BioLiP

>protein
HTPEEALALLKRGAEEIVPEEELLAKLKEGRPLTVKLGADPTRPDLHLGHAVVLRKMRQFQELGHKVVLIIGDFTGMIGD
PSGRSKTRPPLTLEETRENAKTYVAQAGKILRQEPHLFELRYNSEWLEGLTFKEVVRLTSLMTVAQMLEREDFKKRYEAG
IPISLHELLYPFAQAYDSVAIRADVEMGGTDQRFNLLVGREVQRAYGQSPQVCFLMPLLVGLDGREKMSKSLDNYIGLTE
PPEAMFKKLMRVPDPLLPSYFRLLTDLEEEEIEALLKAGPVPAHRVLARLLTAAYALPQIPPRIDRAFYESLGYAWEAFG
RDKEAGPEEVRRAEARYDEVAKGGIPEEIPEVTIPASELKEGRIWVARLFTLAGLTPSNAEARRLIQNRGLRLDGEVLTD
PMLQVDLSRPRILQRGKDRFVRVRLSD

The query sequence (length=427) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1h3e:A	427	427	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	1h3f:B	406	427	0.9485	0.9975	0.9485	0.0	1h3f:A
3	6bqz:A	215	220	0.2834	0.5628	0.5500	3.42e-83	6bqz:B
4	1jil:A	323	265	0.1967	0.2601	0.3170	1.28e-27	1jii:A, 1jij:A, 1jik:A
5	6otj:B	431	414	0.2670	0.2645	0.2754	1.93e-27	6otj:A
6	6hb5:B	417	442	0.2717	0.2782	0.2624	6.36e-27	7ap3:A, 7ap3:B, 6hb5:A, 6hb6:A, 6hb6:B, 6hb7:A, 6hb7:B, 6i5y:A, 6i5y:B, 4oud:A, 1vbm:A, 1vbm:B, 1vbn:A, 1vbn:B, 6wn2:A, 6wn2:B, 1wq3:A, 1wq4:A, 1x8x:A, 2yxn:A
7	3ts1:A	317	280	0.2014	0.2713	0.3071	1.32e-25	4ts1:A, 4ts1:B, 1tya:E, 1tyb:E, 1tyd:E
8	2cyb:A	319	256	0.1756	0.2351	0.2930	3.49e-22	2cyb:B
9	5ihx:A	360	316	0.1780	0.2111	0.2405	6.40e-18
10	4ojm:X	382	284	0.1756	0.1963	0.2641	4.68e-17	2rkj:B, 2rkj:F, 2rkj:J, 2rkj:N, 1y42:X
11	2pid:B	324	271	0.1663	0.2191	0.2620	1.37e-16	2pid:A, 3zxi:A, 3zxi:B
12	5ijx:A	365	202	0.1335	0.1562	0.2822	8.23e-15
13	4nx2:A	313	260	0.1663	0.2268	0.2731	8.16e-14	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
14	7rou:A	335	244	0.1616	0.2060	0.2828	6.06e-10	1q11:A, 4q93:A, 4qbt:A, 5thh:A
15	2dlc:X	339	257	0.1429	0.1799	0.2374	1.62e-06
16	2a4m:C	331	129	0.0960	0.1239	0.3178	1.98e-05	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
17	2cyc:A	371	243	0.1358	0.1563	0.2387	3.01e-05	2cyc:B
18	2g36:A	322	231	0.1452	0.1925	0.2684	1.70e-04
19	5tew:A	333	265	0.1522	0.1952	0.2453	0.001
20	5usf:A	682	333	0.1756	0.1100	0.2252	0.001	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
21	7sc6:A	349	237	0.1218	0.1490	0.2194	0.002	7scq:A, 7scq:B
22	3p0j:A	657	163	0.1030	0.0670	0.2699	0.003	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
23	6dfu:A	332	121	0.0773	0.0994	0.2727	0.012	6dfu:B
24	8i1w:B	333	126	0.0796	0.1021	0.2698	0.015	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
25	6ncr:A	342	95	0.0656	0.0819	0.2947	0.083	6ncr:B
26	3a04:A	367	244	0.1405	0.1635	0.2459	0.094	3a05:A
27	7ror:B	362	80	0.0585	0.0691	0.3125	0.27	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
28	3hv0:A	352	144	0.0867	0.1051	0.2569	2.0	3hv0:B
29	8rxh:LY	133	104	0.0656	0.2105	0.2692	2.9	8a3w:Y, 8a98:Y, 6az3:Y, 3jcs:Y, 8ovj:Y, 8rxx:LY, 5t2a:Y
30	3fhj:D	286	232	0.1335	0.1993	0.2457	3.1	3fhj:C
31	3kt8:D	410	126	0.0703	0.0732	0.2381	3.5	3kt0:A, 3kt3:A, 3kt3:B, 3kt3:C, 3kt3:D, 3kt6:A, 3kt6:B, 3kt6:C, 3kt6:D, 3kt8:A, 3kt8:B, 3kt8:C
32	1v5n:A	89	48	0.0398	0.1910	0.3542	5.6
33	7cms:A	328	125	0.0656	0.0854	0.2240	5.7	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
34	5oeu:C	412	129	0.0656	0.0680	0.2171	7.6
35	8x6f:C	1153	70	0.0515	0.0191	0.3143	8.0
36	2cul:A	225	119	0.0820	0.1556	0.2941	8.1
37	4a35:A	441	55	0.0375	0.0363	0.2909	8.3
38	7w54:B	518	47	0.0375	0.0309	0.3404	9.2	7w54:A
39	5oeu:A	460	130	0.0703	0.0652	0.2308	9.4

[Back]