BioLiP

>protein
HMKLSLVISTSDAAFDALAFKGDLRKGMELAKRVGYQAVEIAVRDPSIVDWNEVKILSEELNLPICAIGTGQAYLADGLS
LTHPNDEIRKKAIERVVKHTEVAGMFGALVIIGLVRGRREGRSYEETEELFIESMKRLLELTEHAKFVIEPLNRYETDFI
NTIDDALRILRKINSNRVGILADTFHMNIEEVNIPESLKRAGEKLYHFHVADSNRWAPGCGHFDFRSVFNTLKEIGYNRY
VSVECLPLPGGMEEAAEIAFKTLKELIIKL

The query sequence (length=270) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5h1w:A	270	270	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5b7y:A, 5b7y:B, 5b80:A, 5b80:B, 5h1w:B, 5h6h:A, 5h6h:B
2	7cj5:A	292	244	0.2889	0.2671	0.3197	4.52e-26	7cj4:A, 7cj4:B, 7cj5:B, 7cj6:A, 7cj6:B, 7cj7:A, 7cj7:B, 7cj8:A, 7cj8:B, 7cj8:C, 7cj8:D, 7cj8:E, 7cj8:F, 7cj9:A, 7cj9:B, 7cj9:C, 7cj9:D, 7cj9:E, 7cj9:F, 7cj9:G, 7cj9:H
3	6wn6:B	264	250	0.2778	0.2841	0.3000	1.48e-21	6wn6:A, 6wn6:C, 6wn6:D
4	7x7w:A	288	122	0.1667	0.1562	0.3689	4.45e-21	7x7w:B
5	3vnl:A	291	249	0.2556	0.2371	0.2771	2.18e-19	7e9w:A, 7e9w:B, 7e9w:C, 7e9w:D, 3vni:A, 3vni:B, 3vni:C, 3vni:D, 3vnj:A, 3vnj:B, 3vnj:C, 3vnj:D, 3vnk:A, 3vnk:B, 3vnk:C, 3vnk:D, 3vnl:B, 3vnl:C, 3vnl:D, 3vnm:A, 3vnm:B, 3vnm:C, 3vnm:D
6	4pfh:A	298	211	0.2185	0.1980	0.2796	1.00e-18	5j8l:A, 5j8l:B, 5j8l:C, 5j8l:D, 2ou4:A, 2ou4:B, 2ou4:C, 2ou4:D, 4pfh:B, 4pgl:A, 4pgl:B, 4pgl:C, 4pgl:D, 4q7i:A, 4q7i:B, 2qul:A, 2qul:B, 2qul:C, 2qul:D, 2qum:A, 2qum:B, 2qum:C, 2qum:D, 2qun:A, 2qun:B, 2qun:C, 2qun:D, 4xsl:A, 4xsl:B, 4xsl:C, 4xsl:D, 4xsm:A, 4xsm:B, 4xsm:C, 4xsm:D, 4ytq:A, 4ytq:B, 4ytq:C, 4ytq:D, 4ytr:A, 4ytr:B, 4ytr:C, 4ytr:D, 4yts:A, 4yts:B, 4yts:C, 4yts:D, 4ytt:A, 4ytt:B, 4ytt:C, 4ytt:D, 4ytu:A, 4ytu:B, 4ytu:C, 4ytu:D
7	3vyl:A	297	238	0.2148	0.1953	0.2437	2.01e-18	3vyl:B, 3vyl:C, 3vyl:D, 3vyl:E, 3vyl:F, 3vyl:G, 3vyl:H
8	7ern:C	284	232	0.2259	0.2148	0.2629	8.07e-18	7erm:A, 7erm:B, 7erm:C, 7erm:D, 7ern:A, 7ern:B, 7ern:D, 7ero:A, 7ero:B, 7ero:C, 7ero:D
9	5zfs:B	294	228	0.2222	0.2041	0.2632	5.57e-17	5zfs:A
10	7dz4:C	286	217	0.2333	0.2203	0.2903	6.76e-17	7dz2:A, 7dz2:B, 7dz2:C, 7dz2:D, 7dz3:A, 7dz3:B, 7dz3:C, 7dz3:D, 7dz4:A, 7dz4:B, 7dz4:D, 7dz5:A, 7dz5:B, 7dz5:C, 7dz5:D, 7dz6:A, 7dz6:B, 7dz6:C, 7dz6:D
11	2hk1:A	289	106	0.1407	0.1315	0.3585	2.06e-16	2hk1:B, 2hk1:C, 2hk1:D
12	3kws:A	265	202	0.2370	0.2415	0.3168	2.86e-15	3kws:B
13	1i6n:A	278	123	0.1556	0.1511	0.3415	6.08e-11
14	3wqo:A	271	90	0.1074	0.1070	0.3222	5.11e-05	3wqo:B
15	3cqj:A	276	228	0.1926	0.1884	0.2281	6.83e-04	3cqj:B, 3cqk:A, 3cqk:B
16	2qw5:A	327	184	0.1481	0.1223	0.2174	0.008	2qw5:B
17	1de5:A	417	109	0.1037	0.0671	0.2569	0.13	1d8w:A, 1d8w:B, 1d8w:C, 1d8w:D, 1de5:B, 1de5:C, 1de5:D, 1de6:A, 1de6:B, 1de6:C, 1de6:D
18	5tnv:A	306	52	0.0593	0.0523	0.3077	0.53
19	8of1:A	505	104	0.1074	0.0574	0.2788	0.73	8of1:B, 8ofm:A, 8ofm:B
20	5hmq:D	624	99	0.0778	0.0337	0.2121	0.95	5hmq:A, 5hmq:B, 5hmq:C, 5hmq:E, 5hmq:F
21	3tva:A	282	98	0.0889	0.0851	0.2449	1.4	3tva:B
22	6ki3:B	300	80	0.0778	0.0700	0.2625	1.5	6khy:A, 6khy:C, 6khy:B, 6khy:D, 6ki3:A
23	6n2n:B	291	22	0.0370	0.0344	0.4545	2.0	6n2n:D, 6n2o:B, 6n2o:D
24	7suk:SP	2234	43	0.0630	0.0076	0.3953	2.5	6zqb:UT
25	3o0f:A	287	41	0.0556	0.0523	0.3659	3.0	3e0f:A
26	1gax:A	862	27	0.0444	0.0139	0.4444	3.1	1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
27	3uva:C	405	31	0.0407	0.0272	0.3548	3.9	3uu0:A, 3uu0:B, 3uu0:C, 3uu0:D, 3uva:A, 3uva:B, 3uva:D, 3uxi:A
28	2zsj:A	350	58	0.0704	0.0543	0.3276	4.1	2zsj:B, 2zsj:C, 2zsj:D
29	1q9s:A	149	70	0.0704	0.1275	0.2714	5.7	1nb0:A, 1nb9:A, 1p4m:A
30	6dft:A	384	20	0.0333	0.0234	0.4500	7.3	6dft:C, 6dft:E, 6dft:G, 6dft:I, 6dft:K
31	8fpj:A	1345	59	0.0778	0.0156	0.3559	9.7

[Back]