BioLiP

>protein
HMASTYLSDMDWSSATHGDIDKTKTVQKDAPFTTGNKGEHTKISLLTSDDKVKYFDKGIGTVADSPSVISYDISGQGFEK
FETYIGIDQSANSSRSDHAVVDRIEIEIDGKVVYSSSVTNPEGFRYNTQAQFISVTIPQNAKKISLKSFAGEHTWGDEVV
FADAKLIKTVSTQTITPDLLNKGINGGVYLSDLEWVDATHGDDDKSKTVQKDKPFTPGNNGSNNKIKLLIDGKEVEFNKG
LGTVASNPSSIKYDVSGANVTRFISYVGIDRSANHLNSDYADIQKFEVVADGKVIYSSDSKYPKGIKYDTSAFLVDVEIP
KDTQTIELKSYSGKHTWADELVLGGALFMA

The query sequence (length=350) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2ygm:B	352	350	1.0000	0.9943	1.0000	0.0	2ygl:A, 2ygl:B, 2ygm:A
2	2vng:B	173	164	0.2714	0.5491	0.5793	3.82e-63	2vng:A, 2vno:A, 2vno:B, 2vnr:A
3	2vng:B	173	161	0.2571	0.5202	0.5590	2.79e-58	2vng:A, 2vno:A, 2vno:B, 2vnr:A
4	7jrl:A	457	164	0.1457	0.1116	0.3110	5.27e-07	7jrm:A
5	2vmh:A	147	167	0.1429	0.3401	0.2994	9.65e-07	2vmg:A, 2vmi:A
6	2vmh:A	147	113	0.1057	0.2517	0.3274	0.021	2vmg:A, 2vmi:A
7	6z1s:A	381	67	0.0571	0.0525	0.2985	1.7
8	1r6m:A	236	106	0.0800	0.1186	0.2642	1.9
9	6v1s:E	276	27	0.0400	0.0507	0.5185	4.6	6v1s:A, 6v1s:B, 6v1s:C, 6v1s:D, 6v1s:F, 6v1s:G
10	2is4:B	632	56	0.0457	0.0253	0.2857	4.9
11	2is6:A	654	56	0.0457	0.0245	0.2857	5.0	2is1:A, 2is1:B, 2is2:A, 2is2:B, 2is4:A, 2is6:B
12	7vnn:D	641	27	0.0400	0.0218	0.5185	5.5	8ekm:A, 8ekm:B, 8ekm:C, 8ekm:D, 8ekm:E, 8ekm:F, 8ekm:G, 7vnj:A, 7vnj:B, 7vnj:C, 7vnj:D, 7vnj:E, 7vnj:F, 7vnj:G, 7vnn:A, 7vnn:B, 7vnn:C, 7vnn:E, 7vnn:F, 7vnn:G, 7yvq:A, 7yvq:B, 7yvq:C, 7yvq:D, 7yvq:E, 7yvq:F, 7yvq:G, 7yvs:A, 7yvs:B, 7yvs:C, 7yvs:D, 7yvs:E, 7yvs:F, 7yvs:G
13	8ekk:A	533	27	0.0400	0.0263	0.5185	5.6	8ekk:B, 8ekk:C, 8ekk:D, 8ekk:E, 8ekk:F, 8ekk:G, 8ekl:A, 8ekl:B, 8ekl:C, 8ekl:D, 8ekl:E, 8ekl:F, 8ekl:G
14	6uwr:A	660	27	0.0400	0.0212	0.5185	5.6	6uwi:A, 6uwi:h, 6uwi:G, 6uwi:n, 6uwi:F, 6uwi:m, 6uwi:E, 6uwi:l, 6uwi:D, 6uwi:k, 6uwi:C, 6uwi:j, 6uwi:B, 6uwi:i, 6uwi:H, 6uwi:a, 6uwi:I, 6uwi:b, 6uwi:J, 6uwi:c, 6uwi:K, 6uwi:d, 6uwi:L, 6uwi:e, 6uwi:M, 6uwi:f, 6uwi:N, 6uwi:g, 6uwr:B, 6uwr:C, 6uwr:D, 6uwr:E, 6uwr:F, 6uwr:G, 6uwr:H, 6uwr:I, 6uwr:J, 6uwr:K, 6uwr:L, 6uwr:M, 6uwr:N, 6uwt:H, 6uwt:I, 6uwt:J, 6uwt:K, 6uwt:L, 6uwt:M, 6uwt:N, 6uwt:A, 6uwt:B, 6uwt:C, 6uwt:D, 6uwt:E, 6uwt:F, 6uwt:G
15	8dcm:C	695	27	0.0400	0.0201	0.5185	5.7
16	3k7y:A	405	26	0.0371	0.0321	0.5000	6.1
17	2cz2:A	212	32	0.0400	0.0660	0.4375	6.2
18	8a0c:A	1116	44	0.0543	0.0170	0.4318	10.0	8a0c:B, 8a0m:A, 8a0m:C

[Back]