BioLiP

>protein
HMIREILKMGDPRLLEVAKPVAQFDTPELHEIVADMFETMHHANGAGLAAPQIGIGLQIIIFGFNRYPDAPPVPETVLIN
PKLEYMPPDMEEGWEGCLSVPGMRGVVSRYAKVRYSGYDQFGAKIDRVAEGFHARVVQHEYDHLIGKLYPMRITDFTRFG
FTEVLFP

The query sequence (length=167) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5hgw:A	174	170	1.0000	0.9598	0.9824	3.06e-121	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
2	5kob:A	171	170	0.7844	0.7661	0.7706	1.81e-96	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
3	6jfc:B	161	166	0.6287	0.6522	0.6325	5.34e-73	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
4	5cy7:A	171	167	0.5808	0.5673	0.5808	3.30e-68	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
5	1y6h:A	177	168	0.4731	0.4463	0.4702	7.63e-49	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
6	1ix1:A	169	156	0.3832	0.3787	0.4103	7.51e-32	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
7	4dr8:A	188	158	0.3952	0.3511	0.4177	4.53e-30	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
8	3fwx:A	165	162	0.4072	0.4121	0.4198	1.36e-29	3fwx:B
9	6ck7:A	172	150	0.3713	0.3605	0.4133	3.21e-29	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
10	6jes:A	159	154	0.3593	0.3774	0.3896	3.41e-28	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
11	6jex:A	172	144	0.3473	0.3372	0.4028	4.96e-28	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
12	1bs4:A	168	146	0.3653	0.3631	0.4178	1.33e-27	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
13	4je6:A	193	159	0.3653	0.3161	0.3836	7.50e-26	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
14	3g5k:A	183	178	0.3473	0.3169	0.3258	3.55e-22	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
15	4wxl:C	165	157	0.3473	0.3515	0.3694	7.23e-22	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
16	3cpm:A	184	153	0.3293	0.2989	0.3595	7.34e-22	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
17	5j46:A	169	144	0.3114	0.3077	0.3611	1.34e-21
18	3qu1:A	168	148	0.3353	0.3333	0.3784	1.46e-21	3qu1:B
19	1jym:A	179	154	0.3234	0.3017	0.3506	7.14e-21	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
20	3e3u:A	196	156	0.3533	0.3010	0.3782	3.77e-20
21	1ws1:A	151	154	0.3293	0.3642	0.3571	2.11e-19
22	3uwb:A	149	145	0.2934	0.3289	0.3379	3.29e-19	3uwa:A
23	3oca:A	179	160	0.3114	0.2905	0.3250	1.13e-18	3oca:B, 3u04:A
24	2ew5:A	166	156	0.3293	0.3313	0.3526	1.06e-17	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
25	3cmd:B	188	174	0.3653	0.3245	0.3506	1.45e-15	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
26	5jex:A	203	188	0.3533	0.2906	0.3138	2.70e-14	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
27	2os3:A	205	185	0.3593	0.2927	0.3243	2.84e-14
28	2os1:A	179	176	0.3413	0.3184	0.3239	4.27e-13
29	5mtc:A	137	142	0.2874	0.3504	0.3380	4.34e-13	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
30	6ow7:P	196	182	0.3413	0.2908	0.3132	1.98e-12	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
31	2okl:A	185	167	0.3174	0.2865	0.3174	1.26e-11	2okl:B
32	3l87:A	200	137	0.2754	0.2300	0.3358	1.07e-10
33	1lqy:A	184	169	0.2934	0.2663	0.2899	3.79e-10
34	1lm4:A	190	170	0.3054	0.2684	0.3000	4.10e-09	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
35	5zwp:A	207	79	0.1078	0.0870	0.2278	1.9	5zwp:B
36	4s1x:A	38	37	0.0659	0.2895	0.2973	3.4	4s1x:B, 4s1x:D, 4s1x:E
37	4nax:A	237	40	0.0958	0.0675	0.4000	5.9	4nax:B
38	6kmx:aA	717	75	0.1377	0.0321	0.3067	7.7	6kmx:bA, 6kmx:cA
39	4bc0:A	542	36	0.0599	0.0185	0.2778	7.8	4a16:A, 4a16:B, 4a16:C, 4a16:D, 4a23:A, 4a23:B, 4ara:A, 4ara:B, 4arb:A, 4arb:B, 4b7z:A, 4b7z:B, 4b80:A, 4b80:B, 4b81:A, 4b81:B, 4b82:A, 4b82:B, 4b83:A, 4b83:B, 4b84:A, 4b84:B, 4b85:A, 4b85:B, 4bc0:B, 4bc0:C, 4bc0:D, 4bc1:A, 4bc1:B, 4bc1:C, 4bc1:D, 4btl:A, 4btl:B, 2c0p:A, 2c0p:B, 2c0q:A, 2c0q:B, 5dtj:A, 5dtj:B, 5ehn:A, 5ehn:B, 5ehq:A, 5ehq:B, 5ehz:A, 5ehz:B, 5eia:A, 5eia:B, 5eie:A, 5eie:B, 5eih:A, 5eih:B, 5fkj:A, 5fkj:D, 5fkj:B, 5fkj:C, 5foq:A, 5foq:B, 5fpp:A, 5fpp:B, 6fsd:A, 6fsd:B, 6fse:A, 6fse:B, 5fum:A, 5fum:B, 2gyu:A, 2gyu:B, 2gyv:A, 2gyv:B, 2gyw:A, 2gyw:B, 2h9y:A, 2h9y:B, 2ha0:A, 2ha0:B, 2ha2:A, 2ha2:B, 2ha3:A, 2ha3:B, 2ha4:A, 2ha4:B, 2ha5:A, 2ha5:B, 2ha6:A, 2ha6:B, 2ha7:A, 2ha7:B, 1j06:A, 1j06:B, 1j07:A, 1j07:B, 2jey:A, 2jey:B, 2jez:A, 2jez:B, 2jf0:A, 2jf0:B, 1maa:A, 1maa:B, 1maa:C, 1maa:D, 1n5m:A, 1n5m:B, 1n5r:A, 8orc:A, 8orc:B, 5ov9:A, 5ov9:B, 1q83:A, 1q83:B, 1q84:A, 1q84:B, 7qak:A, 7qak:B, 7qb4:A, 7qb4:B, 7qyn:A, 7qyn:B, 7r02:A, 7r02:B, 7r0a:A, 7r0a:B, 7r2f:A, 7r2f:B, 7r3c:A, 7r3c:B, 7r4e:A, 7r4e:B, 6td2:A, 6td2:B, 2whp:A, 2whp:B, 2whq:A, 2whq:B, 2whr:A, 2whr:B, 2wls:A, 2wls:B, 2wu3:A, 2wu3:B, 2wu4:A, 2wu4:B, 2xud:A, 2xuf:A, 2xuf:B, 2xug:A, 2xug:B, 2xuh:A, 2xuh:B, 2xui:A, 2xui:B, 2xuj:A, 2xuj:B, 2xuk:A, 2xuk:B, 2xuo:A, 2xuo:B, 2xup:A, 2xup:B, 2xuq:A, 2xuq:B, 3zlu:B, 3zlv:A, 3zlv:B
40	8iuf:S8	182	34	0.0719	0.0659	0.3529	8.7	8j9h:S8, 8j9i:S8, 8j9j:S8

[Back]