BioLiP

>protein
HMDTTFQAAIDTGKINGAVVCATDAQGHFVYNKATGERTLLSGEKQPQQLDDVLYLASATKLITTIAALQCVEDGLLSLD
GDLSSIAPELAAKYVLTGFTDDESPLDDPPARPITLKMLLTHSSGTSYHFLDPSIAKWRAQYANPENEKPRLVEEMFTYP
LSFQPGTGWMYGPGLDWAGRVVERVTGGTLMEFMQKRIFDPLGITDSQFYPVTREDLRARLVDLNPSDPGALGSAVIGGG
GEMNLRGRGAFGGHGLFLTGLDFVKILRSLLANDGMLLKPAAVDNMFQQHLGPEAAASHRAALASPLGPFFRVGTDPETK
VGYGLGGLLTLEDVDGWYGERTLTWGGGLTLTWFIDRKNNLCGVGAIQAVLPVDGDLMADLKQTFRHDIYRKYSAWKGQQ

The query sequence (length=400) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6kjd:B	400	400	0.9975	0.9975	0.9975	0.0	6kjd:A, 6kje:B, 6kje:A, 6kjf:B, 6kjf:A
2	3hlf:A	425	403	0.3900	0.3671	0.3871	2.99e-74	3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
3	7u1b:A	403	382	0.3125	0.3102	0.3272	2.67e-38
4	4ivk:A	404	404	0.2975	0.2946	0.2946	1.67e-31
5	7pp8:A	402	384	0.2775	0.2761	0.2891	1.14e-26	7pp8:B, 7pp8:C, 7pp8:D, 7pp8:E, 7pp8:F, 7pp8:G, 7pp8:H, 7pu6:A, 7pu6:B, 7pu6:C, 7pu6:D, 7pu6:E, 7pu6:F, 7pu6:G, 7pu6:H
6	1ci9:A	377	383	0.2650	0.2812	0.2768	2.35e-21	1ci9:B
7	4p85:A	390	387	0.2325	0.2385	0.2403	3.77e-13	4p85:B, 4p87:A, 4p87:B, 5zwq:A, 5zwq:B, 5zwr:B, 5zwr:A
8	6kjj:A	361	210	0.1450	0.1607	0.2762	1.50e-12	6kjp:A, 6kjq:A, 6kjr:A
9	2qmi:F	447	221	0.1450	0.1298	0.2624	1.22e-09	2qmi:E, 2qmi:G, 2qmi:H
10	1cef:A	347	163	0.1025	0.1182	0.2515	4.44e-07	1ceg:A, 1hvb:A, 1ikg:A, 1iki:A, 1mpl:A, 1pw1:A, 1pw8:A, 1pwc:A, 1pwd:A, 1pwg:A, 1scw:A, 1sde:A, 1yqs:A
11	3wwx:A	340	253	0.1675	0.1971	0.2648	7.35e-07
12	2dns:A	362	251	0.1675	0.1851	0.2669	7.91e-07	2dns:B, 2dns:C, 2dns:D, 2dns:E, 2efu:A, 2efu:B, 2efu:C, 2efu:D, 2efx:A, 2efx:B, 2efx:C, 2efx:D, 2efx:E
13	7v1y:A	394	355	0.1900	0.1929	0.2141	2.24e-06	7v1y:C, 7v1y:B, 7v1y:D
14	5tgf:D	332	337	0.1950	0.2349	0.2315	2.26e-06
15	2efu:E	342	180	0.1125	0.1316	0.2500	1.20e-05	2efu:F, 2efx:F
16	7mdf:A	453	166	0.1050	0.0927	0.2530	3.42e-05	4e6w:A, 4e6w:B, 4e6w:C, 7mdc:A
17	4e6x:C	305	164	0.0975	0.1279	0.2378	0.003	4e6x:B
18	1b3o:B	410	126	0.0725	0.0707	0.2302	0.31
19	4yut:A	351	55	0.0525	0.0598	0.3818	2.0	8qfe:A, 8qff:A, 8qfg:A, 8qfh:A, 8qfi:A, 8qfj:A, 5x4t:A, 5x4u:A, 5x4v:A, 4yus:A, 4yut:B
20	9baq:A	1001	97	0.0725	0.0290	0.2990	4.5
21	6kby:A	362	92	0.0650	0.0718	0.2826	4.7	6k9t:A, 6ka5:A, 6m5p:A, 6m5q:A
22	9baz:A	965	97	0.0725	0.0301	0.2990	4.8	9bap:A
23	5kd6:A	400	89	0.0575	0.0575	0.2584	4.9	5kcl:A, 5kcl:B, 5kcq:A, 5kcq:B, 5kcy:A, 5kcy:B, 5kd0:A, 5kd0:B, 5kd6:B, 5kda:A, 5kda:B
24	1ord:A	730	103	0.0750	0.0411	0.2913	4.9	1c4k:A, 1ord:B
25	6z1p:Aq	273	60	0.0475	0.0696	0.3167	5.2
26	7poa:A	398	96	0.0675	0.0678	0.2812	6.2	7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
27	3j7y:f	95	43	0.0400	0.1684	0.3721	6.6
28	1d7r:A	431	50	0.0375	0.0348	0.3000	7.7	1d7s:A, 1d7u:A, 1d7v:A, 1dgd:A, 1dge:A, 1dka:A, 2dkb:A, 1m0n:A, 1m0o:A, 1m0p:A, 1m0q:A, 1z3z:A, 1zc9:A, 1zob:A, 1zod:A
29	8rlk:A	385	109	0.0625	0.0649	0.2294	7.7	8rlk:B, 8rlk:C, 8rlk:D
30	8cav:A	860	124	0.0900	0.0419	0.2903	7.8	8cav:B

[Back]