BioLiP

>protein
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRE
RLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLD
TVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFA
HLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNG
KLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAAL
IASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKV
RAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAV
GPYLVTKDLRH

The query sequence (length=571) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3ven:A	571	571	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3veo:A, 3ver:A, 3ves:A, 3vet:A, 3vew:A, 3vex:A, 3vez:A, 3vf2:A, 3vf4:A
2	8hiu:A	597	596	0.3660	0.3501	0.3507	2.16e-81	8hiu:B, 7xb6:A, 7xb6:B, 7xb6:C, 7xb6:D
3	7vx0:B	680	598	0.3433	0.2882	0.3278	2.58e-66	7vx0:A, 7vyj:A, 7vyj:B, 7vyo:A, 7vyo:B, 7vyp:A, 7vyp:B, 7vzn:A, 7vzn:B, 7vzq:A, 7vzq:B, 7vzu:A, 7vzu:B, 7vzy:A, 7vzy:B, 7vzz:A, 7vzz:B
4	6z81:A	342	324	0.1366	0.2281	0.2407	0.16	4wq4:A, 4wq4:B, 4wq5:A, 4wq5:B, 4ydu:A, 4ydu:B, 6z81:B, 3zet:B, 3zeu:B, 3zeu:E
5	8r6s:N	224	56	0.0315	0.0804	0.3214	0.39	7bjk:A, 7bjk:B, 7bjk:C, 7bjk:D, 7bjk:E, 8qma:L, 8r5o:N, 8ras:N, 8rdj:N
6	8wa0:L	235	93	0.0368	0.0894	0.2258	0.97	8w9z:L, 8wa1:L
7	5tnx:A	370	186	0.0806	0.1243	0.2473	1.1
8	1woq:A	253	74	0.0403	0.0909	0.3108	1.3	1woq:B
9	3b50:A	310	54	0.0350	0.0645	0.3704	1.7	2cex:A, 2cex:B, 2cex:C, 2cex:D, 2cey:A, 8cp7:A, 6h75:A, 6h76:A, 2v4c:A, 2wx9:A, 2wyk:A, 2wyp:A, 2xa5:A, 2xwi:A, 2xwk:A, 2xwo:A, 2xwv:A, 2xxk:A
10	5yjy:B	465	49	0.0263	0.0323	0.3061	2.0	5yjw:A, 5yjx:A, 5yjx:B, 5yjy:A
11	4g6h:A	472	49	0.0263	0.0318	0.3061	2.1	4g6g:A, 4g6g:B, 4g6h:B, 4g73:A, 4g73:B, 4g74:A, 4g74:B, 4g9k:A, 4g9k:B, 4gap:A, 4gap:B, 4gav:A, 4gav:B
12	5dzt:A	886	34	0.0263	0.0169	0.4412	2.6
13	2ivn:A	325	73	0.0350	0.0615	0.2740	3.8	2ivo:A, 2ivo:B, 2ivo:C, 2ivp:A
14	1ovm:A	535	50	0.0315	0.0336	0.3600	4.9	1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
15	1unf:X	214	64	0.0245	0.0654	0.2188	5.4
16	6sgb:F1	889	110	0.0543	0.0349	0.2818	5.6	6sg9:F1, 6sga:F1
17	5vm2:A	347	48	0.0315	0.0519	0.3750	6.0	5vm2:B
18	4m99:A	206	54	0.0228	0.0631	0.2407	6.0	4m99:B, 4m99:C
19	8z99:H	582	63	0.0280	0.0275	0.2540	9.2	8yhd:I, 8yhd:L, 8yhe:I, 8yhe:L, 8z4j:H, 8z4j:I, 8z4j:L, 8z4l:H, 8z4l:I, 8z4l:L, 8z99:I, 8z99:L, 8z9c:H, 8z9c:I, 8z9c:L, 8z9e:I, 8z9e:L
20	3gql:A	287	144	0.0630	0.1254	0.2500	9.6	5a4c:B, 1agw:B, 5am6:B, 5b7v:B, 6c18:A, 6c18:B, 6c19:A, 6c19:B, 6c1b:A, 6c1b:B, 6c1c:A, 6c1c:B, 6c1o:A, 6c1o:B, 4f63:B, 4f64:B, 4f65:A, 4f65:B, 1fgi:B, 2fgi:B, 3gql:B, 3gql:C, 6mzq:A, 6mzq:B, 6mzw:A, 6mzw:B, 4nk9:A, 4nk9:B, 4nka:B, 4nks:A, 4nks:B, 6nvl:A, 6nvl:B, 6nvl:C, 5o49:B, 7ozf:BBB, 3rhx:B, 4rwj:B, 4rwk:B, 4rwl:B, 3tt0:B, 5uq0:A, 5uq0:B, 5ur1:A, 5ur1:B, 4v01:A, 4v01:B, 4v05:B, 7wcl:B, 4wun:B, 8yki:A, 8yki:B, 5zv2:B
21	8z9e:H	553	63	0.0280	0.0289	0.2540	10.0

[Back]