Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HMVSEVRKKKLLHVFTVFFDSDKSGVVEKQDFELAAQNIAKLRGWAPGSPAYDILQESMIAIWLGLQKQADADGDGKVTQ
DEWLALWDEYAKDPAAAKDWQNLLCKSIFQIQDSSNDGSVDVNEYVTVHESFGLNKEESTEAFKKLAKGKDSISWADFQE
LWKEYFSSDDPDVPGNYIFGRLTC

The query sequence (length=184) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7pjd:B 184 184 1.0000 1.0000 1.0000 6.75e-136 7pjd:A, 7pjd:C, 7pjd:D, 7pjd:E, 7pjd:F
2 6kth:A 190 182 0.5217 0.5053 0.5275 1.03e-71
3 2ccm:A 190 186 0.3587 0.3474 0.3548 9.62e-37 2ccm:B, 5f6t:A, 4ndb:A, 4ndb:B, 4ndc:A, 4ndc:B, 4ndd:A, 4ndd:B
4 7wbo:A 193 186 0.2772 0.2642 0.2742 6.54e-11
5 2sas:A 185 183 0.2391 0.2378 0.2404 3.28e-10
6 1nya:A 176 129 0.1793 0.1875 0.2558 2.35e-09
7 3akb:A 166 162 0.2120 0.2349 0.2407 1.45e-08 3aka:A
8 3u0k:A 397 123 0.1848 0.0856 0.2764 2.94e-04
9 1la0:A 161 164 0.2065 0.2360 0.2317 0.002 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
10 2scp:A 174 151 0.1957 0.2069 0.2384 0.004 2scp:B
11 2scp:A 174 73 0.0870 0.0920 0.2192 4.0 2scp:B
12 5ukg:A 393 96 0.1413 0.0662 0.2708 0.010 5ukg:B
13 1hqv:A 178 142 0.1902 0.1966 0.2465 0.018 3aaj:A, 3aaj:B, 3aak:A, 5gqq:C, 5gqq:D, 5jjg:A, 3wxa:A, 3wxa:B, 2zn8:A, 2zn9:A, 2zn9:B, 2zne:A, 2zne:B, 2zrs:A, 2zrs:B, 2zrs:C, 2zrs:D, 2zrs:E, 2zrs:F, 2zrs:G, 2zrs:H, 2zrt:A, 2zrt:B, 2zrt:C, 2zrt:D, 2zrt:E, 2zrt:F, 2zrt:G, 2zrt:H
14 5xnd:A 110 67 0.1250 0.2091 0.3433 0.019
15 1a75:B 108 70 0.1304 0.2222 0.3429 0.024 1a75:A
16 8c6o:A 195 62 0.1141 0.1077 0.3387 0.028 8a9s:A, 8a9s:B, 8c6o:B, 1el4:A, 2f8p:A, 1jf2:A, 4mrx:A, 4mry:A, 4n1f:A, 4n1g:A, 4n1g:B, 7o3u:A, 1qv0:A, 1qv1:A, 1s36:A, 1sl7:A, 1sl9:A
17 1tn4:A 157 147 0.1848 0.2166 0.2313 0.035 1tcf:A, 2tn4:A
18 1tn4:A 157 126 0.1522 0.1783 0.2222 5.4 1tcf:A, 2tn4:A
19 1jf0:A 192 62 0.1141 0.1094 0.3387 0.036
20 1ncy:A 162 147 0.1902 0.2160 0.2381 0.046 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
21 1ncy:A 162 121 0.1467 0.1667 0.2231 2.8 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
22 2l1w:A 149 148 0.1902 0.2349 0.2365 0.063 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
23 4wri:A 187 96 0.1359 0.1337 0.2604 0.081
24 1b8c:A 108 66 0.1196 0.2037 0.3333 0.083 1b8c:B, 1b8l:A, 1b8r:A, 1b9a:A, 1cdp:A, 4cpv:A, 5cpv:A
25 6hr1:A 406 116 0.1685 0.0764 0.2672 0.086 6hr1:B
26 6iie:A 87 70 0.1141 0.2414 0.3000 0.091
27 1jfk:A 134 121 0.1467 0.2015 0.2231 0.092 3li6:A, 3li6:D, 3li6:G, 3li6:J, 2m7m:A, 2m7n:A, 2nxq:A, 2nxq:B, 3ulg:A, 3ulg:B, 5xop:A, 5xop:B, 5xop:C, 5xop:D, 5xop:E, 5xop:F
28 1jfk:A 134 66 0.1141 0.1567 0.3182 0.53 3li6:A, 3li6:D, 3li6:G, 3li6:J, 2m7m:A, 2m7n:A, 2nxq:A, 2nxq:B, 3ulg:A, 3ulg:B, 5xop:A, 5xop:B, 5xop:C, 5xop:D, 5xop:E, 5xop:F
29 1rjv:A 110 81 0.1304 0.2182 0.2963 0.10 3f45:A, 1g33:A, 1rk9:A, 1rtp:1, 1rtp:2, 1rtp:3, 1rwy:A, 1rwy:B, 1rwy:C
30 2mbx:A 109 73 0.1359 0.2294 0.3425 0.11
31 8b6q:A 466 113 0.1685 0.0665 0.2743 0.13 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
32 8b6q:A 466 130 0.1467 0.0579 0.2077 1.0 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
33 7eg3:E 194 78 0.1250 0.1186 0.2949 0.13 7eg2:A, 7eg2:B, 7eg2:C, 7eg2:D, 7eg2:E, 7eg2:F, 7eg2:G, 7eg2:H, 7eg2:I, 7eg2:J, 7eg2:K, 7eg2:L, 7eg2:M, 7eg2:N, 7eg2:O, 7eg2:P, 7eg3:A, 7eg3:B, 7eg3:C, 7eg3:D, 7eg3:F, 7eg3:G, 7eg3:H, 7eg3:I, 7eg3:J, 7eg3:K, 7eg3:L, 7eg3:M, 7eg3:N, 7eg3:O, 7eg3:P, 1ej3:A, 1ej3:B, 1sl8:A, 1uhh:A, 1uhh:B, 1uhi:A, 1uhi:B, 1uhj:A, 1uhj:B, 1uhk:A, 1uhk:B, 5zab:A, 5zab:B, 5zab:C, 5zab:D, 5zab:E, 5zab:F, 5zab:G, 5zab:H, 5zab:I, 5zab:J, 5zab:K, 5zab:L, 5zab:M, 5zab:N, 5zab:O, 5zab:P
34 1bu3:A 108 67 0.1250 0.2130 0.3433 0.13
35 1pal:A 107 67 0.1141 0.1963 0.3134 0.13 2pal:A, 3pal:A, 4pal:A, 1pvb:A, 2pvb:A
36 6u2m:A 464 115 0.1685 0.0668 0.2696 0.14 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
37 4nqg:A 197 87 0.1304 0.1218 0.2759 0.16 4nqg:B
38 6k67:B 83 58 0.0815 0.1807 0.2586 0.19 6k67:D
39 8aht:A 140 87 0.1250 0.1643 0.2644 0.22 8aht:B
40 4i2y:A 381 141 0.2011 0.0971 0.2624 0.25 4i2y:B
41 3khe:B 191 63 0.1141 0.1099 0.3333 0.30 3khe:A
42 3o78:A 402 114 0.1630 0.0746 0.2632 0.30 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
43 6tz6:E 146 74 0.1141 0.1438 0.2838 0.31 6tz6:B
44 6xw2:A 387 115 0.1685 0.0801 0.2696 0.34
45 2f2p:A 169 96 0.1359 0.1479 0.2604 0.36 2f2o:B, 2f2p:B
46 3lij:A 465 65 0.1033 0.0409 0.2923 0.37 3l19:A, 3l19:B
47 8x3a:A 151 129 0.1793 0.2185 0.2558 0.44 8x39:A, 8x39:B
48 1s3p:A 109 106 0.1359 0.2294 0.2358 0.45 1xvj:A, 1xvj:B
49 2ggz:A 165 113 0.1576 0.1758 0.2566 0.45 2ggz:B
50 6xyr:A 348 96 0.1359 0.0718 0.2604 0.72
51 3fs7:A 108 74 0.1141 0.1944 0.2838 0.75 3fs7:B, 3fs7:C, 3fs7:D, 3fs7:E, 3fs7:F, 3fs7:G, 3fs7:H
52 4ysm:A 475 106 0.1413 0.0547 0.2453 0.82 3ma6:A, 3ma6:B, 4ysj:A, 4ysj:B, 4ysm:B, 4yuq:A, 4yuq:B, 4yzb:A, 4yzb:B
53 6xu4:A 389 58 0.0815 0.0386 0.2586 0.85 6xu4:B, 6xu4:E
54 5h7d:E 113 58 0.0815 0.1327 0.2586 1.00 5h7d:F, 5h7d:G, 5h7d:H, 5h7d:K, 5h7d:L, 5h7d:O, 5h7d:P
55 1fpw:A 190 119 0.1576 0.1526 0.2437 1.0 2ju0:A
56 2lhi:A 176 70 0.1033 0.1080 0.2714 1.1 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D
57 2lhi:A 176 147 0.1848 0.1932 0.2313 1.7 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D
58 4y5q:A 449 68 0.1033 0.0423 0.2794 1.1 9d8s:A, 3igo:A, 3mwu:A, 3ncg:A, 2wei:A
59 2jnx:A 134 61 0.1087 0.1493 0.3279 1.2
60 2jnx:A 134 66 0.0978 0.1343 0.2727 2.8
61 2jnx:A 134 73 0.1033 0.1418 0.2603 7.1
62 5g4p:A 184 120 0.1413 0.1413 0.2167 1.2 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
63 2pas:A 109 70 0.1141 0.1927 0.3000 1.2 3pat:A, 1pva:A, 1pva:B
64 5d43:A 150 86 0.1304 0.1600 0.2791 1.3 5d43:B
65 8osi:A 400 96 0.1196 0.0550 0.2292 1.3
66 9c57:L 404 70 0.1141 0.0520 0.3000 1.4 9c6n:L, 8x15:T, 8x19:T, 8x1c:T, 8xvg:J, 8xvt:J
67 7ukh:I 181 62 0.0978 0.0994 0.2903 1.5 7ukh:J, 7ukh:K, 7ukh:L
68 5coc:A 124 58 0.0815 0.1210 0.2586 1.7
69 1osa:A 148 96 0.1304 0.1622 0.2500 1.8 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
70 2m3g:A 229 50 0.0978 0.0786 0.3600 2.1 2m3g:B, 2m3g:C, 4tl3:A, 4tl3:B, 1xio:A
71 6tz8:B 174 139 0.1522 0.1609 0.2014 2.5 6tz8:E
72 6tz8:B 174 62 0.1033 0.1092 0.3065 3.7 6tz8:E
73 1omr:A 201 53 0.0761 0.0697 0.2642 2.7 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
74 6k4k:D 95 58 0.0761 0.1474 0.2414 2.8
75 2l4h:A 184 33 0.0598 0.0598 0.3333 3.3 2l4i:A, 2lm5:A, 6ocx:D, 6ocx:C, 6ocx:A, 6ocx:B, 6od0:A, 6od0:B, 1xo5:A, 1xo5:B, 1y1a:A, 1y1a:B
76 3kpx:A 189 107 0.1522 0.1481 0.2617 4.4
77 3k21:A 178 111 0.1630 0.1685 0.2703 4.9
78 6tj5:A 131 61 0.1196 0.1679 0.3607 5.2
79 2kn2:A 92 80 0.1196 0.2391 0.2750 5.7
80 1rfj:A 148 93 0.1304 0.1622 0.2581 5.9 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
81 3h4s:E 96 46 0.0761 0.1458 0.3043 6.2
82 8ebs:J 149 80 0.1141 0.1409 0.2625 6.2 2a4j:A, 8ebt:J, 8ebv:J, 8ebw:J, 8ebx:J, 2ggm:A, 2ggm:B, 2k2i:A, 2obh:A, 2obh:B
83 5zh6:A 107 76 0.1250 0.2150 0.3026 8.9 5zh6:B
84 4i6v:B 430 103 0.1522 0.0651 0.2718 9.2 4i6v:A, 4i6v:C
85 3gyt:A 242 33 0.0815 0.0620 0.4545 9.6 3gyu:A
86 2lvj:A 77 60 0.0924 0.2208 0.2833 9.9 1k9u:A, 1k9u:B, 2lvk:A, 5otj:D, 5otj:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218