Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HRRVRLLKHGSDKPLGFYIRDGTSVRVTASGLEKQPGIFISRLVPGGLAESTGLLAVNDEVIEVNGIEVAGKTLDQVTDM
MVANSSNLIITVKPAN

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1rzx:A 98 96 1.0000 0.9796 1.0000 3.30e-66 5i7z:A, 1x8s:A
2 4wsi:A 372 89 0.3125 0.0806 0.3371 2.08e-10 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
3 6xa7:B 96 83 0.2708 0.2708 0.3133 4.68e-08 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
4 6nid:B 88 95 0.2604 0.2841 0.2632 1.10e-07 6nid:A, 6nid:C
5 7pcb:A 415 95 0.3438 0.0795 0.3474 5.12e-06 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
6 4wyu:A 201 90 0.3021 0.1443 0.3222 1.08e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
7 4wyu:A 201 79 0.2604 0.1244 0.3165 0.033 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
8 7x2e:A 163 68 0.2708 0.1595 0.3824 2.16e-05 2kbs:A
9 2ejy:A 85 84 0.2083 0.2353 0.2381 2.55e-05
10 1n7f:A 86 76 0.2500 0.2791 0.3158 3.58e-05 1n7f:B
11 7qct:A 90 58 0.1979 0.2111 0.3276 4.39e-05 7qct:B
12 2ka9:A 189 55 0.2292 0.1164 0.4000 5.49e-05 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
13 2m0z:A 97 66 0.2188 0.2165 0.3182 8.91e-05 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
14 8bv7:A 95 57 0.1667 0.1684 0.2807 1.88e-04 8buw:A, 8buw:B
15 8bq8:C 93 92 0.2604 0.2688 0.2717 3.54e-04 8bq8:A, 8bq8:B
16 2koh:A 111 45 0.1771 0.1532 0.3778 3.87e-04 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
17 1zub:A 109 51 0.1875 0.1651 0.3529 4.79e-04
18 5zys:A 90 63 0.2396 0.2556 0.3651 5.54e-04
19 5wou:A 95 57 0.2396 0.2421 0.4035 6.62e-04
20 2l4t:A 124 86 0.2500 0.1935 0.2791 8.01e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
21 2exg:A 101 56 0.1771 0.1683 0.3036 8.87e-04 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
22 3jxt:A 96 91 0.2604 0.2604 0.2747 0.001 3jxt:B
23 6ezi:A 86 57 0.2083 0.2326 0.3509 0.002 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
24 5heb:A 119 92 0.2708 0.2185 0.2826 0.002 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
25 3vqg:A 85 58 0.1667 0.1882 0.2759 0.002
26 8c1t:A 90 51 0.1875 0.2000 0.3529 0.002 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
27 4xhv:A 94 60 0.2292 0.2340 0.3667 0.003
28 2m0v:A 128 49 0.1979 0.1484 0.3878 0.003
29 8cn1:H 101 79 0.2500 0.2376 0.3038 0.004 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
30 1ihj:B 95 48 0.1875 0.1895 0.3750 0.005 1ihj:A
31 5oak:A 90 58 0.2083 0.2222 0.3448 0.009 5oak:C
32 2m0u:A 117 56 0.2292 0.1880 0.3929 0.011
33 5ez0:D 95 69 0.2188 0.2211 0.3043 0.016 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
34 2r4h:C 98 54 0.1771 0.1735 0.3148 0.018
35 1b8q:A 127 92 0.2396 0.1811 0.2500 0.027
36 1u38:A 89 46 0.1354 0.1461 0.2826 0.028
37 2i0i:A 81 50 0.1875 0.2222 0.3600 0.038 2i0i:B, 2i0i:C
38 2qt5:A 194 75 0.2188 0.1082 0.2800 0.063 2qt5:B
39 2qt5:A 194 72 0.2188 0.1082 0.2917 0.17 2qt5:B
40 4xh7:A 110 43 0.1562 0.1364 0.3488 0.075
41 7p73:A 420 52 0.1875 0.0429 0.3462 0.17 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
42 6ar4:B 87 51 0.1667 0.1839 0.3137 0.25 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
43 6x23:A 89 68 0.2083 0.2247 0.2941 0.27
44 7qqn:C 414 62 0.1667 0.0386 0.2581 0.32 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
45 7pc5:A 405 66 0.2188 0.0519 0.3182 0.36
46 8b82:A 108 45 0.1667 0.1481 0.3556 0.36 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
47 4e34:A 87 48 0.1771 0.1954 0.3542 0.43 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
48 7weg:B 96 44 0.1667 0.1667 0.3636 0.60 7weg:A
49 8blu:B 195 56 0.1771 0.0872 0.3036 0.70 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
50 3e4o:A 254 85 0.2708 0.1024 0.3059 0.73 3e4o:B, 3e4q:A, 3e4q:B
51 3kvn:X 628 47 0.1562 0.0239 0.3191 0.78 3kvn:A
52 6kz1:A 97 62 0.2188 0.2165 0.3387 0.80 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
53 5dy2:A 378 31 0.1250 0.0317 0.3871 0.90 5dxx:A, 5dxy:A, 5dy3:A
54 4c2c:A 433 29 0.1458 0.0323 0.4828 1.7 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
55 2q3r:A 351 26 0.1250 0.0342 0.4615 1.8 1vji:A
56 9em0:A 376 29 0.1250 0.0319 0.4138 2.3 8aua:A, 8aua:B, 8aub:A, 8aub:B, 8aue:A, 8aue:B, 8auj:A, 8auj:B, 8aul:A, 8aul:B, 8aum:A, 8aum:B, 8aun:A, 8aun:B, 8auo:B, 8auo:A, 8auq:A, 8auq:B, 9em0:B, 9em2:B, 9em2:A, 9em3:A, 9em4:B, 9em4:A, 9em5:A, 9em6:B, 9em6:A, 3hgo:A, 3hgo:B, 3hgs:A, 3hgs:B, 2hs6:A, 2hs6:B, 2hs8:A, 2hs8:B, 2hsa:B, 2hsa:A, 8qmx:A, 8qmx:B, 8qn1:A, 8qn1:B, 8qn1:C, 8qn1:D, 8qn3:A, 8qn3:B, 8qn9:B, 8s8v:A, 8s8v:B, 8s8y:B, 8s8y:A
57 6gbe:A 119 57 0.1458 0.1176 0.2456 3.1
58 7rr5:T 162 31 0.1042 0.0617 0.3226 3.9
59 5e1q:B 644 28 0.1250 0.0186 0.4286 4.8 3a24:A, 3a24:B, 5e1q:A
60 8sew:A 629 31 0.1250 0.0191 0.3871 6.5 8seu:A, 8seu:B, 8seu:C, 8seu:D, 8sev:A, 8sev:B, 8sev:C, 8sev:D, 8sew:B, 8sew:C, 8sew:D, 8sex:A, 8sex:B, 8sex:C, 8sex:D, 8sey:A, 8sey:B, 8sey:C, 8sey:D, 8sez:A, 8sez:B, 8sez:C, 8sez:D, 8sf0:A, 8sf0:B, 8sf0:C, 8sf0:D
61 8c3a:D 214 63 0.1979 0.0888 0.3016 6.6 8c3a:CO, 8cq7:D, 8cq7:CO, 8cqw:D, 8cqw:CO, 8cre:D, 8cre:CO, 8oeq:D, 8oeq:CO, 7pzy:C, 7q08:C, 7q0f:C, 7q0p:C, 7q0r:C, 8q5i:C
62 6hks:B 94 55 0.1458 0.1489 0.2545 6.8 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
63 7b0h:F 762 22 0.1042 0.0131 0.4545 6.8 7b07:A, 7b08:A, 7b0f:A, 7b0g:A, 7b0h:E, 1qqc:A, 5vu8:A, 2vwj:A, 2xhb:A
64 6z6p:M 534 61 0.1667 0.0300 0.2623 7.0
65 3u7e:B 380 34 0.1562 0.0395 0.4412 8.7 3u7f:B, 3u7g:A, 3u7h:B, 3zvl:A, 3zvm:A, 3zvm:B, 3zvn:A
66 3r0h:D 199 57 0.1458 0.0704 0.2456 9.7 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218