BioLiP

>protein
HTIFQKVSVNGADQGQLKGIRAPANNNPVTDVMSSDIICNAVTMKDSNVLTVPAGAKVGHFWGHEIGGAAGPNDADNPIA
ASHKGPIMVYLAKVDNAATTGTSGLKWFKVAEAGLSNGKWAVDDLIANNGWSYFDMPTCIAPGQYLMRAELIALHNAGSQ
AGAQFYIGCAQINVTGGGSASTVSFPGAYSASDPGILINIYGGSGKTDNGGKPYQIPGPALFTC

The query sequence (length=224) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4d7u:A	227	227	1.0000	0.9868	0.9868	1.01e-163	4d7u:B, 4d7v:A, 4d7v:B
2	5foh:A	218	229	0.4688	0.4817	0.4585	8.75e-64
3	4eir:A	223	231	0.4866	0.4888	0.4719	5.44e-62	4eir:B, 7t5c:A, 7t5c:B, 7t5d:A, 7t5d:B, 7t5e:A, 7t5e:B, 5tkf:A, 5tkf:C, 5tkf:B, 5tkf:D, 5tkg:A, 5tkg:B, 5tkh:A, 5tkh:B, 5tki:A, 5tki:B
4	6rs6:A	221	230	0.4330	0.4389	0.4217	8.91e-58	6rs9:A
5	5acf:A	235	215	0.4018	0.3830	0.4186	1.98e-37	5acg:A, 5ach:A, 5aci:A, 5acj:A, 8e1w:A, 5n04:A, 5n05:A, 7nim:A, 7nin:A, 5nkw:A, 5nln:A, 5nlo:A, 5nlp:A, 5nlq:A, 5nlr:A, 5nls:A, 7pqr:A, 7ptz:AAA, 7pxi:A, 7pxj:A, 7pxk:A, 7pxl:A, 7pxm:A, 7pxn:A, 7pxr:A, 7pxs:A, 7pxt:A, 7pxu:A, 7pxv:A, 7pxw:A, 7pyd:A, 7pye:A, 7pyf:A, 7pyg:A, 7pyh:A, 7pyi:A, 7pyl:A, 7pym:A, 7pyn:A, 7pyo:A, 7pyp:A, 7pyq:A, 7pyu:A, 7pyw:A, 7pyx:A, 7pyy:A, 7pyz:A, 7pz0:A, 6ydg:A
6	3eii:A	208	233	0.4062	0.4375	0.3906	5.27e-34	3eii:B, 3eii:C, 3eii:D, 3eja:A, 3eja:B, 3eja:C, 3eja:D
7	8b7p:AAA	213	215	0.3705	0.3897	0.3860	8.11e-34	8b7p:BBB, 8b7p:CCC, 8b7p:DDD
8	4eis:A	225	209	0.3482	0.3467	0.3732	1.78e-33	4eis:B
9	4qi8:A	214	240	0.4018	0.4206	0.3750	9.94e-32	4qi8:B
10	5nlt:B	227	237	0.3795	0.3744	0.3586	1.05e-31	5nlt:A, 5nlt:C, 5nlt:D, 5nlt:E, 5nlt:F, 6ydc:A, 6ydc:B, 6ydc:C, 6ydc:D, 6ydd:A, 6ydd:B, 6yde:A, 6ydf:A, 6ydf:B
11	8b4g:AAA	228	249	0.3929	0.3860	0.3534	1.06e-30	7pu1:AAA, 7pu1:BBB, 7pz3:A, 7pz4:A, 7pz5:A, 7pz6:A, 7pz7:A, 7pz8:A, 7q1k:A, 2yet:A, 2yet:B, 3zud:A
12	5nns:A	225	222	0.3616	0.3600	0.3649	1.78e-30	5nns:B
13	7exk:A	217	241	0.3884	0.4009	0.3610	4.63e-30	7exk:B, 7exk:C, 7exk:D, 7exk:E, 7exk:F
14	7ova:DDD	231	198	0.3393	0.3290	0.3838	4.81e-30	7ova:AAA, 7ova:BBB, 7ova:CCC
15	7vfc:A	228	201	0.3616	0.3553	0.4030	7.46e-30
16	5x6a:A	229	201	0.3438	0.3362	0.3831	3.96e-29	6h1z:A, 6h1z:B, 6ha5:A, 6ha5:B, 6haq:A, 6haq:B, 5x6a:B
17	7a8v:A	230	203	0.3304	0.3217	0.3645	9.17e-28
18	7ntl:A	220	149	0.2812	0.2864	0.4228	2.10e-27
19	4b5q:A	217	209	0.3438	0.3548	0.3684	5.35e-26	4b5q:B
20	5o2w:A	248	153	0.2723	0.2460	0.3987	6.37e-24	5o2x:A
21	2vtc:A	228	196	0.2902	0.2851	0.3316	2.68e-19	2vtc:B
22	5ufv:A	228	158	0.2634	0.2588	0.3734	1.11e-18	5ufv:B, 5ufv:C, 5ufv:D, 5ufv:E, 5ufv:F
23	6jo5:2	119	81	0.1071	0.2017	0.2963	1.4
24	7jil:n	95	53	0.0625	0.1474	0.2642	1.6
25	3hbz:A	341	32	0.0446	0.0293	0.3125	1.6
26	1jxq:A	242	50	0.0714	0.0661	0.3200	2.5	1jxq:C
27	7c39:A	346	77	0.0938	0.0607	0.2727	4.3	7c38:A, 7c38:B, 7c39:B, 7c3c:A, 7c3c:B, 7c3d:A, 7c3d:B
28	3kl9:A	340	68	0.0893	0.0588	0.2941	5.0	3kl9:B, 3kl9:C, 3kl9:D, 3kl9:E, 3kl9:F, 3kl9:G, 3kl9:H, 3kl9:I, 3kl9:J, 3kl9:K, 3kl9:L
29	7dz7:2	217	18	0.0491	0.0507	0.6111	8.2	7bgi:2, 7d0j:2, 7dz8:2, 6ijo:2
30	3tto:A	1055	172	0.1875	0.0398	0.2442	9.4	3tto:B, 3tto:C, 3tto:D, 3ttq:A, 4ttu:A, 4tvc:A, 4tvd:A

[Back]