BioLiP

>protein
HMLLERPQQKKNSRFYQMSPEERLASLLNEGQISADTKKEFENTALSSQIANHMIENQISETEVPMGVGLHLTVDETDYL
VPMATEEPSVIAALSNGAKIAQGFKTVNQQRLMRGQIVFYDVADPESLIDKLQVREAEIFQQAELSYPSIVKRGGGLRDL
QYRAFDESFVSVDFLVDVKDAMGANIVNAMLEGVAELFREWFAEQKILFSILSNYATESVVTMKTAIPVSRLSKGSNGRE
IAEKIVLASRYASLDPYRAVTHNKGIMNGIEAVVLATGNDTRAVSASCHAFAVKEGRYQGLTSWTLDGEQLIGEISVPLA
LATVGGATKVLPKSQAAADLLAVTDAKELSRVVAAVGLAQNLAALRALVSEGIQKGHMALQARSLAMTVGATGKEVEAVA
QQLKRQKTMNQDRALAILNDLR

The query sequence (length=422) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7m1z:B	425	422	0.9976	0.9906	0.9976	0.0	7m1z:A, 7m1z:C, 7m1z:D, 7m3h:A, 7m3h:B, 7m66:A, 7m66:C, 7m66:B, 7m66:D
2	5wpk:B	422	417	0.4408	0.4408	0.4460	9.09e-113	5wpj:A, 5wpk:A
3	6dio:C	428	420	0.4242	0.4182	0.4262	4.54e-98	6dio:A, 6dio:B, 6eev:A
4	1qax:A	425	418	0.4028	0.4000	0.4067	3.21e-91	8gdn:A, 8gdn:B, 4i4b:A, 4i4b:B, 4i56:A, 4i56:B, 4i6a:A, 4i6a:B, 4i6w:A, 4i6w:B, 4i6y:A, 4i6y:B, 1qax:B, 1qay:A, 1qay:B, 1r31:A, 1r31:B, 8sz6:A, 8sz6:B, 1t02:A, 8vlq:A, 8vlq:B
5	6p7k:A	375	376	0.3531	0.3973	0.3963	7.86e-75
6	3cd5:A	425	366	0.2156	0.2141	0.2486	2.98e-10	3bgl:A, 3bgl:B, 3bgl:C, 3bgl:D, 3cct:A, 3cct:B, 3cct:C, 3cct:D, 3ccw:A, 3ccw:B, 3ccw:C, 3ccw:D, 3ccz:A, 3ccz:B, 3ccz:C, 3ccz:D, 3cd0:A, 3cd0:B, 3cd0:C, 3cd0:D, 3cd5:B, 3cd5:C, 3cd5:D, 3cd7:A, 3cd7:B, 3cd7:C, 3cd7:D, 3cda:A, 3cda:B, 3cda:C, 3cda:D, 3cdb:A, 3cdb:B, 3cdb:C, 3cdb:D, 1dq8:A, 1dq8:B, 1dq8:C, 1dq8:D, 1dq9:A, 1dq9:B, 1dq9:C, 1dq9:D, 1dqa:A, 1dqa:B, 1dqa:C, 1dqa:D, 1hw8:A, 1hw8:B, 1hw8:C, 1hw8:D, 1hw9:A, 1hw9:B, 1hw9:C, 1hw9:D, 1hwi:A, 1hwi:B, 1hwi:C, 1hwi:D, 1hwj:A, 1hwj:B, 1hwj:C, 1hwj:D, 1hwk:A, 1hwk:B, 1hwk:C, 1hwk:D, 1hwl:A, 1hwl:B, 1hwl:C, 1hwl:D, 2q1l:A, 2q1l:B, 2q1l:C, 2q1l:D, 2q6b:A, 2q6b:B, 2q6b:C, 2q6b:D, 2q6c:A, 2q6c:B, 2q6c:C, 2q6c:D, 2r4f:A, 2r4f:B, 2r4f:C, 2r4f:D
7	6hr8:A	397	356	0.2038	0.2166	0.2416	3.70e-07	6hr8:B, 6hr8:C, 6hr8:D, 6hr8:E, 6hr8:F
8	8ecg:A	357	335	0.1896	0.2241	0.2388	2.38e-05
9	7pzb:A	227	101	0.0687	0.1278	0.2871	0.095	7pza:A, 7pza:B, 7pzb:B
10	5dai:A	247	95	0.0711	0.1215	0.3158	0.16
11	3anl:A	400	44	0.0450	0.0475	0.4318	0.36	3anl:B, 3anm:A, 3anm:B, 3ann:A, 3ann:B, 2egh:A, 2egh:B, 1jvs:A, 1jvs:B, 1ono:A, 1ono:B, 1onp:A, 1onp:B, 1q0h:A, 1q0l:A, 1q0q:A, 1q0q:B, 3r0i:A, 3r0i:B, 1t1r:A, 1t1r:B, 1t1s:A, 1t1s:B
12	7mfm:G	1483	70	0.0474	0.0135	0.2857	2.4	7mfm:H, 7mft:G
13	4f1m:A	278	60	0.0403	0.0612	0.2833	5.9	4f0f:A, 4f1o:A, 4f1t:A, 4yzm:A, 4yzm:B, 4yzn:A
14	7dvq:0	100	39	0.0332	0.1400	0.3590	7.3
15	3q08:A	241	18	0.0237	0.0415	0.5556	9.1	3q08:B, 3q08:C, 3q08:D, 3q08:E, 3q08:F, 3q08:G, 3q08:H, 3q08:I, 3q08:J, 3q08:K, 3q08:L, 3q08:M, 3q08:N, 3q08:O, 3q08:P, 3q08:Q, 3q08:R, 3q08:S, 3q08:T, 3q09:A, 3q09:B, 3q09:C, 3q09:D, 3q09:E, 3q09:F, 3q09:G, 3q09:H, 3q09:I, 3q09:J, 3q09:K, 3q09:L, 3q09:M, 3q09:N, 3q09:O, 3q09:P, 3q09:Q, 3q09:R, 3q09:S, 3q09:T, 2vxh:A, 2vxh:B, 2vxh:C, 2vxh:D, 2vxh:E, 2vxh:F

[Back]