BioLiP

>protein
HSFLTNDELAVLPVVKVLPSGKYTGANLKSVIRVLRGLLDQGIPSKELENLQELKPLDQCLIGQTKENRRKNRYKNILPY
DATRVPLGDEGGYINASFIKIPVGKEEFVYIACQGPLPTTVGDFWQMIWEQKSTVIAMMTQEVEGEKIKCQRYWPNILGK
TTMVSNRLRLALVRMQQLKGFVVRAMTLEDIQTREVRHISHLNFTAWPDHDTPSQPDDLLTFISYMRHIHRSGPIITHCS
AGIGRSGTLICIDVVLGLISQDLDFDISDLVRCMRLQRHGMVQTEDQYIFCYQVILYVLTRLQAEEEQ

The query sequence (length=308) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1wch:A	308	308	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	4ri5:A	284	274	0.3312	0.3592	0.3723	3.28e-58	4qum:A, 4rh5:A, 4rh9:A, 4rhg:A, 4ri5:B, 4s0g:A
3	2i4g:A	289	261	0.3506	0.3737	0.4138	1.19e-56	2h02:A, 2h02:B, 2h03:A, 2h04:A, 2i4h:A, 2i5x:A, 2i5x:B, 8jbn:B, 8jby:A, 8jby:B
4	6kr4:C	575	240	0.3052	0.1635	0.3917	7.22e-56
5	6kr4:C	575	244	0.2955	0.1583	0.3730	2.64e-43
6	9c55:A	288	240	0.2922	0.3125	0.3750	1.17e-53	9c56:A, 8u0h:A, 8u0h:B, 7uad:A, 8uh6:C
7	3ps5:A	529	269	0.3604	0.2098	0.4126	4.14e-53	1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
8	5xzr:A	519	320	0.4058	0.2408	0.3906	4.82e-52	1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
9	8gwh:A	295	287	0.3182	0.3322	0.3415	6.50e-52
10	8eya:A	301	246	0.2890	0.2957	0.3618	4.77e-51	1aax:A, 2azr:A, 2b07:A, 6b8z:A, 6b95:A, 2bgd:A, 2bge:A, 4bjo:A, 4bjo:B, 1bzc:A, 1bzh:A, 1bzj:A, 1c83:A, 1c84:A, 1c85:A, 1c86:A, 1c87:A, 1c88:A, 2cm7:A, 2cm8:A, 2cma:A, 2cmb:A, 2cmc:A, 2cne:A, 2cnf:A, 2cng:A, 2cnh:A, 2cni:A, 3cwe:A, 3d9c:A, 3eax:A, 3eb1:A, 1ecv:A, 1een:A, 1eeo:A, 8exj:A, 8exk:A, 8exm:A, 8exn:A, 8eya:B, 8eyb:A, 8eyb:B, 8eyc:A, 2f6t:A, 2f6v:A, 2f6w:A, 2f6y:A, 2f6z:A, 2f70:A, 2f71:A, 8f88:A, 8f88:B, 8f88:C, 2fjm:A, 2fjm:B, 2fjn:A, 2fjn:B, 7fqm:A, 7fqn:A, 7fqo:A, 7fqp:A, 7fqq:A, 7fqs:A, 7fqt:A, 7fqu:A, 7fqx:A, 7fqy:A, 7fqz:A, 7frf:A, 7frg:A, 7fri:A, 7frj:A, 7frl:A, 7frm:A, 7frn:A, 7fro:A, 7frp:A, 7frq:A, 7frr:A, 1g1f:A, 1g1g:A, 1g1h:A, 8g65:A, 8g65:B, 8g67:A, 8g68:A, 8g68:B, 8g69:A, 8g69:B, 8g6a:A, 1g7f:A, 1g7g:A, 1gfy:A, 7gs7:A, 7gs8:A, 7gs9:A, 7gsa:A, 7gsb:A, 7gsc:A, 7gse:A, 7gsf:A, 7gsg:A, 7gsh:A, 7gsi:A, 7gsj:A, 7gsk:A, 7gsl:A, 7gsm:A, 7gsn:A, 7gso:A, 7gsq:A, 7gsr:A, 7gst:A, 7gsu:A, 7gsv:A, 7gsx:A, 7gsy:A, 7gsz:A, 7gt0:A, 7gt1:A, 7gt2:A, 7gt3:A, 7gt4:A, 7gt5:A, 7gt6:A, 7gt7:A, 7gt8:A, 7gt9:A, 7gta:A, 7gtb:A, 7gtc:A, 7gtd:A, 7gte:A, 7gtf:A, 7gtg:A, 7gth:A, 7gti:A, 7gtj:A, 7gtk:A, 7gtl:A, 7gtm:A, 7gtn:A, 7gto:A, 7gtp:A, 7gtq:A, 7gtr:A, 7gts:A, 7gtt:A, 7gtu:A, 7gtv:A, 2h4g:A, 2h4k:A, 2hb1:A, 2hnq:A, 3i7z:A, 3i80:A, 4i8n:A, 1jf7:B, 5k9w:A, 1kak:A, 1kav:A, 5ka1:A, 5ka3:A, 5ka7:A, 5ka9:A, 5kab:A, 5kad:A, 5kad:B, 7klx:A, 1l8g:A, 1lqf:A, 1lqf:B, 1lqf:C, 1lqf:D, 7mm1:A, 7mn7:A, 7mna:A, 7mnb:A, 7mnd:A, 7mnf:A, 7mow:A, 1nl9:A, 1nny:A, 1no6:A, 2nt7:A, 2nta:A, 1nwe:A, 1nwl:A, 1nz7:A, 1oeu:A, 1ony:A, 1onz:A, 1ph0:A, 1ptt:A, 1ptu:A, 1ptv:A, 1pty:A, 1pxh:A, 1pyn:A, 1q1m:A, 1q6j:A, 1q6m:A, 1q6n:A, 1q6n:B, 1q6p:A, 1q6p:B, 1q6s:A, 1q6s:B, 1q6t:A, 1q6t:B, 2qbp:A, 2qbq:A, 2qbr:A, 2qbs:A, 5qde:A, 5qdf:A, 5qdh:A, 5qdi:A, 5qdj:A, 5qdk:A, 5qdl:A, 5qdm:A, 5qdn:A, 5qdo:A, 5qdp:A, 5qdq:A, 5qdr:A, 5qds:A, 5qdt:A, 5qdu:A, 5qdv:A, 5qdw:A, 5qdx:A, 5qdy:A, 5qdz:A, 5qe0:A, 5qe1:A, 5qe2:A, 5qe4:A, 5qe5:A, 5qe6:A, 5qe8:A, 5qe9:A, 5qea:A, 5qeb:A, 5qec:A, 5qed:A, 5qef:A, 5qeg:A, 5qeh:A, 5qei:A, 5qej:A, 5qek:A, 5qel:A, 5qem:A, 5qen:A, 5qeo:A, 5qep:A, 5qeq:A, 5qer:A, 5qes:A, 5qet:A, 5qeu:A, 5qew:A, 5qex:A, 5qey:A, 5qez:A, 5qf0:A, 5qf1:A, 5qf2:A, 5qf3:A, 5qf4:A, 5qf5:A, 5qf6:A, 5qf7:A, 5qf8:A, 5qf9:A, 5qfa:A, 5qfb:A, 5qfc:A, 5qfd:A, 5qfe:A, 5qff:A, 5qfg:A, 5qfh:A, 5qfi:A, 5qfj:A, 5qfk:A, 5qfl:A, 5qfm:A, 5qfn:A, 5qfo:A, 5qfp:A, 5qfq:A, 5qfr:A, 5qfs:A, 5qft:A, 5qfu:A, 5qfv:A, 5qfw:A, 5qfx:A, 5qfy:A, 5qfz:A, 5qg0:A, 5qg1:A, 5qg2:A, 5qg3:A, 5qg4:A, 5qg5:A, 5qg6:A, 5qg7:A, 5qg8:A, 5qg9:A, 5qga:A, 5qgb:A, 5qgc:A, 5qgd:A, 5qge:A, 5qgf:A, 1qxk:A, 8skl:A, 5t19:A, 1t48:A, 1t49:A, 1t4j:A, 2veu:A, 2vev:A, 2vew:A, 2vex:A, 2vey:A, 6w30:A, 1wax:A, 1xbo:A, 6xe8:A, 6xed:A, 6xef:A, 6xeg:A, 4y14:A, 4y14:B, 2zmm:A, 3zmp:B, 3zmp:A, 3zmq:A, 2zn7:A, 4zrt:A
11	7r7l:A	490	310	0.3864	0.2429	0.3839	1.13e-50	6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
12	6bn5:B	448	306	0.3831	0.2634	0.3856	2.60e-50
13	3h2x:A	302	250	0.3084	0.3146	0.3800	6.63e-49	3brh:A, 3brh:B, 4j51:A, 4j51:B, 3olr:A, 3olr:B, 3olr:C, 3olr:D, 3omh:A, 3omh:B, 3omh:C, 3omh:D, 2qct:A
14	3s3e:A	287	264	0.3247	0.3484	0.3788	8.74e-49	3s3e:B, 3s3f:B, 3s3h:B, 3s3h:A, 3s3k:B
15	1ygu:B	582	240	0.3182	0.1684	0.4083	4.69e-48	1ygr:A, 1ygr:B, 1ygu:A
16	1ygu:B	582	290	0.2955	0.1564	0.3138	4.97e-40	1ygr:A, 1ygr:B, 1ygu:A
17	4ge6:A	303	286	0.3052	0.3102	0.3287	3.00e-46	4ge2:A, 4ge5:A, 4icz:A, 6kzq:A, 6l03:A
18	4gfv:B	288	245	0.3052	0.3264	0.3837	6.05e-46	4gfu:A, 4gfv:A, 4nnd:A, 4nnd:B, 4nnd:D, 4nnd:G
19	3qck:A	289	240	0.2857	0.3045	0.3667	2.73e-45	3qce:A, 3qce:B, 3qcf:A, 3qcf:B, 3qcg:A, 3qch:A, 3qci:A, 3qcj:A, 3qcl:A, 3qcm:A, 3qcm:B
20	3d42:A	289	234	0.2825	0.3010	0.3718	3.17e-45	3d44:A, 1zc0:A
21	5h08:A	282	240	0.2792	0.3050	0.3583	6.90e-45
22	6crg:B	462	303	0.3636	0.2424	0.3696	1.58e-43	6bn5:A
23	6h8s:A	291	237	0.2662	0.2818	0.3460	9.24e-39	2cjz:A, 6h8r:A, 5ovr:A, 5ovx:A, 5ow1:A
24	1xxp:A	287	227	0.1721	0.1847	0.2335	1.02e-04	3blt:A, 3blu:A, 3bm8:A, 6drb:A, 3f9a:A, 3f9b:A, 2i42:A, 1pa9:A, 1qz0:A, 1qz0:B, 3u96:A, 3u96:B, 1xxp:B, 1xxv:A, 1xxv:B, 2y2f:A, 2ydu:A, 1ytn:A, 1yts:A, 1ytw:A, 4z6b:A, 4zi4:A, 4zn5:A
25	2i6j:A	161	87	0.0844	0.1615	0.2989	2.53e-04	2dxp:A, 2i6m:A, 2i6o:A, 2i6p:A, 7mpc:A, 7mpd:A
26	5z5a:A	148	81	0.0812	0.1689	0.3086	0.006	5z5a:B, 5z5a:C
27	1g4u:S	360	221	0.1494	0.1278	0.2081	0.013
28	6g84:B	368	60	0.0649	0.0543	0.3333	0.014	6g84:A, 6g85:A, 6g85:B, 6g86:A, 6g86:B, 5xw5:A
29	4erc:A	150	114	0.0844	0.1733	0.2281	0.070	4erc:B
30	5bx1:A	153	83	0.0812	0.1634	0.3012	0.10	3rz2:A, 3rz2:B, 1xm2:A, 1xm2:B, 1xm2:C, 1xm2:D, 1xm2:E, 1zcl:A, 1zcl:B
31	3f41:A	590	68	0.0584	0.0305	0.2647	0.12	3f41:B, 4wu3:A, 4wu3:B, 4wu3:C, 4wu3:D
32	2oz5:A	265	76	0.0649	0.0755	0.2632	0.27	2oz5:B
33	1ywf:A	241	76	0.0649	0.0830	0.2632	0.32
34	1ohd:A	338	18	0.0390	0.0355	0.6667	0.41	1ohe:A
35	4r0s:A	162	45	0.0357	0.0679	0.2444	1.4	4r0s:B, 4r0t:B
36	6zck:A	271	32	0.0390	0.0443	0.3750	1.9
37	3v0h:B	327	59	0.0649	0.0612	0.3390	3.0	3v0h:A
38	9fjc:1	223	32	0.0422	0.0583	0.4062	3.4
39	3kws:A	265	25	0.0325	0.0377	0.4000	3.7	3kws:B
40	3qfe:A	305	71	0.0714	0.0721	0.3099	4.3
41	4p92:A	233	80	0.0747	0.0987	0.2875	5.6
42	1yn9:B	169	48	0.0487	0.0888	0.3125	5.7	1yn9:A, 1yn9:C
43	7q54:C	368	97	0.0812	0.0679	0.2577	6.7	2pkq:O, 2pkq:Q, 2pkq:T, 7q53:O, 7q53:Q, 7q54:Q, 7q54:O, 7q54:A, 7q55:O, 7q55:Q, 7q55:A, 7q55:C, 7q55:E, 7q55:G, 7q55:I, 7q55:K, 7q56:K, 7q56:E, 7q56:I, 7q56:A, 7q56:G, 7q56:C, 7q56:Q, 7q56:O, 7q57:O, 7q57:Q, 7q57:A, 7q57:C, 7q57:G, 7q57:E, 7q57:I, 7q57:K, 7q57:M, 7q57:S
44	6i28:A	161	51	0.0519	0.0994	0.3137	9.1
45	3eu7:A	313	65	0.0649	0.0639	0.3077	9.6

[Back]