BioLiP

>protein
HMWIGVISLFPEMFKAITEFGVTGRAVKHNLLKVECWNPRDFTFDKHKTVDDRPYGGGPGMLMMVQPLRDAIHTAKAAAG
EGAKVIYLSPQGRKLDQGGVTELAQNQKLILVCGRYEGIDERLIQTEIDEEWSIGDYVLTGGELPAMTLIDAVARFIPGV
LDSFADGLLDCPHYTRPEVLEGLTVPPVLMSGHHEEIRKWRLKQSLQRTWLRRPELLEGLALTDEQRKLLKEAQAEHNS

The query sequence (length=239) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8apw:A	250	241	0.9958	0.9520	0.9876	4.64e-177	8apt:A, 8apu:A, 8apv:A, 3axz:A, 5d9f:A, 4mcb:A, 4mcb:B, 4mcc:A, 4mcc:B, 4mcd:A, 1uak:A, 1ual:A, 1uam:A, 4ypw:A, 4ypx:A, 4ypy:A, 4ypz:A, 4yq0:A, 4yq1:A, 4yq2:A, 4yq3:A, 4yq4:A, 4yq5:A, 4yq6:A, 4yq7:A, 4yq8:A, 4yq9:A, 4yqa:A, 4yqb:A, 4yqc:A, 4yqd:A, 4yqg:A, 4yqi:A, 4yqj:A, 4yqk:A, 4yql:A, 4yqn:A, 4yqo:A, 4yqp:A, 4yqq:A, 4yqr:A, 4yqs:A, 4yqt:A, 4yvg:A, 4yvh:A, 4yvi:A, 4yvi:B, 4yvj:A, 4yvj:B, 4yvk:A, 4yvk:B
2	1p9p:A	235	236	0.8117	0.8255	0.8220	3.33e-135
3	5wyr:B	248	240	0.6234	0.6008	0.6208	4.01e-111	6afk:A, 6afk:B, 6jki:A, 6jki:B, 6joe:A, 6joe:B, 5wyq:A, 5wyq:B, 5wyr:A, 5zhm:A, 5zhm:B, 5zhn:A, 5zhn:B
4	7mys:A	239	238	0.5397	0.5397	0.5420	6.47e-95	7mys:B
5	4h3z:B	256	244	0.5481	0.5117	0.5369	1.01e-87	4h3y:A, 4h3y:B, 4h3z:A
6	8b1n:B	410	234	0.4435	0.2585	0.4530	1.20e-65
7	8b1n:A	433	234	0.4435	0.2448	0.4530	1.90e-65	8byh:A, 8byh:B, 8ri0:A, 8ri0:B
8	7kff:A	249	234	0.4142	0.3976	0.4231	7.95e-56
9	4ig6:A	223	223	0.3808	0.4081	0.4081	1.86e-52
10	6qrb:A	220	222	0.3849	0.4182	0.4144	2.03e-49	6nw6:A, 6nw6:B, 6nw7:A, 6nw7:B, 6qo2:A, 6qo2:B, 6qo3:A, 6qo3:B, 6qo4:A, 6qo4:B, 6qo6:A, 6qo6:B, 6qoa:A, 6qoa:B, 6qoc:A, 6qoc:B, 6qod:A, 6qod:B, 6qoe:B, 6qof:A, 6qof:B, 6qog:A, 6qoh:A, 6qoh:B, 6qoi:A, 6qoi:B, 6qoj:A, 6qoj:B, 6qok:A, 6qok:B, 6qol:A, 6qol:B, 6qom:A, 6qon:A, 6qon:B, 6qoo:A, 6qoo:B, 6qop:A, 6qop:B, 6qoq:A, 6qoq:B, 6qor:A, 6qor:B, 6qos:A, 6qos:B, 6qot:A, 6qot:B, 6qou:A, 6qou:B, 6qov:A, 6qov:B, 6qow:A, 6qow:B, 6qox:B, 6qqq:A, 6qqq:B, 6qqr:B, 6qqs:A, 6qqt:A, 6qqt:B, 6qqu:A, 6qqu:B, 6qqv:A, 6qqv:B, 6qqw:A, 6qqx:A, 6qqx:B, 6qqy:A, 6qqy:B, 6qqz:A, 6qr0:A, 6qr1:A, 6qr2:A, 6qr3:A, 6qr3:B, 6qr4:A, 6qr4:B, 6qr5:A, 6qr6:A, 6qr6:B, 6qr7:A, 6qr7:B, 6qr8:A, 6qr8:B, 6qr9:A, 6qr9:B, 6qra:A, 6qra:B, 6qrb:B, 6qrc:A, 6qrc:B, 6qrd:A, 6qrd:B, 6qre:A, 6qre:B, 6qrf:A, 6qrg:A, 6qrg:B, 7rez:A, 7rez:B, 7rf0:A, 7rf0:B
11	6w15:A	202	219	0.3724	0.4406	0.4064	1.12e-48
12	5zhk:A	208	219	0.3515	0.4038	0.3836	3.05e-42	6jof:A, 5zhj:A, 5zhl:A
13	8fci:A	197	220	0.3598	0.4365	0.3909	1.89e-41	8fci:B
14	6qqs:B	204	220	0.3598	0.4216	0.3909	8.87e-41	6qqw:B, 6qqz:B, 6qr0:B, 6qr1:B, 6qr2:B, 6qr5:B, 6qrf:B
15	8ee7:A	456	39	0.0586	0.0307	0.3590	1.0	8ee4:A, 8ee4:B, 8ee4:C, 8ee4:D, 8ee4:E, 8ee4:F, 8ee7:B, 8eea:A, 8eea:B, 8eea:C, 8eea:D, 8eea:E, 8eea:F, 8sux:A, 8sux:B, 8sux:C, 8sux:D, 8sux:E, 8sux:F
16	3f3z:A	272	50	0.0837	0.0735	0.4000	5.5
17	8dvv:A	3886	47	0.0586	0.0036	0.2979	7.6	8dvv:B, 8dvv:C, 8dvv:D
18	7dpi:C	292	42	0.0502	0.0411	0.2857	7.6	7dpi:A
19	8i0d:A	446	45	0.0586	0.0314	0.3111	7.8	8i0e:A
20	8dty:A	4004	47	0.0586	0.0035	0.2979	8.0	8dty:B, 8dty:C, 8dty:D
21	6wou:A	3921	47	0.0586	0.0036	0.2979	8.0	6wou:B, 6wou:C, 6wou:D, 6wov:A, 6wov:B, 6wov:C, 6wov:D
22	8dtz:A	4061	47	0.0586	0.0034	0.2979	8.0	8dtz:B, 8dtz:C, 8dtz:D
23	6rtp:B	484	166	0.1548	0.0764	0.2229	8.2	5jsh:B, 5jsk:B, 5jsu:B, 5jsy:B, 5jt1:B, 6ru9:B, 6ruc:B, 2wpn:B, 6z7r:B, 6z7r:D, 6z8j:B, 6z8j:D, 6z8m:B, 6z8o:B, 6z8o:D, 6z9g:B, 6z9g:D, 6z9g:F, 6z9g:H, 6z9o:B, 6za1:B, 3ze6:B, 3ze7:B, 3ze8:B, 3ze9:B, 3zea:B
24	3b0h:A	536	50	0.0669	0.0299	0.3200	9.3	3b0h:B

[Back]