BioLiP

>protein
HMSIITDVYAREVLDSRGNPTLEVEVYTESGAFGRGMVPSGGEHEAVELRDGDKSRYGGLGTQKAVDNVNNIIAEAIIGY
DVRDQQAIDRAMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADYLEIPLYSYLGGFNTKVLPTPMMNIINGGSHSDAPIAF
QEFMILPVGAPTFKEALRYGAEIFHALKKILKSRGLETAVGDEGGFAPRFEGTEDGVETILAAIEAAGYVPGKDVFLGFD
CASSEFYDRKVYDYTKFEGEGAAVRTSAEQIDYLEELVNKYPIITIEDGMDENDWDGWKALTERLGKKVQLVGDDFFVTN
TDYLARGIQEGAANSILIKVNQIGTLTETFEAIEMAKEAGYTAVVSHRSGETEDSTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRI
AKYNQLLRIEDQLGEVAEYRGLKSFYNL

The query sequence (length=428) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1w6t:B	430	430	1.0000	0.9953	0.9953	0.0	1w6t:A
2	5bof:A	434	432	0.8178	0.8065	0.8102	0.0	5boe:A, 5boe:B, 5bof:B
3	1iyx:A	431	429	0.8178	0.8121	0.8159	0.0	1iyx:B
4	4mks:A	400	428	0.6636	0.7100	0.6636	0.0	4mks:B
5	5j04:A	424	420	0.5958	0.6014	0.6071	2.08e-180	5j04:B, 4rop:A
6	4z17:A	424	426	0.5981	0.6038	0.6009	1.09e-177	4yws:A, 4z17:B, 4z1y:A, 4z1y:B
7	3tqp:A	418	424	0.6051	0.6196	0.6108	2.43e-173	3tqp:B
8	3uj2:A	423	427	0.5771	0.5839	0.5785	1.63e-171	3uj2:B, 3uj2:C, 3uj2:D, 3uj2:E, 3uj2:F, 3uj2:G, 3uj2:H
9	6bfy:A	439	429	0.5864	0.5718	0.5851	2.94e-169	6bfy:B, 6bfy:C, 6bfy:F, 6bfy:D, 6bfy:E, 6bfz:A, 6bfz:B, 6bfz:E, 6bfz:F, 6bfz:D, 6bfz:C, 6d3q:A, 6d3q:C, 6d3q:B, 6d3q:E, 6d3q:F, 6d3q:D, 1e9i:A, 1e9i:B, 1e9i:C, 1e9i:D, 2fym:A, 2fym:C, 2fym:D, 2fym:F, 3h8a:A, 3h8a:B, 3h8a:C, 3h8a:D, 6npf:A, 6npf:B, 6npf:C, 6npf:D, 6npf:F, 6npf:E, 5ohg:A, 5ohg:B, 5ohg:H, 5ohg:I
10	6o4n:A	422	427	0.5514	0.5592	0.5527	2.47e-164	6o4n:B, 8w21:A, 8w21:B, 8w21:C, 8w21:E, 8w21:G, 8w21:H
11	4yws:B	393	424	0.5771	0.6285	0.5825	2.42e-158
12	7cll:C	426	427	0.5584	0.5610	0.5597	5.70e-158	7ckp:A, 7clk:A, 7cll:A, 7cll:B, 7cll:D, 7dlr:A, 7e4f:A, 7e51:A, 7e51:B, 7e51:C, 7e51:D, 7e51:E, 7e51:F, 7e51:G, 7e51:H, 6l7d:A
13	6nb2:B	424	411	0.5234	0.5283	0.5450	7.77e-156	6nb2:A, 6nbm:A, 6nbm:B
14	3qtp:B	439	430	0.5070	0.4943	0.5047	3.25e-136	3qtp:A
15	3qn3:A	415	425	0.5187	0.5349	0.5224	1.54e-135	3qn3:B, 3qn3:C, 3qn3:D
16	5eu9:C	436	434	0.4907	0.4817	0.4839	2.65e-135	2akm:A, 2akm:B, 2akz:A, 2akz:B, 5eu9:A, 5eu9:B, 5eu9:D, 5eu9:E, 5eu9:F, 5eu9:G, 5eu9:H, 5idz:A, 5idz:B, 7mbh:A, 7mbh:B, 5td9:A, 5td9:B, 1te6:A, 1te6:B, 5tij:A, 5tij:B, 3ucc:A, 3ucc:B, 3ucd:A, 3ucd:B, 3uje:A, 3uje:B, 3ujf:A, 3ujf:B, 3ujr:A, 3ujr:B, 3ujs:A, 3ujs:B, 4za0:A, 4za0:B, 4zcw:A, 4zcw:B
17	7vrd:A	439	433	0.5140	0.5011	0.5081	8.80e-134	7vrd:B, 7vrd:C, 7vrd:D
18	3b97:C	433	434	0.4790	0.4734	0.4724	2.05e-133	3b97:A, 3b97:B, 3b97:D, 2psn:A, 2psn:B, 2psn:C, 2psn:D
19	1pdz:A	433	434	0.4930	0.4873	0.4862	4.12e-133	8uel:A, 8uel:B
20	2xsx:B	435	430	0.4836	0.4759	0.4814	1.29e-132	2xsx:A
21	2ptx:A	431	428	0.4953	0.4919	0.4953	4.14e-131	1oep:A, 2pty:A, 2ptz:A, 2pu0:A, 2pu1:A
22	2xgz:A	437	431	0.4907	0.4805	0.4872	5.27e-130	2al1:A, 2al1:B, 2al2:A, 2al2:B, 1ebg:A, 1ebg:B, 1ebh:A, 1ebh:B, 1els:A, 4enl:A, 5enl:A, 6enl:A, 7enl:A, 1l8p:A, 1l8p:B, 1l8p:C, 1l8p:D, 1nel:A, 1one:A, 1one:B, 2one:A, 2one:B, 1p43:A, 1p43:B, 1p48:A, 1p48:B, 2xgz:B, 2xh0:A, 2xh0:B, 2xh0:C, 2xh0:D, 2xh2:A, 2xh2:D, 2xh2:B, 2xh2:C, 2xh4:A, 2xh4:B, 2xh4:C, 2xh4:D, 2xh7:A, 2xh7:B
23	4g7f:A	419	422	0.4836	0.4940	0.4905	3.53e-128
24	2ptw:A	406	427	0.4860	0.5123	0.4871	2.39e-126
25	7rhw:A	437	434	0.4977	0.4874	0.4908	4.65e-125	7rhv:A, 7rhv:B, 7rhw:B, 7ri0:A, 7ri0:B
26	7ugh:A	436	428	0.4696	0.4610	0.4696	3.09e-118	7ugh:B
27	8b9d:L	87	64	0.0397	0.1954	0.2656	0.47	7plo:L
28	3bub:A	1016	77	0.0584	0.0246	0.3247	0.78	2alw:A, 3blb:A, 3bud:A, 3bui:A, 3bup:A, 3buq:A, 3bvt:A, 3bvu:A, 3bvv:A, 3bvw:A, 3bvx:A, 3cv5:A, 3czn:A, 3czs:A, 3d4y:A, 3d4z:A, 3d50:A, 3d51:A, 3d52:A, 3ddf:A, 3ddg:A, 3dx0:A, 3dx1:A, 3dx2:A, 3dx3:A, 3dx4:A, 3ejp:A, 3ejq:A, 3ejr:A, 3ejs:A, 3ejt:A, 3eju:A, 2f18:A, 2f1a:A, 2f1b:A, 2f7o:A, 2f7p:A, 2f7q:A, 2f7r:A, 2fyv:A, 1hty:A, 1hww:A, 1hxk:A, 2ow6:A, 2ow7:A, 1ps3:A, 1qwn:A, 1qwu:A, 1qx1:A, 1r33:A, 1r34:A, 6rpc:A, 6rqz:A, 6rrh:A, 6rrj:A, 6rru:A, 6rrw:A, 6rrx:A, 6rry:A, 6rs0:A, 1tqs:A, 1tqt:A, 1tqu:A, 1tqv:A, 1tqw:A
29	6rrn:A	989	77	0.0584	0.0253	0.3247	0.84
30	3gy1:B	388	132	0.0771	0.0851	0.2500	1.5	3gy1:A, 3s47:A, 3s47:B
31	6p24:B	793	217	0.1215	0.0656	0.2396	1.6
32	4hnl:A	401	139	0.0771	0.0823	0.2374	2.2
33	4h83:F	368	132	0.0771	0.0897	0.2500	2.4	4h83:A, 3no1:A, 3no1:B, 3no1:C, 3no1:D, 3no1:E, 3no1:F
34	4v6w:Cb	75	57	0.0397	0.2267	0.2982	5.5	6xu6:Cb, 6xu7:Cb, 6xu8:Cb
35	4rnh:A	423	54	0.0467	0.0473	0.3704	5.8
36	4amv:A	608	56	0.0397	0.0280	0.3036	5.9	4amv:B, 4amv:C, 7dnr:A, 2j6h:A, 2j6h:B, 1jxa:A, 1jxa:B, 1moq:A, 1mor:A, 1mos:A, 3ooj:A, 3ooj:B, 3ooj:C, 3ooj:D, 3ooj:E, 3ooj:F, 3ooj:G, 3ooj:H, 2vf5:X, 1xff:A, 1xff:B, 1xfg:A, 1xfg:B

[Back]