Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HMFFKDKNVLIIGGTGTIGKSILSNVLQEKPKVVRVFSRSEYNQFLLQEEFRDKRNIRYLIGDIRNYDRVFSAMENIDYV
FHVAAMKHVSFCEYNPFEAVLTNIFGTQNVIKAAIAQKVKKVVFTSSNAAISPTNNYGATKLTAERLITSAEYSKGSSET
TFTSVRFGNVMGSRGSVIPLFENQIKENQKITVTDLSMSRFMMTLNQATMLTIEAMKIAKGGETFILKMPVISLNDLSEV
MIEEVTKENIKIEEIGLKPGEKMYEELMTHDESLQAFELPDMFIIPSPTQYENAKRAKAGFYRSDNAISKEELRNLILNQ
QLL

The query sequence (length=323) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6bwc:C 327 329 0.9814 0.9694 0.9635 0.0 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
2 4j2o:C 316 288 0.3406 0.3481 0.3819 6.45e-75 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
3 2gn4:A 329 292 0.3591 0.3526 0.3973 5.86e-74 2gn4:B, 2gn6:A, 2gn6:B, 2gn8:A, 2gn8:B, 2gn9:A, 2gn9:B, 2gna:A, 2gna:B
4 3w1v:A 347 328 0.3839 0.3573 0.3780 8.60e-72 4g5h:A, 3vvc:A, 3w1v:B
5 5bju:A 340 274 0.3189 0.3029 0.3759 1.93e-49 5bju:B, 5bjv:A, 5bjv:B, 5bjw:A, 5bjw:B, 5bjx:A, 5bjx:B, 5bjy:A, 5bjy:B
6 3vvb:A 270 317 0.3096 0.3704 0.3155 1.95e-48
7 4tqg:A 297 328 0.3034 0.3300 0.2988 9.68e-36
8 3pvz:A 372 343 0.2663 0.2312 0.2507 1.05e-20 3pvz:C, 3pvz:D
9 3pvz:B 300 194 0.1765 0.1900 0.2938 4.17e-16
10 6dnt:A 310 279 0.2105 0.2194 0.2437 1.11e-10
11 6vlo:A 319 269 0.2043 0.2069 0.2454 2.29e-10 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
12 1sb8:A 341 256 0.2105 0.1994 0.2656 3.01e-10 1sb9:A
13 4lis:A 364 166 0.1486 0.1319 0.2892 3.63e-10 4lis:B, 4lis:C
14 6nbr:A 316 101 0.1053 0.1076 0.3366 4.79e-10 6nbr:B, 6nbr:C, 6nbr:D
15 6jkh:A 212 148 0.1300 0.1981 0.2838 7.27e-10 6jkh:B
16 4zrn:A 309 215 0.1517 0.1586 0.2279 2.67e-09 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
17 7kn1:A 336 188 0.1548 0.1488 0.2660 6.41e-09 7kn1:B
18 6kv9:A 299 180 0.1548 0.1672 0.2778 7.42e-09 6kvc:A
19 6pnl:A 336 272 0.2229 0.2143 0.2647 7.48e-09 6pmh:A
20 1gy8:C 370 203 0.1641 0.1432 0.2611 1.54e-08 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
21 2c20:A 329 182 0.1455 0.1429 0.2582 1.91e-08 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
22 3ehe:A 290 196 0.1703 0.1897 0.2806 2.51e-08 3ehe:B
23 7k3p:A 329 181 0.1393 0.1368 0.2486 4.74e-08 7k3p:B
24 2q1w:A 300 228 0.1858 0.2000 0.2632 9.30e-08 2q1w:B, 2q1w:C
25 1a9y:A 338 186 0.1455 0.1391 0.2527 1.17e-07 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
26 6k0g:A 335 189 0.1672 0.1612 0.2857 1.78e-07 6k0h:A, 6k0i:A
27 3a1n:A 315 156 0.1393 0.1429 0.2885 3.83e-07 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
28 4r1s:A 319 151 0.1331 0.1348 0.2848 3.92e-07 4r1s:B
29 1rkx:C 351 195 0.1703 0.1567 0.2821 6.53e-07 1rkx:A, 1rkx:B, 1rkx:D
30 4twr:A 325 182 0.1486 0.1477 0.2637 8.85e-07 4wok:A
31 2pzm:A 316 309 0.2043 0.2089 0.2136 3.36e-06 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
32 1z45:A 674 193 0.1548 0.0742 0.2591 4.93e-06
33 3lu1:A 336 274 0.1950 0.1875 0.2299 5.24e-06 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
34 6vo6:D 311 175 0.1362 0.1415 0.2514 5.48e-06 6vo6:A, 6vo6:B, 6vo6:C, 6vo8:A, 6vo8:B
35 1wvg:A 352 254 0.1889 0.1733 0.2402 6.02e-06 1wvg:B
36 8vr2:B 321 178 0.1269 0.1277 0.2303 9.27e-06 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
37 7xpo:A 344 193 0.1517 0.1424 0.2539 1.08e-05 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
38 5u4q:B 304 187 0.1455 0.1546 0.2513 1.81e-05
39 6wj9:B 308 212 0.1610 0.1688 0.2453 2.60e-05 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
40 6kwt:A 338 174 0.1362 0.1302 0.2529 3.34e-05
41 6jyg:D 307 181 0.1424 0.1498 0.2541 3.40e-05 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
42 5u4q:A 321 187 0.1424 0.1433 0.2460 3.63e-05
43 1r66:A 322 158 0.1269 0.1273 0.2595 4.06e-05 1r6d:A
44 6bwl:A 313 259 0.1796 0.1853 0.2239 4.45e-05
45 2b69:A 312 129 0.0991 0.1026 0.2481 4.60e-05 4gll:A, 4gll:B
46 3aw9:A 304 271 0.2105 0.2237 0.2509 4.66e-05 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
47 2hun:A 329 158 0.1084 0.1064 0.2215 6.24e-05 2hun:B
48 1ker:B 347 111 0.0991 0.0922 0.2883 6.61e-05 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
49 5tqm:A 315 152 0.1331 0.1365 0.2829 8.93e-05 5tqm:B
50 8wov:B 341 191 0.1548 0.1466 0.2618 1.00e-04 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
51 4id9:B 328 168 0.1238 0.1220 0.2381 1.07e-04 4id9:A, 4idg:A, 4idg:B
52 2pk3:A 309 106 0.1146 0.1197 0.3491 2.79e-04 2pk3:B
53 4lk3:B 274 129 0.0991 0.1168 0.2481 3.63e-04 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
54 5z75:A 306 234 0.1641 0.1732 0.2265 3.83e-04 5z75:B, 5z75:D
55 6zll:A 321 176 0.1455 0.1464 0.2670 3.83e-04 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
56 1bxk:B 344 114 0.1084 0.1017 0.3070 8.20e-04 1bxk:A
57 8v4h:B 342 125 0.1053 0.0994 0.2720 0.001 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
58 8fip:A 338 132 0.1115 0.1065 0.2727 0.002 8fio:A, 8fio:B, 8fip:B
59 5u9c:A 288 158 0.1238 0.1389 0.2532 0.003 5u9c:C
60 7cgv:A 310 243 0.1765 0.1839 0.2346 0.003 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
61 7c1e:A 342 167 0.1455 0.1374 0.2814 0.004 7c1e:B, 7c3v:A, 5z2x:A, 5z2x:B, 8zav:A, 8zav:B, 5zec:A, 5zec:B, 5zed:A, 5zed:B
62 3rfv:A 265 180 0.1331 0.1623 0.2389 0.004 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
63 2ydx:A 312 155 0.1115 0.1154 0.2323 0.005 2ydx:C, 2ydx:B, 2ydx:D, 2ydx:E
64 7yst:A 312 156 0.1238 0.1282 0.2564 0.005 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
65 3sxp:D 314 201 0.1393 0.1433 0.2239 0.007 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
66 3enk:A 340 130 0.1115 0.1059 0.2769 0.008 3enk:B
67 7us5:A 346 145 0.1176 0.1098 0.2621 0.010 7us5:B, 7us5:C, 7us5:D
68 4m55:E 164 127 0.0960 0.1890 0.2441 0.012
69 7csh:A 312 100 0.0991 0.1026 0.3200 0.014
70 2c59:A 364 126 0.1022 0.0907 0.2619 0.017 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
71 1bdb:A 267 164 0.1300 0.1573 0.2561 0.023
72 9cly:B 242 151 0.1176 0.1570 0.2517 0.023 9cly:A
73 1o5i:B 234 141 0.1022 0.1410 0.2340 0.025
74 2p5u:A 311 210 0.1486 0.1543 0.2286 0.025 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
75 8du1:A 361 111 0.0960 0.0859 0.2793 0.025 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
76 5y1f:A 311 230 0.1641 0.1704 0.2304 0.026 5y1e:A, 5y1g:A
77 2q1s:A 336 286 0.1981 0.1905 0.2238 0.030 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
78 6ql9:D 1765 37 0.0619 0.0113 0.5405 0.040 3hmj:A, 3hmj:B, 3hmj:C, 8prv:A, 8prv:B, 8prw:A, 8prw:B, 8prw:C, 8prw:D, 8prw:E, 8prw:F, 8ps1:A, 6ql6:F, 6ql6:E, 6ql6:D, 6ql6:C, 6ql6:B, 6ql6:A, 6ql9:F, 6ql9:A, 6ql9:E, 6ql9:B, 6ql9:C, 6ta1:A, 6ta1:B, 6ta1:D, 6ta1:K, 6ta1:F, 6ta1:I, 6u5u:A, 2vkz:A, 2vkz:B, 2vkz:C, 2wat:A, 2wat:B, 2wat:C, 2wat:D, 2wat:E, 2wat:F
79 2ggs:A 273 150 0.1146 0.1355 0.2467 0.040 2ggs:B
80 7cs6:F 300 89 0.0743 0.0800 0.2697 0.055 7cs3:A, 7cs3:B, 7cs3:C, 7cs3:D, 7cs3:E, 7cs3:F, 7cs4:E, 7cs4:A, 7cs4:F, 7cs4:D, 7cs4:C, 7cs4:B, 7cs5:E, 7cs5:A, 7cs5:F, 7cs5:D, 7cs5:C, 7cs5:B, 7cs6:A, 7cs6:B, 7cs6:C, 7cs6:D, 7cs6:E, 7cs7:A, 7cs7:B, 7cs7:C, 7cs7:D, 7cs7:E, 7cs7:F, 7cs8:A, 7cs8:B, 7cs8:C, 7cs8:D, 7cs8:E, 7cs8:F
81 6xyw:Ai 138 43 0.0433 0.1014 0.3256 0.063
82 6h0n:A 377 293 0.1858 0.1592 0.2048 0.090 6h0n:B, 6h0p:A, 6h0p:B
83 1keu:A 361 112 0.0960 0.0859 0.2768 0.091 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
84 1i3k:A 347 164 0.1269 0.1182 0.2500 0.098 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
85 4pvd:A 342 135 0.1176 0.1111 0.2815 0.12 4pvd:B
86 8sk0:B 330 154 0.1022 0.1000 0.2143 0.20 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
87 8gjb:A 320 181 0.1455 0.1469 0.2597 0.34 8gjb:B
88 7csa:A 310 93 0.0929 0.0968 0.3226 0.38 7csa:B, 7csa:C, 7csa:D, 7csb:C, 7csb:D, 7csb:A, 7csb:B, 7csc:E, 7csc:F, 7csc:A, 7csc:B, 7csc:C, 7csc:D, 7csd:C, 7csd:D, 7csd:A, 7csd:B, 7cse:E, 7cse:F, 7cse:A, 7cse:B, 7cse:C, 7cse:D, 7csf:C, 7csf:D, 7csf:A, 7csf:B
89 6u5w:A 1435 49 0.0619 0.0139 0.4082 0.43
90 7pyt:B 392 117 0.0960 0.0791 0.2650 0.49 7pyt:D, 7yxm:B, 7yxm:D
91 5uam:A 440 141 0.1022 0.0750 0.2340 0.79 5uam:B, 5uas:A, 5uas:B
92 6x3b:A 300 172 0.1115 0.1200 0.2093 0.81 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
93 5ywn:A 333 171 0.1331 0.1291 0.2515 0.85 5yw4:A
94 1orr:A 338 156 0.1084 0.1036 0.2244 1.0 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
95 3sc6:D 283 180 0.1269 0.1449 0.2278 1.2 3sc6:A, 3sc6:B, 3sc6:C, 3sc6:E, 3sc6:F
96 3c3x:A 310 80 0.0650 0.0677 0.2625 1.2 3c3x:B, 2qw8:A, 2qw8:B, 2qx7:A, 2qx7:B, 2qzz:A, 2qzz:B, 2r2g:A, 2r2g:B, 2r6j:A, 2r6j:B
97 3qvo:A 197 75 0.0557 0.0914 0.2400 1.3
98 5ilg:A 265 189 0.1393 0.1698 0.2381 1.4 5ilg:B, 5ilo:A, 5ilo:B
99 6vtj:A 472 332 0.2291 0.1568 0.2229 1.7
100 8r2j:B 275 228 0.1517 0.1782 0.2149 1.7 8r2j:A
101 3pk0:B 262 198 0.1517 0.1870 0.2475 1.9 3pk0:A, 3pk0:C, 3pk0:D
102 6uh2:B 255 77 0.0619 0.0784 0.2597 2.1 6uh2:A
103 1sez:A 465 85 0.0805 0.0559 0.3059 2.5 1sez:B
104 5wqo:A 234 61 0.0526 0.0726 0.2787 2.5 5wqp:A
105 3asv:A 248 152 0.1207 0.1573 0.2566 2.6 3asv:B, 3asv:C, 3asv:D, 3asv:E, 3asv:F
106 5gt9:B 263 150 0.1238 0.1521 0.2667 2.7 5gt9:A
107 6aqz:A 334 84 0.0774 0.0749 0.2976 2.7 6aqz:B, 6aqz:C, 6aqz:E, 6aqz:F
108 7epr:B 310 130 0.1084 0.1129 0.2692 2.8 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
109 4qec:A 248 156 0.1269 0.1653 0.2628 2.8 4qec:B, 4qed:A, 4qed:B
110 2jbh:B 213 35 0.0495 0.0751 0.4571 3.4 2jbh:A
111 7s04:A 396 132 0.0960 0.0783 0.2348 3.5
112 3c1t:B 326 133 0.1022 0.1012 0.2481 3.8 3bxx:A, 3bxx:B, 3bxx:C, 3bxx:D, 3bxx:E, 3bxx:F, 3c1t:A, 3c1t:C, 3c1t:D, 2c29:D, 2c29:F, 2iod:A, 2iod:B, 2iod:C, 2iod:D, 2nnl:D, 2nnl:F
113 7l5u:A 520 33 0.0433 0.0269 0.4242 5.2 7l5u:B, 7l5u:C, 7l5u:D, 7l5u:E, 7l5u:F, 7l5u:G, 7l5u:H, 7l5u:I, 7l5u:J, 7l5u:K, 7l5u:L, 7l5u:M, 7l5u:N, 7l5u:O, 7l5u:P, 7l5u:Q, 7l5u:R, 7l5u:S, 7l5u:T, 7l5u:U, 7l5u:V, 7l5u:W, 7l5u:X, 7l5u:Y, 7l5u:Z, 7l5u:a, 7l5u:b, 7l5u:c, 7l5u:d, 7l5u:e, 7l5u:f, 7l5u:g, 7l5u:h, 7l5u:i, 7l5u:j, 7l5u:k, 7l5u:l, 7l5u:m, 7l5u:n, 7l5u:o, 7l5u:p, 7l5u:q, 7l5u:r, 7l5u:s, 7l5u:t, 7l5u:u, 7l5u:v, 7l5u:w, 7l5u:x, 7l5u:y, 7l5u:z, 7l5u:1, 7l5u:2, 7l5u:3, 7l5u:4, 7l5u:5, 7l5u:6, 7l5u:7, 7l5u:8
114 5n10:B 236 52 0.0588 0.0805 0.3654 5.2 6a5q:C, 6a5q:B, 6a5q:A, 6byk:B, 6byk:D, 6byk:A, 6byk:C, 2c23:A, 8dp5:C, 5f74:A, 4gnt:A, 6hep:A, 6hep:B, 6hep:C, 6hep:D, 5n10:A, 7qi1:A, 7qi1:D, 7qi1:B, 7qi1:C, 6ygj:A, 6ygj:F
115 5itv:A 255 80 0.0619 0.0784 0.2500 5.3 5itv:B, 5itv:C
116 6dzi:C 275 74 0.0650 0.0764 0.2838 5.9 6dzp:C, 7f0d:C, 8fr8:K, 8kab:C, 7kgb:C, 7msc:C, 7msh:C, 7msm:C, 7msz:C, 7mt2:C, 7mt3:C, 7mt7:C, 5o60:C, 5o61:C, 7s0s:D, 7sfr:C, 5v7q:C, 5v93:C, 8v9j:C, 8v9k:C, 8v9l:C, 8whx:E, 8why:E, 8wi7:E, 8wi8:E, 8wib:E, 8wic:E, 7xam:C, 5xym:C, 8xz3:C, 7y41:C, 5zeb:C, 5zep:C, 5zet:C
117 5itv:D 227 80 0.0619 0.0881 0.2500 6.1
118 3c1o:A 314 114 0.0929 0.0955 0.2632 6.3
119 8ewu:B 354 26 0.0372 0.0339 0.4615 8.4 8ewu:A
120 6bul:B 327 102 0.0712 0.0703 0.2255 9.4 6aqj:A, 6aqj:B, 6bul:A, 6c55:A, 6c55:B, 6c5n:A, 6c5n:B, 7ke2:B, 7ke2:A, 7kh7:A, 7kh7:B, 6vo2:A, 6vo2:B, 5w3k:A, 5w3k:B
121 6bge:A 323 70 0.0557 0.0557 0.2571 9.6 6bge:B, 1g6o:A, 1g6o:B, 1nly:A, 1nly:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218