BioLiP

>protein
HLEIPTAIKPRDGRFGSGPSKVRLEQLQTLTTTAAALFGTSHRQAPVKNLVGRVRSGLAELFSLPDGYEVILGNGGATAF
WDAAAFGLIDKRSLHLTYGEFSAKFASAVSKNPFVGEPIIITSDPGSAPEPQTDPSVDVIAWAHNETSTGVAVAVRRPEG
SDALVVIDATSGAGGLPVDIAETDAYYFAPQKNFASDGGLWLAIMSPAALSRIEAIAATGRWVPDFLSLPIAVENSLKNQ
TYNTPAIATLALLAEQIDWLVGNGGLDWAVKRTADSSQRLYSWAQERPYTTPFVTDPGLRSQVVGTIDFVDDVDAGTVAK
ILRANGIVDTEPYRKLGRNQLRVAMFPAVEPDDVSALTECVDWVVERL

The query sequence (length=368) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2fyf:A	368	368	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	2fyf:B, 3vom:A, 3vom:B
2	3ffr:A	361	357	0.2500	0.2548	0.2577	4.07e-24
3	5yb0:B	349	361	0.2147	0.2264	0.2188	8.00e-19	5yb0:A, 5yb0:C, 5yb0:D, 5yb0:E, 5yb0:F, 5yb0:G, 5yb0:H, 5yb0:I, 5yb0:J, 5yb0:K, 5yd2:A, 5yd2:B
4	8a5v:E	366	377	0.2527	0.2541	0.2467	5.53e-18	8a5v:C, 8a5v:F, 8a5v:B, 8a5v:A, 8a5v:G, 8a5v:H, 8a5w:D, 8a5w:C, 8a5w:E, 8a5w:F, 8a5w:B, 8a5w:A, 8a5w:H, 3e77:A, 3e77:B
5	3qbo:B	359	283	0.1957	0.2006	0.2544	3.50e-11	3qbo:A
6	4azj:A	360	365	0.2147	0.2194	0.2164	1.15e-10	4azj:B, 4azk:A, 4azk:B, 2bhx:A, 2bhx:B, 2bi1:A, 2bi1:B, 2bi2:A, 2bi2:B, 2bi3:A, 2bi3:B, 2bi5:A, 2bi5:B, 2bi9:A, 2bi9:B, 2bia:A, 2bia:B, 2bie:A, 2bie:B, 2big:A, 2big:B, 1w23:A, 1w23:B
7	1bt4:A	361	368	0.2174	0.2216	0.2174	8.09e-10	2c0r:A, 2c0r:B, 1w3u:A
8	2dr1:A	381	382	0.2120	0.2047	0.2042	9.81e-10	2dr1:B
9	6czy:A	362	261	0.1766	0.1796	0.2490	1.58e-09	6czy:B, 6czy:C, 6czy:D, 6czz:A, 6czz:B, 6czz:C, 6czz:D
10	1bjo:A	360	368	0.2255	0.2306	0.2255	9.97e-08	1bjo:B
11	7t7j:B	360	284	0.1766	0.1806	0.2289	1.37e-06	7t7j:A
12	1m32:B	362	169	0.1168	0.1188	0.2544	0.005	1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
13	3zrq:A	382	231	0.1603	0.1545	0.2554	0.005	3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
14	2yri:A	352	292	0.1957	0.2045	0.2466	0.006	2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
15	6xdk:D	359	287	0.1766	0.1811	0.2265	0.007	6xdk:B, 6xdk:A, 6xdk:C
16	1iug:A	348	210	0.1413	0.1494	0.2476	0.015	1iug:B
17	3qm2:B	331	162	0.1168	0.1299	0.2654	0.019	3qm2:A
18	8odq:D	410	71	0.0652	0.0585	0.3380	0.38	8odq:B
19	7cep:A	414	171	0.1250	0.1111	0.2690	0.50	7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
20	3isl:A	387	71	0.0625	0.0594	0.3239	1.6	3isl:B
21	7d4i:3B	242	74	0.0571	0.0868	0.2838	1.8	7aju:CB, 7d4i:3C, 7d5s:3C, 7d5t:3B, 7d5t:3C, 7d63:3C, 6ke6:3C, 6lqp:3C, 6lqq:3C, 6lqr:3C, 6lqs:3C, 6lqt:3C, 6lqu:3C, 6lqv:3C, 7suk:SD, 5wlc:SD, 6zqd:CA, 6zqd:CB
22	3gzc:A	403	187	0.1413	0.1290	0.2781	2.1	3gzc:B, 3gzd:A, 3gzd:B, 3gzd:C, 3gzd:D
23	2wym:A	303	68	0.0543	0.0660	0.2941	3.0	2wym:B, 2wym:C, 2wym:D, 2wym:E, 2wym:F
24	1fcv:A	324	65	0.0516	0.0586	0.2923	3.4
25	3afg:B	507	83	0.0598	0.0434	0.2651	4.2	3afg:A
26	8wm6:e	169	72	0.0435	0.0947	0.2222	4.7	8wmv:e, 8wmw:e
27	5cof:A	172	56	0.0625	0.1337	0.4107	5.7
28	1n31:A	386	53	0.0462	0.0440	0.3208	5.7	1elq:A, 1elq:B, 1elu:A, 1elu:B, 1n2t:A, 1n2t:B, 1n31:B
29	7x6v:A	1381	109	0.0842	0.0224	0.2844	6.2
30	7x6s:A	1453	109	0.0842	0.0213	0.2844	6.2	5ltf:A, 5ltn:A, 5ltn:B, 5t2t:A
31	6pd2:C	616	79	0.0489	0.0292	0.2278	6.7	6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
32	6pk3:B	400	85	0.0707	0.0650	0.3059	8.3	6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
33	4ifd:H	295	57	0.0489	0.0610	0.3158	8.5	5c0x:H, 6fsz:HH, 5jea:H, 5k36:H, 8qcf:I
34	7vwt:A	326	39	0.0408	0.0460	0.3846	9.2	7vwt:B

[Back]