BioLiP

>protein
HSELRKLFYSADAVCFDVDSTVIREEGIDELAKICGVEDAVSEMTRRAMGGAVPFKAALTERLALIQPSREQVQRLIAEQ
PPHLTPGIRELVSRLQERNVQVFLISGGFRSIVEHVASKLNIPATNVFANRLKFYFNGEYAGFDETQPTAESGGKGKVIK
FLKEKFHFKKIIMIGDGATDMEACPPADAFIGFGGNVIRQQVKDNAKWYITDFVELLGELEE

The query sequence (length=222) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6hyj:B	223	220	0.9865	0.9821	0.9955	1.93e-164	6hyj:A, 6hyy:A, 6hyy:B, 1l8l:A, 1l8l:B, 1l8o:A, 1l8o:B, 1nnl:A, 1nnl:B, 6q6j:A, 6q6j:B
2	6iuy:A	585	221	0.3829	0.1453	0.3846	2.06e-44	6iuy:B
3	3kd3:A	216	212	0.2703	0.2778	0.2830	7.21e-21	3kd3:B
4	1f5s:A	210	194	0.2748	0.2905	0.3144	4.19e-20	1f5s:B, 1j97:A, 1j97:B, 1l7m:A, 1l7m:B, 1l7n:A, 1l7n:B, 1l7o:A, 1l7o:B, 1l7p:A, 1l7p:B
5	3m1y:C	208	188	0.2658	0.2837	0.3138	2.11e-16	3m1y:A, 3m1y:B, 3m1y:D
6	8q4s:A	295	169	0.2568	0.1932	0.3373	4.13e-14	7qpl:A
7	8a1z:A	396	212	0.2748	0.1540	0.2877	2.37e-12	8a21:A, 5is2:A, 5it0:A, 5it4:A, 5jjb:A, 5jlp:A, 5jlr:A, 5jma:A, 3p96:A, 5t41:A
8	4ap9:A	200	189	0.2207	0.2450	0.2593	1.73e-08	4ap9:B, 4ap9:C, 4ap9:D
9	2fea:A	225	212	0.2162	0.2133	0.2264	1.88e-04	2fea:B
10	4fe3:A	291	116	0.1171	0.0893	0.2241	0.008	2g06:A, 2g06:B, 2g07:A, 2g07:B, 2g08:A, 2g08:B, 2g09:A, 2g09:B, 2g0a:A, 2g0a:B, 2jga:A, 4kx3:A, 4kx5:A, 2vkq:A
11	4as2:A	327	91	0.1126	0.0765	0.2747	0.032	4as2:B, 4as2:C, 4as2:D, 4as3:A, 4as3:B, 4as3:C, 4as3:D
12	5v0t:E	457	107	0.1306	0.0635	0.2710	0.19	5v0t:A, 5v0t:B, 5v0t:C, 5v0t:D, 5v0t:F, 5v0t:G, 5v0t:H
13	8ioy:A	816	103	0.1306	0.0355	0.2816	0.37
14	3sky:A	261	112	0.1216	0.1034	0.2411	0.96
15	8snb:6R	72	26	0.0586	0.1806	0.5000	1.3
16	1nf2:A	267	29	0.0541	0.0449	0.4138	1.3	1nf2:B, 1nf2:C
17	3pco:C	323	112	0.1532	0.1053	0.3036	2.5	6oz5:A, 6oz5:C, 6p24:A, 6p26:A, 6p26:C, 3pco:A
18	1te2:A	218	62	0.0901	0.0917	0.3226	3.2	1te2:B
19	7c2x:A	490	30	0.0631	0.0286	0.4667	3.5
20	7si6:A	873	103	0.1216	0.0309	0.2621	3.7	7si3:A, 7si7:A
21	4u99:A	187	28	0.0586	0.0695	0.4643	6.8	2kii:A, 2kil:A, 4u99:B, 4u9b:A, 4u9g:A, 4u9g:B, 4u9j:A, 4u9j:B, 4u9k:A, 4u9k:B
22	5c5e:A	284	50	0.0811	0.0634	0.3600	6.9	5c5e:B, 4g86:A, 4g86:B
23	8iwp:A	896	125	0.1351	0.0335	0.2400	8.1	8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
24	2yj4:B	252	120	0.1351	0.1190	0.2500	9.9	2iye:A, 2iye:C, 2yj3:A, 2yj4:A, 2yj5:A, 2yj5:B, 2yj6:A, 2yj6:B
25	5z9o:A	373	22	0.0450	0.0268	0.4545	9.9	5z9o:B

[Back]