi:L, 1ggi:M, 1ibg:L, 3s35:L, 7st8:L, 5vxr:L, 5w23:N, 5x2m:L, 2y5t:B
67	8jyq:E	164	80	0.0707	0.1341	0.2750	1.9	8jyq:B
68	8dao:D	109	85	0.0740	0.2110	0.2706	2.5	7tn9:N, 7tn9:P
69	7dbe:B	332	26	0.0354	0.0331	0.4231	3.0	7dbe:A, 7dbe:C, 7dbe:D, 7wud:B, 7wud:A, 7wud:C, 7wud:D
70	4nbm:C	369	88	0.0772	0.0650	0.2727	3.4	4nbm:D, 4nc4:A, 4nc4:C
71	3uer:A	651	20	0.0289	0.0138	0.4500	3.6
72	3atq:A	452	39	0.0450	0.0310	0.3590	4.6	3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
73	4k36:A	381	92	0.0675	0.0551	0.2283	5.2	4k36:B, 4k37:A, 4k37:B, 4k38:B, 4k38:A, 4k39:B, 4k39:A
74	6u05:A	413	60	0.0740	0.0557	0.3833	5.9	6tzm:A, 6tzo:A, 6tzx:A, 6u00:B, 6u03:A, 5u32:A
75	5jop:D	218	73	0.0707	0.1009	0.3014	7.5	5jop:L
76	8q9t:A	1075	100	0.0836	0.0242	0.2600	9.3
77	6iun:B	692	87	0.0804	0.0361	0.2874	9.7	6iun:A

[Back]