BioLiP

>protein
HMDPVSVWGNTPLATVDPEIHDLIEKEKRRQCRGIELIASENFTSFAVIEALGSALTNKYSEGMPGNRYYGGNEYIDQIE
NLCRSRALQAFHLDAQSWGVNVQPYSGSPANFAAYTAVLNPHDRIMGLDLPSGGHLTHGYYTSGGKKISATSIYFESLPY
KVNSTTGYIDYDRLEEKALDFRPKLIICGGSAYPRDWDYKRFREVADKCGALLLCDMAHTSGLVAAQEVNSPFEYCDIVT
TTTHKSLRGPRAGMIFYRKGPKPPKKGQPENAVYDFEDKINFAVFPSLQGGPHNHQIGALAVALKQAASPGFKAYAKQVK
ANAVALGKYLMGKGYSLVTGGTENHLVLWDLRPLGLTGNKVEKLCDLCNITVNKNAVFGDSSALAPGGVRIGAPAMTSRG
LVEKDFEQIGEFLHRAVTLTLEIQKEHGKLLKDFNKGLVNNKAIEDLKADVEKFSALFDMPGFLVSEMKYKD

The query sequence (length=472) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8dsk:A	472	472	0.9979	0.9979	0.9979	0.0	8dsk:B, 8dsk:C, 8dsk:D, 8fsd:A, 8fsd:B, 8fsd:C, 8fsd:D, 8tqf:A, 8tqf:B, 8tqf:C, 8tqf:D, 7ujh:A, 7ujh:B, 6uxi:A, 6uxi:B, 6uxj:A, 6uxj:B, 6uxj:C, 6uxj:D, 6uxl:A, 6uxl:B
2	6smr:A	473	470	0.8877	0.8858	0.8915	0.0	6smr:B, 6smr:C, 6smr:D
3	7e13:A	475	468	0.5763	0.5726	0.5812	0.0	7e13:B, 7e13:C, 7e13:D
4	6smn:D	480	468	0.5636	0.5542	0.5684	0.0	6smn:A, 6smn:B, 6smn:C, 6smw:A, 6smw:B, 6smw:C, 6smw:D
5	7byi:A	463	463	0.5826	0.5940	0.5940	0.0	8aql:A, 8aql:B, 8aql:C, 8aql:D, 9box:A, 9box:C, 9box:B, 9box:D, 7byi:B, 8fjt:A, 8fjt:B, 8fju:A, 8fju:B, 8gks:A, 8gks:B, 8gkt:A, 8gkt:B, 8gku:A, 8gku:B, 8gkw:A, 8gkw:B, 8gky:A, 8gky:B, 8gkz:A, 8gkz:B, 6m5o:A, 6m5o:B, 6qvg:A, 6qvg:B, 6qvl:A, 6qvl:B, 8t4o:A, 8t4o:B, 8t4p:A, 8t4p:B, 8tlc:A, 8tlc:B, 5v7i:A, 5v7i:B
6	6cd1:A	452	458	0.5678	0.5929	0.5852	0.0	6ccz:A, 6ccz:B, 6cd1:B, 6cd1:C, 6cd1:D, 6cd1:E, 6cd1:F, 6cd1:G, 6cd1:H
7	1rv3:B	466	458	0.5742	0.5815	0.5917	0.0	1cj0:A, 1ls3:A, 1ls3:B, 1ls3:C, 1ls3:D, 1rv3:A, 1rv4:A, 1rv4:B, 1rvu:A, 1rvu:B, 1rvy:A, 1rvy:B
8	1eji:A	478	462	0.5720	0.5649	0.5844	0.0	8a11:B, 1bj4:A, 1cj0:B, 1eji:B, 1eji:C, 1eji:D, 6fl5:A, 6fl5:D, 6fl5:G, 6fl5:J, 6m5w:A
9	5gvk:A	442	455	0.4725	0.5045	0.4901	1.30e-159	5gvk:B, 5gvk:C, 5gvl:A, 5gvl:B, 5gvl:C, 5gvm:A, 5gvm:B, 5gvm:C, 5gvn:A, 5gvn:B, 5gvn:C, 5gvp:A, 5gvp:B, 5gvp:C, 4oyt:A, 4oyt:B, 4oyt:C, 4pff:A, 4pff:B, 4pff:C, 4pfn:A, 4pfn:B, 4pfn:C, 4tmr:A, 4tmr:B, 4tmr:C, 4tn4:A, 4tn4:B, 4tn4:C, 5xmp:A, 5xmp:B, 5xmp:C, 5xmq:A, 5xmq:B, 5xmq:C, 5xmr:A, 5xmr:B, 5xmr:C, 5xms:A, 5xms:B, 5xms:C, 5xmt:A, 5xmt:B, 5xmt:C, 5xmu:A, 5xmu:B, 5xmu:C, 5xmv:A, 5xmv:B, 5xmv:C, 5yfy:A, 5yfy:B, 5yfy:C, 5yfz:A, 5yfz:B, 5yfz:C, 5yg0:A, 5yg0:B, 5yg0:C, 5yg1:A, 5yg1:B, 5yg1:C, 5yg2:A, 5yg2:B, 5yg2:C, 5yg3:A, 5yg3:B, 5yg3:C, 5yg4:A, 5yg4:B, 5yg4:C
10	4o6z:A	448	449	0.4767	0.5022	0.5011	2.91e-158	4o6z:B, 4o6z:C
11	6ymd:A	420	402	0.4047	0.4548	0.4751	9.98e-122	6ymd:B, 6ymf:A
12	1kkj:A	405	398	0.3962	0.4617	0.4698	4.54e-117	1kkp:A, 1kl1:A, 1kl2:A, 1kl2:B, 2vgs:A, 2vgt:A, 2vgu:A, 2vgv:A, 2vgw:A, 2vi8:A, 2vi9:A, 2via:A, 2vib:A, 2vmn:A, 2vmo:A, 2vmp:A, 2vmq:A, 2vmr:A, 2vms:A, 2vmt:A, 2vmu:A, 2vmv:A, 2vmw:A, 2vmx:A, 2vmy:A, 2vmy:B, 2vmz:A, 2w7d:A, 2w7e:A, 2w7f:A, 2w7g:A, 2w7h:A, 2w7i:A, 2w7j:A, 2w7k:A, 2w7l:A, 2w7m:A, 1yjs:A, 1yjy:A, 1yjz:A
13	9boh:A	402	402	0.3941	0.4627	0.4627	7.40e-117	9boh:B, 9bow:A, 9bow:B, 9bpe:A, 9bpe:B, 2dkj:A, 2dkj:B, 8ssy:A, 8ssy:B, 8sui:B
14	7x5o:B	412	405	0.4004	0.4587	0.4667	2.77e-111	7v3d:A, 7v3d:B, 7x5n:A, 7x5n:B, 7x5o:A
15	4n0w:A	416	406	0.3856	0.4375	0.4483	4.98e-108	4n0w:B, 4n0w:C, 4n0w:D, 4ot8:A, 4ot8:C, 4ot8:B, 4ot8:D, 4otl:A, 4otl:B, 4otl:D, 4otl:C
16	6uld:A	428	414	0.3835	0.4229	0.4372	7.15e-105	6uld:B
17	3pgy:B	404	416	0.3729	0.4356	0.4231	6.33e-104	3pgy:A
18	1dfo:B	417	402	0.3856	0.4365	0.4527	7.45e-102	1dfo:A, 1dfo:D, 1dfo:C, 1eqb:A, 1eqb:B, 1eqb:D, 1eqb:C, 3g8m:A
19	6tgh:A	410	403	0.3665	0.4220	0.4293	9.41e-101	6tgh:C, 6tgh:B, 6tgh:D, 6ti1:A, 6ti1:C, 6ti3:A, 6ti3:C, 6ti3:B, 6ti3:D, 6ti4:A, 6ti4:C, 4wxf:A, 4wxf:C, 4wxg:A, 4wxg:C, 6yrw:A, 6yrw:C, 6yrw:B, 6yrw:D
20	4uqv:G	429	406	0.2966	0.3263	0.3448	4.63e-63	4uqv:A, 4uqv:B, 4uqv:C, 4uqv:D, 4uqv:E, 4uqv:F, 4uqv:H, 4uqv:I, 4uqv:J, 4uqv:K, 4uqv:L
21	4bhd:B	395	405	0.2733	0.3266	0.3185	5.67e-47
22	2yba:B	382	105	0.0572	0.0707	0.2571	0.38	3c9c:A, 2xyi:A, 2yb8:B
23	6zrd:A	411	105	0.0572	0.0657	0.2571	0.52	7m40:A, 4pby:B, 4pc0:A, 4pc0:B, 5xwr:A, 2yba:A
24	3cfv:B	393	105	0.0572	0.0687	0.2571	1.1	6bw3:C, 6bw3:A, 6bw4:C, 6bw4:A, 3cfs:B, 3cfv:A, 7m40:B, 4pby:A, 4pbz:A, 4r7a:B, 5vtb:A, 2xu7:B, 2xu7:A, 5xwr:B, 5xxq:B, 5xxq:A, 5y1u:B, 5y1u:A, 6zrc:A, 6zrc:B, 6zrd:B
25	6s1r:A	391	108	0.0657	0.0793	0.2870	1.2	5wjc:A
26	6kjj:A	361	95	0.0657	0.0859	0.3263	1.8	6kjp:A, 6kjq:A, 6kjr:A
27	8xvg:L	3485	74	0.0445	0.0060	0.2838	2.6	8xvv:L
28	7ktr:A	3042	74	0.0445	0.0069	0.2838	2.8
29	8urw:Z	1235	66	0.0424	0.0162	0.3030	5.4	8syi:Z
30	4oge:A	977	91	0.0530	0.0256	0.2747	6.9	4ogc:A
31	4wbr:D	157	84	0.0424	0.1274	0.2381	7.2
32	8p5d:LA0	245	48	0.0360	0.0694	0.3542	8.2	8p60:LA0, 8p60:KA0, 7qca:LA0
33	7q3y:A	1201	50	0.0360	0.0142	0.3400	8.2	5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
34	3tri:A	272	41	0.0297	0.0515	0.3415	9.5	3tri:B

[Back]