BioLiP

>protein
HMKFGVNYTPSHGWFHAWLDPDWDGIDNDLKQISELGMDHVRIFPIWPYLQPNRTWINKKGVADVRRMVHIAGEHGLDAY
VDVFQGHLSSFDFLPSWLVTWHAGNMFTDADAVAAERELVKTMTDELSKEPAFKGLTLGNAVNQLSDRPHPTKMSATDRQ
IDAWLDALLPTAAGEGHNALYSVNDGTWFIDGHPFTPVQSATKGDMTVIHSWVFNGIAQGYGATSEECSSYALYLAELAK
AFGKDSERPVWLQEVGAPENVLETDYTPEFCRKTVERAMDCRNLWGVTWWCSHDVPASMEDFPFFEHSLGLFDEQGQLKP
IGRTFGELAAQYRSALPAQPKTVAVVIDVDEAGNPVNRSALGPGGSVCDLWMKLQVAGQRPTIITSQVAANQEALAQRGI
LELHADEHPYAARYYTAVSDPSFE

The query sequence (length=424) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7lr6:A	424	424	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7lr6:B, 7lr6:C, 7lr6:D
2	7lr8:B	415	404	0.4458	0.4554	0.4678	1.35e-135	7lr8:A
3	1v03:A	487	60	0.0448	0.0390	0.3167	6.90e-04
4	1e55:A	492	60	0.0448	0.0386	0.3167	0.001	1e1f:A, 1e1f:B, 1e4n:A, 1e4n:B, 1e55:B, 1e56:A, 1e56:B, 1h49:B, 1h49:A, 1v08:A, 1v08:B
5	5cy4:C	184	157	0.0896	0.2065	0.2420	0.11	5cy4:A, 5cy4:B, 5cy4:D, 5cy4:E, 5cy4:F
6	2e9l:A	466	64	0.0448	0.0408	0.2969	0.18	2e9m:A, 3vkk:A, 2zox:A
7	6qwi:A	448	60	0.0354	0.0335	0.2500	0.57	1bgg:B, 1bgg:C, 1bgg:D, 1e4i:A, 6qwi:B, 6r4k:A, 6r4k:B, 1uyq:A
8	6jhf:A	653	142	0.0708	0.0459	0.2113	0.82	6jeq:A, 6jfj:A, 6jfx:A, 6jhg:A, 6jhh:A, 6jhi:A
9	3naz:C	613	90	0.0590	0.0408	0.2778	0.94	3naz:D, 3o3c:A, 3o3c:B, 3o3c:C, 3o3c:D, 3rsz:C, 3rsz:D, 3rsz:A, 3rsz:B
10	7jzw:B	306	65	0.0448	0.0621	0.2923	1.0	6b44:B, 6b45:B, 6b47:B, 6b48:B, 7ecv:B, 7ecw:B, 7elm:B, 7elm:L, 7eln:B, 7eln:L, 7eqg:C, 7jzx:B, 7jzy:B, 7jzz:B, 6ne0:B, 7t3j:B, 7t3k:B, 7t3k:b, 7t3l:B, 7t3l:b, 7taw:B, 7taw:b, 7tax:B, 5uz9:B, 6vqv:D, 6vqw:C, 6vqx:C, 6w1x:B, 7we6:B, 7we6:L, 6whi:B, 7yhs:E
11	7wdo:A	445	58	0.0377	0.0360	0.2759	1.1	7wdn:A, 7wdp:A, 7wdr:A, 7wds:A, 7wdv:A
12	6rjm:B	456	60	0.0401	0.0373	0.2833	1.2	6rjm:A, 6rjo:A, 6rjo:B, 6rk2:A, 6rk2:B
13	3ptk:A	478	60	0.0330	0.0293	0.2333	1.6	3ptk:B, 3ptm:A, 3ptm:B, 3ptq:A, 3ptq:B
14	8ivy:A	451	52	0.0354	0.0333	0.2885	1.6	8ivy:B
15	2jal:B	444	58	0.0377	0.0360	0.2759	2.3	2cbu:A, 2cbu:B, 2cbv:A, 2cbv:B, 2ces:A, 2ces:B, 2cet:A, 2cet:B, 2j75:A, 2j75:B, 2j77:A, 2j77:B, 2j78:A, 2j78:B, 2j79:A, 2j79:B, 2j7b:A, 2j7b:B, 2j7c:A, 2j7c:B, 2j7d:A, 2j7d:B, 2j7e:A, 2j7e:B, 2j7f:A, 2j7f:B, 2j7g:A, 2j7g:B, 2j7h:A, 2j7h:B, 2jal:A, 5n6s:A, 5n6s:B, 5n6s:C, 5n6s:D, 5n6t:A, 5n6t:B, 1oif:A, 1oif:B, 1oim:A, 1oim:B, 1oin:A, 1oin:B, 5oss:B, 1uz1:A, 1uz1:B, 2vrj:A, 2vrj:B, 1w3j:A, 1w3j:B, 2wbg:A, 2wbg:B, 2wbg:C, 2wbg:D, 2wc3:A, 2wc3:B, 2wc3:C, 2wc3:D, 2wc4:A, 2wc4:B, 2wc4:C, 2wc4:D
16	3gnr:A	478	61	0.0307	0.0272	0.2131	3.0	3wba:A, 3wbe:A
17	6eon:A	754	120	0.0660	0.0371	0.2333	3.4
18	6h9x:A	428	54	0.0401	0.0397	0.3148	3.6	7ap1:A, 6hhy:A, 6hhz:A, 6hi0:A, 6r1m:A, 6r1m:B, 6r1o:A
19	3nk3:A	284	89	0.0613	0.0915	0.2921	5.0	3nk3:B, 3nk4:A, 3nk4:B
20	5ydl:A	408	59	0.0495	0.0515	0.3559	6.9	5ydm:A
21	4hz7:A	441	44	0.0330	0.0317	0.3182	7.3	4hz8:A
22	3qo8:A	441	62	0.0354	0.0340	0.2419	7.6	3qo7:A
23	6z1m:A	423	58	0.0330	0.0331	0.2414	7.8	6z1m:B, 6z1m:C
24	6z1h:A	382	58	0.0330	0.0366	0.2414	7.9
25	8kaq:A	401	68	0.0448	0.0474	0.2794	8.0	8kaq:B, 8kaq:C
26	8i0v:4	161	63	0.0425	0.1118	0.2857	8.2
27	8kaq:D	364	70	0.0448	0.0522	0.2714	8.6

[Back]